不同时间序列COVID-19基因表达与基因调控网络构建

目的 探讨新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疾病进展相关的潜在调控因素。方法 从GEO数据库中获得COVID-19的24个全血转录组样本。使用R包“DSEeq2”识别差异表达的mRNA和LncRNA。利用R包“MaSigPro”和短时间序列表达软件(STEM)识别mRNA和lncRNA的时间表达模式。共表达分析用于发现mRNA-LncRNA的共表达模式。利用TRRUST数据库获取转录因子(TFs)。miRcode、TargetScan、miRTarBase和miRDB构建ceRNA调控网络。利用R包“CIBERSORT”表征免疫细胞浸润情况。结果 与健康对照组相比,COVID-19患者在3个伪时间内有3 639个差异的mRNA和304个差异的LncRNA。主要功能富集在细胞分裂进展、细胞对干扰素-γ、干扰素-α的反应。CIBERSOR分析显示,CD₄⁺、CD₈⁺和浆细胞在COVID-19发病轨迹中发挥重要作用。随着疾病的进展,识别了1 750个具有显著差异表达的mRNA和31个lncRNA。在ce...     

KRAS突变对人肺腺癌转录组影响的生物信息学分析

目的 鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌是临床常见肺癌亚型,发病机制不清,预后不良。推测可能与KRAS突变对整个基因组的影响有关。本研究通过对KRAS突变型肺腺癌的转录组分析,探讨其预后不良和耐药的组学机制。为研究KRAS突变型肺腺癌的发病机制和临床治疗提供指导。方法 从公共基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）中下载KRAS突变型肺腺癌的转录组数据库,首先利用R语言Impute程序包进行数据标准化,然后利用Limma程序包筛选差异基因,最后利用Robust rank aggregation算法筛选显著性基因。为进一步研究其表观调控机制,我们利用R语言Clusterprofile程序包和STRING数据库分别进行了KEGG pathway分析和蛋白质互作网络分析。结果 KRAS突变对全转录组影响复杂,包括改变细胞周期促进肿瘤细胞异常增殖;影响白细胞介素-17信号通路促炎反应导致免疫耐受,促进肿瘤生长;影响细胞色素P450信号通路导致耐药。结论 KRAS突变能够引起整个基因组发生异常变化,并与促进肿瘤生长、抑制抗肿瘤免疫以及耐药相关基因的表达密切相关。     

我国省（市）属医科院校投入与产出效率分析研究

目的：分析我国省属医科院校的投入与产出效率,促进医科院校管理的规范化、科学化。方法：通过采用数据包络分析方法（DEA）,以我国24所省属医科类院校为研究对象,利用医科类院校的经费、人员投入等投入和产出数据,对2017年省属医科类院校的技术效率、纯技术效率、规模效率分别进行分析。结果：2017年省属医科院校的技术效率与院校所处地域相关性不大,样本院校中三分之二的院校的纯技术效率、规模效率高于平均值,存在投入冗余量的院校占到所选院校的一半。结论：样本院校中效率结果不理想的院校应该大力推进现代大学治理体系建设,并根据科研效率的具体情况采取不同的措施进行改进。     

大学生信息素养指标体系构建研究

以雾霾与健康相关知识为例,构建大学生健康信息素养评价指标体系,通过问卷调查了解大学生健康信息素养水平现状,采用相关性和线性回归分析法探测其主要影响因素,据此对提高大学生健康信息素养水平提出有针对性的策略和建议。     

国内卫生信息管理教材建设现状及思考

基于CNKI中194篇相关领域文献的摘要信息,分析21世纪以来我国卫生信息管理教材建设的总体发展趋势、主要分支领域、成熟研究主题,揭示目前其存在的问题,提出现阶段教材建设的基本方向和思路。     

山西省医学高等教育文献保障体系的建设与研究

 

从国家对高等教育文献保障体系的建设背景入手，阐述了山西医科大学图书馆充分利

用该馆丰富的文献资源，建设山西省医学高等教育文献信息保障体系的可行性

与必要性以及该保障体系的具体建设内容，指出建设该保障体系对全省医学教学、科研及

医疗工作的开展所起到的积极作用。

     

医学高校图书馆藏书效益评价

藏书效益是反映和评价图书馆藏书实效的一套评价指标,它反映藏书投入在各要素之间分配状况的合理性以及运行状况和功能发挥状况的合理性,用资源匹配适宜度来表示,包含结构效益和权变效益2大类指标。通过对这2大指标及其效益评价模型的构建和分析,试图建立一个更加合理、可行性强、实用性强的图书馆藏书效益评价指标。     

研究生医学信息检索教学体系的创新与实践

医学信息检索教学是培养研究生的情报意识，使他们掌握获取最新文献信息的渠道和方法的重要手段。现从教学内容、实习环节、考核方法等方面阐述山西医科大学在研究生医学信息检索教学中的方法和体会，并且对本教学体系的创新性、先进性、科学性、合理性及实践意义进行论述。     

我国健康医疗大数据政策文献的多维分析

背景　近年来,我国颁布了一系列健康医疗大数据政策,目前有关健康医疗大数据政策的分析多为定性研究,缺乏定量研究。目的　多维度分析我国国家层面健康医疗大数据政策文献,从整体上把握我国健康医疗大数据政策的基本特征与政策目标,以期为我国健康医疗大数据政策制定和完善提供新思路和切实参考。方法　文章使用Python自编程序抓取国家卫生健康委员会官方网站中的政策文本,以179篇健康医疗大数据相关政策为研究对象,检索截止日期为2017-12-31。运用统计分析方法从政策年度、政策类型和政策主体3个维度分析我国健康医疗大数据政策文献的外部特征。运用VOSviewer对表征政策文本内容特征的关键词进行聚类分析,并以Pajek对其进行可视化分析。结果　从外部特征来看,我国国家层面健康医疗大数据政策的发展经历了萌芽期,已进入快速发展期;“函”“意见”和 “通知”等效率优先的政策形式较多,分别占34.1%（61/179）、17.9%（32/179）、16.2%（29/179）;国家卫生健康委员会在单独发文的143篇政策文献中发文最多,占69.9%（100/143）,在联合发文中与其他机构的合作关系最多,占机构间所有合作关系数的16.3%（28/172）,政策主体之间的合作比较广泛,政策的制定涉及政府、产业和研究各个方面。从内部主题来看,相关政策聚焦健康医疗大数据建设、应用、服务和人工智能辅助诊疗4个方面。结论　从外部特征来看,我国健康医疗大数据政策目前比较注重政策的推进和普及。国家卫生健康委员会是政策制定的主要力量。从内部主题来看,我国健康医疗大数据的建设尚处于起步阶段,健康医疗大数据可以应用于疾病、医药和养老等各个领域,以此来发展远程医疗、分级诊疗以及社区医疗,从而推进便民惠民工程。相关政策内容强调基于大数据的智能医疗技术的规范化,涉及内容广泛。     

国内新型冠状病毒肺炎的研究热点和趋势分析

目的：分析国内新冠肺炎的研究热与趋势。方法：运用VOSviewer和CiteSpace对从中国知网上获取的315篇文献中的研究热点与趋势进行共词聚类和研究趋势分析。结果：新冠肺炎的研究主题聚焦于中西医治疗、公共防控、医院管理,以及诊疗和流行趋势预测4方面,新冠肺炎的关注热点包括对其的认识、防护、诊断和治疗。结论：建议重点攻克新冠肺炎的有效治疗方案、加强我国的公共卫生体系建设和提高传染病的防治工作、重视中西医结合事业的发展和深化新冠肺炎的研究。