DNA计算模型的研究

DNA计算模型在DNA计算的各个研究领域中占有重要的地位,对DNA计算模型进行研究是有意义的。首先回顾了DNA计算模型的发展历史;然后从DNA的基本结构入手研究了DNA计算的机理,并对DNA计算的过程进行了详细分析,从而归纳出DNA计算模型的基本概念;再对DNA计算模型按照DNA计算的物质形态进行了分类并对每一类DNA计算模型的理论及其应用进行了详细的分析。     

DNA计算研究

本文主要讨论了DNA计算原理，综述了DNA计算的特点、DNA计算模型，指出了DNA计算目前存在的问题．最后就DNA计算的发展前景进行了展望。     

计算科学的新领域：DNA计算（Ⅰ）

DNA计算是应用分子生物技术进行计算的新方法。从理论上研究DNA计算方法，有利于推动理论计算科学的发展。本系列文章应用形式语言及自动机理论技术，系统地探讨了DNA分子的可计算性及其计算能力。本文主要介绍常用DNA分子操作方法，并根据DNA分子的结构及特点，给出了DNA分子的形式化描述。     

DNA计算中的信息安全技术

DNA计算是一种模拟生物分子的结构并借助于分子生物技术进行计算的新模式。它引入了崭新的数据结构和计算方法,为解决NP完全问题提供了全新的途径。由于DNA计算具有信息处理的高并行性、低能耗及高存储密度等优点,对传统的基于计算安全的密码体系提出了挑战。DNA密码便是近年来伴随着DNA计算的研究而出现的密码学新领域。用DNA分子作为信息载体,以实现数据隐藏、认证、加密等安全技术。在简要回顾DNA计算原理的基础上,详细分析了基于DNA的一次一密方案以及Boneh用DNA计算机破解DES的方法;最后探讨在DNA计算中的信息安全技术。     

DNA计算的研究进展及展望

DNA计算是在计算科学和分子生物学的基础上发展起来的一个新颖而极具发展潜力的学科。由于它具有信息处理的巨并行性、低耗能以及高存储密度等特点,DNA计算已被广泛应用于解决各种复杂性计算问题以及模拟电子计算机进行四则运算。DNA计算机的研制也正在向着实用化阶段迈进。综述了当前DNA计算的运行机理与计算模型,重点讨论了当前研究的热点与难点问题,并对未来的发展进行了展望。     

浅析DNA计算及其发展状况

近年来,基于生化反应机理的DNA计算模型受到科学领域内许多不同学科领域学者们的关注。DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点。该文主要讨论了DNA计算的原理,综述了DNA计算的特点、DNA计算模型,并指出了DNA计算研究中存在的问题,最后就DNA计算的发展前景进行了展望。     

DNA计算原理、现状及展望

综述了DNA计算原理和特点,接着介绍了DNA计算的研究现状,指出了目前DNA计算的主要研究方向和DNA计算需要解决问题,最后对DNA计算的发展前景进行了展望.     

旅行商问题的闭环DNA算法

旅行商问题TSP是NP完全问题,在工程实践中有着广泛的应用,利用常规算法很难在多项式时间内解决。DNA计算是一种新兴的计算模式,与生俱来的强大并行计算能力使得它在解决众多NP问题上表现出了巨大的优势。尝试利用DNA计算中改进的闭环模型解决TSP问题。首先介绍了闭环DNA计算模型及其改进;随后提出了一种基于改进的闭环模型求解TSP问题的算法,并对算法的实验过程进行了详细的描述;最后运用该算法解决了一个小规模的TSP问题算例,结果表明,该算法能在较低的时间复杂度内有效地解决TSP问题。     

DNA编码问题及其复杂性研究*

高质量的DNA编码可以避免DNA分子间的非特异性杂交,提高DNA计算的有效性和可靠性。首先对DNA编码的约束条件进行归类,分析了各编码约束对编码质量的影响;然后研究了编码质量、编码数量、序列长度与DNA计算可靠性、有效性、可扩充性之间的关系;最后通过类比DNA编码问题和图的独立集问题,说明了求解最大DNA序列集合问题是NP完全的。     

