胃镜活检组织RASSF1基因启动子甲基化检测及其临床意义分析

目的：探讨胃镜活检组织RAS相关结构域蛋白1（RASSF1）基因启动子甲基化水平及其临床意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测胃癌患者胃镜活检癌组织、癌旁组织及健康者正常胃组织RASSF1基因启动子甲基化状态,并比较其差异;分析胃癌患者RASSF1基因启动子甲基化与不同临床病理因素的关系。结果胃癌患者癌组织RASSF1基因启动子甲基化率为62．7％,癌旁组织甲基化率为4．0％,健康者正常胃组织甲基化率为2．7％,癌组织RASSF1基因启动子甲基化率高于癌旁组织和正常胃组织（P＜0．05）。胃癌患者癌组织RASSF1基因启动子甲基化率在不同性别、年龄、病变部位及幽门螺杆菌感染患者间比较差异无统计学意义（P＞0．05）,在不同分化程度、肿瘤最大径、淋巴结转移、远处转移和 TNM 分期患者间,比较差异均有统计学意义（P＜0．05）。结论胃癌患者胃镜活检癌组织RASSF1基因启动子甲基化率高于癌旁组织和正常胃组织,且甲基化率与癌组织分化程度、肿瘤最大径、淋巴结转移、远处转移和TNM分期有关,可反映胃癌患者的病情及预后。     

贲门腺癌组织中RASSF1A基因甲基化及其蛋白表达的研究

目的探讨RASSF1A基因甲基化及其蛋白表达与贲门腺癌的相关性。方法回顾性将33例贲门腺癌手术切除标本纳入本研究,每例标本选取癌组织,癌旁正常组织(距癌5 cm)组织各一块。采用甲基化特异性PCR检测RASSF1A基因的甲基化情况,采用免疫组织化学检测RASSF1A蛋白表达。结果 33例大体标本中共选取57块组织,其中癌组织33块,癌旁正常组织24块。贲门腺癌癌组织中RASSF1A基因甲基化的发生率为63.6%,明显高于贲门腺癌癌旁正常组织中RASSF1A基因甲基化的发生率(4.2%),两组比较差异有统计学意义(P0.05)。贲门腺癌癌组织中RASSF1A蛋白阳性表达率为45.5%,明显低于贲门腺癌癌旁正常组织中RASSF1A蛋白阳性表达率(87.5%),两组比较差异有统计学意义(P0.01)。21例RASSF1A基因甲基化阳性贲门癌组织中,15例(71.4%)蛋白表达阴性;12例RASSF1A基因甲基化阴性贲门癌组织中,9例(75%)蛋白表达阳性,3例(25%)蛋白表达阴性;经Spearman correlations相关分析发现:在贲门腺癌癌组织中RASSF1A基因甲基化与蛋白表达呈显著负相关(P0.01)。结论RASSF1A基因可能通过启动子区甲基化导致的表达失活参与了贲门腺癌的发生发展过程。     

肾细胞癌患者组织中RASSF1A、hMLH1及ALU甲基化水平的分析

目的探讨错配修复基因(h MLH1)、RAS相关区域家族1A基因(RASSF1A)启动子区甲基化以及ALU基因甲基化水平与肾细胞癌(肾癌)的关系。方法巢式甲基化特异性PCR(n MSP)检测15例肾癌组织及其相应癌旁组织中h MLH1、RASSF1A基因启动子区的甲基化状态,联合亚硫酸氢钠限制酶分析方法(COBRA)分析ALU基因甲基化水平。结果 h MLH1基因在肾癌组织中的甲基化率(0.41±0.18)%高于癌旁组织(0.32±0.13)%,差异有统计学意义(t=2.52,P0.05);ALU基因在癌组织中的甲基化率(0.11±0.04)%低于癌旁组织(0.12±0.03)%,差异有统计学意义(t=3.82,P0.05)。而RASSF1A基因在肾癌组织和癌旁组织中的甲基化率分别为(0.75±0.11)%和(0.69±0.12)%,差异无统计学意义(t=1.35,P0.05)。结论 h MLH1基因启动子区甲基化以及ALU基因甲基化可能与肾癌的发病有关,RASSF1A基因启动子区甲基化与肾癌发病无关。     

