湖北省HIV-1 B′亚型核心蛋白基因序列分析

目的 分析湖北省人类免疫缺陷病毒(HIV-1)主要流行株核心蛋白(gag)基因P17/24区序列特征,了解其流行特点和变异规律.方法 对湖北省HIV-1主要流行区域进行流行病学调查,应用巢式聚合酶链反应对102例HIV-1感染者的gag基因P17/24区进行扩增,对阳性扩增样本进行基因测序和序列分析.结果 湖北省共发现4种HIV亚型和重组亚型,B'亚型占82.69%,B'/C重组毒株、CRF01-AE重组毒株各占7.69%,C亚型占1.92%;基因序列分析显示,湖北省HIV-1 B'亚型与我国河南和云南省等地的毒株有较高的同源性;氨基酸序列变异分析显示,HIV-1 B'亚型毒株gag基因P17/24区发生不同程度的变异,P17突变位点较多,P24较为保守.结论 B'亚型依然是湖北省HIV优势流行株,HIV-1在湖北省有加快流行和进一步复杂化的趋势.     

湖南省HIV-1分子流行病学研究

目的 了解HIV毒株在湖南省的亚型别特点和流行规律。方法 收集湖南省不同地区40名既往已确认为HIV-1感染者的抗凝全血样品，提取前病毒DNA，用套式聚合酶链反应方法（nested-PCR）扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V3区，并进行序列测定。序列的排列、比较和同源性分析使用威斯康星GCG公司软件完成，确定亚型。结果 通过PCR扩增得到33份样品的结果，依据env区基因序列，与HIV-1各个亚型国际参考株比较，通过系统进化分析，最后确定湖南省样品分属6个亚型，分别为HIV-1B亚型中的泰国B（B’）亚型10份，欧美B亚型3份，流行重组型CRF-BC5份，流行重组型CRF01-AE13份，A亚型1份和D亚型1份。结论 湖南省已存在多种HIV-1亚型，应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测，及时调整防治策略。     

湖州市不同感染人群HIV-1流行毒株亚型分析

目的了解湖州市HIV-1型流行毒株的基因型分布情况,为艾滋病防治工作提供科学依据。方法采集204份HIV-1型抗体阳性的全血标本,从样本中提取病毒RNA,采用巢式PCR方法扩增病毒gag基因,对PCR产物进行核苷酸序列测定。应用Clustal W软件对测序结果和HIV分型参考株序列进行多序列比对和分析;使用MEGA 4.0软件进行系统进化分析。结果 204份标本有138份样品扩增出HIV-1的gag基因片段,共存在4种HIV-1亚型和重组型。其中CRF07_BC重组亚型74株(53.62%)、CRF01_AE重组亚型40株(28.99%)、B亚型12株(8.69%)、CRF08_BC重组亚型12株(8.69%)。异性、同性性传播以CRF07_BC和CRF01_AE为主;注射吸毒传播以CRF07_BC为主。结论湖州市不同感染人群中主要存在4种基因亚型,CRF07_BC已成为湖州市不同感染人群中HIV主要流行亚型,重组型毒株占优势,应加强对HIV-1流行毒株亚型变异的监测,及时调整防控策略。     

输血后感染的HIV-1流行株分子流行病学调查

目的了解河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中HIV-1亚型特点和来源。方法采集HIV-1感染者的全血样品,分离外周血单核细胞（PBMC）,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应（nested-PCR）,扩增HIV-1的env基因的C2～V3区,并进行序列测定和亚型分析。结果对7例HIV-1感染者的血标本进行nested-PCR扩增,得到6份HIV-1 env C2～V3基因片段,经序列测定分析,6份样品均为B′亚型。组内基因离散率6.22%±1.38%,基因序列与云南瑞丽株RL42（泰国B亚型）相近。受血者Heb0224及其配偶Heb0223与云南瑞丽株RL42 env的基因离散率分别为3.93%和7.71%。结论在河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中流行的为HIV-1 B′亚型。     

北京市2006年HIV一1流行毒株的gag和env基因序列测定及亚型分析

目的监测2006年北京市北京户籍HIV感染者中HIV-1型流行病毒株的亚型分布特点和变化规律。方法采集北京市2006年新确认北京户籍HIV-1感染者的抗凝全血样品32份,分离血浆,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应方法扩增病毒gag和env基因,并进行序列测定和亚型分析。结果系统进化分析表明北京户籍HIV-1感染者样品分别属于5个亚型,分别为B亚型9份,泰国B亚型2份、C亚型2份,流行重组型CRF07 BC亚型5份,流行重组型CRF01．AE亚型4份。结论北京市居民中已存在多种HIV-1亚型和流行重组型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。     

