致病性小肠结肠炎耶尔森氏菌分离鉴定及三重PCR检测方法的建立

为鉴定导致患病鲫鱼肛门红肿、腹部有出血点症状的病原菌,并建立一种快速检测该病原菌的方法。本研究从患病鲫鱼中分离了病原菌,采用形态学、理化特性分析及16S rDNA序列分析方法鉴定菌株。采用PCR扩增法检测该菌毒力基因,琼脂纸片扩散法检测该菌株的耐药性,致病性能验证试验检测其致病性。针对该菌ail基因、inv基因和intB基因设计了3条特异性引物,通过对反应体系和条件的优化,建立了一种检测该菌的三重PCR方法并初步应用于患病鲫鱼样品的检测中。结果显示,从患病鲫鱼心脏组织中分离了一株小肠结肠炎耶尔森氏菌（Yersinia enterocolitica）,命名为fsznc-10。检测到该菌携带ail、ystB、virF、intB毒力基因,该菌对诺氟沙星、庆大霉素等5种抗生素敏感,对鲫鱼具有一定的致病性。三重PCR方法可准确扩增出小肠结肠炎耶尔森氏菌ail、inv和intB三个目的基因,而其他菌株均未扩增出目的基因。该方法检测该菌DNA最低检出量为1.704×10?6 ng/μL,检测患病鱼心脏样品的阳性率约为86.67%,与16S rDNA序列分析方法的检测符合率为100%。本试验建立的三重PCR检测法具有特异性强、敏感性高、操作简单、成本低的优点。这为临床中小肠结肠炎耶尔森氏菌的防控和检测提供参考依据。     

食源性MRSA氨基糖苷类耐药基因多重PCR方法建立

目的:了解食源性金黄色葡萄球菌中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)及对氨基糖苷类庆大霉素、卡那霉素抗生素的耐药性情况,并建立快速检测鉴定金黄色葡萄球菌耐药性多重PCR方法。方法:对金黄色葡萄球菌进行增菌培养,并提取DNA作为模板,以nuc基因作为菌属鉴定基因,mec A基因作为MRSA检测基因,aac A-aph D及aph(3')-Ⅲa基因作为耐氨基糖苷类庆大霉素、卡那霉素的检测目的基因,建立四重PCR检测方法并进行特异性及灵敏度评价;利用所建立的方法检测72株食品及食物中毒患者来源的金黄色葡萄球菌。结果:成功建立四重PCR检测方法,且72株金黄色葡萄球菌均有nuc基因检出,mec A基因与MRSA检测符合率达100%,aac A-aph D、aph(3')-Ⅲa基因与庆大霉素、卡那霉素耐药菌株的符合率达95.12%。结论:本实验所建立的多重PCR方法灵敏度高、特异性好,可以快速检测出MRSA,并对氨基糖苷类庆大霉素、卡那霉素耐药菌株检测具有较高的准确率。     

金黄色葡萄球菌基因组岛对多重耐药表型与生物被膜能力的影响机制

本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从耐药性微生物感染防控角度出发,对广州地区临床分离的127株葡萄球菌的耐药表型、基因组岛分型与生物被膜生长能力进行研究。通过微量肉汤稀释法检测确定菌株对26种抗菌药物的药敏结果;PCR扩增葡萄球菌属特异性基因16S r RNA、金黄色葡萄球菌菌株特异性基因fem A、耐药基因mec A以检测确定菌株耐药特性;多重PCR检测金葡菌基因组岛SCCmec基因元件中ccr复合物,mec复合物以对其进行分型。107株耐药型金葡菌均为多重耐药,且呈耐9种或以上抗生素占76.1%(86/113)。113株葡萄球菌SCCmec分型结果为:I型0株,II型12株,III型73株,IV型10株,V型11株,5株为无法分型;本文对基因组岛和金黄色葡萄球菌耐药表型与生物被膜能力的相关性进行分析与探讨,为进一步对各种食源性微生物引起的食品污染进行安全控制,提供了研究基础。     

