广州市2008－2015年注射吸毒人群HIV-1亚型分布特征及变化趋势

目的 了解2008-2015年广州市注射吸毒人群HIV感染者（IDU感染者）HIV-1亚型分布特征及变化趋势。方法 研究对象为2008-2015年确证的HIV-1感染者、注射吸毒途径感染、现住址为广州市。收集血清样本提取HIV-1 RNA,采用巢式PCR法扩增HIV-1 pol区基因片段,测序后构建系统进化树,确定HIV-1亚型,比较不同年份和不同特征样本的HIV-1亚型分布。结果 从517份血清样本中成功获得437份样本的pol区基因片段。437份样本的年龄（37.37±8.17）岁;外省户籍者占51.5%（225/437）,以广西壮族自治区户籍（广西籍）居多（54.2%,122/225）。HIV-1亚型分布以CRF07_BC（46.5%）、CRF01_AE（24.3%）和CRF08_BC（23.3%）为主。CRF07_BC和CRF08_BC在2008-2015年各年份构成比的差异有统计学意义（CRF07_BC：趋势χ²=19.703,P=0.006;CRF08_BC：趋势χ²=25.718,P=0.001）,其中CRF07_BC的构成比呈下降趋势（趋势χ²=15.139,P=0.000）,CRF08_BC的构成比呈上升趋势（趋势χ²=22.577,P=0.000）。广西籍IDU感染者中CRF08_BC亚型的构成比较高（蒙特卡罗模拟精确概率P=0.000,99% CI：0.000~0.000）。结论 2008-2015年广州市IDU感染者HIV-1亚型分布以CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC为主、多个亚型共存,CRF08_BC亚型的构成比呈上升趋势的特点。提示广西籍IDU感染者是广州市艾滋病防治重点人群,应加强干预。     

德宏傣族景颇族自治州2017年HIV-1感染者抗病毒治疗前耐药和病毒基因亚型研究

目的 了解德宏傣族景颇族自治州（德宏州）抗病毒治疗（ART）前的HIV-1感染者基因型和耐药株的流行水平。方法 2017年1-6月在德宏州收集初始ART的HIV-1感染者170例,扩增pol基因,进行HIV-1基因分型和基因型耐药分析。结果 147份样品获得了pol基因,通过进化分析,发现12种HIV-1基因型,居于前3位包括C亚型（29.9%,44/147）、独特型重组形式（URFs）（27.2%,40/147）和CRF01_AE（19.7%,29/147）,还检测到了近年该地区新鉴定出的流行重组形式（CRFs）,包括CRF62_BC、CRF64_BC、CRF86_BC和CRF96_cpx。基因型在异性性传播和注射吸毒传播人群中的分布差异有统计学意义。发现耐药突变的比例为8.8%（13/147）。注射吸毒的HIV-1感染者中耐药株的比例（25.0%,8/32）,高于异性性传播的HIV-1感染者（4.6%,5/109）（χ²=10.166,P=0.002）。结论 2017年德宏州初始ART的HIV-1感染者中病毒基因型高度复杂,HIV-1耐药株的流行达中度水平。     

凉山彝族自治州HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素分析

目的 了解凉山彝族自治州（凉山州）HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素,为预防HIV-1耐药毒株的传播提供参考依据。方法 分别于2017年1月1日至6月30日、2018年1月1日至6月30日在凉山州开展HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药的横断面调查。提取获得HIV-1 pol基因区序列,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,应用HyPhy 2.2.4和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1耐药毒株传播网络分析。结果 研究对象464例HIV/AIDS,HIV-1毒株为CRF07_BC亚型的占88.6%（411/464）,总的HIV-1耐药率为9.9%（46/464）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）和蛋白酶抑制剂（PI）耐药率分别为6.7%（31/464）、1.9%（9/464）和0.4%（2/464）;有1组HIV-1新型重组毒株URF_01BC亚型独立成簇并携带相关耐药突变位点;多因素logistic回归分析结果显示,与异性性传播人群相比,注射吸毒人群的HIV-1耐药风险较高（aOR=3.03,95% CI：1.40～6.54）。结论 凉山州HIV/AIDS抗病毒治疗前的HIV-1耐药率较高,且有新型重组毒株URF_01BC亚型携带相关耐药突变位点的成簇传播,建议加强HIV-1耐药毒株传播的预防工作。     

