基于TCGA数据库应用生物信息学方法分析和挖掘肺腺癌预后和诊断miRNA研究

目的基于TCGA数据库,应用生物信息学方法分析和挖掘肺腺癌预后和诊断miRNA生物学标志物。方法数据下载:从TCGA下载获取肺腺癌miRNA表达谱数据,包括miRNAseq和临床数据。筛选差异表达miRNAs:应用R-version 3.6.2软件中的edgeR包筛选肺腺癌组织和正常肺组织的差异基因,以│logFC│>2,P<0.05为筛选条件。筛选与预后相关miRNAs:应用R-version 3.6.2软件中的survival包绘制KM生存曲线,筛选与预后相关的miRNAs。筛选可作为肺腺癌诊断的miRNAs:应用R-version 3.6.2软件中的pROC包制作受试者工作特征曲线(ROC)评价与预后相关miRNAs诊断肺腺癌的特异性和敏感性。结果共识别到肺腺癌与正常肺组织差异表达的miRNA 144个,其中上调表达119个,下调表达25个。通过K-M生存曲线筛选出与预后显著相关(P<0.05)的miRNA共13个,分别为hsa-miR-139-3p、hsa-miR-328-3p、hsa-let-7g-3p、hsa-miR-142-3p、hsa-miR-147b、hsa-miR-31-5p、hsa-miR-548v、hsa-miR-188-3p、hsa-miR-31-3p、hsa-miR-490-3p、hsa-miR-4664-3p、hsa-miR-1293、hsa-miR-615-3p,其中hsa-miR-147b、hsa-miR-4664-3p、hsa-miR-1293、hsa-miR-615-3p与预后呈负相关,其他呈正相关。应用ROC评价上述与预后相关miRNAs诊断肺腺癌的特异性和敏感性,其中hsa-miR-147b、hsa-miR-142-3p、hsa-let-7g-3p、hsa-miR-139-3p 4个miRNA的AUC曲线>0.9,分别为0.904、0.927、0.945、0.965,提示具有较高诊断价值及准确性。结论 hsa-miR-147b、hsa-miR-142-3p、hsalet-7g-3p、hsa-miR-139-3p可作为肺腺癌预后评估和诊断miRNA的生物学标志物,具有重要的临床价值。     

芯片技术分析卵巢子宫内膜异位症外泌体microRNA表达差异

目的：探讨卵巢子宫内膜异位症（ovarian endometriosis,OEM）外泌体微小RNA（microRNA,miRNA）的表达谱。方法：采用芯片技术对3例OEM患者及3例健康对照者的在位内膜间质细胞外泌体miRNA进行分析,筛选出组间差异miRNA。结果：获得存在差异表达miRNA共12条,其中hsa-miR-6829-5p、hsa-miR-5188、hsa-miR-4430、hsa-miR-584-5p、hsa-miR-4485-5p、hsa-miR-4257在实验组表达上调,hsa-miR-188-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-4516、hsa-miR-1229-5p、hsa-miR-7150、hsa-miR-5787表达下调。对表达差异较大的外泌体miRNA进行靶基因预测及其基因功能（gene ontology,GO）分析和信号通路（pathway）分析,发现靶基因聚集的生物学功能多数参与生物进展过程的调控。结论：OEM患者与健康对照者的在位内膜间质细胞外泌体miRNA存在着差异性表达。差异性表达的miRNA特异性很高,对进一步阐明该疾病的发病机制和寻找新的诊断标记物具有重要意义。     