致病性迟钝爱德华氏菌毒力基因的PCR检测

为了筛选可用于检测致病性迟钝爱德华氏菌的毒力基因,最终建立致病性迟钝爱德华氏菌PCR检测体系.根据致病性迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda,E.et w.)PPDl30/91分离株的6个毒力基因citC,fimA、gadB、katB、mukF、esrB序列,设计了6对引物,进行PCR扩增、引物灵敏度试验及特异性试验.结果显示:在国内分离的3个致病株中同时出现citC.fimA、gadB、mukF 4个毒力基因,而katB和esrB毒力基因未出现.各毒力基因单重PCR灵敏度试验中,gadB基因可检测到的模板量为1 pg,其余3个毒力基因可检测到的模板量为100Pg.在特异性试验中,11株常见致病菌没有扩增出与目的基因大小相近的片段,引物特异性良好.由此推断,citC、fimA、gadB、mukF 4个毒力基因中的任意一个,均可作为检测致病性迟钝爱德华氏菌的标志物,但此结论还有待于更多国内分离株的验证.     

赤水丹霞山土壤来源抗菌活性链霉菌的分离及放线菌素产生链霉菌Streptomyces sp.CSDX001发酵产物分析

分离、鉴定赤水丹霞地区土壤来源的抗临床耐药菌活性的链霉菌。采集赤水丹霞山区不同海拔的土样并利用多种培养基分离、纯化菌株。热酚法提取菌株基因组DNA,PCR扩增16S r RNA基因并测序后在线比对以确定其系统分类学地位。利用多种测试菌测试抗菌活性,通过HPLC和LC/MS分析菌株发酵抽提物并与数据库比较。分离得到菌株600株,其中59株链霉菌中有41株具有1种以上的抗测试菌活性。Streptomycetes sp.CSDX001具有抗耐药耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、抗耐万古霉素金黄色葡萄球菌、抗多药耐药鲍曼不动杆菌、抗枯草芽孢杆菌、抗藤黄微球菌、抗白色念球菌的活性,具有抗多种微生物的活性和产生多种新结构次级代谢产物潜力,可能是抗微生物新天然活性产物的重要来源。     

三重荧光PCR检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和大肠埃希氏菌O157:H7

目的 建立一种检验沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌O157:H7的Taqman探针三重荧光PCR方法。方法 针对沙门氏菌属特异性invA基因、金黄色葡萄球菌rpoB基因、大肠埃希氏菌O157：H7 的rfbE基因设计引物与探针,建立三重荧光PCR体系,对引物与探针浓度及退火温度优化,并进行特异性和敏感性研究。结果 引物与探针的最优浓度组合为：invA 0.2μL、ropB 0.4μL、rfbE 0.5μL;最优退火温度为60℃。16株非目标菌株扩增结果为阴性;目标菌株均出现显著扩增。敏感性试验显示,三种微生物对应的能检出的最低菌体数量依次为：460CFU、76CFU、660CFU。结论 该方法特异性好、灵敏度高,能够快速检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌O157:H7     

SYBR~ GreenⅠ实时PCR快速检测沙门菌

为应用SYBRGreenⅠ实时PCR技术建立沙门菌的快速检测方法,根据沙门菌invA基因序列的特点设计特异性引物,进行SYBRRGreenⅠ实时PCR检测。以沙门菌及非同源性参考菌株做特异性检测;沙门菌不同群菌株做重现性检测;将沙门菌菌株稀释成不同梯度,做灵敏度检测。该方法有较好的特异性、重现性,沙门菌属5个群菌株均为阳性,而其它非同源菌株均为阴性。该方法灵敏度较高,检测低限为19CFUml。该方法特异性强,重现性好,敏感性高,可以快速、准确检测食品中沙门菌。应用实时PCR技术,利用SYBRGreenI染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到沙门菌中invA基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,且通过熔解曲线可知其熔点值约为80.4℃,而对其它非沙门菌则检测不到荧光信号。SYBRGreenⅠ实时PCR能通过熔解曲线有效地区分特异性产物、非特异性产物以及引物二聚体,是基因鉴定检测的新方法。     

