湖州市不同感染人群HIV-1流行毒株亚型分析

目的了解湖州市HIV-1型流行毒株的基因型分布情况,为艾滋病防治工作提供科学依据。方法采集204份HIV-1型抗体阳性的全血标本,从样本中提取病毒RNA,采用巢式PCR方法扩增病毒gag基因,对PCR产物进行核苷酸序列测定。应用Clustal W软件对测序结果和HIV分型参考株序列进行多序列比对和分析;使用MEGA 4.0软件进行系统进化分析。结果 204份标本有138份样品扩增出HIV-1的gag基因片段,共存在4种HIV-1亚型和重组型。其中CRF07_BC重组亚型74株(53.62%)、CRF01_AE重组亚型40株(28.99%)、B亚型12株(8.69%)、CRF08_BC重组亚型12株(8.69%)。异性、同性性传播以CRF07_BC和CRF01_AE为主;注射吸毒传播以CRF07_BC为主。结论湖州市不同感染人群中主要存在4种基因亚型,CRF07_BC已成为湖州市不同感染人群中HIV主要流行亚型,重组型毒株占优势,应加强对HIV-1流行毒株亚型变异的监测,及时调整防控策略。     

陕西省HIV-Ⅰ流行毒株亚型分析

目的 了解陕西省近年来发现的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者所携带毒株的基因序列特征、亚型种类和毒株来源以及在各高危人群中的分布,推断其传播来源和流行趋势,为本省艾滋病防治工作提供技术资料.方法 对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集HIV感染者抗凝全血,提取前病毒DNA,应用套式聚合酶链式反应(nested-PCR)扩增其膜蛋白基因env,对其C2～V3区及邻区的核苷酸序列进行测定,用GCG软件(Wisconsin 公司)进行亚型分析.结果 35份样本PCR扩增阳性并得到相应序列.经基因离散率计算和系统树分析,共发现4种HIV-1基因亚型和重组毒株,即HIV-1 B'、C、CRF01-AE和CRF-BC重组型.其中泰国B'亚型为主要流行株,占82.35%(28/34),主要来源于既往采供血者及其配偶;其次是CRF-BC重组型,占11.77%(4/34),主要来源于吸毒人群:CRF01-AE和C亚型各1份,分别占2.94%,均来自劳务输出的归国人员.该组样本B'亚型内的基因离散率为5.2%(n=23);而CRF-BC亚型内的基因离散率为0.9%(n=3),彼此间显示出较近的传播关系.结论 陕西省HIV-1流行株以泰国B'亚型为主,发生在与既往有偿采供血相关的地区和人群,已有6～7年的流行史;首次在当地吸毒人群中发现HIV-1 CRF-BC重组型,并且显示近期高度流行的趋势.加强对既往有偿献血人群和吸毒人群的行为干预,控制HIV病毒在家庭内和吸毒人群中的传播,将是今后本省艾滋病防治工作重点之一.     

海南省HIV-1基因亚型分析

目的 分析海南省人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)基因亚型,监测HIV毒株的流行状况.方法 从88份HIV-1抗体阳性的血浆中提取RNA,逆转录后采用PCR法扩增HIV-1基因序列中的env及pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,经比对分析而确定基因亚型.构建最大似然(ML)进化树,分析感染者间的传播链.结果 88份样品中,有83份样品被扩增出HIV-1的env及pol基因片段;共发现6种HIV-1亚型和重组型,其中CRF01-AE亚型70份,B'亚型8份,C亚型2份,B亚型和CRF08-BC、CRF01-AE/B'重组亚型各1份.在ML进化树上83份样品分成4个传播群(66/83)和非传播群(17/83),其中传播群1最庞大(59/83).结论 海南省HIV/AIDS的HIV-1基因亚型至少有6种,其中CRF01-AE为主要亚型,占84.33%(70/83),主要分布在静脉吸毒者及其性伴侣之间,形成了一个庞大的传播群.其次为B'亚型(9.6%).另外的4种亚型(6%)仅见单个病例.提示海南省静脉吸毒为主要的感染途径(67.5%);经性接触传播的亚型种类复杂多样,包括本次检出的全部亚型和重组株.     

天津市不同感染途径HIV-1感染者流行毒株亚型分析

目的 了解天津市HIV-1毒株的流行情况,比较不同感染途径HIV-1感染者中流行毒株的亚型分布.方法 采集100例感染途径已知的HIV-1感染者抗凝全血标本,提取DNA,用巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因,并进行序列测定和亚型分析.结果 100份样品中,有87份样品被成功扩增出HIV-1的gag基因片段,通过系统进化分析,确定天津市HIV-1流行毒株分属4个亚型和重组型,其中CRF01 _AE比例最大,达59.77％(52/87),主要分布在通过同性和异性性传播的HIV-1感染者中,而在通过静注吸毒感染的HIV-1感染者中以CRF07_BC亚型为主.结论 天津市HIV-1流行株至少有4种基因亚型,且不同感染途径HIV-1感染者流行毒株的亚型分布略有不同,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略.     

