生物信息学的现状和展望

随着人类基因组计划的实施 ,通过基因组测序、蛋白质序列测定结构解析等实验 ,有关核酸、蛋白质的序列和结构数据呈指数增长 ,为了更有效地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义 ,产生了综合生物学研究与计算机技术研究等领域最新成果的交叉学科“生物信息学”。本文就生物信息学的产生背景 ,概念 ,研究内容 ,应用以及发展等方面予以综述     

腺苷A_(2A)受体在中枢神经系统损伤中的相关研究进展

中枢神经系统损伤以其高发生率和高死残率,已经成为紧迫的世界性公众健康问题,但目前还缺乏公认安全有效的疗法。腺苷A_(2A)受体(A_(2A)R)作为神经精神活动及中枢神经系统损伤的重要调控因子,引起了普遍的关注。目前,研究发现在中枢神经系统损伤中,激活A_(2A)R有加重神经损伤与神经保护的复杂作用。本文即对A_(2A)R在中枢神经损伤中的作用与机制进行探讨。     

原代成纤维细胞和纤维肉瘤细胞自分泌转化生长因子β1浓度检测及对转化生长因子β1增殖的调节

背景：体外实验常采用外源性转化生长因子β1刺激来观察细胞增殖变化，易忽略细胞本身自分泌转化生长因子β1的影响。 目的：检测原代成纤维细胞和纤维肉瘤细胞(L929)自分泌转化生长因子β1的浓度和细胞增殖的变化。 方法： Elisa试剂盒检测原代成纤维细胞和纤维肉瘤细胞各时相点细胞内和培养上清中生长转化因子β1水平。 结果与结论：纤维肉瘤细胞内转化生长因子β1浓度随培养时间延长而升高，原代成纤维细胞内转化生长因子β1浓度随培养时间延长而降低；两种细胞培养上清转化生长因子β1浓度均随时间而上升，但纤维肉瘤细胞显著高于原代成纤维细胞 (P < 0.01)，峰值时达到原代成纤维细胞的20倍；两种细胞增殖曲线在72 h内均随时间而显著增高(P < 0.01)，同一时间点比较，纤维肉瘤细胞明显高于原代成纤维细胞。提示自分泌转化生长因子β1具有促进细胞增殖的作用，不同的自分泌水平可能是影响原代成纤维细胞这种正常细胞和纤维肉瘤细胞肿瘤细胞对于外源转化生长因子β1反应不同的重要原因。     

纳络酮对失血致低血容量性休克大鼠的治疗作用

目的 :探讨纳络酮 （naloxone,NAL）对失血致低血容量性休克大鼠的治疗作用。方法 :颈总动脉放血 ,使平均动脉压 （MAP）降至 6 .0 k Pa,稳定 1h,完成失血致血容量性休克大鼠模型 ,2 1只大鼠随机均分为 :休克组、纳络酮治疗组、正常对照组。观察 NAL 治疗前后及各时相点大鼠呼吸频率 （RR）、MAP、血液指标等各参数的变化。结果 :纳络酮组给药后 ,MAP即刻升高 ,5 min后 MAP升至 （13.6± 2 .0 ） k Pa,较休克组增高明显 （P<0 .0 1） ,休克组、纳络酮治疗组失血后 RR明显减慢 ,纳络酮给药后 30 min RR升至高峰 （84± 10 ） / min,与休克组相比明显增加 （P<0 .0 1）。NAL 降低了肺体指数和肺含水率 ;升高 p H,Pa O2 ,降低 Pa CO2 ,改善酸中毒和心肺功能。结论 :纳络酮在失血致低血容量性休克大鼠治疗过程中有重要作用 ,能有效减轻休克的严重程度     

Wistar大鼠c-ski基因部分序列的克隆、测序及实时荧光定量PCR的建立

目的 测定Wistar大鼠c-ski基因部分序列,并应用于检测大鼠c-ski基因表达的实时荧光定量PCR的建立.方法 提取培养的Wistar大鼠皮肤成纤维细胞总RNA,通过RT-PCR扩增,将扩增产物克隆到PMD-18T载体上并测序.根据获得的c-ski基因部分序列设计实时荧光定量PCR引物,建立SYBR green定量PCR检测方法,并检测培养的大鼠皮肤成纤维细胞c-ski mRNA表达水平.结果 获得的Wistar大鼠c-ski基因cDNA序列长561bp,为未曾报道的新序列,其与人、小鼠具有较高的同源性,Gen-Bank收录(收入号DQ409171).建立的SYBR green定量PCR检测标准品在103～109拷贝范围内的相关系数为0.991 49.体外培养的Wistar大鼠皮肤成纤维细胞样晶中c-ski mRNA水平为(1.024±0.18)×106拷贝/μl.结论 新获得了Wistar大鼠c-ski基因部分序列,该序列可用于实时荧光定量PCR的建立.     