空肠和结肠弯曲菌鞭毛蛋白基因fla A的检测

目的 运用一种快速、敏感、特异的检测空肠和结肠弯曲菌的方法.方法 以空肠和结肠弯曲菌所共有特异的鞭毛蛋白基因 fla A的一段高度保守序列为引物,用PCR法扩增fla A基因上的一段约1 700 bp的片断.用该引物对空肠和结肠弯曲菌的标准株、福建省的食品分离株进行PER扩增检测,并同时检测该PCR方法的敏感性.结果 扩增片断表现出极好的特异性,2株空肠和结肠弯曲菌标准菌株、8株分离自不同食品样品的空肠穹曲菌和结肠弯曲菌菌株均为阳性,且敏感性实验显示该PCR方法的反应体系最低检出菌量为6 CFU.结论 该方法快速、敏感、特异,可用于突发性食物中毒和暴发感染的调查.     

SYBR GreenⅠ实时PCR快速检测沙门菌

为应用SYBR GreenⅠ实时PCR技术建立沙门菌的快速检测方法，根据沙门菌invA基因序列的特点设计特异性引物，进行SYBR GreenⅠ实时PCR检测。以沙门菌及非同源性参考菌株做特异性检测；沙门菌不同群菌株做重现性检测；将沙门菌菌株稀释成不同梯度，做灵敏度检测。该方法有较好的特异性、重现性，沙门菌属5个群菌株均为阳性：而其它非同源菌株均为阴性。该方法灵敏度较高，检测低限为19CFU／ml。该方法特异性强，重现性好，敏感性高，可以快速、准确检测食品中沙门菌。应用实时PCR技术，利用SYBR GreenⅠ染料能选择性结合双链DNA的特点，可检测到沙门菌中invA基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号，且通过熔解曲线可知其熔点值约为80，4℃，而对其它非沙门菌则检测不到荧光信号。SYBR GreenⅠ实时PCR能通过熔解曲线有效地区分特异性产物、非特异性产物以及引物二聚体，是基因鉴定检测的新方法。     

基于rpoB靶基因的PCR法快速检测弓形菌

建立了一种弓形菌(Arcobacter)快速、敏感、特异的PCR检测方法.采用PCR技术扩增弓形菌编码RNA聚合酶β亚基的rpoB基因,并对该方法进行特异性和敏感性测试.结果只有弓形菌在205bp处出现目的扩增带,其他菌株扩增结果均为阴性.该法对弓形菌的检测限可达8.20×102cfu/mL.建立的PCR方法具有操作简便、准确可靠以及灵敏特异的特点,为食品中弓形菌的快速检测提供了新的手段.     

Detection of wheat as an allergenic substance in food by a nested PCR method

A nested PCR method was developed for the detection of DNAs extracted from allergenic substances (here, wheat) in food. Because of DNA fragmentation, detection of wheat-specific DNA extracted from food, such as retort pouch food, is very difficult. Therefore, to improve the sensitivity of detection, a nested PCR primer pair (Wtr01NE2-5' and Wtr10NE5-3': amplicon size 97 bp) was newly designed within the region of the PCR products amplified by the official Japanese primer pair (Wtr01-5' and Wtr10-3'; amplicon size 141 bp) for wheat. Genomic DNAs of seven kinds of commercial processed foods containing wheat, wheat flour and three kinds of wheat flours pressure-heated at 100, 121 and 131 degrees C were extracted with a commercial ion-exchange type kit by modifying the Japanese official method. The nested PCR method involved two PCR procedures. First, PCR was performed by varying both the PCR reagents and cycling conditions of the Japanese official method. Second, PCR was performed using the first PCR products diluted 200-fold with TE buffer. The Japanese official method enabled detection of only four of the seven kinds of foods and three of the four kinds of flours (one sample was just a trace), while the nested PCR method detected all seven foods and all four flours. Investigation of the detectability of the four kinds of wheat flours depending on the size of the amplified fragment using five primer pairs showed that its size must be kept to less than approximately 100 bp. The nested PCR method significantly improved the sensitivity of detection of wheat-specific DNA.     

