海南省2008年手足口病样本核酸检测分析

目的 了解2008年海南省手足口病(HFMD)暴发的病原及主要的病毒型别,为HFMD病例诊断和防控措施提供科学依据.方法 依据卫生部<手足口病预防控制指南>提取HFMD临床诊断病例各种样本中的病毒核酸,用肠道病毒通用引物、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)特异性引物进行逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),检测基因片段大小.结果 274例临床诊断手足口病病例中EV71型核酸阳性、柯萨奇病毒A16核酸阳性、其他型别肠道病毒核酸阳性分别有102,12,35例;样本中疱疹液阳性检出率最高,为72.0%,肛拭子为40.0%,鼻咽拭子为34.8%,其余样本均阴性;54份直接提取病毒核酸进行RT-PCR检测,结果阴性但细胞培养出现细胞病理改变(CPE)的分离物;肠道病毒、EV71型、CoxA16型阳性分别有48,29,4份,阳性率分别为88.89%,53.70%,7.40%;其中1份样本EV71型和CoxA16型均为阳性.结论 引起海南省2008年手足口病暴发流行的主要病原是肠道病毒71型,其次为CoxA16型.     

临海市2010-2011年手足口病病原学监测结果分析

目的了解浙江省临海市2010-2011年手足口病主要病原体型别及分布特征,为手足口病的防控提供病原学依据。方法采用实时荧光RT-PCR方法,对哨点医院定期采集的临床诊断病例样本进行肠道病毒(EV)核酸检测和型别鉴定。结果共采集咽拭子样本157份,检出112例EV阳性病例,阳性率为71.34%;其中EV71阳性病例28例,CoxA16阳性病例33例,分别占EV阳性病例的25.00%、29.46%;5岁以下儿童EV感染占所有感染者的95.54%;2010年和2011年儿童EV71和CoxA16阳性率分别为17.44%、24.42%和18.31%、16.90%,差异无统计学意义(P>0.05);男性病例EV阳性检出率高于女性病例(P<0.05);重症病例EV71阳性检出率为100%。2010-2011年病原构成呈动态变化特征。结论引起临海市手足口病的主要病原体为EV71和CoxA16;5岁以下儿童是EV感染的高危人群;EV71是引起重症病例的主要病原体。     

2008年广西手足口病病原体检测分析

目的了解2008年引起广西手足口病的病原体型别及分布特征,为制定预防控制措施提供实验依据。方法采集手足口病临床诊断病例的疱疹液、咽拭子、肛拭子、粪便等样本,应用RT-PCR方法检测EV、EV71和CoxA16病毒核酸。结果共检测753例手足口病临床诊断病例1 286份样本,422例(56.0%)检测到肠道病毒核酸,其中EV71阳性176例(41.7%),CoxA16阳性36例(8.5%),非EV71、CoxA16肠道病毒阳性210例(49.7%)。全区14个市送检的病例标本均检测到EV71,来宾市等5市EV71检出率大于50%,钦州市和百色市EV71检出率小于20%。25例(89.2%)重症死亡病例中检测到EV71病毒核酸。结论手足口病在广西分布广,病原体组成复杂,引起广西2008年手足口病的主要病原体为EV71。应加强HFMD病原图谱监测,为手足口病防控提供实验依据。     

2010年济南地区重症手足口病肠道病毒基因特征

目的了解2010年发生的重症手足口病(HFMD)病原及流行特征,为济南地区重症HFMD的防控提供科学依据。方法对辖区哨点医院送检的40例重症手足口病病例样本,应用RT-PCR技术检测肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)、非EV71和CoxA16的其他肠道病毒(EV);选取10例阳性病例样本进行VP1基因的扩增和核苷酸序列测定。结果 40例重症手足口病病例中,有38例感染了肠道病毒,其中感染EV71的有30例,占78.95%;感染CoxA16的有3例,占7.89%;感染其他肠道病毒的5例,占13.16%。手足口病重症病例呈散发,主要集中于5～8月份,病例人群男性高于女性(3.44∶1),其中2岁以下幼儿是重症病例发生主要年龄段,占77.50%;10株EV71阳性扩增产物经基因测序,证实均为C4b基因亚型。结论 EV71是引起2010年济南地区手足口病重症及死亡病例的主要病毒类型,且主要为C4b基因亚型。     

