含双叔丁基苯基杂环化合物的三维定量构效关系研究

目的建立两环系环氧合酶-2抑制剂的三维定量构效关系,设计新型环氧合酶-2抑制剂。方法和结果通过与选定的模板(III-1)进行叠合,利用比较分子力场分析方法建立20个选择性环氧合酶-2抑制剂的三维定量构效关系。该模型的交叉验证系数R_CV²=0.718;传统相关系数R²=0.992,F=260.624,标准偏差S=0.072。结论所得的模型解释了已有的构效关系,并对同类化合物的预测能力较好,系数等势图影射的受体性质可指导新的抑制剂的设计。     

选择性环氧合酶-2抑制剂的三维定量构效研究

目的：建立环氧合酶-2选择性抑制剂的三维构效关系,设计新型的环氧合酶-2抑制剂。方法和结果：通过44个抑制剂与环氧合酶-2的对接确定分子的叠合模式,利用比较分子力场分析方法建立了44个选择性环氧合酶-2抑制剂的三维定量构效模型。模型的交叉验证系数R_CV²=0.709,传统相关系数R_CV²＝0.911,F_5,38＝75.66,标准偏差SE＝0.242。结论：利用DOCK和CoMFA相结合的方法提供了分子设计的新途径。     

1-咪唑基苯并二氮杂类法呢基蛋白转移酶抑制剂的三维定量构效关系研究

目的建立法呢基蛋白转移酶抑制剂的三维定量构效关系,设计高效法呢基蛋白转移酶抑制剂.方法和结果利用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了32个法呢基蛋白转移酶抑制剂的三维定量构效关系,模型的交叉验证相关系数R²_CV=0.602,非交叉验证相关系数R²=0.958,标准偏差SE=0.270,F=124.5.结论此模型对设计和预测高活性结构类型的化合物有一定的可靠性.     

噻唑烷二酮和芳酮酸类PPARγ激动剂三维定量构效关系研究

目的建立PPARγ激动剂-噻唑烷二酮和芳酮酸类化合物的三维定量构效关系,为设计高活性PPARγ激动剂提供结构信息。方法与结果用比较分子力场分析方法得到噻唑烷二酮和芳酮酸类化合物CoMFA模型,其交叉验证相关系数R²=0.656,非交叉验证相关系数R²=0.982,F_10,37=201.1,绝对误差SE=0.115。结论从CoMFA系数等势图中揭示芳酮酸类化合物较噻唑烷二酮类化合物活性更高的原因,提示芳酮酸类化合物与PPARγ结合时形成了不同于BRL-PPARγ复合物晶体的结合腔。     

阿片类药物透过血脑屏障的三维构效研究

目的:建立药物透过血脑屏障的三维构效模型,为药物分子设计提供理论依据。方法与结果:利用比较分子力场分析方法建立了阿片类药物透过血脑屏障的三维定量构效模型,该模型有较高的预测能力,交叉验证系数r²_cv=0.718,相关系数r²=0.978,F₃,7=67.902,标准偏差SE=0.209。结论:根据CoMFA模型系数等势图,解释了该类药物透过血脑屏障的构效关系。     

糖蛋白IIb/IIIa受体拮抗剂三维构效关系研究

目的：研究三维构效关系,建立药效模型,为设计新型糖蛋白IIb/IIIa受体拮抗剂提供指导。方法和结果：利用比较分子力场方法,建立了IIb/IIIa受体拮抗剂的三维定量构效模型。在比较分子力场分析中,利用拮抗剂晶体结构为模板,进行了多种分子叠合形式研究,建立了具有良好预测能力的三维定量构效关系模型,表征模型预测能力的交叉验证系数R_CV²＝0.834,传统相关系数R²＝0.988,F＝323.63,标准偏差SE（Standard Error of Estimate）＝0.135。结论：所得模型解释了已有的构效关系,系数等势图映射的受体性质与实验结果相一致,可以指导新的拮抗剂设计。     

NMDA受体甘氨酸位点拮抗剂的三维构效关系研究

目的　建立NMDA受体甘氨酸位点拮抗剂的三维构效关系(3D-QSAR)模型。方法和结果　使用比较分子场分析法(CoMFA)建立的3D-QSAR模型,交叉验证回归系数R²cv、非交叉验证回归系数R²和标准偏差SEE分别为0.650,0.940和0.330,说明系列化合物分子周围立体场和静电场的分布与生物活性间存在良好的相关性。结论　所得模型较好的模拟了受体结合腔穴的立体和静电性质,可用于综合解释已报道的甘氨酸位点拮抗剂构效关系研究结果,并对文献中较少或较模糊的一些区域作了新的探讨,可用来指导设计新的先导物分子。     

