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1.
目的研究干血斑(DBS)样本用于人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染前病毒DNA基因诊断的可行性。方法采集59例静脉吸毒HIV-1感染者和22名HIV-1阴性健康人EDTA抗凝静脉全血5ml,保存全血1ml,另用50μl制备干血斑样本后,分离血浆。QIAamp Blood Mini试剂盒和10%Chelex 100树脂分别提取全血和干血斑中细胞DNA。Roche Cobas Amplicor逆转录聚合酶链反应检测HIV-1感染者血浆病毒载量。HIV-1Env基因Gp41区,gag基因,pol基因分别用2对外侧和内侧引物,按照套式PCR方法,进行扩增。以HIV-1任何两个基因区扩增结果组合判断HIV-1感染。结果在重复2~3次的前提下,59份DBS样本HIV-1感染基因诊断敏感度93%(95%可信区间89%~97%),34份全血样本94%(95%可信区间89%~98%)。疋。检验显示,两种样本用于HIV-1基因诊断时差异无统计学意义。22份两种阴性样本特异性均为100%(95%可信区间95.93%~100%)。8份血浆病毒载量(VL)〉4.0 Log的DBS样本用于基因诊断的可重复性和HIV-1感染样本检出率优于5份VL〈4.0 Log样本。18对全血和DBS样本HIV-1基因诊断一致性分析,符合率94%,一份DBS样本HIV-1特异三个基因片段均未扩增。结论干血斑样本易采集,便于运输,保存条件低,费用低廉,用于HIV-1基因诊断时与全血样本检测结果无显著性差异,病毒载量〈4.0 Log的样本,为增加检出概率需要对样本重复检测。DBS样本HIV-1基因诊断方法适合于无条件立即处理血样本的偏远地区或采样困难的感染者的诊断,及HIV-1母婴垂直传播研究中婴幼儿感染的早期诊断。 相似文献
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乙型肝炎病毒DNA聚合酶逆转录酶蛋白反式调节基因1的克隆化研究 总被引:5,自引:0,他引:5
目的 应用抑制性消减杂交 (SSH)技术及生物信息学 (bioinformatics)技术筛选并克隆乙型肝炎病毒 (HBV)DNA聚合酶(DNAPolymerase)逆转录酶 (RT)区蛋白的反式调节新型靶基因 ,进一步阐明HBV感染相关疾病的发病机制。方法 以HBVDNA聚合酶RT基因的表达质粒pcDNA3 1( -) RT转染HepG2细胞 ,以空载体pcDNA3 1( -)为平行对照 ,提取mRNA并进行SSH分析。并应用分子生物学技术 ,结合生物信息学技术 ,克隆RT反式调节作用的新的靶基因。结果 对于所获基因片段序列分析表明 ,其中之一为新型基因片段。从HepG2细胞提取总RNA ,以逆转录多聚酶链反应 (RT PCR)技术扩增获得该新基因的全长序列 ,并测序证实 ,因其可以被HBVDNA聚合酶逆转录酶RT反式激活 ,故命名为DNA多聚酶反式激活蛋白 1(DNAPTP1) ,已在GenBank中注册 ,注册号 :AY45 0 3 89。DNAPTP1基因的编码序列全长为 43 5个核苷酸 (nt) ,编码产物由 14 4个氨基酸残基 (aa)组成。结论 HBVDNA聚合酶逆转录酶RT在HBV进入宿主细胞的过程中起着重要的作用 ,最近的研究表明RT蛋白还具有反式激活的作用 ,上调宿主细胞某些基因的表达 ,从而改变宿主正常的免疫应答水平 ,引起病变。逆转录酶RT反式激活新靶基因的发现 ,为进一步研究RT蛋白的分子生物学机制和探索新型治疗 相似文献
6.
辛伐他汀诱导肺成纤维细胞凋亡的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
成纤维细胞过度增殖并产生过量细胞外基质可导致多种肺部疾病 ,如特发性肺间质纤维化、气道重建[1 ] ,目前对此类疾病尚缺乏有效治疗方法 ,羟甲基戊二酸单酰辅酶 A(HMG CoA)还原酶抑制剂辛伐他汀是目前广泛应用于临床的降脂类药物。近年来 ,很多研究证实 ,HMG CoA还原酶抑制剂具有诱导多种细胞凋亡的作用[2 ,3] 。本实验在体外研究辛伐他汀对肺成纤维细胞凋亡的诱导作用。材料与方法 (1 )肺成纤维细胞的原代培养 :取肺组织约 1cm3,剪成碎块 ,加入 0 2 5 %的胰蛋白酶 ,37℃消化30min ,1 0 0目钢丝网过滤 ,离心混悬液 ,… 相似文献
7.
乙型肝炎病毒对c-fos基因表达调节的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
0 引言癌基因(oncogene)是一类编码关键性调控蛋白的正常细胞基因,在正常情况下,不表达或只有有限表达,又称原癌基因(proto-oncogene).当受到理化等因素刺激时,他们可以异常表达,导致细胞的增生、分化或癌变. 众所周知,乙型肝炎病毒(HBV)不仅可引起急慢性病毒性肝炎,而且与肝纤维化和肝细胞癌(HCC)的发生及发展密切相关.许多实验已证实肝细胞癌变过程涉及多种原癌基因的激活和突变,其中HBV对原癌基因c-fos 的激活及表达调节也越来越受到关注.通过对HBV与c-fos之间表达调节的阐述,有助于进一步了解HBV导致HCC的分子学机制. 相似文献
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9.
10.
目的 通过抑制性消减杂交(SSH)技术构建丙型肝炎病毒(HCV)NS5A反式激活蛋白5(NS5ATP5)的反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库,筛选HCV NS5ATP5蛋白反式激活靶基因。方法 以HCV NSSATP5表达质粒pcDNA3.1(-)-NSSATP5转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,从中提取mRNA并合成cDNA,经RsaⅠ酶切后将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR后进行测序及同源性分析。结果 成功构建人HCV NSSATP5蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库。文库扩增后得到91个白色克隆,进行菌落PCR分析,其中86个均得到100~1000bp插入片段。挑取32个插入片段测序分析。其中包括结缔组织生长因子、纤维连接蛋白、胰岛素样生长因子结合蛋白1等重要的基因。结论 成功筛选出HCV NS5ATP5的上调基因。 相似文献