长链内含子非编码RNA在基因表达过程中的调控作用

在绝大多数人类基因中都存有非蛋白编码RNA(non-coding RNA,ncRNA).长链内含子ncRNA(long intronic non-coding RNA,lincRNA)是众多ncRNA中的一员,而内含子区域则是具有调节性的ncRNA的关键源.长链内含子ncRNA可通过作为短链RNA的前体、或是与启动子元...     

非编码RNA调控精子发生的研究进展

随着基因组学研究的发展,发现生物体基因组内存在大量不编码蛋白质的基因。这些基因的转录产物称为非编码RNA(Noncoding RNA,ncRNA)。以前认为ncRNA是基因组中无用的序列,但是研究表明ncRNA在很多生命活动中起到很重要的作用。按照转录产物的序列长短ncRNA分为短链非编码RNA(Small ncRNA)和长链非编码RNA(LncRNA)。精子发生包括精原细胞增殖,精母细胞减数分裂以及精子成熟等一系列受到精确调控的生理发育过程。精子发生需要相关基因的适时表达,并受到转录和转录后水平的调控。但是精子发生过程的调控机制目前还未完全研究清楚。最新研究发现在精子发生过程ncRNA起到很重要的作用,即使在成熟精子细胞中也有ncRNA的表达。表明ncRNA参与调控精子发生的过程,并且这些父源ncRNA可能在接下来的受精和胚胎发育中起到重要的调节作用。结合最新研究进展,本文综述了ncRNA在精子发生过程所起的作用,以期为精子发生过程中ncRNA的进一步研究提供参考。     

卵巢癌与非编码RNA研究进展

卵巢癌是全球女性因癌症死亡的第5大病因,尽早明确诊断并积极治疗是改善预后的有效方法。随着测序技术的不断发展,人们发现了大量的种类丰富的非编码RNA。ncRNAs在细菌、真菌和哺乳动物等多种生物体的活动中可作为致癌驱动因子和肿瘤抑制因子,对肿瘤的发生、发展起到调控作用,ncRNA有望成为肿瘤诊治的新型生物标志物和治疗靶点。探索ncRNA可为卵巢癌的研究提供一些系统性新思路。现将卵巢癌相关ncRNA最新研究进展进行综述,并着重讨论微小RNA（miRNA）、长链非编码RNA（lncRNA）及环状RNA（circRNA）在卵巢癌中的作用。     

RNA研究进展

近10年来,人们对RNA领域有了更多更新的研究发现,RNA早已不再局限于编译蛋白质,它还影响着生物体的基因表达、细胞周期及个体发育过程。小干扰RNA(smallinterfering RNA,siRNA)和非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)对生物体的生命活动有着重要的调控作用。siRNA引起RNA干扰(RNA interference,RNAi),ncRNA在包括转录调节、染色体复制、RNA剪切及加工、维护mRNA稳定和     

非编码RNA与系统性红斑狼疮的相关研究进展

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类不具有编码蛋白质功能的基因组转录产物,其具有复杂的生物学功能,广泛参与人体生理、病理活动的调控。近来研究发现,ncRNA的表达失调与SLE的发生密切相关。该文对ncRNA与SLE的相关研究进展进行综述,旨在为进一步探索ncRNA在SLE中的作用提供新思路,为SLE的诊断和治疗提供新方向。     

非编码RNA在生殖领域的研究进展

人类绝大部分基因可发生转录,约98%的产物为非编码RNA(ncRNA)。ncRNA参与调控基因转录、RNA成熟和蛋白质翻译,在机体生长发育与新陈代谢过程中发挥重要作用。现研究发现,ncRNA与卵泡生长发育、精子生成、胚胎植入等密切相关。本文总结近五年ncRNA在生殖领域的相关研究行以下综述。     

环状RNA在肿瘤免疫中的研究进展

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)可以分为环状RNA(circular RNA,circRNA)和线性ncRNA.ncRNA存在于不同的细胞类型中,包括正常细胞、肿瘤细胞和免疫细胞等.目前已经发现线性ncRNA,如长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和微RNA(m...     