浙江省2013-2015年学生男男性行为人群HIV-1亚型与分子传播簇特征分析

目的 了解浙江省12～30岁学生MSM HIV-1亚型及传播簇的特征。方法 以2013-2015年浙江省新确诊290例经男男性行为感染的学生HIV感染者（学生MSM感染者）为研究对象，开展HIV分子流行病学研究。收集流行病学相关信息，从采集的血浆中提取RNA，运用RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1的pol区基因，进行系统进化和分子传播簇分析。结果 290例学生MSM感染者中，杭州市确诊的占50.3%，大专及以上文化程度占81.0%。成功获取178例序列，有10种亚型，以CRF01_AE（49.4%，88/178）和CRF07_BC（39.3%，70/178）亚型为主。共形成18个分子传播簇（簇大小：2～4例/簇），成簇比例为23.6%（42/178），簇内学生MSM感染者所在学校为同一县（区、市）的占61.9%（26/42），其性伴类型为学生和非学生并存。中学生MSM感染者的成簇比例为38.2%（13/34），高于大学生MSM感染者的成簇比例20.1%（29/144）（χ²=4.996，P<0.05）。结论 2013-2015年浙江省学生MSM感染者的HIV-1亚型多样，提示HIV-1感染来源的多样化，HIV-1分子传播簇内的毒株呈现地理的相对聚集性，应加强性伴追踪和针对性干预，有效遏制艾滋病的传播。     

昆明市2016-2018年男男性行为人群HIV-1分子网络特征分析

目的 分析云南省昆明市2016-2018年MSM中HIV-1分子网络的特征,探讨HIV-1传播网络的危险因素,为干预的有效实施提供依据。方法 2016-2018年在昆明市连续收集新报告的感染HIV-1的MSM的样品540份,通过巢式PCR扩增HIV-1的pol区基因,按照最大似然进化树中bootstrap值 > 95%和基因距离 < 3%构建分子网络,对研究对象进入网络和网络增长的相关因素进行分析。结果 459份样品获得pol序列,检测到7种HIV-1基因型,其中以CRF07_BC（49.2%,226/459）和CRF01_AE（40.3%,185/459）为主,其他基因型包括URFs（4.8%,22/459）、CRF08_BC（3.1%,14/459）、CRF55_01B（1.7%,8/459）、B亚型（0.7%,3/459）和CRF68_01B（0.2%,1/459）。共163条序列进入网络,入网率为35.5%（163/459）,形成56个簇,簇内个体数在2～13个之间。对研究对象进入网络的影响因素分析,发现已婚和多性伴者在网络中检测到的比例较大;多因素logistic回归分析结果显示,性伴数是MSM感染者分子网络增长的影响因素;按照每年出现≥3个新增感染者的网络为活跃传播簇的标准,有6个传播簇可判定为活跃传播簇,外地、有STD史、离异和学生的MSM是活跃传播簇干预的关键对象。结论 昆明市MSM中HIV-1基因型日趋复杂,进入分子网络的相关因素包括已婚和多性伴,活跃传播簇中外地、有STD史、离异和学生MSM需要加强干预,本研究为分子网络运用于该人群的干预提供了基础。     