microRNA标志物在早期诊断室间隔缺损中的价值*

目的 评价血浆microRNA（miRNA）在室间隔缺损（VSD）早期诊断中的临床应用价值以及作为VSD分子诊断标志物的可行性,并建立临床早期诊断模型。方法 采用以济南市儿童医院、泰安市妇幼保健院为基础的病例-对照研究方法开展本次研究。研究分为VSD组85例和对照组80例,分3个阶段进行检测：首先选取VSD组及其匹配对照组各3例,应用miRNA全基因组表达谱芯片进行初筛;然后扩大样本量（20例VSD组vs 15例对照组）,对选定的8个有差异的miRNA采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）进行芯片结果的验证;最后进一步扩大样本（62例VSD组vs 62例对照组）进行qRT-PCR检测,筛选先天性心血管病早期诊断的生物标志物,建立多指标的Logistic回归模型,并应用MedCalc软件进行受试者工作特征（ROC）曲线分析评价诊断模型的价值。结果 芯片杂交初筛结果显示,与对照组比较,有36个表达有差异的miRNA（P?<0.05）,两阶段大样本qRT-PCR验证,检测到5种血浆miRNA（let-7e-5p、miR-155-5p、miR-222-3p、miR-433-3p和miR-487b-5p）在VSD中的表达差异有统计学意义（P?<0.05）,可以选择作为具有VSD早期诊断意义的生物标志物。5种血浆miRNA的ROC曲线下面积（AUC）分别在0.678～0.832,其中miR-222-3p的ROC曲线下面积最大为0.832。建立多指标Logistic回归分析模型,5种血浆miRNAs联合模型可提高VSD的诊断效率,ROC曲线下面积达到0.955,敏感性和特异性分别为83.87%和95.16%;3种血浆miRNA（let-7e-5p、miR-155-5p、miR-222-3p）联合诊断模型,ROC曲线下面积达到0.910,敏感性和特异性分别为82.30%和90.30%,接近5个miRNA的诊断效率。结论 5种血浆miRNA作为VSD早期诊断标志物,具有一定的可信性。将其整合后可建立起多指标的联合诊断模型。联合3种血浆miRNA构建诊断模型可提高VSD的诊断效率,临床应用价值更大。     

基于生物信息学的乳腺癌miRNA生物标志物的筛选

目的 筛选与乳腺癌相关的miRNA生物标志物,为乳腺癌的早期诊断、预后评估以及药物靶点的研究提供参考.方法 从TCGA数据库中收集乳腺癌相关基因芯片数据,将肿瘤组织与正常组织样本数据进行对比分析,筛选差异miRNA与mRNA;预测差异miRNA的潜在靶基因并与差异mRNA取交集,进一步对miRNA进行筛选;采用ROC曲线分析对筛选得到的miRNA进行评价.结果 筛选得到9个差异miRNA,对肿瘤样本和正常样本分类良好.分别为6个上调miRNA:hsa-miR-141、hsa-miR-182、hsa-miR-183、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-21;3个下调miRNA:hsa-let-7c、hsa-miR-125b-1、hsa-miR-145.结论 筛选得到的差异miRNA可作为乳腺癌的生物标志物,可对乳腺癌的发生进行预测.     

靶向维生素D受体的miRNA的筛选及其对继发性甲状旁腺功能亢进患者甲状旁腺激素分泌的影响

目的 探讨靶向维生素D受体（VDR）基因的miRNA及其对继发性甲状旁腺功能亢进甲状旁腺激素（PTH）分泌的影响。方法 用胶原酶消化法提取、分离和培养出继发性甲状旁腺功能亢进的甲状旁腺组织的原代细胞;运用生物信息学方法及全转录组测序的方法筛选得到靶向VDR的miRNA,双荧光素酶报告基因实验验证筛选出的miRNA与VDR的靶向关系;qRT-PCR及Western blotting检测过表达或抑制miRNA后的对VDR mRNA水平及蛋白水平和对PTH分泌的影响;qRT-PCR和免疫组织化学分别验证部分miRNA、VDR mRNA和蛋白水平的表达差异。结果 成功培养得到甲状旁腺原代细胞;筛选并验证了hsa-miR-149-5p、hsa-miR-221-5p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-29a-5p、hsa-miR-301a-5p、hsa-miR-873-5p、hsa-miR-93-3p均与VDR存在靶向关系;筛选并验证的7个miR中,过表达hsa-miR-149-5p、hsa-miR-301a-5p PTH分泌增加。hsa-miR-149-5p在继发性甲状旁腺功能亢进中高表达（P=0.046）,VDR mRNA（P=0.0267）和蛋白水平表达均下降。结论 hsa-miR-149-5p、hsa-miR-301a-5p可能通过下调VDR基因的表达促进继发性甲状旁腺功能亢进患者PTH的分泌。     