噻嗪类11β-羟类固醇脱氢酶抑制药三维定量构效关系研究

摘 要 目的：通过构建噻嗪类11β-羟类固醇脱氢酶（11β-HSD）抑制药的三维定量构效关系(3D QSAR)模型,用于其结构改造及发现具有更高生物活性的11β-HSD抑制药。方法: 基于骨架叠合的模式,采用比较分子力场分析（CoMFA）的方法,构建噻嗪类衍生物定量构效关系模型,并用分子对接的方法对已构建的3D QSAR模型进行验证。结果: 得到了高精度的11β-HSD抑制药的3D-QSAR模型（CoMFA:q²=0.346,r²=0.850;其中q²为交叉验证系数,r²为非交叉验证系数）。结论:本文构建的3D QSAR模型可为11β-HSD抑制药骨架各个位点的化学修饰,实施定向合理设计,为开发新型抗2型糖尿病药物提供理论基础。     

药物透过血脑屏障的3D-QSPR:H2受体拮抗剂的CoMFA和EVA分析

目的：药物透过血脑屏障是药代动力学的重要过程,H₂受体拮抗剂是作用于神经外周的抗溃疡药物,为避免该类药物透过血脑屏障损伤中枢神经,产生毒副作用,指导该类药物的设计与合成。方法和结果：选择了不依赖于实验参数的比较分子力场分析(CoMFA)方法和最近发展的本征值(EVA)方法,建立了有关的三维药代动力学性质(3D-QSPR)模型。CoMFA模型的统计参数为：交叉验证系数r²_cv=0.625,相关系数r2=0.893,F_3,17=47.270,标准偏差SE=0.254;EVA模型的统计参数为：交叉验证系数r²_cv=0.697,相关系数r²=0.922,F_3,17=67.766,标准偏差SE=0.203。结论：两种方法都能建立三维定量构效模型,EVA模型有更高的预测能力。     

P45017α抑制剂──17位取代甾体化合物的三维定量构效关系

目的　建立P450_17α的17位取代甾体抑制剂的三维定量构效关系,为设计新的、更有效的抑制剂提供理论依据。方法和结果　利用比较分子力场方法,建立了P450_17α抑制剂的三维定量构效关系模型。交叉验证回归系数R2CV、非交叉验证回归系数R2 和标准偏差SEE分别为0.538,0.799和0.257。说明该系列化合物分子周围立体场和静电场的分布与生物活性间有良好的相关性。用该模型对本室合成的3个化合物进行活性预测,结果与实测值相符。结论　所得模型支持了假设的抑制剂作用机理和作用模型。所得CoMFA模型有一定的预测能力,可用来指导设计新的P450_17α抑制剂     

1-咪唑基苯并二氮杂类法呢基蛋白转移酶抑制剂的三维定量构效关系研究

目的　建立法呢基蛋白转移酶抑制剂的三维定量构效关系 ,设计高效法呢基蛋白转移酶抑制剂。方法和结果　利用比较分子力场分析方法 (CoMFA)建立了 3 2个法呢基蛋白转移酶抑制剂的三维定量构效关系 ,模型的交叉验证相关系数R2 CV=0 60 2 ,非交叉验证相关系数R2 =0 95 8,标准偏差SE =0 2 70 ,F =12 4 5。结论　此模型对设计和预测高活性结构类型的化合物有一定的可靠性     

选择性5-羟色胺再摄取抑制剂3-苯基-1-茚胺类似物雕三维定量构效关系研究

目的建立可以提示高活性的选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRIs）3-苯基-1-茚胺类化合物分子结构信息的三维定量构效关系模型，研究结构与活性间的关系，为进一步提高药物的选择性、指导新化合物的设计提供理论依据。方法通过确定34个茚胺类化合物分子的药效构象，与模板分子进行分子叠加，利用比较分子力场分析方法（CoMFA），建立了一个选择性SSRIs的三维定量构效模型。结果该模型的交叉验证相关系数R^2 CV=0．660，非交叉验证相关系数R^2=0．976，标准偏差SEE=0．196，F=181．916。用此模型预测了4个SSRIs的活性，结果与试验值相符。结论该模型解释了已有的构效关系，且有较高的预测能力，系数等势图映射的受体结合部位的性质对进一步提高该类药物活性的设计具有一定的指导意义。     

3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的三维定量构效关系研究

目的 建立3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.方法 采用分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)来研究3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的构效关系.结果 建立了合理、可靠的3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂CoMFA(q2=0.630,r2 =0.994,rpred2=0.909)和CoMSIA(q2=0.676,r2=0.972,rpred2 =0.574)模型.结论 构建的3D-QSAR模型揭示了3-羧基香豆素类化合物的结构和生物活性间的关系,可为该类乳酸转运抑制剂的进一步优化设计提供科学依据.     

