结核分枝杆菌北京基因型菌株与耐药表型的关系

目的研究我国结核分枝杆菌北京基因型菌株的分布以及与耐药表型的关系。方法2008年4-12月从我国6个区域收集痰涂片阳性的结核病患者的临床分离株，每一患者的一份分离株经生化方法鉴定为结核分枝杆菌复合群。收集患者的性别、年龄、病史、菌株耐药谱和菌株来源资料。药物敏感性实验采用比例法。运用间隔区寡核苷酸分型方法或基因dnaA—dnaN之间插入序列IS6110鉴定北京基因型菌株。结果在410份结核分枝杆菌分离株中，67．1％（275N10）的分离株属于北京基因型菌株，东北部区域感染北京基因型菌株患者的比例高于中西部区域（x^2=20．50，P=0．000）。患者的年龄、性别和治疗史与感染北京基因型菌株无关。在耐多药菌株和耐利福平菌株中，北京基因型菌株的比例显著高于非北京基因型（P=0．002，P=0．005）。结论患者的年龄、性别和治疗史与感染北京基因型菌株无关，东北部区域北京基因型菌株分布比例显著高于中西部区域。北京基因型菌株与利福平耐药和耐多药有关。     

新疆南疆地区结核分枝杆菌临床分离株中北京基因型菌株的鉴定

目的 鉴定MTB北京基因型菌株,了解北京基因型菌株在新疆维吾尔自治区(简称新疆)南疆地区的分布特征,为新疆地区结核病的防治和分子流行病学研究提供科学依据.方法 2009年1-6月,从新疆喀什市、和田市结核病医院和疾病预防控制中心住院及登记结核病拟诊患者的痰液中收集MTB临床分离株,采用RD105缺失基因检测法鉴定北京基因型菌株.用频数和百分率进行统计学描述.结果 共收集到200株MTB临床分离株,采用RD105缺失基因检测法对临床分离株进行鉴定,共分为2个基因群,即北京基因型和非北京基因型,其中北京基因型菌株79株,占全部菌株的39.5%(79/200),非北京基因型菌株121株,占全部菌株的60.5%(121/200).结论 MTB北京基因型菌株在新疆南疆地区维吾尔族人群中呈一般流行趋势,北京基因型菌株是否为新疆地区的主要流行菌株还有待进一步研究.     

天津市监狱羁押人员中结核病患者临床分离菌株的基因型分析

为揭示结核分枝杆菌(MTB)北京基因型菌株中基于差异区域(RD)多态性形成的各个进化分支在天津监狱羁押人员中的流行情况,笔者收集2013年1月至2016年6月从天津市监狱羁押人员结核病患者痰标本中分离培养获得的124株MTB菌株进行基因型分析。结果发现,124株菌株中经鉴定为北京基因型者有116株(93.5%)。116株北京基因型菌株中,96株(82.8%)为北京基因型现代株,20株(17.2%)为北京基因型古代株。基于大片段多态性分析,北京基因型MTB分为4个进化分支。20株北京基因型古代株中有7株(6.0%)为RD181(+)菌株,13株(11.2%)为RD181(-)菌株;96株北京基因型现代株中,95株(81.9%)为RD150(+)菌株,仅1株(0.9%)为RD150(-)菌株。北京基因型MTB的各个进化分支中,RD150(+)北京基因型现代株在监狱中传播流行最为广泛。结果提示需加强RD150(+)北京基因型现代株在天津监狱羁押人员中流行的监测工作。     

利用多重PCR方法快速鉴定结核分枝杆菌北京基因型菌株

目的 建立结核分枝杆菌北京基因型菌株快速鉴定方法 ,研究该家族在人群中的流行传播的规律和特点。 方法 采用间隔区寡核苷酸（spoligotyping）分型与多重PCR方法 分别对临床分离的112株结核分枝杆菌进行北京基因型菌株鉴定。 结果在分析的112株结核分枝杆菌中,107株为北京基因型,多重PCR鉴定结果与Spoligotyping分型符合率为100%。 结论 与spoligotyping分型相比,多重PCR技术可以快速地区分北京基因型与非北京基因型株,且方法 简单,更适于基层试验室中对北京基因型结核分枝杆菌在人群中的流行进行大规模监测。     