北京及其周边地区儿童手足口病病原学监测及流行病学分析(2017-2018年)

目的了解北京及其周边地区儿童手足口病(HFMD)的流行特点及病原学特征。方法采集北京及其周边地区2017—2018年儿童HFMD病例咽拭子样本,使用肠道病毒(EV)通用、EV71及柯萨奇病毒A16型(CA16)三通道Real-time PCR的方法进行肠道病毒核酸检测,对非EV71非CA16的EV阳性样本采用RT-PCR法扩增VP1基因片段,通过BLAST比对进一步进行型别鉴定。结果2017—2018年共纳入HFMD患者939例,包括重症病例2例;男女性别比为1.54∶1;3岁以下儿童占46.96%,5岁以下儿童占75.19%。EV总阳性检出率为89.24%(838/939),其中2017年、2018年分别为87.44%(181/207)和89.75%(657/732);2017年主要为CA6(47.51%)、EV71(16.02%)、CA16(7.73%)和未分型EV(27.62%);2018年包括CA6(46.88%)、CA16(14.31%)和未分型EV(36.99%)。结论2017—2018年,引起北京及其周边地区儿童HFMD的主要病原体是CA16,EV71的检出率显著下降,因此需要加强HFMD病原体中CA6等非EV71非CA16肠道病毒的监测工作。     

河北省2009年手足口病病原学研究

目的了解2009年引起河北省手足口病的病原谱及分布特征,为制定预防控制措施提供实验依据。方法通过流行病学调查,采集手足口病临床诊断病例的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液和脑脊液标本,针对肠道病毒(EV)5′端非编码区保守基因序列以及EVVP1至2A区基因序列设计EV通用引物和型特异性引物,通过RT-PCR扩增检测HFMD临床诊断病例的标本,并对病原进行分型。结果采用RT-PCR法共检测HFMD临床诊断病例1990份标本,1296份标本EV阳性,阳性率为65.13%,其中752份标本EV71阳性,452份CA16阳性,1份EV71+CA16阳性,91份其他EV阳性。随机抽取55份其他EV阳性标本经RT-PCR和测序进一步分型,除24份未定型外,共鉴定出31份,其中CA10占18.18%(10/55),CA6占14.55%(8/55),ECO30占9.09%(5/55),ECO6、ECO9各占3.64%(2/55),CA5、CA14、CB5、ECO14各占1.82%(1/55),未定型占43.64%(24/55)。结论 2009年引起河北省手足口病流行的病原体主要为EV71和CA16,同时还有部分CA5、CA6、CA10、CA14、CB5、ECO6、ECO9、ECO14、ECO30等其他型别,引起河北省重症病例的EV主要型别为EV71。     

2010年粤东地区手足口病的病原学研究

目的 了解粤东地区2010年手足口病患儿的病原学特点并探讨实时RT-PCR法检测手足口病患儿咽拭子和疱疹液样本病原体的敏感性.方法 收集94例手足口病(重症35例,轻症59例)患儿的咽拭子和疱疹液样本,以肠道病毒(EV)通用型、柯萨奇病毒A16(CA16)型、肠道病毒71(EV71)型核酸检测试剂盒,应用实时RT-PCR法检测样本中的EV,并结合临床资料对样本阳性率的样本进行比较.结果 94份咽拭子样本中,EV通用型阳性59例(62.77％),EV71阳性49例(52.13％),CA16阳性18例(19.15％),其中35份重症患儿咽拭子样本中EV通用型阳性31例(88.57％),EV71阳性23例(65.71％),CA16阳性7例(20.00％);94份疱疹液样本中EV通用型阳性44例(46.81％),EV71阳性33例(35.11％),CA16阳性15例(15.96％),其中35份重症患儿疱疹液样本中EV通用型阳性22例(62.86％),EV71阳性15例(42.86％),CA16阳性6例(17.14％).统计资料显示,咽拭子的阳性率高于疱疹液,EV71的检出率差异有统计学意义(x2=5.537,P＜0.05),重症患儿EV71阳性率高于轻症患儿,两组患儿的EV通用型及EV71检出差异有统计学意义(x2=15.889、4.125,P＜0.05).结论 2010年我院手足口病住院患儿的病原体主要为EV71和CA16,并且以EV71为主.应用实时RT-PCR法检测手足口病病原体,咽拭子的病毒检出率较疱疹液高,重症患儿的病毒检出率明显高于轻症患儿.     

