微阵列芯片Meta分析序列相似家族72成员A mRNA水平与乳腺癌预后关系

目的 探讨序列相似家族72成员A(FAM72A)mRNA表达水平与乳腺癌患者预后的关系.方法 在NCBI的GEO数据库中检索乳腺癌基因表达谱的数据集,对数据进行预处理后,对数据集进行标准化合并.采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用单因素Cox模型分析乳腺癌患者以及不同分型乳腺癌患者的总体无事件生存期与FAM72A mRNA表达的相关性.结果 总共纳入10个微阵列数据集,包含1 720例乳腺癌患者癌组织样本.在所有乳腺癌患者中,FAM72A mRNA高表达者无事件生存期低于FAM72A mRNA低表达者(P<0.05);在雌激素受体阳性乳腺癌患者中,FAM72A mRNA高表达者无事件生存期低于FAM72A mRNA低表达者(P<0.05);在乳腺管腔B型患者中,FAM72A mRNA高表达者无事件生存期低于FAM72A mRNA低表达者(P<0.05).结论 FAM72可以作为预测乳腺管腔B型乳腺癌患者预后的潜在标志物.     

乳腺浸润性导管癌TOP2A基因状态与HER2及临床病理特征的关系

目的: 检测乳腺浸润性导管癌拓扑异构酶Ⅱα(topoisomerase Ⅱ alpha, TOP2A)基因状态,探讨其与人类表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2, HER2)基因状态、HER2蛋白表达及临床病理特征之间的相关性。方法: 筛选乳腺浸润性导管癌患者371例,通过荧光原位杂交法(FISH)检测癌组织TOP2A基因状态,同时用双色银染原位杂交法(DISH)检测HER2基因扩增情况,免疫组织化学法(IHC)检测HER2蛋白表达,分析其相关性。结果： 371例患者中TOP2A基因扩增64例,基因缺失12例,异常率20.49%(76/371);HER2基因扩增122例(32.88%)。TOP2A基因扩增中有53例HER2基因扩增,11例HER2基因无扩增;TOP2A基因缺失中有9例HER2基因扩增,3例HER2基因无扩增;TOP2A基因无扩增或缺失中有60例HER2基因扩增,235例HER2基因无扩增;HER2蛋白表达为0～1+,2+,3+对应的TOP2A基因扩增率分别为4.69%,23.44%,71.88%;HER2表达为3+时TOP2A基因缺失率为66.67%(8/12)。TOP2A基因状态与患者年龄、性别、部位及有无淋巴结转移无明显相关(P>0.05),与组织分级、肿瘤直径相关(P<0.05)。 结论： TOP2A基因状态与HER2基因异常具有相关性,TOP2A基因扩增随HER2蛋白表达增强而增高;肿瘤直径为2～5 cm,组织分级高的浸润性乳腺癌TOP2A基因异常率高。     

PKMYT1在乳腺癌中表达的生物信息学分析及实验用细胞系筛选

目的 基于生物信息学研究PKMYT1基因在乳腺癌进展中的作用及影响以及在乳腺癌各细胞系中的表达情况。方法 将癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)乳腺癌RNA转录组数据中的PKMYT1进行单基因分析,其中包括差异分析、配对差异分析、临床相关性分析、GSEA富集分析及生存分析,同时还利用GEPIA 2、TIMER2.0、The Human Protein Atlas及Kaplan-Meier Plotter数据库进行了多次验证。且通过实时荧光定量PCR检测了PKMYT1在乳腺癌各细胞系中的表达情况,为后续研究筛选合适的细胞系。结果 经生物信息学分析发现在乳腺癌中与正常样本比较,PKMYT1在肿瘤样本中的表达明显升高(P＜0.05);临床相关性分析结果表明,PKMYT1在乳腺癌中与年龄、肿瘤分期及原发肿瘤直径相关(P＜0.05),而与性别、远处转移、淋巴结转移无显著相关性(P＞0.05);GSEA富集分析显示在乳腺癌中PKMYT1高表达时,其功能富集与细胞周期、DNA复制、同源重组等功能密切相关,低表达时则与TGF-β信号通路、MAPK信号通路等相关;生存分析发现PKMYT1在乳腺癌中HR=1.22提示为高风险因素,且与生存相关(P＜0.05)。同时细胞实验验证了PKMYT1在人乳腺癌细胞系中以正常乳腺细胞系为参照在MDA-MB-231中表达最高,在小鼠乳腺癌细胞系中4T1细胞系表达最高。结论 PKMYT1是一种与乳腺癌恶性肿瘤相关的基因,是一种新的肿瘤标志物,或可成为乳腺癌新的治疗靶点。     