德国分离出北京基因型耐多药结核分枝杆菌株

背景：德国1995年至2001年。目的：确定在德国分离出的451株耐多药结核分枝杆菌株问的基因相关性，以及鉴定北京基因型菌株。设计：所有菌株均行IS61l0指纹及簇型分析。成簇的分离菌株作为近期传播的尺度。结果：433株中有214株(49．4％)具有4个以上IS6110拷贝，构成了46个指纹簇型，包含2-32例病人。以经典的流行病学资料为基础，39例病人(18．2％)、在14个簇型(30．4％)间建立了传播联系，还包括3例MDR-TB(耐多药结核杆菌)的外源性再感染。有175株(38．8％)为北京基因型菌株，并呈逐年增长趋势，从1995年的19．2％增至2001年的58．3％。这些病例约70％在国外主要是前苏联出生。结论：MDR-TB菌株的传播看来是导致德国MDR-TB播散的原因。MDR-TB菌株的外源性再感染应考虑为治疗失败的可能原因。高比例的MDR-TB菌株很可能是由前苏联传入，北京基因型菌株说明了MDR-TB在德国增长的原因之一。     

结核分枝杆菌McSpoligotyping 基因分型在宜昌地区耐多药结核病中的应用研究 凝血筛查指标变化及其对临床分型的诊断价值

[摘要]　目的　运用熔解曲线间隔区寡核苷酸分型（melting curve spacer oligonucleotide typing, McSpoligotyping）方法对宜昌地区耐多药结核分枝杆菌进行基因分型,以评价其在结核病流行病学调查中的应用价值。方法　选择2019年1月—2020年12月耐多药菌株77株作为实验组,并以异烟肼和利福平敏感菌株110株作为对照组,运用McSpoligotyping方法进行基因分型,将分型结果与SpolDB4.0数据库进行比对分析。结果　187株菌株中北京基因型116株（62.03％）,非北京基因型71株（37.97％）。对照组110株中北京基因型60株（54.55％）,其中数量最多的1组国际型别编码（spoligotype inter-national type, SIT）为1的北京基因型共44株（40.00％）;非北京基因型50株（45.45％）,以T族、Manu族常见。实验组77株中北京基因型56株（72.73％）,其中数量最多的1组为 SIT为1的北京基因型共44株（57.14％）,非北京基因型21株（27.27％）,以T族、Manu2族常见。实验组北京基因型菌株所占比例与对照组差异有统计学意义。实验组成簇率（79.22％）与对照组成簇率（79.09％）差异无统计学意义。结论　北京基因型菌株是宜昌地区结核病的主要流行菌株,在耐多药结核病患者中北京基因型菌株更为流行。耐多药结核菌株有一定的遗传多态性。McSpoligotyping方法操作简单、快速、对于结核病分子流行病学研究具有重要意义。     

结核分枝杆菌北京基因型菌株新型分子遗传标志的鉴定

目的分析结核分枝杆菌北京基因型菌株与非北京基因型菌株间差异表达的蛋白质，寻找可用于快速区分北京基因型的分型标志。方法应用间隔寡核苷酸分型法对56株结核分枝杆菌进行基因分型，经双向电泳技术比较北京基因型菌株与非北京基因型菌株的全菌蛋白表达图谱差异，差异表达的蛋白质通过基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪进行质谱分析，蛋白质数据库进行检索。进而对差异表达的蛋白质相应基因及上游进行序列分析。结果56株结核分枝杆菌中有49株为北京型菌株，7株为非北京型菌株。两个基因型菌株中差异明显表达的蛋白质为Rv0927c，该蛋白质斑点在49株北京基因型菌株中均缺失，而在7株非北京菌株和H37Rv中均有出现。北京基冈型菌株Rv0927c基因有两个特征性突变：在421位核苷酸位点的AGC3个碱基缺失，以及该基因上游127位点G—A的突变；而非北京基因型菌株该基因及其上游序列与H37Rv完全相同。结论 Rv0927c基因在北京基因型菌株中的特征性突变，对开发新型区分北京基因型和非北京基因型结核分枝杆菌的方法奠定了基础。     