2010年广州地区儿童肠道病毒71型感染的分子流行病学研究

目的了解广州地区2010年肠道病毒(EV)71病毒流行状况。方法设计肠道病毒71型实时荧光RT-PCR引物和TaqMan探针,运用TaqMan实时荧光RT-PCR技术,对2010年全年来医院就诊的疑似手口足病患儿送检标本20150份,进行肠道病毒71型荧光RT-PCR检测,同时,设计了扩增EV71病毒全基因组的引物,随机选取了5株病毒进行全基因组进行测定。结果在20150份临床标本中,EV71病毒的阳性为4780份,全年总的检出率为23.72%,每个月均有阳性检出;其中,EV71病毒阳性率较高的为4～7月份,最高检出率为6月份,达32.19%,最低检出率为10月份,为7.91%;扩增了5株广州株EV71病毒全基因组全长序列,提交到GenBank上,将5株广州株EV71病毒与EV71的A、B3、B4、B5、C1、C2、C3、C4型及阜阳株全基因组核苷酸序列进行ClustalW比较,发现与C4a型阜阳株等同源性为98.00%～99.00%,与C4b同源性为91.00%～93.00%,与C1-C3同源性为82.00%～83.00%,与B3、B4、B5同源性为81.00%～83.00%,与A型同源性为80.00%。结论 2010年广州地区手足口病的主要病原是肠道病毒71型,EV71病毒在2010年全年还是较普遍流行,全基因组序列分析表明,2010年分离的5株广州株EV71病毒属于C4a型。     

2015年菏泽地区手足口病病毒核酸检测结果分析

目的探讨2015年菏泽地区手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)的病原体型别及分布特征。方法采集临床诊断为HFMD的粪便样本,采用Real-time PCR方法进行EV71型、Cox A16型的核酸检测,并对结果进行分析。结果2015年1—12月肠道病毒应用Real-time PCR方法对580例临床HFMD病例样本进行检测,肠道病毒核酸检测阳性502例,检出率为86.55%(502/580),其中EV71型阳性340例,占阳性样本总数的67.73%(340/502);Cox A16型阳性8例,占阳性样本总数的1.59%(8/502);EV71型和Cox A16型混合阳性1例,占阳性样本总数的0.20%(1/502);其他肠道病毒型阳性153例,占阳性病例总数的30.48%(153/502)。检测的普通病例中,肠道病毒阳性率为86.36%(481/557),EV71型占阳性病例的66.53%(320/481)。重症病例肠道病毒阳性率为91.30%(21/23),EV71型占阳性病例的95.24%(20/21)。502例肠道病毒核酸阳性病例中,男328例(65.34%),女174例(34.66%),性别比为1.89:1。结论 2015年菏泽地区HFMD病原体主要是EV71型肠道病毒,不同县区、人群分布有差异。     

杭州市肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析

目的了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型(EV71)流行株VP1基因特征。方法手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行病毒分离、培养;通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物,并扩增VP1区全长基因和序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建基因进化树。结果从2008年和2011年手足口样本中分离到EV71阳性毒株各4株,VP1基因全序列测定结果显示其与C4亚型代表株核苷酸和氨基酸的相似性最高,分别为93.8%～95.2%、99.0%～99.7%。结论杭州市手足口病患者感染EV71病毒的流行株属C基因型的C4亚型。     

2011年龙岩市手足口病例肠道病毒通用引物核酸阳性未分型样本病原分析

目的 了解龙岩市大量判定为其他肠道病毒（EV）感染的手足口病（HFMD）样本的病原组成。方法 对龙岩市2011年经Real-time RT-PCR检测判为未分型EV感染的104份HFMD咽拭子样本经RD细胞分离培养后以RT-PCR法检测EV、EV71、CoxA16,对仍不能分型的样本以187/222引物进行扩增,对扩增产物进行纯化回收、克隆、测序,并用Blast程序在线比对判定型别。同时对培养物进行Real-time RT-PCR检测EV、EV71、CoxA16。任一法检出培养物阳性即判为阳性。结果 104份样本中检出EV阳性88份（84.62%）,包括29份EV71,4份EV71＋CoxA16,3份CoxB5,2份CoxA10,50份仍未能分型。结论 Real-time RT-PCR检测未能分型的HFMD病例中,相当部分（37.18%）还是由EV71所致,临床不应该随意排除该类病例EV71感染的可能,同时还包含CoxB5和CoxA10病毒。     