广州市2008-2015年未接受抗病毒治疗的注射吸毒人群HIV-1感染者耐药分析

目的 了解广州市未接受抗病毒治疗的注射吸毒人群（IDU）HIV-1感染者耐药株流行情况。方法 收集2008-2015年新确证HIV-1抗体阳性、现住址为广州市、传播途径为注射吸毒、确证时未接受抗病毒治疗的IDU HIV-1感染者的血清样本,提取HIV-1 RNA,采用巢式PCR法扩增pol区蛋白酶（PR）基因全序列与反转录酶（RT）基因部分序列并测序后,提交到美国斯坦福大学HIV耐药数据库做耐药分析。结果 518例HIV感染者中,有407例（78.57%）血清样本成功获得pol区基因片段。年龄18~64（37.44±8.14）岁,男性占89.68%（365/407）,汉族占89.93%（366/407）,未婚者占55.28%（225/407）,文化程度以初中及以下为主（83.78%,341/407）。HIV-1亚型以CRF07_BC为主（47.18%,192/407）,CRF01_AE占23.83%（97/407）和CRF08_BC占22.85%（93/407）,其他亚型占6.14%（25/407）。总耐药率为3.44%（14/407）,蛋白酶抑制剂耐药率为1.47%（6/407）,核苷类反转录酶抑制剂耐药率为0.25%（1/407）,非核苷类反转录酶抑制剂耐药率为1.72%（7/407）。突变发生率为12.29%（50/407）,蛋白酶区和核苷类反转录酶区未检出主要耐药突变,非核苷类反转录酶区中V179E突变率更高的是其他亚型和CRF07_BC亚型,其他亚型中的CRF55_01B亚型8例全部发生此突变;E138A突变率最高的是CRF08_BC亚型,为3.23%。有2例病例对NNRTIs的4种药物全都耐药。结论 2008-2015年广州市未接受抗病毒治疗的IDU HIV-1感染者的耐药率处于较低水平,大多数IDU HIV-1感染者对现有抗病毒治疗药物敏感。应加强IDU HIV-1感染者的耐药监测,控制耐药性毒株多重、交叉耐药的流行。     

嘉兴市2017-2018年新确证HIV/AIDS的HIV-1分子传播特征分析

目的 分析嘉兴市HIV/AIDS的感染和传播关系,探索区域HIV-1分子传播网络特征,为制定针对性的防控措施提供依据。方法 以2017-2018年嘉兴市新确证HIV/AIDS为研究对象,收集社会人口学、感染和传播等相关信息。采集血样并提取RNA,运用RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1的pol区基因序列,采用Mega 6.0软件构建系统进化树进行HIV-1亚型分析。计算研究对象的HIV-1基因序列遗传距离,筛选构建分子传播网络的基因距离阈值,使用Cytoscape 3.6.0软件绘制分子传播网络。对基于分子传播网络的流行病学调查结果进行分析。结果 研究对象HIV/AIDS 517例中,HIV-1基因序列包括15种基因亚型,以CRF01_AE（37.1%）、CRF07_BC（36.2%）和CRF08_BC（11.8%）为主。在1.0%的基因距离阈值下构建HIV-1分子传播网络,形成87个分子簇,总体入网率为45.8%（237/517）。多因素logistic回归分析结果显示,60~81岁年龄组（与14~24岁年龄组相比,OR=2.690,95%CI：1.058~6.844）、已婚（与未婚相比,OR=1.698,95%CI：1.003~2.875）、CRF07_BC亚型（与CRF01_AE亚型相比,OR=2.203,95%CI：1.426~3.404）的HIV-1分子成簇风险较高。分子传播网络中最大的CRF07_BC-1分子簇包括50例（2017年入网21例,2018年新增入网29例）HIV/AIDS,未婚（与已婚相比,OR=2.482,95%CI：1.140~5.402）、同性性传播（与异性性传播相比,OR=3.163,95%CI：1.543~6.483）、疑似高传播风险HIV/AIDS（与其他HIV/AIDS相比,OR=7.631,95%CI：1.783~32.654）、确证地在南湖区和平湖市[与其他区（县）相比,OR=2.225,95%CI：1.074~4.608]是进入最大簇的主要危险因素。该分子簇包含7例疑似高传播风险HIV/AIDS,均为同性性传播;自我报告首次发生男男性行为的时间范围为2010-2018年,确证前2年内的同性性伴数为20（P₂₅,P₇₅：10,100）;其中6例自我报告有近期在南湖区某MSM交友活动场所寻找性伴活动史。结论 2017-2018年嘉兴市新确证HIV/AIDS的HIV-1亚型多样,以散发为主,存在地理聚集性和一定数量的疑似高传播风险HIV/AIDS,呈快速传播现象,需开展针对性的强化干预。     