TUBB3和TOP2A与晚期乳腺癌患者临床病理特征及与紫杉类联合蒽环类药物治疗疗效的关系

目的 探讨3型β微管蛋白(3 beta tubulin,TUBB3)和拓扑异构酶2(topoisomerase 2,TOP2A)在晚期乳腺癌患者乳腺组织中的表达及其与患者临床病理特征的关系,并分析TUBB3和TOP2A表达与患者接受紫杉类联合蒽环类药物治疗效果的关系.方法 回顾性分析我院2015年收治的60例确诊的晚期乳腺癌患者,采用液相芯片法检测患者乳腺组织中TUBB3和TOP2A mRNA的表达,比较不同病理特征患者的TUBB3和TOP2A mRNA表达差异;两组患者均采用(多西他赛+吡柔比星+异环磷酰胺)/(紫杉醇+表柔比星+环磷酰胺)(PAC/PEC)进行化疗,4周后进行疗效评价,并分析临床效果与TUBB3和TOP2A mRNA表达的相关性.结果 TUBB3 mRNA表达在不同乳腺癌组织学分级患者间的差异具有统计学意义(P＜0.05);TOP2A mRNA表达与患者的年龄、是否绝经、组织学分级、是否淋巴结转移、ER表达、PR表达、HER-2表达关系不显著(P＞0.05);TUBB3 mRNA低表达患者的缓解率高于高表达患者(57.14％ vs 14.71％,x2=5.299,P＜0.05);TUBB3 mRNA低表达、中表达患者的总有效率均高于高表达组(92.86％、83.33％ vs 52.94％,x2=10.533、4.190,P＜0.05);TOP2AmRNA高表达患者的总有效率高于低表达组(93.55％ vs 69.23％,x2=3.967,P＜0.05).结论 TUBB3 mRNA表达与乳腺癌组织学分级有关,TUBB3低表达、TOP2A高表达患者应用PAC/PEC的效果更好.     

超氧化物歧化酶2在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的 评估超氧化物歧化酶2（SOD2）在乳腺癌中表达及预后价值,揭示其在乳腺癌发生发展中可能的作用机制。方法 采 用R 软件对TCGA数据进行生信分析,用Wilcoxon秩和检验和Wilcoxon符号秩和检验分析SOD2在乳腺癌中的表达及临床相 关性,应用KEGG的基因集进行基因富集分析（GSEA）,然后通过STRING数据库构建蛋白质相互作用网络,用Cytoscape 软件进行关键基因筛选,两基因相关性使用Pearson’s相关性分析。通过免疫组化和 RT-qPCR 法对2018~2019年收治的原发性乳腺癌组织、癌旁组织样本各60例进行临床验证。结果 SOD2在乳腺癌组织中的表达明显低于乳腺正常组织,其表达与乳腺癌TNM分期和腋窝淋巴结转移显著相关（P<0.05）。Kaplan-Meier法生存分析显示SOD2高表达患者的无复发生存、无远处转移生存和后进展生存期均显著低于SOD2低表达者（P<0.05）;GSEA富集分析结果显示SOD2在JAK-STAT信号通路中发挥重要的生物学作用。构建PPI网络筛选出关键基因IL10和STAT4,二者均与SOD2呈正相关性。SOD2在临床乳腺癌组织样本中高表达,其表达与腋窝淋巴结有无转移、雌激素受体表达及雄激素受体表达有显著性差异（P<0.05）。结论 SOD2在乳腺癌中的表达与TNM分期、腋窝淋巴结转移显著相关,SOD2可能通过调控IL10和/或STAT4介导JAK/STAT信号通路影响乳腺癌细胞的增殖、侵袭和转移。     