维吾尔族HIV-1感染者gag基因序列分型研究

目的 通过扩增乌鲁木齐维吾尔族HIV-1感染者gag基因片段,确定该民族HIV-1感染者流行株的基因亚型. 方法 对68例新疆乌鲁木齐市HIV-1感染者的血浆标本的RNA,用巢式PCR扩增gag基因片段,将所得到的序列与国际标准株进行比较,确定被检标本的亚型. 结果 在68例HIV感染者的血浆标本中,共成功扩增35例gag基因片段,扩增率为51.47％.经BLAST初步判断和构建进化树并与国际标准株比对确认,35例感染者感染的HIV毒株序列中,发现均为CRF07_ BC亚型.35例毒株之间的平均基因距离为(0.043±0.003),与3例CRF07_ BC亚型国际参考株之间的平均基因距离在(0.034±0.004) ～(0.039±0.005)之间. 结论 新疆乌鲁木齐市HIV-1感染者以CRF07_ BC亚型为主要流行株.35例序列相互之间以及与3株不同来源的国际参考毒株之间表现出高度的同源性.     

湖北省HIV-1分子流行病学研究

目的了解湖北省HIV-1基因型分布特征。方法对湖北省HIV-1主要流行区域进行流行病学调查，应用巢式聚合酶链反应对其中102例HIV-1感染者的env基因V3～V4区、gag基因P17/P24区和tat基因第一外显子区进行扩增，对各基因区阳性扩增样本进行序列测定，并对各基因区核苷酸进行序列分析。结果所有目标人群中共存在B^＋、C2种亚型以及CRF08-BC和CRF01-AE2种重组毒株，B^＋亚型在人群和地域上分布最广，涉及献血员、受血者以及二者的配偶和性乱人群，主要分布既往有偿献血员集中的地区。CRF08-BC、CRF01-AE重组主要涉及性乱人群，分布于经济发达的城市或地理位置偏南方的地区。C亚型为离散病例，主要涉及静脉毒品注射者。结论湖北省已由既往单一HIv-1 B^＋亚型转变为多种亚型、重组亚型流行的复杂局面，各亚型在省内高危人群和地域分布不平衡，各有特点，从总的亚型流行特征来看，HIV-1在湖北省有加快流行和进一步复杂化的趋势。     

郑州市男男性行为人群HIV-1毒株变异特征及其与既往有偿供血感染者的关系

目的 分析郑州市男男性行为者(MSM)中HIV感染者的毒株变异特点及其与当地有偿供血者中流行毒株的关系.方法 以郑州市2010年确证的31例MSM的HIV感染者和41例既往有偿供血HIV感染者为研究对象,采集血标本并收集流行病学信息.RT-PCR法扩增全部研究对象的HIV-1 gag、pol全长基因(分别为1584 bp和3147 bp)及env基因的C2V3片段(558 bp)并测序,使用LosAlamosHIV Database在线工具确定病毒基因亚型、绘制系统进化树并分析可能的传播关系.结果 在72例研究对象中,获得全长gag序列53条、pol序列38条、env(C2V3)序列48条;31例MSM的HIV感染者中,CRF01 AE亚型14例、CRF07_BC亚型5例、B亚型12例(B'亚型11例、B亚型1例),41例既往有偿供血的HIV感染者均为B'亚型.MSM人群的CRF01 AE亚型毒株与河北、辽宁省的毒株关系密切、CRF07 BC毒株与河北省石家庄和北京市的毒株关系密切.在MSM人群中的12条HIV-1 B亚型中,有8条聚集成簇并与1例有偿供血感染者的序列距离最近、2条形成可靠的进化簇且与02HNseq4的序列距离最近,提示MSM人群中的B'毒株可能来自有偿供血员,且在MSM人群中存在传播关系.结论 郑州市MSM人群中流行的HIV-1毒株遗传背景复杂、有多个来源.首次发现目前MSM人群中流行的HIV-1 B亚型毒株主要是B'亚型,可能来自当地的有偿供血人群.     