河南省2006～2008年吸毒人群HIV-1分子流行病学调查

目的了解河南省吸毒人群HIV-1的亚型分布及流行特征。方法采集27例HIV-1抗体阳性的吸毒者外周血单个核细胞(PBMC),应用套式聚合酶链反应(PCR)对其核酸样品进行扩增并测序,对其env基因C2-V3段及邻近350～450个核酸序列进行比较分析。结果27份血样中,6份为BC重组亚型,其中4份为CRF07-BC,2份为CRF08-BC。与国际参考株CRF07-BC.CN.97.CN54A.CRF08-BC.97CNGX6F.接近。21份为泰国B(B’)亚型,与国际参考株RL42接近。结论河南省吸毒人群感染的HIV-1以在中国中部地区献血人群中流行的泰国B(B′)亚型为主,也存在主要以性传播途径感染的人群中流行的BC重组亚型。     

九江市HIV-流行毒株基因序列测定和亚型分析

目的：了解九江市HIV-1流行毒株的亚型分布情况。方法：对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT—PCR扩增，获得GAG基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果：在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株四株，B亚型和A／E重组亚型HIV-1毒株各一株。结论：HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂，防控形势严峻。     

输血后感染的HIV-1流行株分子流行病学调查

目的了解河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中HIV-1亚型特点和来源。方法采集HIV-1感染者的全血样品,分离外周血单核细胞(PBMC),提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应(nested-PCR),扩增HIV-1的env基因的C2～V3区,并进行序列测定和亚型分析。结果对7例HIV-1感染者的血标本进行nested-PCR扩增,得到6份HIV-1 env C2～V3基因片段,经序列测定分析,6份样品均为B′亚型。组内基因离散率6.22%±1.38%,基因序列与云南瑞丽株RL42(泰国B亚型)相近。受血者Heb0224及其配偶Heb0223与云南瑞丽株RL42 env的基因离散率分别为3.93%和7.71%。结论在河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中流行的为HIV-1 B′亚型。     

陕西省HIV-Ⅰ流行毒株亚型分析

目的了解陕西省近年来发现的人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者所携带毒株的基因序列特征、亚型种类和毒株来源以及在各高危人群中的分布,推断其传播来源和流行趋势,为本省艾滋病防治工作提供技术资料。方法对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集HIV感染者抗凝全血,提取前病毒DNA,应用套式聚合酶链式反应（nested-PCR）扩增其膜蛋白基因env,对其C2～V3区及邻区的核苷酸序列进行测定,用GCG软件（Wisconsin公司）进行亚型分析。结果35份样本PCR扩增阳性并得到相应序列。经基因离散率计算和系统树分析,共发现4种HIV-1基因亚型和重组毒株,即HIV-1 B’、C、CRF01-AE和CRF-BC重组型。其中泰国B’亚型为主要流行株,占82.35%（28/34）,主要来源于既往采供血者及其配偶;其次是CRF-BC重组型,占11.77%（4/34）,主要来源于吸毒人群：CRF01-AE和C亚型各1份,分别占2.94%,均来自劳务输出的归国人员。该组样本B’亚型内的基因离散率为5.2%（n=23）;而CRF-BC亚型内的基因离散率为0.9%（n=3）,彼此间显示出较近的传播关系。结论陕西省HIV-1流行株以泰国B’亚型为主,发生在与既往有偿采供血相关的地区和人群,已有6～7年的流行史;首次在当地吸毒人群中发现HIV-1 CRF-BC重组型,并且显示近期高度流行的趋势。加强对既往有偿献血人群和吸毒人群的行为干预,控制HIV病毒在家庭内和吸毒人群中的传播,将是今后本省艾滋病防治工作重点之一。     

天津市不同感染途径HIV-1感染者流行毒株亚型分析

目的 了解天津市HIV-1毒株的流行情况,比较不同感染途径HIV-1感染者中流行毒株的亚型分布.方法 采集100例感染途径已知的HIV-1感染者抗凝全血标本,提取DNA,用巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因,并进行序列测定和亚型分析.结果 100份样品中,有87份样品被成功扩增出HIV-1的gag基因片段,通过系统进化分析,确定天津市HIV-1流行毒株分属4个亚型和重组型,其中CRF01 _AE比例最大,达59.77％(52/87),主要分布在通过同性和异性性传播的HIV-1感染者中,而在通过静注吸毒感染的HIV-1感染者中以CRF07_BC亚型为主.结论 天津市HIV-1流行株至少有4种基因亚型,且不同感染途径HIV-1感染者流行毒株的亚型分布略有不同,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略.