数据库分析和验证HMMR为乳腺癌的主要生物标志物

目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因。方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,venn图取交集;Cytoscape构建PPI网络,获取TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和通路。通过UALCAN和HPA数据库分析了mRNA和蛋白表达水平,通过Kaplan-Meier plotter数据库进行生存分析。QRT-PCR检测验证透明质酸介导的运动受体(Recombinant Hyaluronan Mediated Motility Receptor, HMMR)在乳腺癌细胞中的表达水平。结果 筛选到217个乳腺癌差异表达基因,确定了TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析结果显示,TOP10枢纽基因与DNA复制、有丝分裂细胞周期的G1/S转变、有丝分裂细胞周期的G2/M转变相关,并且主要富集在p53信号通路上。经数据库验证,HMMR在乳腺癌中表达上调,并且与临床分期以及生存率负相关。QRT-PCR结果显示,与正常乳腺细胞MCF-10A相比,HMMR mRNA在乳腺癌细胞MCF-7、MDA-MB-231、SKBR3的...     

基于TCGA数据分析NEK2基因在恶性胸膜间皮瘤中的表达及预后意义

目的 分析永不有丝分裂基因A相关激酶2(NEK2)基因在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达及预后意义。方法 下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库MPM基因表达数据、临床病理数据和生存状态数据;使用perl软件和R语言的limma、timeROC等程序包作NEK2基因在MPM中的差异分析、临床病理相关性分析、COX单因素和多因素分析以及基因富集分析,并绘制ROC曲线;利用TIMER2.0数据库分析MPM中NEK2表达与常见的免疫细胞浸润的相关性。选取12例MPM组织和6例非MPM胸膜组织,通过RT-qPCR的方法验证NEK2基因在MPM与非瘤组织中的表达情况。结果 与正常肺组织相比,NEK2在MPM组织中高表达(P<0.001)。NEK2基因mRNA表达量与MPM淋巴结分期具有显著相关性(P<0.05);NEK2高表达与MPM患者预后不良相关(P<0.001);NEK2基因表达与MPM中B淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(P<0.05),并在细胞周期、DNA复制、剪接体、mRNA监测等通路显著富集。在收集到的病例样本中,与非MPM胸膜组织相比,NEK2...     

桂西地区109例乳腺癌患者TOP2A基因变异的临床病理意义分析

目的研究桂西地区乳腺癌患者TOP2A基因变异的临床病理意义。方法收集来自右江民族医学院附属医院的乳腺癌患者病理标本109例,用荧光原位杂交法检测乳腺癌组织样本TOP2A与HER2基因的变异情况,而乳腺癌其他临床病理分子标志物HER2蛋白、ER、PR、Ki67等通过免疫组织化学方法检测,通过χ~2检验等方法分析TOP2A基因变异与这些分子标志物等临床病理特征的相关性。结果 109例患者中有26例TOP2A与HER2共扩增病例,4例TOP2A缺失HER2扩增,1例TOP2A缺失HER2未扩增(P<0.05),TOP2A基因变异与淋巴结转移、组织分级相关(P<0.05);但与患者年龄、肿瘤大小、乳腺癌分子分型无关(P>0.05)。结论乳腺癌TOP2A基因变异与HER2基因变异密切相关。TOP2A基因变异是乳腺癌患者预后不良的指标。     