芳构酶抑制剂7α-取代雄甾二酮三维定量构效关系的研究

目的 建立7α-取代雄甾二酮芳构酶抑制剂的三维定量构效模型，为设计高效芳构酶抑制提供理论依据。方法 利用比较分子力场分析方法，建立了30个7α-取代雄甾二酮芳构酶抑制剂的三维定量构效模型。结果 该模型的交叉验证相关系数Rcv^2＝0．721，非交叉验证相关系数只R^2＝0．994，标准偏差SE＝0．062，F＝170．787。用此模型预测了4个芳构酶抑制剂的活性，结果与实验值相符。结论 该模型有较高的预测能力，可为甾体芳构酶抑制剂的结构优化提供理论指导。     

3D QSAR studies on cinnamaldehyde analogues as farnesyl protein transferase inhibitors

Three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) studies on 59 cinnamaldehyde analogues as Farnesyl Protein Transferase (FPTase) inhibitors were investigated using comparative molecular field analysis (CoMFA) with the PLS region-focusing method. Forty-nine training set inhibitors were used for CoMFA with two different grid spacings, 2A and 1A. Ten compounds, which were not used in model generation, were used to validate the CoMFA models. After the PLS analysis, the best predictive CoMFA model showed that the cross-validated value (r2cv) and the non-cross validated conventional value (r2ncv) are 0.557 and 0.950, respectively. From the CoMFA contour maps, the steric and electrostatic properties of cinnamaldehyde analogues can be identified and verified.     

吡咯烷类基质金属蛋白酶-2抑制剂的比较分子力场分析

目的通过CoMFA方法来获得吡咯烷类基质金属蛋白酶-2(MMP-2)抑制剂的三维定量构效关系.方法应用FlexX对接方法与构象系统搜索程序来确定MMP-2抑制剂的可能活性构象,并以此活性构象为模板构建28个小分子化合物的三维结构,最后运用CoMFA方法对MMP-2进行定量构效关系研究.结果 CoMFA方法建立了定量构效关系模型,交叉验证系数q2=0.803,回归系数r2=0.989,F=293.663,SEE＝0.076.结论该模型具有可靠性和可预测性,该模型的建立为吡咯烷类基质金属蛋白酶抑制剂的结构优化提供了理论支持.     

川芎嗪酯类衍生物的3D-QSAR研究

目的建立预测模型,进行合理的药物设计和修饰。方法应用构象系统搜索程序确定23个2-取代酰氧甲基-3,5,6-三甲基吡嗪衍生物的可能活性构象,并以此活性构象为模板构建了这23个小分子化合物的三维结构,采用CoMFA及CoMSIA法对衍生物进行系统的三维定量构效关系分析。结果与结论CoMFA模型交叉验证系数q2=0.694,回归系数R2=0.994,SEE=0.023,F=376.924。CoMSIA模型交叉验证系数q2=0.657,回归系数R2=0.987,SEE=0.034,F=166.815。两种方法得到的构效关系模型都具有较好的预测能力。通过分析分子场等值面图在空间的分布,可以观察到叠合分子周围分子场特征对化合物活性的影响,为该类化合物进一步结构优化提供了有价值的参考。     

缬草醇衍生物定量构效关系模型的构建及其在镇静活性筛选中的应用

目的建立2种缬草醇型倍半萜镇静活性与其结构定量构效关系的模型,试图对从北缬草中分离得到的多种缬草醇型倍半萜的镇静活性进行预测。方法采用比较分子力场方法建立两种模型分子(CoMFA Model 1及CoMFA Mode 2)研究缬草醇型倍半萜的三维定量构效关系。结果根据建立的三维定量构效关系模型预测了由北缬草中分离出来的6个愈创木烷单体化合物的镇静活性,该结果与体内实验的实测结果有较好的一致性。结论建立的CoMFA Mode1 1及CoMFAMode1 2具有较好的预测能力,具有一定的可信度。