基于系统药理学方法筛选抗急性髓系白血病的中药活性分子

目的:筛选抗急性髓系白血病(AML)中药活性分子。方法:搜集治疗急白草药及化合物,通过系统药理学方法预测药物成药性质,潜在靶点以及潜在巯基消耗特性。选择口服生物利用度、类药性和巯基消耗活性较高的紫草素作为验证分子。构建潜在活性化合物-靶点、靶点-疾病网络,通过拓扑学特性筛选关键靶点及潜在活性分子。利用谷胱甘肽(glutathione,GSH)试剂盒及邻苯二甲醛(OPA)荧光法检测加入紫草素后还原型GSH含量变化。数字表达谱芯片检测紫草素100μg·L-1处理HL-60细胞48 h后基因表达。结果:在治疗AML的40味草药的4 024个化合物中,经过口服生物利用度(OB),类药性(drug-likeness,DL)及巯基消耗特性筛选获得72个分子,最后通过与AML相关靶点联系筛选出10个潜在活性化合物。实验验证紫草素消耗细胞及化学体系内GSH,预测靶点能够调控基因芯片的差异基因(100μg·L-1,48 h)。结论:本方法可用于研究中药的物质基础,有助于挖掘治疗AML中药活性分子,为抗AML药物研究提供借鉴。     

治疗慢性肾病中药的计算机药理学研究

采用分子描述符主成分分析、药代动力学参数预测和毒性预测等计算机药物分子辅助设计技术对治疗慢性肾脏病补益类和攻逐类中药所含化学分子的药理学性质进行研究.结果表明计算机药物分子辅助设计技术可以全面直观地体现补益类和攻逐类中药所含化学分子的结构差异,并快速筛选出一批类药性良好的先导化合物.     

基于中药药性组合模式的“老药”抗癌作用发现

目的从中药药性组合的概念出发,探索“老药”抗癌新作用,为“老药新用”提供中医药理论指导下的新方法与新思路。方法以气阴两虚型肺癌为例,通过分析中医抗肺癌的治则治法,依据功效-药性组合关系,整理出中医抗肺癌所需要的药性组合模式,筛选符合此标准的化学药,预测其具有抗癌作用。结果筛选出符合益气、养阴药性组合模式的15种化学药,其中2种是临床使用的抗癌药,另有4种非抗癌化学药物具有抗癌作用。结论基于药性组合模式发现“老药”抗癌作用的方法具有一定的可靠性,对于“老药新用”的研发具有指导意义。     

基于药效团模型与正负效应双靶标分子对接策略挖掘TPH1抑制剂相关的中药活性分子

目的基于药效团模型与正负效应双靶标分子对接策略挖掘色氨酸羟化酶1（Tryptophan hydroxylase-1, TPH1）抑制剂相关的中药活性分子。方法搭建药效团模型、类药性筛选、药代动力学预测、双靶标分子对 接、分子动力学模拟于一体的药物筛选平台,从TCM@TAIWAN 数据库中发现新型TPH1 候选抑制剂。结果 命中分子ZINC85626251、ZINC85626260 实验数据均表现出良好的抑制活性及类药性,预测命中分子可有效抑 制胃肠道相关的TPH1 活性,但对中枢神经系统相关TPH2 活性抑制作用较小,并精准预测靶标与命中分子的 结合自由能及相互作用方式。结论整合多种计算机虚拟筛选技术挖掘TPH 抑制剂,从天然产物中挖掘到2 个 缓解肠易激综合征相关痛症的潜在的活性分子ZINC85626251、ZINC85626260。     

基于计算机模拟技术从中药天然产物库中挖掘色氨酸羟化酶1抑制剂

目的 基于计算机模拟技术从中药天然产物库中挖掘色氨酸羟化酶1(tryptophan hydroxylase-1,TPH1)抑制剂。方法 搭建分子对接、类药性筛选、药动学预测、分子动力学模拟于一体的药物筛选平台，从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库中挖掘TPH1抑制剂。结果 川贝酮碱(TCMSP＿ID:MOL009572)实验数据均表现出良好的TPH1抑制活性及类药性，预测命中分子可有效抑制胃肠道相关TPH1活性，但对中枢神经系统相关TPH2活性抑制作用较小；通过酶活抑制实验验证抑制效应，并借助分子动力学模拟动态解析结合能变化及各项能量分布。结论 整合多种虚拟筛选技术挖掘到缓解肠易激综合征相关痛症的TPH1抑制剂-川贝酮碱MOL009572。     

基于药物靶点从传统中药库中高通量虚拟筛选EGFR-TK抑制剂

目的运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCMSP)中寻找表皮生长因子受体激酶(EGFR-TK)的中药小分子抑制剂。方法以EGFR-TK为靶点,运用分子对接技术进行首轮筛选,然后运用ADME/T预测进行第二轮筛选,最后基于靶点与药物相互作用位点进行第三轮筛选。结果以原配体(吉非替尼)为阳性对照,筛选出3个类药性良好的天然小分子化合物,它们与EGFR-TK亲和力及相互作用基团均优于吉非替尼(临床抗肿瘤药物),并且确定了它们的中草药来源。结论成功建立一整套高通量虚拟筛选EGFR-TK抑制剂的策略,该研究结果可促进从传统中药库中提取、设计以及实验合成新的抗肿瘤药物。     

