铁皮石斛互补脱氧核糖核酸表达文库的构建及分析

构建铁皮石斛互补脱氧核糖核酸(cDNA)表达文库,为克隆石斛活性成分生物合成相关功能基因的全长奠定基础。【方法】以Trizol一步法从4年生的铁皮石斛中提取总RNA,分离纯化mRNA,LD-PCR(long distance polymerase chain reaction)法反转录合成双链cDNA,以λTripIEX2为载体,构建铁皮石斛cDNA文库,文库滴度以每mL含噬菌斑形成单位 (pfu)的数目来表示,PCR扩增鉴定插入片段。【结果】成功地构建了铁皮石斛cDNA表达文库,原始文库的噬菌斑滴度为 4．3×105pfu/mL,总克隆数为3．1×105,重组率为97．6％,扩增后文库总滴度为6．8×109 pfu／mL,对随机挑取的噬菌斑进行 PCR鉴定,结果插入片段多分布在0．5～2．0kb之间,绝大部分在1．2～1．7 kb左右。【结论】文库质量鉴定结果表明,所构建的铁皮石斛cDNA文库具有较好的库容量、较高的重组率以及较大的插入片段。     

人上皮性卵巢癌组织cDNA表达文库的构建

目的为进一步获得人卵巢癌相关抗原基因,构建人上皮性卵巢癌组织cDNA表达文库.方法从人上皮性卵巢癌组织提取总RNA,分离纯化mRNA,并以此为模板合成第1链cDNA,用置换法合成第2链cDNA.双链cDNA经末端削平、EcoR Ⅰ接头连接、XhoⅠ酶切、过柱分级分离,除去<400 bp片段,收集符合需要的cDNA片段与噬菌体ZAP Express载体连接,体外包装后获得人卵巢癌组织cDNA表达文库.结果经检测该原始文库滴度为5.5×106 pfu/ml,扩增后文库滴度为3.0×1011 pfu/ml,重组率96%.插入片段平均大小1.0 kb以上.结论所构建的人上皮性卵巢癌组织cDNA表达文库质量合格,为以后筛选获取卵巢癌特异性相关抗原基因或其它相关基因奠定了基础.     

人乙型肝炎肝硬化组织cDNA文库的构建及鉴定

目的:构建人乙型肝炎肝硬化组织cDNA文库,为筛查与乙型肝炎肝硬化的发生特异相关的基因及探讨乙型肝炎肝硬化的发病机制奠定基础.方法:用Trizol方法提取人乙型肝炎肝硬化组织总RNA,并用mRNA纯化试剂盒进行mRNA纯化;反转录合成单链cDNA,长距离PCR方法合成双链cDNA;PCR产物经蛋白酶K水解、纯化后,用Sfi I酶切;将酶切产物进行分级分离,回收0.4 kb以上的cDNA组分,并与λTripl Ex2载体连接;连接产物经体外蛋白包装,产生未扩增文库;鉴定文库的滴度和重组效率后,进行文库扩增;鉴定扩增文库的滴度和重组效率;随机挑取11个噬菌斑,用载体克隆位点两端的通用引物进行PCR扩增,以检测所构建的cDNA文库的质量.结果:未扩增文库滴度为1.03×106 pfu/ml,重组效率为97.24%,扩增后文库滴度为1.36×109 pfu/ml,重组效率为99.02%;用载体两端的通用引物进行PCR鉴定,插入片段平均长度为1.02 kb,含1 kb以上的占36.36%,0.5～1 kb的占63.64%.结论:已成功构建一高质量的人乙型肝炎肝硬化组织cDNA文库,为筛查与乙型肝炎肝硬化的发生特异相关的基因及探讨乙型肝炎肝硬化的发病机制奠定了基础.     

恒河猴(Macaca mulatta)肝脏cDNA文库的构建

目的 构建正常恒河猴的肝脏组织cDNA表达文库,以筛选恒河猴的相关基因并提供其作为医学研究动物模型的遗传学依据.方法 提取正常恒河猴肝脏组织总RNA,纯化的mRNA反转录合成cDNA,连接EcoR Ⅰ接头,经XhoⅠ酶切并用CHROMA SPIN-400分离cDNA,将大于500 bp的cDNA片段连接于λ ZAP表达载体,体外包装后转染至XL1-Blue MRF'宿主菌中,再扩增文库.对cDNA文库的滴度、重组率和插入片段的大小进行检测.结果 初始文库的库容量为1.2×106 pfu,初始文库和扩增文库的滴度分别为1.1×106 pfu/mL、 7.7×109 pfu/mL,重组率分别为99.3%、98.2%,插入片段平均长度分别为2.0 kb、2.3 kb.结论 成功构建了恒河猴肝脏组织的cDNA表达文库,为同种和异种移植以及移植相关药物临床前研究奠定了良好的基础.     

