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为研究奶制品污染中阪崎肠杆菌的同源性关系,并建立起阪崎肠杆菌基于重复序列的分型技术。对2005-2006年福建省出入境检验检疫局从各类奶制品中分离出的阪崎肠杆菌先进行API鉴定,然后进行DiversiLab分型。其中DiversiLab分型包括:DNA提取,rep-PCR和微电泳芯片分离检测。rep-PCR条件为:94℃预变性2 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,70℃延伸90 s,35个循环;最后70℃延伸3 min。结果表明:31株阪崎肠杆菌被API分成了5种不同的生物型,DiversiLab分型能将阪崎肠杆菌分为不同的亚型,但它们之间没有必然的联系。部分同一企业来源的菌株具有同源性,样品的同源性与采样地无关。DiversiLab分型系统是一种快速,高效,易于操作,高重复性,高分辨率的基因分型方法,可作为食源性污染的同源性分型工具。 相似文献
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目的:为研究食品污染中沙门氏菌间的同源性关系,建立起沙门氏菌基于重复序列的分型技术。通过建立DiversiLab基因图谱数据库,以便对将来不同来源的沙门氏菌的基因图谱进行即时比较,确定其同源性,进而追溯污染来源,切断传播途径,为预测预警保障食品安全提供科学依据,为防止食源性疾病的发生提供技术支持。同时进行血清分型,比较分析2种方法的优劣和之间的关系。方法:对2002~2010年福建省出入境检验检疫局从各类食品及饲料中分离出的沙门氏菌先进行血清分型,然后进行DiversiLab分型,其中包括:DNA提取,rep-PCR和微电泳芯片分离检测。rep-PCR条件:94℃预变性2min;94℃变性30s,50℃退火30s,70℃延伸90s,35个循环,最后70℃延伸3min。结果:23株沙门氏菌被分成6个血清型,DiversiLab分型能将相同血清型的菌株分为不同的亚型。同一企业来源的菌株具有同源性。结论:DiversiLab分型系统是一种快速、易于操作、高重复性、高分辨率的基因分型方法,可作为食源性疾病同源性分型工具。结论:DiversiLab分型的分辨率高于血清型,2种分型方法密切相关。 相似文献
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目的:研究从同一类食品中分离出的单增李斯特菌间的同源性关系,为预测预警保障食品安全和食源性疾病溯源提供科学依据和技术支持。方法:应用DiversiLab分型系统对2001-2010年福建出入境检验检疫局从各类禽肉制品中分离出的25 株单增李斯特菌进行分型,其中包括:DNA提取、重复序列-聚合酶链式反应(repetitivesequence-based polymerase chain reaction,rep-PCR)、微电泳芯片分离检测及数据分析。结果:DiversiLab分型中,相似系数为95%时,25 株菌被分为了6 组(G);相似系数为97%时,25 株菌被分为11 组(P)。结论:DiversiLab分型结果较准确地揭示了25 株菌株间的亲缘性关系。基于rep-PCR的DiversiLab分型系统,是一种操作简单、分辨率高、重复性好且高效快速的基因分型方法,可作为食源性病原体检测及食源性疾病溯源的工具。 相似文献
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