食源性沙门氏菌携带质粒介导的喹诺酮类耐药基因的液相芯片检测技术研究

目的:建立应用新型液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的质粒介导喹诺酮类耐药(PMQR)基因中4种基因:qnrS、aac(6’)-Ib-cr、oqxA、oqxB的方法。方法:针对食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6’)-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因,设计对应引物和微球,采用液相芯片技术对7株标准菌株进行特异性实验;对4株各含1种PMQR基因的食源性沙门氏菌进行重复性和灵敏度实验;然后检测来自食源性风险监测的71株耐喹诺酮类沙门氏菌,和普通PCR进行对比实验。结果:成功建立了液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6’)-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因的方法,携带qnrS基因的耐药株检出限为5 CFU/mL、携带aac(6’)-Ib-cr基因的耐药株检出限为25 CFU/mL、携带oqxA和oqxB基因的耐药株检出限为10 CFU/mL。所有阳性判定结果荧光中位值(MFI)均≥5倍阴性对照组。重复性实验变异系数(CV)均小于5%,特异性实验结果特异性100%,阴性菌株无阳性信号反应。qnrS检出率29.6%(21/71)、aac(6’)-...     

Detection of allergenic substances in foods by a multiplex PCR method

A multiplex PCR (M-PCR) method was developed for the detection of DNAs of plant and three allergenic substances (wheat, buckwheat, and peanut) in foods. Genomic DNAs were extracted from allergenic substances with a commercial ion-exchange type kit. Four primer pairs suitable for the specific detection of plant DNA were designed to establish a M-PCR method detecting simultaneously the specific DNAs of plant and allergenic substances. Our four designed primer pairs and the primer pair described in the Japanese official method were applied to the specific detection of plant DNA. A primer pair of Plant01-5' and Plant01-3' (amplicon size; 161 bp) was the most suitable for the specific detection of plant DNA. M-PCR was performed to detect the specific DNAs of allergenic substances using four primer pairs, a pair of Plant01-5' and Plant01-3', and three pairs for allergenic components described in the Japanese official method. The four specific PCR bands were simultaneously amplified from genomic DNAs of allergenic substances. The proposed method is simple, rapid and inexpensive.     

膨化饲料中玉米蛋白粉对黄颡鱼生长的影响

为了研究饲料中玉米蛋白粉对黄颡鱼生长性能、部分生理功能的影响,以初均重(13.82±1.06)g的黄颡鱼为试验对象,以使用挤压膨化日粮在等氮、等能、等磷条件下,将饲料中玉米蛋白粉用量设置0%、6%、10%、14%,以及叶黄素添加对照组共5个试验组,每组3个平行。在池塘网箱中饲养58 d,结果显示,不同饲料组黄颡鱼的成活率、饲料系数、特定生长率、增重率、蛋白效率差异不显著(P0.05);各组别黄颡鱼的脏体长、肝体比、肥满度和鱼体营养组成等差异不显著(P0.05);对黄颡鱼的血脂含量、非特异免疫力、肝胰脏功能等无显著性影响(P0.05),而对血糖含量则产生显著性影响(P0.05)。在黄颡鱼挤压膨化饲料中可以使用6%的玉米蛋白粉,能够维持黄颡鱼的正常生产性能和正常生理功能。     

多重PCR快速检测三种食品病原菌

建立一种快速、经济、实用的可以同步检测食品中金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌的多重聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)的方法。根据金黄色葡萄球菌的nuc基因,沙门氏菌的invA基因,小肠结肠炎耶尔森氏菌的ail基因,分别设计了三对引物,对单个基因PCR和单管多重PCR扩增进行特异性、灵敏性实验以及优化反应体系。三对引物能特异性扩增出236、475、127bp的目的条带。建立的多重PCR同时对3种食源性致病菌进行检测具有较高的灵敏度,灵敏度金黄色葡萄球菌为102CFU/mL、沙门氏菌为102CFU/mL、小肠结肠炎耶尔森氏菌为102CFU/mL。初步建立能同步、简便、快速、灵敏地检测食品中金黄色葡萄球菌、沙门氏菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的三重PCR方法。     