屋尘螨cDNA表达文库的构建及初步鉴定

目的构建屋尘螨cDNA表达文库. 方法用RNAiso Reagent试剂盒提取屋尘螨Total RNA,用Poly AT tract mRNA分离试剂盒提取mRNA,用Clontech公司SMARTTM PCR cDNA library kit反转录合成第1链cDNA,用LD-PCR合成第2链cDNA并扩增,PCR产物与MaxPlax TM试剂盒体外连接包装,建成未扩增的cDNA文库,计算其滴度和重组效率后进行文库扩增并测定扩增文库的滴度. 结果cDNA文库未扩增时滴度为9.148×106,重组效率达93.88%以上,文库扩增后滴度为7.628×109,插入片段平均1.63 kb. 结论成功地构建了高质量的屋尘螨cDNA表达文库.     

RACE法在连翘花蕾全长cDNA文库构建中的应用

目的建立新的连翘花蕾全长cDNA文库构建方法。方法应用GeneRacer^TM试剂盒,采用改良RNA连接酶介导的快速扩增cDNA末端（RNA ligase-mediated rapid amplication of cDNA ends,RLM—RACE）技术构建连翘花蕾全长的cDNA文库,通过计算菌落数、蓝白斑数、酶切鉴定、序列分析等手段评价文库质量。结果通过增加模板用量的方法成功构建了连翘花蕾全长cDNA文库,该文库容量为3．47&#215;10^5,重组率为81．6％,插入片段多集中在500—1000bp之间,所占比例为71％;随机测序的cDNA克隆中均含有完整开放阅读框的全长cDNA序列。结论应用RACE法成功构建了连翘花蕾全长cDNA文库。     

云南个旧肺鳞癌YTMLC细胞cDNA文库构建和鉴定

目的构建云南个旧人肺鳞癌YTMLC-90细胞cDNA文库。方法从培养的人肺鳞癌YTMLC-90细胞株中提取总RNA,利用经修饰的oligo(dr)引物(含S6 ⅠB酶切位点)合成cDNA第一链,同时根据真核生物mRNA5’端帽子结构特点。利用SMART寡核苷酸(含S6 Ⅰ A酶切位点)作为cDNA第一链在mRNA5’端延伸出去的模板,进而以此序列为引物,利用LD-PCR(long-distance PCR)合成双链cDNA,双链cDNA经S6Ⅰ(ⅠA和ⅠB)酶切和过柱分级分离后,克隆入经S6Ⅰ酶切的载体后经体外包装而成cDNA文库。结果人肺癌细胞YTMLC-90的cDNA文库获得1.01×10~6pfu/ml个重组子,重组率为93.2％,文库扩增后,滴度达5.24×10~6pfu/ml,插入cDNA的长度为750～3000bp。结论所构建的cDNA文库具有较好的质量,该文库为进一步筛选、克隆肺癌特异表达基因奠定了基础。     

利用SMART技术构建中国人肝组织cDNA酵母双杂交文库

目的: 针对人类肝脏蛋白质组计划中大规模基因克隆及构建肝脏蛋白相互作用图谱的研究需要,改造酵母双杂交载体pPC86和pDBleu,并构建中国人肝组织cDNA文库,为肝脏蛋白质组计划的研究奠定基础。 方法: 设计并合成特定寡核苷酸序列,经过处理形成具有黏性末端的双链DNA片段,插入到pPC86、pDBLeu载体相应的酶切位点处,从而获得改造的新载体。利用改造后的载体、中国人正常肝组织mRNA和Clontech公司SMART文库构建试剂盒构建NpDBLeu-cDNA文库。 结果: 酶切鉴定和DNA测序证实改造后载体插入位点和序列正确,成功获得新载体NpPC86和NpDBLeu。滴度测试表明,所构建NpDBLeu肝组织cDNA文库容量为1.93×10⁶ cfu,转化子重组效率为95.2%,扩增文库达到109cfu·mL^-1。 结论: 利用SMART技术成功构建了中国人肝组织cDNA酵母双杂交文库。     

含人血红素氧化酶-1重组11P型腺病毒的构建及体外表达

目的构建含人血红素氧化酶-1重组11P型腺病毒,并使之转染人BJ细胞,测定其转染效率及目的蛋白表达情况。方法PCR目的基因序列,克隆成穿梭载体后转化大肠肝菌。扩增提取质粒,鉴定正确后与骨架载体重组,鉴定重组质粒正确并无野毒后在293细胞中扩增,CsCl密度梯度离心法纯化腺病毒,按不同梯度MOI值感染成纤维细胞,根据绿色荧光强度检测其转染效率。1周后用免疫组化方法检测目的蛋白HO—1表达情况。结采对重组腺病毒进行酶切和PCR鉴定,证实含人血红素氧化酶－1（HO－1）的11P型重组腺病毒构建成功,纯化后病毒滴度达到1．0×10^10pfu／ml。通过免疫组化检测可在成纤维细胞中观察到胞浆内有棕褐色目的蛋白阳性颗粒表达。结论可以成功构建含人血红素氧化酶－1（HO－1）的11P型重组腺病毒并表达目的蛋白。     