结肠癌血清microRNA 表达谱的检测及临床应用价值

目的 找寻潜在的新型的结肠癌血清microRNA（miRNA）表达谱,探讨其临床应用价值。方法miRNA 微阵列芯片技术检测结肠癌患者和正常人血清中miRNA 表达的差异,并对有差异表达的miRNA 在60 例结肠癌患者血清和60 例正常对照组血清中的表达进行实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）验证。结果①芯片杂交结果中共有87 种miRNAs 在结肠癌患者血清和正常人血清标本中有差异表达,其中上调表达有39 个,下调表达有48 个。② qRT-PCR 对miRNAs 进行验证,其中miR-31、miR-141、miR-224-3p、miR-576-5p 和miR-4669 这5 个miR 分子在结肠癌症患者中的表达相对于正常对照组差异具有统计学意义（P <0.05）。③ miR-31、miR-141、miR-224-3p、miR-576-5p 和miR-4669 这5 个miR 分子组成的miR- 表达谱诊断结肠癌的效率较高（ROC 曲线下面积为0.992）。结论 临床检测结肠癌患者miR-31、miR-141、miR-224-3p、miR-576-5p 和miR-4669 循环分子标志物表达谱有助于诊断结肠癌,有望成为结肠癌患者临床诊疗评估的重要指标。     

血浆microRNA分子联合检测在前列腺癌中的诊断价值

目的: 分析前列腺癌患者血浆microRNA（miRNA）分子的差异表达,探索血浆miRNA分子联合检测在前列腺癌中的诊断潜能。 方法：应用GEO公共数据库筛选前列腺癌患者血浆及血清差异性表达的miRNA;收集上海市宝山区中西医结合医院诊治的前列腺癌患者、慢性前列腺炎患者以及健康体检人群血浆样本,采用反转录荧光定量PCR对候选血浆miRNA表达水平进行验证;应用受试者工作特征模型分析候选miRNA分子以及联合miRNA对前列腺癌的诊断价值。 结果：通过生物信息学分析,获得26个前列腺癌相关的差异miRNA分子,经NCC-AUC模型进一步筛选, miR-21-5p、miR-5189-5p和miR-6780a-5p以综合评分最高进入临床样本验证阶段。结果显示,血浆miR-21-5p在健康对照组、慢性前列腺炎组、前列腺癌组中依次升高,三组之间具有统计学差异（P<0.05）。慢性前列腺炎组血浆miR-5189-5p水平显著低于前列腺癌组与健康对照组（P<0.001）。血浆miR-6780a-5p在前列腺癌组的表达水平显著高于慢性前列腺炎组和健康对照组（P<0.001）。ROC模型显示,血浆miR-21-5p及miR-6780a-5p均有较好的诊断潜能（P<0.001）,曲线下面积AUC分别为0.695和0.787,敏感度分别为95.6%和64.45%,特异度为41.5%和81.7%。联合使用miR-21-5p和miR-6780a-5p诊断,AUC为0.830,敏感度和特异度分别为82.2%和74.4%,可有效提高诊断效能。 结论：血浆miR-21-5p、miR-6780a-5p均有成为前列腺癌诊断标志物的潜能,两者联合显著提高前列腺癌诊断效能。     