1996-2014年中国HIV-1毒株CRF01_AE亚型传播簇和传播网络研究

目的 了解我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型在省内和省际的传播规律和风险因素,为实施精准干预提供参考依据。方法 收集我国19个省份1996-2014年已有的2 094条CRF01_AE pol区基因序列,利用PhyML 3.0软件构建系统进化树,确定传播簇,利用Cytoscape 3.6.0软件构建传播网络,结合背景信息分析传播风险。结果 发现82个传播簇,包含255条序列（12.18%,255/2 094）,省内传播簇数量和包含序列数（61个,173条）明显多于跨省传播簇（21个,82条）。传播簇中男男性传播人群的成簇比例随时间上升趋势明显,由1996-2008年的2.41%（2/83）上升为2013-2014年的23.61%（72/305）（χ²=27.800,df=1,P=0.000）。跨省传播簇的男男性传播人群比例明显高于省内传播簇,由1996-2008年的0.67%（2/297）上升为2013-2014年的6.36%（30/472）,具有随时间的上升趋势（χ²=20.276,df=1,P=0.000）。跨省传播簇中男男性传播的比例（86.59%,71/82）明显高于省内传播簇（56.65%,98/173）,差异有统计学意义（χ²=22.792,P=0.000）。含2种及以上传播途径的跨省传播簇的比例（33.33%,7/21）明显高于省内传播簇（13.11%,8/61）,差异有统计学意义（χ²=4.273,P=0.039）。传播网络分析发现,跨省传播簇内高传播风险人群比例（51.22%,42/82）明显高于省内传播簇（26.59%,46/173）,差异有统计学意义（χ²=14.932,P=0.000）。跨省传播簇以男男性传播人群为主。结论 我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型存在复杂的传播网络,跨省传播簇快速增长,其中高风险传播者对HIV-1亚型的大范围传播起到重要作用,应深入进行传播网络研究以指导精准干预。     

四川省2011－2015年4类高危人群HIV-1新发感染率及流行趋势分析

目的 在注射吸毒者、MSM、暗娼和性病门诊男性就诊者中开展HIV-1新发感染检测,估算新发感染率,了解艾滋病在4类人群中的流行趋势。方法 收集2011-2015年四川省注射吸毒者、MSM、暗娼和性病门诊男性就诊者监测哨点的确证阳性样本,排除既往感染后,采用BED-CEIA方法进行新发感染检测,估算4类人群的HIV-1新发感染率。结果 2011-2015年4类人群共计监测194 223例,检出HIV-1阳性5 297例,完成BED-CEIA检测4 640例,判为新发感染749例。MSM、暗娼、性病门诊男性就诊,凉山州3个吸毒哨点（主要为彝族聚居地）监测的注射吸毒者、凉山州外地区吸毒哨点监测的注射吸毒者HIV-1新发感染率分别为5.16%（95% CI：4.65~5.66）、0.22%（95% CI：0.16~0.28）、0.57%（95% CI：0.45~0.69）和7.53%（95% CI：6.06~9.01）、0.44%（95% CI：0.36~0.53）。经χ²检验,各年新发感染率差异均有统计学意义。结论 2011-2015年凉山州外地区的注射吸毒者、暗娼和性病门诊男性就诊者新发感染率均保持在较低的水平,防治工作取得一定成效。MSM的HIV-1新发感染率较高,且存在上升趋势,不排除HIV由MSM向其他高危人群扩散的可能。     