常氏肝癌细胞cDNA文库的构建及质量分析(英文)

目的　利用 RNA转录 5′末端转换机制 (SMART)构建适合免疫筛选的经去分化培养基处理的常氏肝癌细胞 c DNA文库。方法　通过反转录 PCR和长距离 PCR获得常氏肝癌细胞的全长 c DNA,然后利用 SMART c DNA文库构建试剂盒建立经去分化培养基处理的常氏肝癌细胞c DNA文库。结果　通过测定 ,高质量的包含常氏肝癌细胞全长 c DNA的 c DNA文库得到建立 ,扩增 c DNA文库的滴度高达 4.5× 10 10 pfu· ml- 1,重组子内平均插入外源基因片段长度在 2 0 0 bp到 40 0 0 bp之间 ,约 150 0 bp左右 ,并且此文库适合免疫筛选。结论　结果显示所构建的经去分化培养基处理的常氏肝癌细胞 c DNA文库具有很高的质量 ,为进一步研究常氏肝癌细胞和筛选相关基因获得 c DNA全长奠定了坚实的基础     

重组腺病毒TGF-β的扩增及病毒滴度检测

目的：探讨高效扩增腺病毒载体的方法。方法：用人胚胎肾细胞株扩增重组腺病毒，并测定病毒滴度。结果：扩增病毒滴度约为5×10^8pfu／mL。结论：用人胚胎肾293细胞株扩增重组腺病毒，在不进行任何浓缩时可达到较高病毒滴度，为腺病毒介导的基因转载提供了有效途径。     

人源性胃癌抗体IgG1Fab噬菌体表面展示文库的构建

目的　利用噬菌体表面展示技术 ,构建人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .方法　从胃癌手术患者胃一级站淋巴结中提取总 RNA,反转录成 c DNA后 ,用PCR扩增人 Ig G1Fd段及κ轻链 ,并克隆至噬菌粒载体p COMB3中 ,转化宿主菌株 XL 1- Blue,以辅助噬菌体M13K0 7超感染噬菌粒文库 ,构建成人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .结果　得到一个含克隆数为 1.2× 10 6 ,实际滴度约为 2 .5 6× 10 1 5 pfu· L- 1的 Ig G1Fab片段的噬菌体表面展示文库 .结论　Ig G1Fab片段的噬菌体表面展示文库的成功构建 ,为下一步利用亲和富集筛选技术 ,获得具有胃癌表面抗原结合活性的融合抗体及可溶性抗体奠定了基础     

AchR特异性TsF cDNA文库的构建及筛选

目的　构建 Ach R特异性 Ts F c DNA文库并对该文库进行筛选。方法　从建立的分泌 Ach R- Ts F的特异性 Ts细胞系中直接提取了 Ts F Poly A+ m RNA,反转录合成全长 c DNA,以脱磷酸化的λgt11Eco RI臂为载体 ,体外包装成噬菌体颗粒并转染 E.coli Y 10 90 hsd R,得到 c DNA文库 ,并用 TCR-α单克隆抗体膜上免疫印迹法对该文库进行筛选。结果　重组噬菌体的滴度约为 1.4× 10 7pfu/ m l,阳性重组率为 86 .9% ,重组噬菌体 DNA的酶切电泳分析证实插入片段大小在 0 .8～ 4 .0 kb之间。初步筛到 2 7个阳性重组噬菌体 ,其插入片段大小约为 1kb左右。结论　该文库的建立有望获得持续高效表达 Ach R特异性 Ts F的重组噬菌体     

重组表达人IDO基因慢病毒载体的构建及鉴定

目的:构建重组表达人吲哚胺2,3-过氧化酶（IDO）基因的慢病毒载体。方法:设计相应引物,从含有人IDO基因的cDNA文库中,利用聚合酶链反应（PCR）方法钓取人IDO基因的全长编码区片段。将目的基因与经酶切线性化的慢病毒载体pGC-FU进行定向的连接,将产物转化细菌感受态细胞。对长出的克隆进行菌落PCR鉴定,并对阳性的克隆进行测序及比对分析。重组慢病毒及辅助包装质粒共转染293T细胞,荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白（GFP）的表达情况;采用Wester blot 检测IDO-GFP融合蛋白的表达情况;实时荧光定量PCR检测慢病毒浓缩液的滴度。结果:成功获取人IDO基因编码区序列,人IDO基因慢病毒转染质粒连接正确;293T细胞中产生慢病毒颗粒;IDO基因在细胞内稳定表达;人IDO基因重组慢病毒载体的滴度为2×108 TU/ml。结论:成功构建并包装出高滴度的人IDO基因重组慢病毒表达载体,为下一步转染目的细胞奠定了实验基础。