非编码RNA与真核生物基因表达调控:从染色体到蛋白质

非编码RNA(ncRNA)在真核生物基因表达调控中至少起着部分关键的作用,这是由RNA本身的化学性质决定的。根据功能,ncRNA可以大致分成“看家RNA”与“调控RNA”。ncRNA的调控,从遗传信息的载体(DNA和染色质)一直到遗传信息的表达产物(蛋白质)的产生,所有生物过程中都有着极其重要的作用。将来的挑战是确定基因组中存在多少ncRNA,并研究它们所有的功能。     

非编码RNA及其调控功能的研究进展

过去认为，在生命活动中RNA只是配角，其作用是将遗传信息从DNA传递给蛋白质，而细胞内存在的小分子RNA（后来称之为非编码RNA，non-coding RNA，ncRNA）只不过是一些降解产物；但随着研究的不断深入，RNA生物学功能的多样性以及ncRNA调控功能的重要性得到了深刻认识。     

非编码RNA在调控胞内寄生菌感染增殖中的作用机制的研究进展

胞内寄生菌在宿主细胞内长期定植与存活，其增殖离不开宿主环境，目前多数胞内寄生菌在宿主细胞中的感染增殖机制仍不非常清楚。新近研究表明，非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)能介导病原体与宿主细胞间的相互作用。胞内寄生菌在感染宿主细胞后引起宿主细胞胞核和胞浆多种ncRNA的差异表达，调控宿主细胞的生长与代谢，促进自身的感染与增殖。该文对宿主细胞中ncRNA在结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)、伤寒沙门菌、衣原体、布鲁氏菌以及单核细胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes, LM)等常见胞内寄生菌细胞内感染增殖中的作用机制进行简要综述，为胞内寄生菌致病机制的研究以及临床治疗开创新思路。     

牛磺酸上调基因1对肿瘤发生发展的调控作用

<正>基因的失调控(异常表达)是肿瘤发生发展的重要原因(诱因)业已被学术界所公认,而在这一过程中非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)起到了极为重要的调控作用~([1-2])。小RNA(small RNA;包括微小RNA,microRNA,miRNA,miR)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)均属于ncRNA~([3-4])。     

De novo search for non-coding RNA genes in the AT-rich genome of Dictyostelium discoideum: performance of Markov-dependent genome feature scoring

Genome data are increasingly important in the computational identification of novel regulatory non-coding RNAs (ncRNAs). However, most ncRNA gene-finders are either specialized to well-characterized ncRNA gene families or require comparisons of closely related genomes. We developed a method for de novo screening for ncRNA genes with a nucleotide composition that stands out against the background genome based on a partial sum process. We compared the performance when assuming independent and first-order Markov-dependent nucleotides, respectively, and used Karlin-Altschul and Karlin-Dembo statistics to evaluate the significance of hits. We hypothesized that a first-order Markov-dependent process might have better power to detect ncRNA genes since nearest-neighbor models have been shown to be successful in predicting RNA structures. A model based on a first-order partial sum process (analyzing overlapping dinucleotides) had better sensitivity and specificity than a zeroth-order model when applied to the AT-rich genome of the amoeba Dictyostelium discoideum. In this genome, we detected 94% of previously known ncRNA genes (at this sensitivity, the false positive rate was estimated to be 25% in a simulated background). The predictions were further refined by clustering candidate genes according to sequence similarity and/or searching for an ncRNA-associated upstream element. We experimentally verified six out of 10 tested ncRNA gene predictions. We conclude that higher-order models, in combination with other information, are useful for identification of novel ncRNA gene families in single-genome analysis of D. discoideum. Our generalizable approach extends the range of genomic data that can be searched for novel ncRNA genes using well-grounded statistical methods.     

非编码RNA在肿瘤中对自噬的调控

非编码RNA（ncRNA）是不参与蛋白质编码的RNA的总称,包括微小RNA（miRNA）、siRNA、piRNA、长链非编码RNA（lncRNA）、转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）等。其在蛋白质转录与后转录过程中有重要的调节作用。自噬是细胞在异常环境中维持生存的一种方式。大量研究表明自噬与肿瘤也存在着密切的关系,而自噬对于肿瘤的影响具有“两面性”。许多研究探讨了非编码RNA在肿瘤细胞中对于自噬过程的调控．文章综述了miRNA与lncRNA这两种研究深入的非编码RNA。     

非编码RNA与人类重大疾病的发生及其在生物医学领域内的应用

2003年人类基因组计划的完成开辟了人类遗传学、人类病理学等研究领域的新时代,然而近年来解析人类基因组意义过程遇到一系列的难题使人们认识到DNA序列本身并不能解释所有关于遗传信息传递、人类疾病生物学基础等问题.     

RNA干扰用于抗HBV感染的研究进展

乙型肝炎病毒(HBV)感染可引起急性和慢性乙型肝炎,最终可能导致肝硬化、肝癌等严重后果。作为一种可以帮助生物抵抗外在感染的体内防御机制,近年来RNA干扰已成为人们进行抗感染和基因治疗研究的有力工具。本文对RNA干扰技术在抗HBV感染方面的研究进展进行综述。