小鼠急性肺损伤后糖皮质激素受体的活性改变与热休克蛋白的关系

目的 研究急性肺损伤(ALI)后机体内糖皮质激素受体(GR)的配体结合活性显著下降与其分子伴侣热休克蛋白(Hsps)改变的关系.方法 以小鼠油酸急性肺损伤为模型,用Western blotting和受体的放射配体结合试验动态观察伤后GR、Hsp90、Hsp70和GR的结合容量和亲和力变化.结果 伤后小鼠肺组织水肿、肺体指数和肺含水量显著升高;GR在伤后1 h升高,然后显著下降,在12 h达最低点;Hsp90和Hsp70在伤后的表达逐渐升高,在12 h达最高点.配体结合试验显示在伤后GR Bmax逐渐下降,Kd值升高,与Hsp90/GR的变化趋势一致.结论 急性肺损伤后的GR配体结合活性的改变可能与Hsp90的变化有关.     

急性肺损伤血栓素A2受体,受体mRNA的变化及拮抗剂酚红对它？…

目的 研究急性肺损伤（ＡＬＩ）肺组织特异性膜受体（ＴＸＡ２Ｒ）的变化及受体拮抗剂酚红对它们的影响，从分子水平阐明血栓素Ａ２（ＴＸＡ２）在ＡＬＩ中的作用机制。方法 采用大鼠油酸肺损伤模型，分析后６小时肺组织ＴＸＡ２Ｒ、ＴＸＡ２ＲｍＲＮＡ表达的变化以及酚红（５０ｍｇ／ｋｇ、５ｍｇ／ｋｇ）对它们的影响。结果 油酸肺损伤后肺组织ＴＸＡ２Ｒ结合容量明显“降低”，其ｍＲＮＡ的转录显升高。酚红的应用使ＴＸＡ２     

原代成纤维细胞和纤维肉瘤细胞自分泌转化生长因子β1浓度检测及对转化生长因子β1增殖的调节

背景：体外实验常采用外源性转化生长因子β1刺激来观察细胞增殖变化,易忽略细胞本身自分泌转化生长因子β1的影响。目的：检测原代成纤维细胞和纤维肉瘤细胞（L929）自分泌转化生长因子β1的浓度和细胞增殖的变化。方法：Elisa试剂盒检测原代成纤维细胞和纤维肉瘤细胞各时相点细胞内和培养上清中生长转化因子β1水平。结果与结论：纤维肉瘤细胞内转化生长因子β1浓度随培养时间延长而升高,原代成纤维细胞内转化生长因子β1浓度随培养时间延长而降低;两种细胞培养上清转化生长因子β1浓度均随时间而上升,但纤维肉瘤细胞显著高于原代成纤维细胞（P〈0.01）,峰值时达到原代成纤维细胞的20倍;两种细胞增殖曲线在72h内均随时间而显著增高（P〈0.01）,同一时间点比较,纤维肉瘤细胞明显高于原代成纤维细胞。提示自分泌转化生长因子β1具有促进细胞增殖的作用,不同的自分泌水平可能是影响原代成纤维细胞这种正常细胞和纤维肉瘤细胞肿瘤细胞对于外源转化生长因子β1反应不同的重要原因。     

人ski基因真核表达载体的构建及促细胞增殖作用

背景：c-Ski既可促进组织修复,又能降低瘢痕形成,有望成为一个全新的基因治疗药物。目的：构建人ski基因的真核表达载体,并对其促成纤维细胞增殖效果进行验证。方法：RT-PCR法从人包皮培养原代成纤维细胞总RNA中扩增出人ski基因,连同真核表达启动子CMV克隆到pUC118载体上,酶切和测序验证后,应用脂质体将其转染到培养的大鼠皮肤成纤维细胞中。结果与结论：酶切和测序结果证实表达质粒构建成功,Westernblot显示Ski蛋白在转染细胞中成功表达,且可显著提高转染细胞的增殖效应,说明以pUC118为骨架的重组ski表达质粒具有促进大鼠皮肤成纤维细胞增殖的作用。     

血必净对大鼠创伤性脑损伤保护作用的初步研究

目的探讨血必净对颅脑损伤的保护作用及机制。方法选取SD雄性大鼠108只,按随机数字表法分成假手术组、对照组、治疗组,每组36只,采用自由落体撞击伤方法制作创伤性脑损伤模型。治疗组大鼠伤后立即腹腔注射血必净4 mg/kg,每12小时重复1次。伤后24、72 h处死大鼠,用干、湿质量法测定脑含水量,测定MDA含量、SOD、GSH-Px活性及观察脑组织形态学改变。结果与假手术组比较,对照组、治疗组大鼠脑含水量、MDA含量均显著增高(P<0.01),SOD、GSH-Px活性显著下降(P<0.01);与对照组相比,治疗组大鼠脑含水量、MDA含量均显著下降(P<0.05),SOD活性显著增高(P<0.05)。结论血必净对大鼠创伤性脑损伤脑组织具有保护作用,其机制可能与减轻创伤后脑水肿、抑制氧自由基反应有关。