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急慢性砷染毒的肝细胞L-02的基因芯片分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的用基因芯片分析急慢性砷染毒时人正常肝细胞(L-02细胞)基因表达谱的变化。方法6omol/L的亚砷酸钠染毒L-02细胞2,15,24h,4μmol/L的亚酸钠染毒L-02细胞2周,分别与未染毒的L-02细胞抽提RNA作表达谱基因芯片杂交。结果急性和慢性砷诱导细胞基因表达谱截然不同。染砷后首先激活的是解毒功能相关的基因和一些蛋白质合成相关的基因。长期染砷后与肿瘤发生及氧化还原有关的基因表达量升高。结论细胞短期染砷毒后,应激和解毒功能有关的蛋白表达上调,长期染砷后与肿瘤有关的基因表达上调,急慢性砷刺激下细胞以不同的方式抵抗砷毒。 相似文献
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砷化物对人类金属硫蛋白-3cDNA基因表达的影响 总被引:5,自引:0,他引:5
目的 探讨砷化物对人类正常肝细胞金属硫蛋白(Metallothionein,MD-3cDNA基因表达的影响。方法 利用SMART方法克隆cDNA基因,生物信息学分析克隆基因的同源性、染色体定位、基因结构和对该基因编码蛋白质进行分析并对该蛋白质进行跨膜信息分析,基因芯片方法检测染砷L-02细胞MT-3基因的表达。结果 成功克隆MT-3cDNA基因,经生物信息学分析可知,该基因定位在人16号染色体16q13区段,跨膜信息分析发现MT-3基因编码蛋白质可以穿出生物膜,基因芯片结果证实染砷的人正常肝L-02细胞在染砷早期MT-3基因表达增高。结论 该研究发现人类MT-3基因是砷化物作用的一个相关基因,早期参与了砷代谢解毒。 相似文献
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目的 应用二维斑点追踪超声心动图(2-dimensional speckle tracking echocardiography, 2D-STE)评估胎儿心肌功能,以确定妊娠期糖尿病对胎儿心肌收缩功能的影响。方法 本研究纳入了50例妊娠期糖尿病孕妇(其中A组28例,5.7%≤HbA1c<6.5%;B组22例,HbA1c≥6.5%),43例健康孕检孕妇(HbA1<5.7%)为对照组,应用2D-STE测量三组胎儿左室整体心肌纵向应变(Global longitudinal strain,GLS),根据孕妇HbA1c水平分层探讨妊娠期糖尿病对胎儿心脏收缩功能的影响。结果 三组间胎儿室间隔厚度、左室后壁厚度依次增厚,两两相比差异有统计学意义(均P<0.001)。与对照组相比,B组预估的胎儿体重更大,两者间有统计学差异,B组预估的胎儿体重较A组大,但两者间差异无统计学意义。妊娠期糖尿病组胎儿二尖瓣E/A均高于对照组,差异有统计学意义,而妊娠期糖尿病组两组间的胎儿二尖瓣E/A差异无统计学意义。三组间胎儿GLS依次减低,两两相比差异有统计学意义(P<0.001)。结论 妊娠期... 相似文献
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全长新基因人核糖体蛋白L14.22在人脑胶质瘤中的研究与体外表达 总被引:1,自引:1,他引:0
目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对507E08克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析,蛋白表达和氨基酸测序。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northern blot 证实507E08基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLAST分析显示,507E08基因为全长新基因,长度为2 002 bp,共编码203个氨基酸。本基因命名为人核糖体蛋白L14.22。经原核表达,在SDS-PAGE胶上获得一条22×103的条带,氨基酸序列分析显示,结果N-端15个氨基酸与序列所示的N-端15个氨基酸残基完全相同。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度, 高敏感等特性。507E08基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。 相似文献
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裸鼠高致瘤性K562-n细胞系基因表达谱的变化 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 探索K5 62和K5 62 n细胞在裸鼠体内致瘤性不同的分子生物学机制。方法 应用基因芯片技术 ,检测K5 62细胞和K5 62 n细胞的差异表达基因。结果 在被检测的 12 80 0个基因中 ,一些与细胞增殖、分化及凋亡等相关基因的表达在高致瘤性K5 62 n与K5 62细胞中有显著的变化。表达上调的基因包括MAD 3基因、转录因子ⅡA(TFⅡA)λ亚基基因等 ,表达下调的基因包括人Fas相关因子基因、含转录子E2F2、ID3 (DNA结合蛋白 3 )基因的染色体 1p3 6.13~ 3 6.2 2、精氨琥珀酸裂解酶基因等。结论 K5 62 n细胞的裸鼠高致瘤特性 ,和与细胞凋亡过程直接或间接相关的基因表达变化导致的细胞凋亡受阻有关 相似文献
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目的 探讨前列腺癌发生发展中相关基因群的表达意义。 方法 应用含有 4 36 6条人类全长基因cDNA基因芯片研究一组前列腺癌及正常前列腺组织基因表达谱的差异性。同时进行生物信息学分析。 结果 在前列腺癌与正常前列腺组织间存在差异表达的基因 2 87条 ,未知基因16 5条 ,已知基因 12 2条。已知基因中有显著差异表达基因 5 6条 ,其中上调基因 2 0条 ,下调基因 36条。 结论 生物信息分析显示 :显著差异表达基因与肿瘤的发病机理可能存在相关性。 相似文献
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一条人脑胶质瘤相关新基因的克隆与表达 总被引:2,自引:1,他引:1
目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条与脑胶质瘤相关的新基因进行了克隆和表达的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察二者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析和蛋白质的表达。结果通过四次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现这两个克隆是同一个基因[命名为cyclophilin—like gene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。并在大肠杆菌中得到了PPIL3a和PPIL3b与GST较好表达的融合蛋白。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。 相似文献
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胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究 总被引:3,自引:1,他引:2
目的探讨人脑胶质母细胞瘤发生、发展中相关基因的表达及功能.方法用含13 939种人类基因的BioStarH140S型表达谱芯片,以正常成人脑及不同级别胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片;ScanArray 4000扫描芯片荧光信号,提取脑及胶质瘤组织差异基因并进行生物信息分析;用Hierarchical聚类对胶质瘤差异基因进行特征提取;用Northern杂交验证及进行初步功能研究.结果正常脑与18例不同级别胶质瘤组织间筛选出多类差异表达基因,通过生物信息学和Hierarchical聚类,发现α-连环素、微型染色体维护蛋白7、细胞周期素B2、FBX05、着丝粒蛋白F基因与胶质母细胞瘤密切相关,该类基因在低级别胶质瘤中表达差异不明显,但胶质母细胞瘤中表达明显上调.Northern杂交显示该类基因与胶质母细胞瘤密切相关,与芯片结果一致.结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选胶质瘤相关基因,发现的5条基因与胶质母细胞瘤侵袭性强密切相关,可成为判断胶质瘤预后的分子生物学指标. 相似文献