STAT3、MMP-2蛋白和mRNA在维吾尔族乳腺癌患者中的表达及意义

目的 探讨STAT3和MMP-2在维吾尔族乳腺癌患者中的表达及其临床意义。方法运用RT-PCR和免疫组化方法检测STAT3、MMP-2蛋白和mRNA在80例维吾尔族乳腺癌和30例正常乳腺组织中的表达。比较两者在不同临床病理学特征乳腺癌组织中表达的差异,分析两者的关系;COX回归分析影响维吾尔族乳腺癌的预后因素。结果乳腺癌组织中STAT3和MMP-2蛋白和mRNA的表达水平明显高于正常乳腺组织（P<0.05）;STAT3和MMP-2蛋白在维吾尔族乳腺癌中的表达呈正相关（P<0.05）;乳腺癌组织中STAT3、MMP-2蛋白的表达与肿瘤大小、组织学分级、淋巴结转移及临床分期有显著相关性（P<0.05）;乳腺癌组织中STAT3、MMP-2 mRNA的相对表达量与淋巴结转移及临床分期有显著相关性（P<0.05）。绘制乳腺癌患者术后60个月生存曲线,STAT3和MMP-2 mRNA低表达组患者生存率明显高于高表达组患者（P<0.05）。结论STAT3和MMP-2蛋白和mRNA表达高的维吾尔族乳腺癌可能更具有侵袭性,预后更差。STAT3和MMP2在维吾尔族乳腺癌发生、发展过程中可能发挥着重要作用,是乳腺癌患者独立的预后因子。     

RASSF1A基因在乳腺癌组织中的表达及意义

目的 探讨RASSF1A基因mRNA在乳腺癌组织中的表达与乳腺癌临床病理特征的关系.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测40例乳腺癌组织和15例乳腺良性病变即乳腺增生病组织中RASSF1A mRNA的表达水平.结果 ①RASSF1A mRNA在乳腺增生病组织中全部表达,在40例乳腺癌组织中有21例表达缺失,缺失率为52.5%;②在乳腺癌组织中淋巴结有转移者RASSF1A mRNA的表达率明显低于淋巴结无转移者,RASSF1A mRNA的表达缺失与淋巴结转移呈负相关(P<0.05);与年龄、组织学分级及雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)及CerbB-2蛋白的表达没有明显的相关性(P>0.05).结论 RASSF1A基因表达缺失可能与乳腺癌的发生、发展过程及其预后存在着一定的相关性.     

基于生物信息学分析SLC44A4基因在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的 通过分析生物信息数据库,探讨胆碱转运蛋白样蛋白SLC44A4基因在乳腺癌中的表达及其临床意义.方法 检索Oncomine数据库,分析SLC44A4基因在不同类型肿瘤中的表达情况;检索基因表达谱动态分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)数据库,对比乳腺癌组织与正常乳腺组织之间SLC44A4基因的表达差异,分析该基因的表达水平与乳腺癌临床病理分期的关系.利用Kaplan-Meier Plotter在线分析SLC44A4基因表达水平与乳腺癌患者预后的关系.检索肿瘤单细胞(CancerSEA)数据库分析SLC44A4基因与乳腺癌单个细胞功能状态的相关性.结果 SLC44A4在多种肿瘤组织中高表达.与正常乳腺组织相比,乳腺癌组织中SLC44A4基因的表达明显升高(P＜0.05),且不同临床病理分期和分型的乳腺癌患者SLC44A4基因表达水平比较差异有统计学意义(P＜0.05).从总体来看,SLC44A4基因高表达组总生存(overall survival,OS)期高于低表达组(P＜0.05).此外,SLC44A4基因的表达与乳腺癌细胞的侵袭、细胞周期、DNA修复呈正相关性.结论 SLC44A4基因在乳腺癌组织中高表达,与患者预后相关,并与乳腺癌细胞功能存在一定相关性.     

