| 1996-2014年中国HIV-1毒株CRF01_AE亚型传播簇和传播网络研究 |
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| 引用本文： | 王晓林,贾磊,李韩平,刘永健,韩婧婉,李天一,李敬云,李林.1996-2014年中国HIV-1毒株CRF01_AE亚型传播簇和传播网络研究[J].中华流行病学杂志,2019,40(1):84-88. |
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| 作者姓名： | 王晓林 贾磊 李韩平 刘永健 韩婧婉 李天一 李敬云 李林 |
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| 作者单位： | 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室, 北京 100071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（81773493）；北京市科技计划（D141100000314001） |
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| 摘 要： | 目的 了解我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型在省内和省际的传播规律和风险因素，为实施精准干预提供参考依据。方法 收集我国19个省份1996-2014年已有的2 094条CRF01_AE pol区基因序列，利用PhyML 3.0软件构建系统进化树，确定传播簇，利用Cytoscape 3.6.0软件构建传播网络，结合背景信息分析传播风险。结果 发现82个传播簇，包含255条序列（12.18%，255/2 094），省内传播簇数量和包含序列数（61个，173条）明显多于跨省传播簇（21个，82条）。传播簇中男男性传播人群的成簇比例随时间上升趋势明显，由1996-2008年的2.41%（2/83）上升为2013-2014年的23.61%（72/305）（χ2=27.800，df=1，P=0.000）。跨省传播簇的男男性传播人群比例明显高于省内传播簇，由1996-2008年的0.67%（2/297）上升为2013-2014年的6.36%（30/472），具有随时间的上升趋势（χ2=20.276，df=1，P=0.000）。跨省传播簇中男男性传播的比例（86.59%，71/82）明显高于省内传播簇（56.65%，98/173），差异有统计学意义（χ2=22.792，P=0.000）。含2种及以上传播途径的跨省传播簇的比例（33.33%，7/21）明显高于省内传播簇（13.11%，8/61），差异有统计学意义（χ2=4.273，P=0.039）。传播网络分析发现，跨省传播簇内高传播风险人群比例（51.22%，42/82）明显高于省内传播簇（26.59%，46/173），差异有统计学意义（χ2=14.932，P=0.000）。跨省传播簇以男男性传播人群为主。结论 我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型存在复杂的传播网络，跨省传播簇快速增长，其中高风险传播者对HIV-1亚型的大范围传播起到重要作用，应深入进行传播网络研究以指导精准干预。
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| 关 键 词： | 艾滋病病毒 CRF01_AE亚型 传播簇 传播网络 |
| 收稿时间： | 2018/7/23 0:00:00 |
Transmission cluster and network of HIV-1 CRF01_AE strain in China, 1996-2014 |
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| Wang Xiaolin,Jia Lei,Li Hanping,Liu Yongjian,Han Jingwan,Li Tianyi,Li Jingyun and Li Lin.Transmission cluster and network of HIV-1 CRF01_AE strain in China, 1996-2014[J].Chinese Journal of Epidemiology,2019,40(1):84-88. |
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| Authors: | Wang Xiaolin Jia Lei Li Hanping Liu Yongjian Han Jingwan Li Tianyi Li Jingyun and Li Lin |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China,State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China,State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China,State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China,State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China,State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China,State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China and State Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Biosecurity, Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Sciences, Beijing 100071, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | HIV-1 CRF01_AE subtype Transmission cluster Transmission network |
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