浙江省HIV-Ⅰ流行毒株GAG基因序列测定和亚型分析

[目的]利用分子生物学方法了解浙江省境内HIV-Ⅰ流行毒株的亚型.[方法]采集14份浙江省检出的HIV-Ⅰ抗体阳性者的抗凝全血,从中提取前病毒DNA作为PCR扩增的模板,设计特异性引物对gag基因区进行扩增并测定其序列.所得序列与国际标准或参考序列进行比较,确定亚型.[结果]14份样本中有9份扩增阳性并得到相应序列,扩增率为64.3%.经过离散率计算和系统树分析后证实4份样本为A/E流行重组模式,3份样本为B亚型,1份样本为B/C流行重组模式,1份样本为G亚型.[结论]目前浙江省境内有多种亚型的HIV-Ⅰ毒株存在.迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预措施以阻断HIV/AIDS的流行和传播.     

湖北省采供血HIV-1感染者分子流行病学分析

目的分析湖北省经采供血感染人类免疫缺陷病毒（HIV-1）流行株的亚型特点和流行规律。方法2005年采集湖北省HIV-1感染者抗凝外周血22份,分离外周血单个核细胞（peripheral blood mononuclear cells,PBM-Cs）,提取前病毒DNA,用巢式PCR方法（nested polymerase chain reaction,nested-PCR）扩增HIV-1病毒gag至pol约3kb的核酸序列,并进行序列测定。应用BioEdit软件对序列排列、比对后,使用Clustal X系统进化树分析,确定亚型,并应用Simplot软件进行重组分析。结果通过巢式PCR扩增以序列测定得到17份样品的序列,根据gag-pol基因序列,与HIV-1亚型国际参考株比较,通过系统进行分析,确定湖北省的17个HIV-1毒株与邻近省份河南省的流行株B′亚型十分接近,均属于泰国B′亚型,并且未发现重组株的存在。结论湖北省经采供血感染的HIV-1流行株属于B′亚型,与河南省有偿献血员流行的HIV-1 B′亚型密切相关。     

2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

目的 了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1（human immunodeficiency virus 1, HIV-1）亚型分布、流行毒株情况。方法 从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合华大基因科技股份有限公司测序。合格序列利用数据库分析亚型以及利用MEGA5构建系统进化树。结果 得到合格的gag基因片段98条序列。来自gag基因片段的序列分析重组流行毒株（circulate recombinant forms, CRFs）的重组亚型CRF01_AE占95.9%（94/98）,异性传播比例为79.8%（75/94）;重组亚型CRF07_BC占4.1%（4/98）。样本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分别为99.0%,100.0%,两两之间传播途径不同。结论 2011-2013年,柳州市HIV-1以重组亚型CRF01_AE为主。柳州市重组亚型CRF01_AE从吸毒人群向异性接触感染人群蔓延。利用系统进化关系结合传播途径,便于分析传染源,为艾滋病干预措施提供有力佐证。     

Divergent HIV and simian immunodeficiency virus surveillance, Zaire

Recent HIV infection or divergent HIV or simian immunodeficiency virus (SIV) strains may be responsible for Western blot-indeterminate results on 70 serum samples from Zairian hospital employees that were reactive in an enzyme immunoassay. Using universal polymerase chain reaction HIV-1, HIV-2, and SIV primers, we detected 1 (1.4%) HIV-1 sequence. Except for 1 sample, no molecular evidence for unusual HIV- or SIV-like strains in this sampling was found.     

江苏省艾滋病病毒感染的分子流行病学研究

目的 了解江苏省不同人群中艾滋病病毒(HIV)各亚型毒株的流行情况和传播规律。方法 收集HIV感染者及患者的流行病学资料；无菌采集HIV感染者或艾滋病(AIDS)患者抗凝全血标本5ml，提取前病毒DNA，用巢式聚合酶链反应(nested—PCR)扩增膜蛋白基因的C2～V3区，进行序列测定，鉴定病毒亚型。用威斯康星GCG软件进行共享序列、基因离散率的计算和毒株的聚类分析。结果 截止2001年底，江苏省已发现HIV-1中的A、B、C、D、E五种亚型和一个B亚型变种(B^ )流行，C(占40．48％)和B^ (38．10％)亚型为主要流行株；静脉吸毒感染人群中86．67％为C亚型，采供血和受血感染人群中91．67％为B^ 亚型，在性途径传播人群中所有六种亚型均有，且分布较为均一。结论有偿献血人群中B^ 亚型毒株由邻省传人，吸毒人群中C亚型毒株的传人主要与新疆籍流动人口的介入有关；多种亚型的并存说明江苏省存在着适宜AIDS流行的各种危险因素；提示今后在药物治疗、疫苗研制以及其他防制工作上将面临更大的困难。     