七种微小RNA在良恶性肺结节鉴别诊断中的价值

目的 探讨良性肺结节与恶性肺结节[早期非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer, NSCLC）]患者外周循环血中7种微小RNA（miRNA）的表达差异及诊断价值。方法 使用RT-PCR检测270例早期NSCLS（其中腺癌200例,鳞癌70例）和327例良性肺结节外周循环血中7种miRNA（miR-15b-5p、miR-16-5p、miR-17-5p、miR-19a-3p、miR-20a-5p、miR-92a-3p、miR-146b-3p）的相对表达量,并对其进行统计学分析。结果 miR-16-5p、miR-17-5p、miR-19a-3p的表达量越低,NSCLS风险越大;miR-15b-5p、miR-146b-3p的表达量越高,NSCLS风险越大。miR-16-5p与miR-20a-5p的差值（即miR16-20）对NSCLS的诊断价值最高（曲线下面积0.71,灵敏度77.3%,特异性65.4%）;联合诊断能够提高诊断的灵敏度与特异性。结论 外周血中这7种miRNA在良恶性肺结节的诊断中有较高的灵敏度和特异度,可能成为辅助诊断早期NSCLS可靠的生物标记物。     

膀胱癌患者血清microRNA检测中内参基因的筛选及验证

目的筛选并验证适用于膀胱癌患者血清microRNA(miRNA)定量检测的内参基因。方法选取100例肌层浸润性膀胱癌患者、105例非肌层浸润性膀胱癌患者及139例健康对照者血清,通过Miseq测序筛选出表达较为稳定的miRNA,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测上述筛选出的miRNA及U6表达水平,利用geNorm及NormFinder软件对其稳定性进行分析,并在新的实验组中对软件所推荐内参基因及组合进行验证,选取miR-148b-3p作为靶分子,以进一步分析所选择内参基因的可靠性。结果采用qRT-PCR法对M iseq测序结果进行验证,筛选出hsa-miR-193a-5p、hsa-miR-16-5p、U6、hsa-miR-191-5p和hsa-let-7d-3p作为候选内参基因,经分析和验证后证实,hsa-miR-193a-5p作为内参基因最稳定,hsa-miR-193a-5p和hsa-miR-16-5p的组合为最佳内参组合。同时,miR-148b-3p在膀胱癌患者血清中明显上调并具有一定的诊断价值。结论在对膀胱癌血清miRNA检测时,hsa-miR-193a-5p为最稳定内参基因,hsa-miR-193a-5p和hsa-miR-16-5p为最佳组合,联合应用可使结果更为准确可靠。     

精神分裂症患者血清差异 microRNA 谱的检测

目的：目前精神分裂症的临床诊断缺乏统一的标准。文中研究精神分裂症患者血清中差异miRNA表达谱,为该病的临床诊断提供依据。方法采用FlashTag TM Biotin RNA芯片技术和SAM软件筛选精神分裂症患者与健康受试者血清中差异表达的miRNA,用实时荧光定量逆转录PCR（RT-PCR）进行验证。结果筛选出3个差异表达的miRNA,其中hsa-miR-1281上调,表达倍数变化为1．50881;hsa-miR-2861、hsa-miR-638下调,表达倍数变化分别为0．64193和0．51624。实时定量PCR结果证实,精神分裂症患者较健康受试者hsa-miR-2861与hsa-miR-638表达下调,分别为[（0．037±0．037） vs （3．159±2．761）,χ2＝4．089, P＜0．05]及[（0．006±0．006） vs （0．689±0．314）,χ2＝4．083, P＜0．05],hsa-miR-1281在精神分裂症患者组呈高表达[（1．221±0．041） vs （0．145±0．036）,χ2＝5．333,P＜0．05）。结论精神分裂症患者血清中存在差异表达的miRNA谱,miR-1281、miR-2861和miR-638可作为诊断精神分裂症的一个新的血清标志物。     

Bim蛋白在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的研究Bim蛋白在乳腺正常组织、乳腺普通导管增生组织、乳腺导管轻中度不典型增生组织、重度不典型增生及导管原位癌组织、乳腺浸润性导管癌组织中的表达及意义。方法应用免疫组织化学S-P法检测101例乳腺石蜡包埋组织中Bim蛋白的表达。结果在乳腺普通导管增生、轻中度不典型增生、重度不典型增生及导管原位癌和浸润性导管癌中,Bim蛋白表达阳性率呈递减趋势。Bim蛋白在乳腺普通导管增生与重度不典型增生及原位癌组间、重度不典型增生及原位癌和浸润性导管癌组间阳性表达率差异均具有统计学意义(P均<0.05)。乳腺浸润性导管癌中Bim蛋白的表达与患者的临床分期、腋窝淋巴结转移无明显关系,但与组织学分级有关(P<0.05)。结论Bim蛋白表达水平的改变可能与乳腺癌的发生发展有关。     