藤黄微球菌过氧化氢酶基因在大肠杆菌中的重组与表达

目的应用基因重组技术在大肠杆菌中高效表达藤黄微球菌过氧化氢酶(catalase,CAT)。方法从藤黄微球菌DNA中获得CAT编码基因,并应用pProEx-HTa质粒构建融合表达载体并表达和检测活性。结果通过融合表达获得可溶性带6×His标签重组蛋白,该蛋白经过Ni-NTA纯化后可获得活性物质。结论从大肠杆菌表达体系中表达了具有生物活性的CAT。     

武汉地区食源性沙门氏菌耐药特征分析

目的分析武汉市售肉类中分离的82株沙门氏菌的药物敏感性及耐药基因。方法根据美国临床和实验室标准协会(Clinical&Laboratory Standards Institute,CLSI)相应标准获得沙门氏菌耐药实验种类和浓度,定制药敏板,采用最低抑菌浓度法(minimum inhibitory concentration,MIC)进行药敏实验,并通过PCR方法检测耐药基因的携带情况。结果药物敏感性试验结果显示,82株沙门氏菌对四环素耐药率最高,有66株菌株对四环素耐药,耐药率高达79.52%,对复方磺胺和氨苄西林的耐药率较高,耐药率分别为49.40%和48.19%;对头孢类药物的耐药率较低,对亚胺培南未表现出耐药性。耐药基因检测结果显示,82株沙门氏菌中四环素耐药基因tetA的检出率最高,且有54株沙门氏菌携带多重耐药基因,头孢类药物耐药基因blaCTX检出率较低,仅为3.66%。结论武汉市食源性沙门氏菌耐药情况较为严重,部分常见抗生素耐药性较高,对临床用药治疗和食源性病菌预防造成巨大的影响。     

生鲜食品中沙门氏菌多重耐药性检测与复合型Ⅰ类整合子的分析

该研究采用纸片扩散法对生鲜食品源沙门氏菌分离株进行耐药表型检测,玻片凝集法测定血清型,MLST方法分析其序列型。用PCR检测结合序列比对,对多重耐药沙门氏菌携带的Ⅰ类整合子及其基因盒、ISCR1及其基因盒进行分析。共筛选出32株多重耐药菌株,多重耐药率为48.48%。多重耐药株中分为11种血清型,优势血清型为S. Thompson(21.88%)和S. Agona(18.75%),MLST的序列分型将多重耐药株分为15种ST型,优势序列型为ST26(21.88%)和ST13(12.50%)。多重耐药菌株中,Ⅰ类整合子的检出率为43.75%(14/32),其中有5株扩出耐药基因盒,检出率为35.71%(5/14);11株检出ISCR1序列,检出率为34.38%(11/32),其中4株扩增出耐药基因盒,检出率为36.36%(4/11);同时含有这两种遗传元件(Ⅰ型复合整合子)的菌株共检测出9株,检出率为28.13%(9/32),检出的基因盒大多包含1~2种耐药基因,与耐药表型具有较好的相关性。通过blast比对,发现28号菌株中的Ⅰ型复合整合子耐药基因盒与沙门氏菌Nsa217质粒和肺炎克雷伯菌的KP15-2-53质粒具有同源性。生鲜制品中沙门氏菌耐药性相对严重,且沙门氏菌多重耐药性与携带的Ⅰ型复合整合子之间具有相关性。     

藤黄微球菌过氧化氢酶基因在大肠杆菌中的重组与表达

目的应用基因重组技术在大肠杆菌中高效表达藤黄微球菌过氧化氢酶（catalase,CAT）。方法从藤黄微球菌DNA中获得CAT编码基因,并应用pProEx．HTa质粒构建融合表达载体并表达和检测活性。结果通过融合表达获得可溶性带6×His标签重组蛋白,该蛋白经过Ni-NTA纯化后可获得活性物质。结论从大肠杆菌表达体系中表达了具有生物活性的CAT。