广州市2008-2015年男男性行为人群HIV-1亚型分布特征及变化趋势

目的 了解2008－2015年广州市MSM人群HIV-1感染者（MSM感染者）HIV-1亚型分布特征及变化趋势。方法 研究对象为2008－2015年确证的HIV-1感染者、男男性行为途径感染、现住址为广州市。收集血清样本提取HIV-1 RNA,采用巢式 PCR法扩增HIV-1 pol区基因片段,测序后构建系统进化树,确定HIV-1亚型,比较不同年份和不同特征样本的HIV-1亚型分布。结果 从2 473份血清样本中成功获得2 210份样本的pol区基因片段。2 210份样本人群的年龄（30.19±8.22）岁;未婚者占73.39%;汉族占90.81%。独特重组形式（URFs）亚型在职业为农民及农民工的构成比高于其他职业者（P＝0.017,99%CI：0.014～0.020）,URFs亚型在多性伴者的构成比高于非多性伴者（ χ²＝5.733,P＝0.017）。HIV-1亚型分布以CRF07_BC（38.10%）和CRF01_AE（34.84%）为主,其次为CRF55_01B（14.62%）、B（6.06%）、URFs（3.58%）、CRF59_01B（2.17%）和其他亚型（0.63%）。B、CRF07_BC、CRF55_01B和URFs亚型在2008－2015年的各年份构成比的差异有统计学意义（B：P＝0.000,99%CI：0.000～0.000;CRF07_BC：χ²＝14.965,P＝0.036;CRF55_01B：χ²＝18.161,P＝0.011;URFs：P＝0.001,99%CI：0.000～0.001）,其中B亚型的构成比呈逐年下降趋势（P＝0.000,99%CI：0.000～0.000）,URFs亚型的构成比呈逐年上升趋势（P＝0.000,99%CI：0.000～0.000）。结论 2008－2015年广州市MSM感染者HIV-1亚型分布表现为CRF07_BC和CRF01_AE为主、多个亚型共存的特点。URFs亚型的构成比呈上升趋势提示HIV-1在MSM感染者中在不断发生重组。应针对MSM感染者农民及农民工、多性伴者加强干预。     

卫生经济成本效果分析的前沿评价方法研究

健康与卫生保健是卫生领域里最受关注的经济和政治问题。由于卫生经济学涉及公共政策的制定和实施,所以,我们必须系统地评价可供选择的政策方案。通过对国内外相关文献中3种经济评价方法的阐述,着重介绍和分析了成衣效用分析法,并认为该方法在现阶段的中国更具有实际应用价值。     

Logistic判别分析及其在医学中应用

Logistic判别分析对总体分布的条件限制较弱。有广泛的适用性。它适用于连续型、离散型与混合型资料。亦可用于两类与多类判别。无论理论上、实用上都很有生命力。此法一般用最大似然法求判别系数。作者用此法处理8个医学资料,其中有5个回代判别符合率为100％。而例1逐步判射分析回代翔别符合率为88.68％。文中讨论了变量筛选、判别符合率与迭代次数关系,以及与其他判别分析的比较。     

浅谈投资分析在大型医疗设备购置中的应用

运用投资分析的方法来论证医院购置大型医疗设备的可行性,着重讨论质量技术分析和财务分析各自不同的分析结果,结合实例说明了此方法的实用性及对决策的影响。     

两生物制品研究所疫苗项目的经济学评价

该以中立的观点，对A和B生物制品研究所的疫苗项目进行学评价。研究结果表明：两所的静态和动态投资回收期都分别为8年和9年，并以企业利润率、成本变动和贴现率为指标进行敏感性分析。在经济学评价基础上，该分析了保本业务量，影响成本的可能因素，寻求降低疫苗单位成本的途径，并提出了两项可能方案。     