2010年-2013年崇左市手足口病监测分析

目的对崇左市2010年-2013年手足口病实验室检查结果进行分析,了解4年来崇左市手足口病病原学特征,为实验室诊断手足口病提供参考。方法应用real-time RT-PCR技术检测样本中的肠道病毒(PE)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)。结果 1 519份各类样本中,检测到肠道病毒阳性411例,EV71病毒特异性基因片段阳性295例,CVA16特异性基因片段阳性297例,1 456例手足口病病例中,CVA16的检出率与EV71相当,分别为20.40%(297/1456)和20.26%(295/1456)。重症及死亡病例中,有35例为EV71核酸阳性,3例为CVA16核酸阳性。可见重症及死亡以EV71为主。男性EV71阳性为193例,CVA16阳性为188例。女性EV71阳性为102例,CVA16阳性为109例。手足口病相关病毒感染中,男性、女性之比为1.81:1(381/211)。结论夏秋季为手足口病高发季节,冬春季发病较低。手足口病流行优势毒株不断发生变化,EV71、CVA16阶段性交替形成优势株流行。6岁及以下年龄组感染手足口病相关病毒最为多见。     

急性弛缓性麻痹病例中EV71感染的初步探讨

目的 了解急性驰缓性麻痹(AFP)病例中肠道病毒71型感染情况,为病原学诊断提供经验.方法 采用病毒分离和RT-PCR法对AFP病例中分离到的非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)进行EV71检测.结果 36例NPEV病例中检出阳性16例,扩增长度为226bp,经证实为EV71.结论 AFP病例中肠道病毒所占比例高,EV71为常见血清型;RT-PCR诊断敏感、快速,有实际应用价值.     

2012-2013年广西桂林地区肠道病毒71型所致手足口病病例的病原学分析

目的对2012-2013年广西桂林地区的手足口病病例进行肠道病毒71型(EV71)相关病原学分析。方法收集手足口病病例样本737份,采用RT-PCR方法进行检测,选取EV71阳性样本分离病毒,将获取的毒株经RT-PCR方法扩增VP1基因序列并测序,对VP1基因进行进化分析。结果 737份病例中,荧光PCR检测出EV71感染共169例,阳性率为22.93%,测序获得的89株EV71的VP1基因核苷酸及氨基酸序列同源性为95.01%~100.00%和98.47%~100.00%,与C4亚型代表株核苷酸同源性大于95%,氨基酸同源性大于97%,并在系统进化树中与C4a亚型代表株处于同一分支,对89份样本VP1基因编码的氨基酸序列与安徽阜阳的FY23毒株进行了比较,发现89株病毒均在791位由S(丝氨酸)变为P(脯氨酸)。结论本研究所收集的2012-2013年广西桂林地区的89例EV71所致手足口病均为C4a亚型的EV71感染。     

肠道病毒(EV71)所致小儿急性呼吸道感染的临床分析

目的:探讨肠道病毒71型(EV71)与小儿急性呼吸道感染(ARTIs)的相关性及临床特征。方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法对110例急性呼吸道感染患儿的咽拭子标本进行EV71检测,分析阳性者的临床特征。结果:110例患儿中,有14例标本出现特异性扩增片段,阳性率为12.73%,EV71阳性患儿的呼吸道感染临床表现无明显特异性。结论:EV71也可引起小儿急性呼吸道感染,可能主要引起婴幼儿的呼吸道感染,且临床表现并无明显特异性。     