基于网络药理学的藏药红景天功效关联性质量标志物预测分析

目的 基于中药质量标志物（quality marker，Q-Marker）核心理论，结合文献研究与网络药理学分析，预测藏药红景天传统功效关联性Q-Marker。方法 通过文献整理、TCMID数据库收集构建红景天化学成分库，利用FAFDrugs4网站计算各成分吸收、分布、代谢、排泄和毒理性（ADMET）属性，筛选得到类药性化合物；采用BATMAN-TCM平台预测并收集红景天类药性化合物靶点，将靶点导入DAVID数据库和CTD平台富集分析得到红景天作用组织和疾病；根据Q-Marker定义，结合红景天类药性化合物与传统功效主治的关联性，分析红景天潜在的Q-Marker。结果 红景天中67个类药性化合物共作用407个靶点；主要靶向作用于肝、肺、肾、心、脑等组织，涉及癌症、高血压、脑缺血、心肌缺血、动脉粥样硬化、心衰、哮喘等1060种疾病；结合《晶珠本草》1986年版等典籍记载藏药红景天"归肺心经，清肺热，治脉病"的传统功效主治与现代文献研究，揭示了类药性成分没食子酸乙酯、没食子酸、红景天苷、草质素、咖啡酸、儿茶素、原儿茶酸、香草酸等可作为红景天传统功效关联性Q-Marker。结论 以Q-Marker"有效性"为核心要素，辅以其他原则分析，有效预测了红景天功效关联性Q-Marker。建议后期可开展功效相关药理学及病理状态下药动学等研究，进一步确定其Q-Marker，为制定全面科学的红景天质量控制标准提供参考。     

金银花保护心力衰竭缺血心肌的网络药理学研究

目的：运用网络药理学的方法研究金银花保护心力衰竭缺血心肌的作用机制。方法：利用TCMSP数据库检索关于金银花中的化合物，口服生物利用度（OB）≥30%和类药性（DL）≥0.18作为筛选金银花活性成分的两种条件。在Genecards数据库和OMIM数据库中输入关键词“心力衰竭”，获得心力衰竭的靶标基因。将各个药物靶标与靶标基因进行逐一比对，筛选得到共同的靶标基因，从中发现金银花对心力衰竭起保护作用的靶点。靶标蛋白的蛋白互作信息通过String数据库完成，然后使用KEGG富集分析说明金银花在心力衰竭缺血心肌中发挥保护作用的机制。结果：检索TCMSP数据库得到金银花的236个化学活性成分，筛选出具有类药性和口服吸收良好的活性化合物23种。在TCMSP平台筛选金银花的23种活性化合物的作用靶点，得到449个作用靶点。经进一步筛选，得到金银花与心力衰竭的173个共同基因。KEGG富集分析显示金银花主要影响以下三条心力衰竭的通路：剪切应力与动脉粥样硬化、TNF、IL-17信号通路。结论：金银花可能经剪切应力与动脉粥样硬化、TNF、IL-17三条信号通路发挥保护心力衰竭缺血心肌的作用，可为未来深入研...     

试论蒙医药的药性与"药能""药力"的区分

防治疾病是以药为主的。药物一般都包含着治病的药味、药能、药力。这些功能对“赫依、希拉、巴达干”三根起着平衡作用 ,在患病器官的康复中起着协调作用 ,但是最终去病根还是药物的功能起着主要作用。在治疗疾病的过程中是药的“药性”功能起着主要作用 ,这是通过临床实践总结出来的。通过药物总的作用 ,及自身的药性和药力、药能 ,进一步掌握药物的筛选和分辨 ,正确实用都有很大的帮助。蒙药的药性是 17个药能的精华 ,是药的药力及药物的主要形成基础。蒙药的药性概念虽然范围很广泛 ,但是药的药性就是药物包含本身的原有的内部药性。蒙…     

肿瘤坏死因子-α中药小分子抑制剂的计算机虚拟筛选

目的 :运用计算机虚拟筛选技术快速搜索肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α, TNF-α)的中药小分子抑制剂。 方法 :采用Accelrys公司Discovery Studio分子模拟软件包(版本2.5),对蛋白质晶体结构数据库PDB中TNF-α与小分子抑制剂(化合物307)形成的复合物(PDB代码:2AZ5)三维结构活性部位进行分析,通过ligandfit模块进行分子对接。运用药代动力学参数预测和毒性预测等模块对分子对接结果进行2次筛选。 结果 :以原配体(化合物307)的Dockscore值为阈值,筛选出中国天然产物数据库中12个类药性良好的化学成分与TNF-α存在较强的相互作用。 结论 :该研究结果可促进治疗类风湿性关节炎、炎性肠病等病的新型药物研制。