NUF2 基因在乳腺癌中的表达及临床意义

目的探讨细胞分裂相关基因NUF2在乳腺癌的表达及临床意义。方法利用Oncomine数据库检测NUF2在乳腺癌组织 中的表达情况,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析NUF2表达与乳腺癌患者总生存期和无复发生存期的关系,利用GEO数据 库及GSEA分析NUF2对基因集富集的影响。利用String数据库分析与NUF2相关的蛋白并通过TIMER数据库验证NUF2表 达情况与BUB1、MAD2L1、MYC表达情况的相关性。利用q-PCR验证在8对乳腺癌组织与配对的癌旁正常乳腺组织中,NUF2 的mRNA表达情况。结果与正常乳腺组织相比,NUF2在乳腺癌中高表达（P<0.001）,且高表达组比低表达组具有较短的总生 存期（HR=1.52,P=0.015）和无复发生存期（HR=1.85,P<0.001）。NUF2高表达组的乳腺癌样本主要富集在细胞周期、P53、G2/ M、DNA修复、MYC和PI3K-AKT-MTOR信号通路,这些通路主要与肿瘤的增殖、侵袭、转移和干性相关。结合String、基因集 富集以及TIMER的结果,NUF2可能与BUB1、MAD2L1、MYC直接相互结合作用,促进乳腺癌的进展。q-PCR实验结果显示在 8对配对乳腺癌组织中,6例癌组织中NUF2表达上调,2例癌组织中NUF2表达下调。结论NUF2基因在乳腺癌中高表达,其表 达水平对预测乳腺癌患者的预后具有重要意义。     

RASSFIA基因启动子甲基化与乳腺癌相关性研究

目的:研究抑癌基因RASSF1A在乳癌组织中的表达情况及与RASSF1A基因启动子甲基化的关系。方法:运用RT-PCR方法检测40例乳癌组织和6例乳腺良性肿瘤和5例正常乳腺组织中RASSF1A的表达,运用甲基化特异PCR方法检测这些组织中RASSF1A基因启动子的甲基化情况。结果:RASSF1A基因在40例乳腺癌组织中8例(20%)存在表达缺失,差异无统计学意义(P>0.05)。但其表达量明显低于正常乳腺组织(P<0.05)。乳腺癌组织的RASSF1A基因启动子甲基化频率(65%)明显高于正常乳腺组织(20%)和乳腺良性肿瘤(17%)(P<0.05)。结论:乳腺癌组织中RASSF1A基因启动子的高甲基化是引起RASSF1A基因表达下调的重要原因,在肿瘤的发生和发展中起重要的调控作用。     

DCTPP1基因在乳腺癌中的表达及其生物信息学分析

目的 利用肿瘤数据库挖掘数据分析DCTPP1基因在乳腺癌组织中的表达及与患者预后的相关性,探讨DCTPP1基因的生物学作用及功能.方法 利用ualcan数据库分析乳腺癌组织中的DCTPP1基因mRNA表达水平,利用Human Protein Reference Database数据库分析不同病理类型乳腺癌组织中DCTPP1蛋白表达水平,采用GEPIA乳腺癌数据分析DCTPP1基因的表达水平与乳腺癌患者预后的相关性.在gene-mania和WebGestalt数据库对与DCTPP1基因表达相关基因及其功能进行生物信息学分析,探讨基因功能.结果 与正常乳腺组织比较,乳腺癌组织中DCTPP1基因mRNA呈高表达(P<0.05).不同病理类型、不同肿瘤分期的乳腺癌组织中DCTPP1基因均呈高表达(P<0.05).乳腺癌组织中DCTPP1蛋白表达水平高于正常乳腺组织.与低表达比较,DCTPP1基因高表达明显降低乳腺癌患者总体生存时间(HR=1.9,P<0.05).基因功能分析提示与DCTPP1表达相关的20个基因主要位于细胞质、细胞核及细胞膜性结构中,参与细胞的代谢、生物调节、细胞生长等过程,在结合蛋白、酶活性、结合核酸等过程中发挥着作用.结论 DCTPP1基因在乳腺癌中明显高表达,与乳腺癌患者不良预后相关,参与多种生物过程,可能成为乳腺癌治疗干预的新靶点.     