乳腺癌发生发展与肿瘤血管生成的相关性分析

目的 探讨血管内皮生长因子(VEGF)与乳腺癌发生发展及血管生成之间的相关性.方法 采用免疫组化染色法(SP法)分别检测88例乳腺浸润性导管癌、25例乳腺原位癌、15例乳腺不典型增生和100例乳腺良性病变患者术后标本中VEGF的表达水平及微血管密度(MVD)值.结果 乳腺良性病变、乳腺不典型增生、乳腺原位癌和乳腺癌标本中VEGF阳性率分别为22.0%(22/100)、33.3%(5/15)、56.0%(14/25)和70.5%(62/88),乳腺良性病变组最低,乳腺癌组最高,4组VEGF表达水平呈依次升高趋势(P=0.000);乳腺癌组中淋巴结转移阳性组VEGF表达水平高于未转移组(P=0.015),VEGF在Ⅱ b期+Ⅲ期组中表达水平高于Ⅰ期+Ⅱ a期组(P=0.006).C-erbB-2阳性组中VEGF表达水平高于阴性组(P=0.016),随着癌组织学分级的升高VEGF表达水平也呈逐渐升高趋势(P=0.017);乳腺良性病变、乳腺不典型增生、乳腺原位癌和乳腺癌标本中MVD值(个)分别为14±4、18±4、20±6和23±15,良性病变组中MVD值最低,乳腺癌组中MVD值最高,4组MVD值旱逐步升高趋势(P=0.000),其中在乳腺癌组中发现随着癌组织学分级的升高MVD值也呈现出逐渐增加趋势(P=0.006);在VEGF阳性组中MVD值高于VEGF阴性组(P=0.000),乳腺癌组中随着VEGF表达水平的升高MVD值也呈现出逐渐增加趋势(P=0.000).结论 VEGF在乳腺浸润性导管癌的肿瘤血管生成及转移过程中可能发挥重要的调控作用.VEGF和MVD值可作为反映乳腺癌生物学行为的指标之一.VEGF可能与乳腺痛的发生发展有关.以VEGF为靶点的抗血管生成治疗策略有望成为治疗C-erbB-2阳性患者的一条新的途径.     

乳腺导管浸润癌组织中促肝细胞再生磷酸酶蛋白的表达

目的:探讨乳腺导管浸润癌组织中促肝细胞再生磷酸酶(PRL-3)的表达及其与临床病理特征之间的关系.方法:采用免疫组化SP法检测60例乳腺浸润性导管癌、6例乳腺正常组织、15例轻中度和20例重度不典型增生组织中PRL-3的表达及其与乳腺浸润性导管痛临床病理特征之间的关系.结果:PRL-3蛋白在乳腺正常组织、乳腺导管轻中度不典型增生、重度不典型增生和乳腺导管浸润癌组织中的阳性表达率分别为0、46.7%、80.0%和95.0%,4组间比较,差异有统计学意义(P=0.008);组间两两比较,差异均有统计学意义(P＜0.01).乳腺浸润性导管癌中PRL-3蛋白与淋巴结转移和组织学分级有关(χ2=6.494,P=0.011和0.008).结论:PRL-3蛋白可能与乳腺浸润性导管癌的发生发展及转移有关.     