2018—2021年西安市儿童手足口病病例及病原学特征分析

目的 调查西安地区2018—2021年儿童手足口病（HFMD）病例特征,并对其病原学特征进行分析。方法 采用描述性流行病学方法分析西安地区手足口病儿童病例的病例特征,采集儿童病例的肛拭子样本,通过实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-PCR）法检测样本的病毒类型,并分析其病原学特征。结果 2018—2021年西安地区手足口病儿童病例累计报告38 720例,年均发病率为278.94/万。其中男23 765例,女14 955例,男女比为1.589∶1;5岁以下手足口病儿童病例36 992例,占比95.54%;每年4—7月份报告病例数最多,占全年总例数的57.67%,春、夏两季是儿童手足口病的高发季节。病原学检测结果显示,11 647例手足口病儿童病例样本中,阳性病例5 739例,阳性率为49.27%,以EV 71阳性（61.30%）为主,其次为Cox A16阳性（24.08%）和其他肠道病毒阳性（14.62%）。不同年份、年龄和季节的阳性检出病原菌分布差异均有统计学意义（均P<0.01）。结论 EV 71病毒是西安地区儿童手足口病的主要病原体,5岁以下儿童是易感人群,在春、夏季节尤其需要注意防护。     

2008年广东省手足口病实验室检测结果分析

目的对广东省2008年手足口病实验室检查结果进行分析,了解2008年广东省手足口病病原学特征,为实验室诊断手足口病提供参考。方法采集2008年4—12月广东省各地送检的292例手足口病患者的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液和脑脊液等标本426份和98名手足口病病例接触者的粪便、肛拭子和咽拭子等标本98份,应用RT-PCR技术检测样本中的肠道病毒、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)。结果292例手足口病患者的426份各类样本中,检测到肠道病毒阳性267份,EV71病毒特异性基因片段阳性169份,CVA16特异性基因片段阳性36份,EV71和CVA16病毒核酸同时阳性3份。292例手足口病病例中,EV71的检出率较CVA16高,分别为50.68%(148/292)和11.99%(35/292),20例手足口病死亡病例均为EV71感染病例。手足口病病例粪便样本的肠道病毒、EV71和CVA16的检测阳性率最高,分别为76.72%(178/232)、45.26%(105/232)和14.66%(34/232),且在发病9 d后仍能检测到EV71病毒。98名手足口病病例接触者的各类样本中,分别检测...     

手足口病患儿EV71的检测与其临床分析

目的了解仙居县2008年6月-2009年6月儿童手足口病病例不同标本中肠道病毒EV71和CoxA16的感染情况,为手足口病的治疗和预防控制提供依据。方法采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)及实时荧光RT-PCR方法,对145例疑似手足口病的咽拭子、疱疹液及脑脊液标本进行手足口致病病毒进行检测,全部取咽拭子145份,49份同时取疱疹液,47份同时取脑脊液,进行EV、EV7I和CoxA16的检测,最后对重症病例的病毒核酸测序,并进行基因分型。结果 145份疑似样品中,39份为肠道通用病毒阳性,其中21份样品EV71阳性,6份样品CoxA16阳性;咽拭子、疱疹液、脑脊液的检出率分别为28.6%、28.6%、12.8%;3例重症病例均只检出肠道病毒EV71,阳性率为100.0%。结论采用咽拭子及其疱疹液标本检出率比较,差异无统计学意义,且阳性检出率高于脑脊液标本,仙居县肠道病毒夏季高发,感染以EV71和CoxA16为主,手足口病重症感染病毒为EV71的C4亚型。     

70例手足口病病原检测和临床分析

目的 分析研究70例手足口病患者的临床一般情况及其致病原.方法 采集70例手足口病患者(其中5岁以下儿童患者60例)的咽拭子标本,提取病毒RNA.用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)一步法检测肠道病毒(EV)的5'-UTR区基因、肠道病毒71型(EV71)的Vp3～Vp1区基因、柯萨奇病毒A16(Cox-A16)的Vp3～Vp1区基因.结果 在70例手足口病患者中,咽拭子标本肠道病毒核酸阳性率为42.8%(30/70).在30例肠道病毒核酸阳性病原中,EV71占66.7%(20/30).5岁以下儿童有EV71肠道病毒、或Cox-A16病毒、或非EV71及非Cox-A16的其他肠道病毒感染病例.而5岁以上的儿童和成人患者则只有EV71肠道病毒感染病例.39例4 d内采集的咽拭子标本病原核酸阳性检测率平均为66.7%(26/39),31例5 d以后采集的标本病原核酸阳性检测率是12.9%(4/31),差异有统计学意义(x~2=20.4,P<0.01).结论 手足口病以0～5岁婴幼儿患病为主,但成人也可发病.用RT-PCR检测病原核酸阳性的手足口病患者以EV71为主,且以发病后4 d内阳性检测率高.