旅行商问题的闭环DNA算法

旅行商问题TSP是NP完全问题,在工程实践中有着广泛的应用,利用常规算法很难在多项式时间内解决。DNA计算是一种新兴的计算模式,与生俱来的强大并行计算能力使得它在解决众多NP问题上表现出了巨大的优势。尝试利用DNA计算中改进的闭环模型解决TSP问题。首先介绍了闭环DNA 计算模型及其改进;随后提出了一种基于改进的闭环模型求解TSP问题的算法,并对算法的实验过程进行了详细的描述;最后运用该算法解决了一个小规模的TSP问题算例,结果表明,该算法能在较低的时间复杂度内有效地解决TSP问题。     

DNA计算机原理、进展及难点(Ⅳ):论DNA计算机模型

在DNA计算机研究中,所建模型的好坏直接影响着DNA计算中诸多问题,如编码的难易程度、整个生物操作或生化反应的设计、解空间的大小、计算时间多少、应用范围以及通用性的程度等.如何建立快速的、功能强的、具有一定通用性的DNA计算机模型,是从事DNA计算机研究者一直关注与感兴趣的难题.为此,该文将主要围绕着DNA计算机的模型建立展开讨论,重点讨论10年来所建立起来的一些主要模型.共分为三种类型:第一种是利用DNA分子结构与特性所建立起来的几种主要模型;第二种是利用生物操作方式所建立的三种模型:试管型、表面型与芯片型;第三种是所谓的DNA计算机模型.文中讨论了这些模型的基本原理、功能、优缺点以及应用的研究进展等.最后,对DNA计算机模型研究中的难点进行了分析,并给出了相应的解决思路.     

DNA计算中的数据与计算模型

对DNA计算的通用性及单链、双链、粘性末端、发夹、质粒、k-臂DNA分子等各种数据作了简单介绍,并对基于DNA分子结构特性和基于DNA计算机研制过程两个方面的DNA计算模型进行了分析对比。针对各种不同的DNA数据及特性,提出了混合DNA计算模型的研究思路,并从不同角度论述了混合DNA计算模型的可行性。     

移动自组网QoS路由的DNA计算模型

QoS路由问题是移动自组网应用面临的一个重要问题,其中如何根据移动自组网动态拓扑结构和单向链路的特点来设计路由算法是关键。DNA计算是一种基于生化反应的新型计算方法,高度的并行性和海量存储能力是其最大的特点。文章首先给出了QoS路由问题模型,然后介绍了DNA的分子结构和DNA计算的基本原理,最后依据Adleman进行DNA计算的编码方法,给出了移动自组网QoS路由问题的DNA计算模型,为解决多约束QoS路由问题提供了一种新的思路。     

智能仿生算法及其网络优化中的应用研究进展

网络优化问题是一类特殊的组合优化问题,很多问题找不到求最优解的多项式时间算法,属于NP困难问题;智能仿生类算法主要是模拟生物进化和生物群体的智能化方法,如人工神经网络、遗传算法、DNA分子算法、蚂蚁算法等,它们在解决NP问题上表现出得天独厚的优势,取得了诸多丰硕的成果。因此,该文系统地综述了近年来智能仿生算法及其网络优化中的应用研究进展和未来发展方向。     

DNA计算与DNA计算机研究进展与展望

DNA computing is a new method based on biochemical reactions and molecular biology technology.The paper first introduces the basic principle and advantages of DNA computing, and then surveys DNA computing and DNA computer, finally, points out current existing problems and future search directions of DNA computing and DNA computer.     

DNA计算的原理和模型

介绍了DNA计算及其模型，阐述了DNA计算的数学基础，讨论了DNA计算的优点和目前存在的问题。     

DNA并行计算中的B-树数据结构的设计与实现

DNA分子特性使得DNA计算具有极大的存储密度和高度的计算并行性。不管何种计算模型,DNA分子的选择和DNA编码都十分重要。提出了DNA计算中的B-树的数据结构设计方法。首先给出了B-树定义及其操作的形式化描述,接着介绍了本计算模型采用的3D结构DNA分子——k-arms分子结构,详细给出了一棵m阶B-树的构造步骤,最后实现了其查找、插入和删除等操作。提出了DNA分子计算的3D结构和分治策略,具有一定的可扩展性和并行性,对DNA计算的其他模型有参考价值。