CD34和α-SMA在乳腺良恶性肿瘤间质中的表达与意义

目的 探讨CD34和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)在乳腺良恶性肿瘤间质中的表达情况及其意义.方法 收集2008年1月-2011年3月在新疆医科大学附属肿瘤医院住院行手术治疗并术后经病理科诊断为乳腺导管上皮普通型增生(50例)、乳腺导管上皮非典型增生(50例)、乳腺导管原位癌(50例)及乳腺浸润性导管癌(50例)标本.应用免疫组织化学PV-9000法检测乳腺间质细胞中CD34和α-SMA的表达.结果 CD34在乳腺导管上皮普通型增生、乳腺导管上皮非典型增生、乳腺导管原位癌及乳腺浸润性导管癌间质中的表达率分别为84%、78%、48%及32%,差异有统计学意义(χ2=40.430,P=0.000),乳腺浸润性导管癌CD34阳性表达率低于乳腺导管上皮普通型增生、乳腺上皮非典型增生及乳腺导管原位癌.α-SMA在乳腺导管上皮普通型增生、乳腺导管上皮非典型增生、乳腺导管原位癌及乳腺浸润性导管癌间质中的表达率分别为28%、46%、62%及86%,差异有统计学意义(χ2=56.772,P=0.000),乳腺浸润性导管癌α-SMA阳性表达率高于乳腺导管上皮普通型增生、乳腺上皮非典型增生及乳腺导管原位癌.结论 富含α-SMA阳性表达而缺少CD34阳性表达的乳腺间质细胞更加有利于肿瘤的发生.     

血管内皮生长因子在不同乳腺组织中的表达及其意义

目的 观察乳腺良性病变、不典型增生及原位癌中血管内皮生长因子(VEGF)的表达水平及肿瘤微血管密度(MVD)值的变化与临床病理学特征之问的相关性.方法 采用免疫组化染色法(SP法)分别检测100例乳腺良性病变(包括乳腺纤维瘤35例、乳腺囊性增生35例和乳腺导管内乳头状瘤30例)、15例乳腺不典型增生和25例乳腺原位癌患者术后标本中VEGF的表达水平及MVD值.结果 乳腺良性病变、乳腺不典型增生和乳腺原位癌标本中VEGF阳性率分别为22%、33%和56%,乳腺良性病变组最低,原位癌组最高,3组VEGF表达水平呈依次升高趋势(P＜0.05);3组中MVD值分别为14.3±3.5、18.5±3.6和20.1±6.1,良性病变组MVD值最低,原位癌组MVD值最高,3组MVD值呈依次升高趋势(P＜0.05);在VEGF阳性组中MVD值高于VEGF阴性组(P＜0.05).结论 VEGF在乳腺肿瘤血管生成过程中可能发挥重要的调控作用.VEGF可能与乳腺癌的发生发展有关.     

Expression of telomerase genes in cancer development in atypical hyperplasia of the mammary duct

目的　观察端粒酶基因在乳腺癌前病变 乳腺导管非典型增生及乳腺癌中的表达 ,探讨其与恶性转化的关系。方法　应用原位杂交方法评价端粒酶基因hTR和hTRT在 5 0例乳腺增生组织 (其中乳腺单纯性增生 6例 ,轻度非典型增生 9例 ,中度非典型增生 12例 ,重度非典型增生 2 3例 )及 2 6例乳腺癌中的表达。结果　在乳腺导管单纯性增生组织中端粒酶基因 (hTR、hTRTmRNA)呈弱表达 (16 6 % )或表达阴性。在乳腺导管轻、中度非典型增生组织中端粒酶基因 (hTR、hTRTmRNA)呈弱表达 (2 2 2 % ,11 1% ;33 3% ,2 5 0 % ) ,在乳腺导管重度非典型增生组织中端粒酶基因 (hTR、hTRTmRNA)表达增强 (6 0 9% ,5 2 1% ) ,在乳腺癌组织中端粒酶基因(hTR、hTRTmRNA)呈较强阳性表达 (88 5 % ,80 8% )。乳腺导管重度非典型增生组织中的端粒酶基因表达与在轻中度非典型增生、乳腺浸润性导管癌组织中的表达比较差异显著 (P <0 0 5 ) ,但与导管内癌表达无显著差异(P >0 0 5 )。结论　端粒酶基因hTR、hTRT的表达与乳腺导管非典型增生细胞的恶性转化有关 ,端粒酶的重新激活可能在乳腺癌的组织发生中起作用     