结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究

目的 揭示结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)北京基因型菌株的进化路径,在进化过程中产生的各个进化分支,以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法 收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株,首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207(RD207)的缺失情况,以鉴定收集的菌株是否为北京基因型;然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况,以及菌株基因组NTF(noise transfer function)区中插入序列6110(IS6110)的存在情况。结果 567株临床分离的MTB菌株中,517株(91.2%)为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中,447株(86.5%)为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株;70株(13.5%)为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析,北京基因型菌株被分为5个亚型,其中RD181(+)的北京基因型菌株为22株(4.3%),且全部为北京基因型古代株。RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的北京基因型古代株分别为41株(7.9%)和7株(1.4%)。447株现代菌株中,RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的分别为404株(78.1%)和43株(8.3%)。结论 MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株;北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支,其中RD181(-)/RD150(+)的北京基因型现代株为主要的流行分支。     

北京基因型是哈萨克斯坦耐药结核病的主要原因

地点：哈萨克斯坦的9个州，2001年。 目的：分析哈萨克斯坦的耐药结核杆菌分离株的遗传学联系，确定北京基因型的频率。 设计：对2001年全国耐药监测中9个州的所有耐药涂阳病例进行IS6110指纹和间隔区寡核苷酸分型法（spoligotyping）分析。分离株来自150名病人（64名初治，86名复治病人）。 结果：8例（5.3％）为重复感染。其余142株，91株（64．1％）分布在18个簇，提示耐药结核病的近期传播率很高。这一结果通过分析成簇菌株相似的耐药谱及病人的来源得到更进一步的证实。而且，成簇菌株中1／3以上为新病例。其中，70％为北京基因型，而对照组40例敏感株中只有37．5％为北京基因型。 结论：耐药结核病的传播是此结核病高发区耐药菌株传播所致。可以看出，北京基因型是引起哈萨克斯坦耐药结核病的主要原因，北京基因型和耐药相关。     

北京基因型结核分枝杆菌的流行及与二线抗结核药物耐药性的相关性

目的探讨北京市北京基因型MTB的流行风险因素及其与二线抗结核药物耐药性的相关性。方法收集北京各区县MTB菌阳临床株1140例,采用比例法进行药敏试验;采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法鉴定北京基因型与非北京基因型MTB;使用SPSS 22.0统计学软件,采用χ2检验或Fisher精确概率检验方法对实验数据进行统计学分析。结果在1140株MTB临床分离株中,北京基因型941株(82.5%),非北京基因型199株;北京基因型菌株来源的患者中男性663例(70.5%),非北京基因型菌株来源的患者中男性124例(62.3%),两者比较差异有统计学意义[P=0.021,OR(95%CI):1.442(1.048~1.985)];北京基因型菌株来源的患者中流动人口441例(46.9%),非北京基因型菌株来源的患者中流动人口78例(39.2%),两者比较差异有统计学意义[P=0.048,OR(95%CI):1.368(1.001~1.869)];北京基因型菌株来源的患者中年龄≥65岁的患者129例(13.7%),非北京基因型菌株来源的患者中40例(20.1%),二者比较差异有统计学意义[P=0.021,OR(95%CI):0.631(0.426~0.936)];北京基因型菌株中对左氧氟沙星(Levofloxacin,Lfx)、阿米卡星(Amikacin,Am)、卷曲霉素(Capreomycin,Cm)、对氨基水杨酸(Para-aminosalicylic,PAS)的耐药率分别为5.5%(52/941)、1.3%(12/941)、3.2%(30/941)和3.0%(28/941),非北京基因型菌株对以上4种药物的耐药率分别为10.6%(21/199)、8.5%(17/199)、12.6%(25/199)和11.6%(23/199),二者对4种药物的耐药率比较差异均有统计学意义(均P<0.05);北京基因型菌株中耐多药(MDR)菌株58株(6.2%),非北京基因型菌株中MDR菌株19株(9.5%),两者比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论北京基因型MTB在北京广泛流行且在男性人群和流动人口中的比例较高;与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株对Lfx、Am、Cm及PAS的耐药率低,但MDR-TB患者的比例无显著差异。     

State of knowledge of helminth fauna of freshwater fishes of Poland

A total 89 fish and lamprey species has been recorded from Polish freshwater habitats. Twenty-seven of them (30.3%) have not been surveyed for parasitic helminthes. Some of the latter fishes are either rare or not easily accessible. Other live only in specific habitats in scattered localities. An important obstacle for studying parasite faunas of some fishes may be their status on an endangered species. Among the non-surveyed fishes, are those which have been relatively recently introduced to Poland or migrated there on their own. The present paper attempts to review all hitherto not studied helminthologically fish species, their habitats, localities and current protection status.