广西吸毒人群艾滋病的分子流行病学研究

目的用分子生物学、流行病学研究方法研究吸毒人群HIV-1感染的分子生物学和行为学因素、流行特征和趋势,为制定有效的防治措施提供依据。方法问卷调查和HIV-1抗体检测,PCR和荧光标记末端终止物循环测序法检测HIV-1受体基因CCR5△32/△32和核苷酸序列、亚型。结果HIV-1感染率为57.14%。没有发现136-bp△32CCR5突变体。静脉注射率为86%,注射器共用率为47.9%。80.4%和8.9%的吸毒人员分别曾有过异性和同性性行为。HIV-1毒株至少有C、E两个亚型,C亚型为优势亚型,可能存在其它亚型或混合感染,亚型基因变异不大。结论吸毒人群为HIV-1易感人群,静脉吸毒、性交为HIV-1感染的行为因素,HIV-1感染毒株亚型呈多样性,应采取行为干预和针对不同流行毒株亚型的措施来防治HIV-1。     

Human immunodeficiency virus type 1 subtypes in cohort of infected patients, Saint-Etienne, France, from 1984 to 2003

OBJECTIVE: The authors had for aim to study the distribution of HIV-1 subtypes in a cohort of HIV-1 positive patients in the University hospital of Saint-Etienne, France, and to describe the epidemiological characteristics of patients infected with a non-B subtype strain. DESIGN: An epidemiological study was made on 271 HIV-1 positive patients followed up in the Infectious Diseases Department over 20 years. All patients sample were subtyped by serotyping and some samples were also tested by genotyping. RESULTS: Two hundred and sixty-four patients (191 men and 73 women) were found infected by an HIV-1 strain belonging to the M group. After combining serotyping and genotyping results, 195 patients were found infected by a B subtype and 69 by a non-B subtype. Most of the latter strains belonged to an A subtype or related ones. The following factors were shown to be linked to an infection by a non-B strain: being born abroad, having contracted the infection though heterosexual practice, and being a woman. The incidence of non-B strains increased regularly over time (to reach more than 40% in 2003). This progression was especially noted for men born in France with risky sexual behaviour. CONCLUSION: These results indicate that more than 40% of HIV-1 new cases detected in the Saint-Etienne area are related to non-B strains and that strains of A and related subtypes are common in the local population with risky sexual behaviour.     

云南省昆明市HIV-1流行株pol基因序列特征分析

目的 了解云南省昆明市人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)的亚型分布特征及其pol结构基因的变异特征.方法 随机抽取2015-2019年昆明市抗病毒治疗半年以上的样本390例,收集其流行病学信息,血浆提纯HIV-1 RNA,采用巢式聚合酶链式反应扩增...     

PEIA法检测吸毒人群HIV-1血清亚型分析

目的建立PEIA法检测HIV-1血清亚型,了解吸毒人群HIV-1感染毒株的血清亚型分布特征,为疫苗和诊断试剂的研制、使用提供科学依据。方法问卷调查了解一般情况和HIV-1感染行为;ELISA法检测HIV-1的抗体阳性率,,nested-PCR检测HIV-1 evn基因V3区;PEIA法检测HIV-1血清亚型。结果吸毒人群HIV-1感染率为57.14%,感染因素为静脉共用注射器吸毒和无保护性交。HIV-1毒株血清亚型为C、E、EC混合型,以C亚型为优势亚型,同一个体可能同时感染不同亚型的病毒株或出现重组毒株。除了上述亚型外,还存在其他未能检测出来的亚型。结论PEIA法检测HIV-1血清亚型具有快速、简便的特点。吸毒人群HIV-1毒株亚型表现为多样性,应加强其变异的监测和研究。     

山东新泰与湖北襄樊有偿献血员HIV感染对比研究

目的 了解有偿献血员艾滋病病毒（HIV）感染率及基因型别分布状况。方法 采用整群抽样的方法,对山东省新泰市和湖北省襄樊市部分农村645例有偿献血员进行调查,用酶联免疫吸附方法（ELISA）和蛋白免疫和印迹法（WB）对献血员血清进行HIV抗体检测,用特异性引物对HIV毒株进行基因序列分析和亚型测定。结果 献血员HIV感染率为3.26(21/645)不同地区之间存在较大差异,襄樊献血员HIV感染率（9.1%)明显高于新泰献血员（0.5%);有单采浆史者HIV感染率为7.80%,显著高于只献全血者（1.1%);对HIV毒株特定区域的基因序列分析显示,山东和湖北献血人群HIV核酸序列与HIV-1泰国B亚型离散率最小,分别为6.2%和5.01%,其内部基因离散率分别为4.53%和2.92%。结论 我国不同地区间献血人群的HIV感染率存在较大差异,而其感染HIV毒株的基因型分布一致,为HIV-1泰国B亚型,估计传入献血人群3-6年。