宫颈癌组织中P~(33ING1)、P53、Bcl-2检测

目的:检测宫颈癌组织中P33ING1、P53和Bcl-2的表达。方法:应用免疫组织化学方法分别检测正常宫颈组织(10例),宫颈不典型增生组织(18例),宫颈原位癌组织(21例)以及宫颈浸润癌组织(69例)中P33ING1,P53和Bcl-2的表达。结果:10例正常宫颈组织中P33ING1表达全部为阳性(10/10);而宫颈不典型增生组织中阳性表达率为72.2%(13/18);宫颈原位癌组织中为57.1%(11/21);宫颈浸润癌组织中为59.4%(41/69)。P33ING1在原位癌、浸润癌组织中的表达明显低于正常宫颈组织和不典型增生组织(P<0.01)。在宫颈病变发展过程中,P53阳性表达率升高,分别为0,0,28.6%,59.4%,各组间比较,除前2组阳性表达率差异无统计学意义外,另外各组间差异均有统计学意义(P<0.05);在宫颈病变发展过程中,Bcl-2的阳性表达率升高,分别为0、44.4%、57.1%、63.8%,各组间阳性表达率比较,差异有统计学意义。P33ING1和P53的表达有相关性(P<0.05),但与Bcl-2表达无相关性。结论:宫颈癌组织中P33ING1表达下降对宫颈癌发生、发展可能起重要作用,同时检测P33ING1与P53的表达水平,对宫颈癌的诊断和治疗具有积极意义。     

FHIT蛋白在乳腺癌进展过程中的表达

目的　探讨FHIT基因蛋白 (Fhit)表达情况与乳腺癌发生发展的关系。方法　用免疫组化法检测了6 1例乳腺浸润癌 ,4 3例导管内癌及上皮不典型增生 ,37例导管上皮增生和 4 2例正常乳腺上皮Fhit表达水平。结果　 90 .5 %正常乳腺上皮Fhit表达为强阳性 ,有 4 9.2 %乳腺癌Fhit表达阴性或明显降低 ,另有 32 .8%中度降低 (P <0 .0 0 1) ;在乳腺上皮增生发展为癌的过程中 ,Fhit表达水平逐渐降低 (P <0 .0 5 ) ;有异常 p5 3蛋白表达的乳腺癌 ,其Fhit低表达率明显高于无异常p5 3蛋白表达者 (P <0 .0 5 )。结论　实验结果提示Fhit表达降低可能对乳腺癌的演化和进展具有一定重要作用 ,Fhit低表达可能与 p5 3基因异常相关     

乳腺癌差异表达miRNA在预后中的意义

目的 运用生物信息学方法研究复发转移乳腺癌组织中的差异表达MicroRNAs,预测其在乳腺癌预后中的分子调控网络。方法 从GEO数据库中获取乳腺癌组织MiRNA表达谱,包括131例10年内无远处转移复发者,79例10年内有复发者。GEO2R在线分析工具筛选差异表达MiRNA,靶基因预测验证数据库预测miRNA靶基因,使用DAVID工具的基因功能注释和通路富集方法对靶基因进行分析。TF-miRNA调控数据库寻找其上游转录因子,Cytoscape软件构建互作网络。结果 复发转移组乳腺癌组织共筛选到差异表达的miRNA 5个,其中表达上调3个,表达下调2个。得到4个相关上游转录因子HIF1A、EGR1、FOXM1、ESR2,与差异miRNA共调控154个的靶基因。靶基因功能集中在BMP信号通路,TGF-β信号通路,细胞骨架组装功能和Rho GTPases信号通路。结论 差异性表达的miRNA包括hsa-miR-210、hsa-miR-33a、hsa-miR-32、hsa-miR-135a、hsa-miR-30a-3p,利用生物信息学方法,能够有效获取信息,为乳腺癌的治疗及预后监测的新策略研究开辟新思路。