Advances in statistical human genetics over the last 25 years

The past 25 years has seen an explosion in the number of genetic markers that can be measured on DNA samples at an ever decreasing cost. Although basic statistical methods for analysing such data gathered on samples of either independent individuals or family members, one or two markers at a time, were already well developed before this explosion occurred, there has been a corresponding burst in activity to develop multiple marker models to find disease-causing gene variants, capitalizing on the data that have become available, to increase the power of such methods. This has required the concomitant development of faster algorithms to speed up the computation of various likelihoods. For linkage analysis, to obtain the approximate locations for genes of interest, Mendelian segregation models have been extended to be more realistic and statistical models that do not assume specific modes of inheritance have been extended to allow for the analysis of larger pedigree structures. For association analysis, to obtain more precise locations for genes of interest, the recent completion of the first stage of the HapMap project has spurred the development, still underway, of novel experimental designs and analytical methods to combat the curse of dimensionality and the resulting multiple testing problem. Perhaps the greatest current challenge concerns how best to gather and synthesize the many lines of evidence possible in order to discover the genetic determinants underlying complex diseases.     

Genetic Analysis Workshop II: further consideration of segregation and linkage analyses in Problem 3

We analyzed disease-marker associations in Problem 3 for the Genetic Analysis Workshop II, using PAP for segregation analysis and LIPED for linkage analysis. In this report we present aspects of our analyses that are not reported in the summary [MacCluer et al, 1984]. Certain features that we added to the running of LIPED to facilitate the analysis are discussed. Furthermore, we tested for Mendelian transmission in the hypothetical trait locus and we calculated modified relative risks for marker-trait genotypes. Some of the problems involved in analyzing complex associations among loci are discussed.     

聚类在流行病学分层分析中的应用

目的：建立一种方法，解决当混杂因素分层界限不清或存在矛盾时，如何进行流行病学分层分析的问题。方法：采用SPSS 10．0软件，以广东省1997～1998年糖尿病流行病学调查资料为实例，进行聚类分层分析。结果：聚类分层分析提高了分层分析效率，有效地控制了混杂偏倚，避免了错分偏倚的产生。结论：聚类分析可以作为一种辅助分层的方法，合理解决当混杂因素分层界限不清或存在矛盾时，如何进行分层分析的问题。     

Hippocampal shape analysis in Alzheimer's disease using functional data analysis

The hippocampus is one of the first affected regions in Alzheimer's disease. The left hippocampi of control subjects, patients with mild cognitive impairment and patients with Alzheimer's disease are represented by spherical harmonics. Functional data analysis is used in the hippocampal shape analysis. Functional principal component analysis and functional independent component analysis are defined for multivariate functions with two arguments. A functional linear discriminant function is also defined. Comparisons with other approaches are carried out. Our functional approach gives promising results, especially in shape classification. Copyright © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.     

中国卫生状况分类的探讨

本文利用全国第三次人口普查资料,按10%比例随机抽取214个县,根据其社会经济、文化教育及健康状况的17个指标,用特尔菲法筛选出其中9个指标进行主成分分析。将筛选出的三个主成分经最大方差旋转(雅可比旋转)转变成与变量有明确关系的三个分类因子,分别反映人群健康状况、人口结构及经济状况。从因子得分系数得出三个模型,经过 K-means 聚类,将全国农村(县级)共分成四类地区。结果表明,多变量分析法筛选综合分类因子进行卫生状况的分类研究是一个良好的途径;分类结果与实际分布吻合,基本上可以反映社会卫生发展状况,可作为卫生行政部门制订政策和事业发展计划,进行分类指导的客观依据。     

2011年北京市房山区手足口病发病时空扫描分析

目的 探讨北京市房山区2011年手足口病发病时空分布特征,为开展针对性控制措施提供理论依据. 方法 通过时空扫描分析呈现手足口病时空聚集区域. 结果 2011年北京市房山区手足口病发病2452例,发病率为259.47/10万,发生聚集性病例126起,位居北京市第一位.时空扫描分析结果显示手足口病高发时间为5月8日-8月4日,高峰为6月15-21日,发病最可能聚集区域位于北京市房山区城区中北部,与丰台区邻接,以7～15 km为半径的区域. 结论 北京市房山区手足口病发病不是随机分布的,存在明显时空聚集,为房山区今后开展针对性的预防控制措施,控制手足口病高发热点区域提供了科学参考依据.