癌/睾丸抗原TEX14与侵袭转移性乳腺癌患者的预后

目的探讨癌/睾丸抗原TEX14与乳腺癌转移及患者预后的关系。方法利用Oncomine网站对目前已知的所有癌/睾丸抗原(CTAs)、促进乳腺癌转移基因AKT2、CD44、EIF4E、ERBB2及抑制乳腺癌转移基因BRMS1、CD82、KISS1、TIMP1在侵袭性和非侵袭性乳腺导管癌中m RNA表达情况进行筛查和分析。利用免疫组化方法检测乳腺癌组织标本的癌细胞TEX14蛋白表达情况。利用TCGA数据库1 102例乳腺癌样本mRNA高通量测序数据,分别对TEX14与多个乳腺癌转移相关基因mRNA表达量进行相关性分析。采用Kaplan-Meier生存曲线和Logrank检验法分析TEX14的表达与乳腺癌患者预后的关系。结果与非侵袭性乳腺导管癌相比,在侵袭性乳腺导管癌中,86个CTAs mRNA表达量升高,其中TEX14升高倍数最大为3.344倍(P0.05);促进乳腺癌转移基因AKT2、CD44、EIF4E、ERBB2 mRNA表达量升高,且与TEX14的表达呈正相关(P0.05);抑制乳腺癌转移基因BRMS1、CD82、KISS1、TIMP1 mRNA表达量降低,且与TEX14的表达呈负相关(P0.05)。进一步利用免疫组化实验证明,与无转移组相比,有转移组乳腺癌细胞TEX14阳性细胞率升高1.5倍(P0.05)。TEX14高表达组乳腺癌患者总生存期较低表达组明显缩短(P0.05)。结论癌/睾丸抗原TEX14在侵袭转移性乳腺癌中高表达,与患者的不良预后相关,为进一步研究TEX14可促进乳腺癌转移提供了实验依据。     

BRCA2在散发性乳腺癌组织中的表达及意义

目的:探讨乳腺癌易感基因2(BRCA2)在散发性乳腺癌组织中的表达及意义,了解BRCA2蛋白的表达与雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)及原癌基因C-erbB-2之间的相关性。方法:采用免疫组化法(SABC)对32例乳腺癌患者癌组织、癌旁组织及正常乳腺组织中BRCA2、C-erbB-2、ER、PR蛋白的表达进行检测并结合年龄、病理组织学分级、腋淋巴结转移情况进行相关性分析。结果:BRCA2在乳腺癌组织中表达的阳性率为56%,而在癌旁及正常乳腺组织中无阳性表达(P<0.05)。BRCA2蛋白的表达在乳腺癌不同组织学分级中有差异(r=0.372 8,P<0.05);与腋下淋巴结转移之间比较差异有显著性(r=0.362 2,P<0.05),但与发病年龄、ER、PR、C-erbB-2表达之间未见相关性。结论:BRCA2蛋白的表达与组织学分级高、腋淋巴结转移相关。BRCA2蛋白的检测有可能成为评估乳腺癌生物学行为和预后的新指标。     

乳腺癌CIP2A蛋白表达及与预后关系的研究

目的 探讨乳腺癌蛋白磷酸酶2A癌性抑制因子(CIP2A)蛋白表达情况及其与患者预后的关系.方法 采用免疫组织化学法检测76例乳腺癌患者乳腺癌组织和癌旁组织中CIP2A蛋白的表达情况,并以正常乳腺组织作为对照组.记录患者3年生存状况,分析CIP2A表达情况与生存状况的关系.结果 乳腺癌组织中CIP2A表达阳性率显著高于癌旁组织和正常组织(P<0.05),癌旁组织CIP2A表达阳性率显著高于正常组织(P<0.05).CIP2A蛋白表达阳性与乳腺癌患者组织学分级和病理分期具有相关性,随分级和分期的提高而增加,与患者年龄和肿瘤大小无关.CIP2A表达阳性患者3年疾病无进展率显著低于阴性患者(P<0.05).结论 CIP2A在乳腺癌发生发展中发挥重要作用,是影响患者预后的重要因素.     

端粒酶基因hTR在乳腺癌组织中的表达

目的研究端粒酶基因hTR在乳腺癌组织和乳腺纤维腺瘤中的表达及意义。方法应用原位杂交的方法检测端粒酶基因hTR在30例乳腺癌和25例乳腺纤维腺瘤中的表达。结果30例乳腺癌中hTR表达阳性率为90%,25例乳腺纤维腺瘤中为16%,乳腺癌组织中hTR的表达与乳腺纤维腺瘤比较差异有显著性(P<0.01)。乳腺癌组织中hTR的表达与肿瘤分型、淋巴结转移、肿瘤大小无相关性(P>0.05)。结论端粒酶基因hTR表达检测在乳腺癌诊断中有一定价值。     

miR-125a和miR-206在乳腺癌中的表达及临床意义

目的:探讨miR-125a和miR-206在乳腺癌中的表达及临床意义.方法:应用Real-time PCR检测35例乳腺癌组织及其癌旁乳腺组织中miR-125a和miR-206的表达,用免疫组化检查乳腺癌中雌激素受体(ER)和孕激素受体(PR)的表达,荧光原位杂交技术检测人类表皮生长因子受体2(HER-2)和DNA拓扑异构酶2A(TOP2A)表达;分析miR-125a和miR-206与乳腺癌患者年龄、月经、淋巴结状态、HER-2、TOP 2A、ER、PR的表达等临床病理特征的相关性.结果:miR-125a和miR-206在乳腺癌组织中的表达水平显著低于癌旁组织,miR-125a高表达与淋巴结阴性、HER-2阴性、TOP 2A阴性具有相关性(P＜0.05),与乳腺癌患者肿瘤大小、年龄、月经状态、ER、PR无相关性.miR-206的高表达与较小的肿瘤体积、ER阴性、PR阴性、HER-2阴性具有相关性(P＜0.05),与乳腺癌患者年龄、月经、淋巴结状态及TOP 2A的表达程度无关.结论:miR-125a和miR-206在乳腺癌发生发展过程中可能发挥重要作用,对指导HER-2阳性和三阴性乳腺癌的治疗有重要临床意义.     

DCTPP1基因在乳腺癌中的表达及其生物信息学分析

目的 利用肿瘤数据库挖掘数据分析DCTPP1基因在乳腺癌组织中的表达及与患者预后的相关性,探讨DCTPP1基因的生物学作用及功能.方法 利用ualcan数据库分析乳腺癌组织中的DCTPP1基因mRNA表达水平,利用Human Protein Reference Database数据库分析不同病理类型乳腺癌组织中DCTPP1蛋白表达水平,采用GEPIA乳腺癌数据分析DCTPP1基因的表达水平与乳腺癌患者预后的相关性.在gene-mania和WebGestalt数据库对与DCTPP1基因表达相关基因及其功能进行生物信息学分析,探讨基因功能.结果 与正常乳腺组织比较,乳腺癌组织中DCTPP1基因mRNA呈高表达(P<0.05).不同病理类型、不同肿瘤分期的乳腺癌组织中DCTPP1基因均呈高表达(P<0.05).乳腺癌组织中DCTPP1蛋白表达水平高于正常乳腺组织.与低表达比较,DCTPP1基因高表达明显降低乳腺癌患者总体生存时间(HR=1.9,P<0.05).基因功能分析提示与DCTPP1表达相关的20个基因主要位于细胞质、细胞核及细胞膜性结构中,参与细胞的代谢、生物调节、细胞生长等过程,在结合蛋白、酶活性、结合核酸等过程中发挥着作用.结论 DCTPP1基因在乳腺癌中明显高表达,与乳腺癌患者不良预后相关,参与多种生物过程,可能成为乳腺癌治疗干预的新靶点.