肾癌组织中BHD、RASSF1A、SPINT2基因启动子的甲基化研究

目的：检测肾癌组织中伯特-霍格-杜贝（BHD）、Ras相关结构域家族（RASSF）1A、丝氨酸蛋白酶抑制剂（SPINT）2基因启动子的甲基化状态,探讨其在肾癌发病中的可能作用。方法：收集肾肿瘤组织标本24份,其中透明细胞癌19份、错构瘤2份、癌旁组织3份,应用甲基化特异性聚合酶链反应法分别检测其BHD、RASSF1A、SPINT2基因启动子区CpG岛甲基化状态。结果：19例透明细胞癌同时检出3种抑癌基因甲基化3例,2种抑癌基因甲基化9例,1种抑癌基因甲基化7例。2例错构瘤中检出1种抑癌基因甲基化1例,3例癌旁组织中检出2种抑癌基因甲基化1例。检出BHD基因甲基化9例,均为透明细胞癌。检出RASSF1A基因甲基化8例,其中透明细胞癌7例,癌旁组织1例。检出SPINT2基因甲基化20例,其中透明细胞癌18例,错构瘤1例,癌旁组织1例。结论：肾癌组织中BHD、RASSF1A、SPINT2基因启动子区存在甲基化状态,抑癌基因甲基化可能在肾癌的发病机制中起重要作用。     

膀胱癌和肾癌中RASSF1A和BLU的甲基化状态

目的探讨RASSF1A和BLU在膀胱癌和肾癌中启动子甲基化状态及其意义。方法采用甲基化特异性PCR（MSP）技术分别在45例膀胱癌组织和相应癌周正常组织、12例肾癌组织及其相应癌周正常组织和3例非肿瘤患者正常膀胱组织中检测RASSF1A和BLU启动子区域的甲基化状态。结果膀胱癌组织中,RASSF1A和BLU甲基化率分别为55.6%和31.5%;肾癌组织中,两基因甲基化率为66.7%和33.3%。RASSF1A和BLU启动子甲基化状态与膀胱癌临床病理参数无明显相关性（P〉0.05）。在膀胱癌或肾癌中,RASSF1A和BLU启动子甲基化状态之间均无明显相关性（P〉0.05）。结论膀胱癌和肾癌中,RASSF1A和BLU频繁发生高甲基化,高甲基化可能参与膀胱癌和肾癌两类肿瘤的发生。     

骨肉瘤组织与血浆中RASSF1A甲基化的检测及其临床诊断意义

【目的】寻求有助于骨肉瘤临床诊断的分子生物学标志物。【方法】甲基化特异性 PCR 法检测30例骨肉瘤患者肿瘤组织和血浆及15例健康志愿者骨组织和血浆中 RASSF1A 启动子甲基化情况。统计分析RASSF1A 甲基化与患者性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤分化、肿瘤转移等临床病理特征的相关性。【结果】正常骨组织及血浆中均未检测到 RASSF1A 基因启动子区的甲基化。骨肉瘤组织中 RASSF1A 甲基化阳性率为40％（12／30）,血浆甲基化阳性率为26．7％（8／30）。12例肿瘤组织甲基化阳性患者其血浆甲基化阳性共8例,癌组织和血浆 RASSF1A 甲基化一致率为66．7％（8／12）,18例癌组织甲基化阴性其血浆甲基化也为阴性,Kappa 一致性检验显示骨肉瘤组织和血浆中 RASSF1A 甲基化水平具有一致性（κ＝0．133,P ＜0．05）。骨肉瘤组织及血浆中 RASSF1A 甲基化阳性率显著高于正常骨组织及血浆的甲基化阳性率（ P ＜0．05）,且骨肉瘤组织和血浆中 RASSF1A 甲基化水平与患者的性别、年龄、肿瘤位置无关（ P ＞0．05）,而与肿瘤的分化及有无远处转移有关（ P ＜0．05）。【结论】骨肉瘤患者血浆中 RASSF1A 启动子甲基化与骨肉瘤组织中变化具有一致性,可作为骨肉瘤患者临床诊断的一个辅助指标。     

胶质瘤患者RASSF1A基因转录表达和启动子区甲基化的研究

目的 探讨RASSF1A(RAS association domain family 1A)基因mRNA表达水平和基因启动子区CpG岛甲基化程度及其与启动子甲基化的关系。方法 用半定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测28份胶质瘤组织和4份正常脑组织中RASSF1A基因mRNA相对表达水平;用甲基化特异性PCR方法研究胶质瘤组织、正常脑组织和U251细胞株中,RASSF1A基因启动子区CpG岛甲基化状态。结果 RASSF1A mRNA在4份正常脑组织中全部表达;在脑胶质瘤中表达缺失率为21.4％(6/28),且表达量低于正常脑组织,但与患者年龄、性别、肿瘤大小、恶性程度间的差异无显著意义(P>0.05)。按病理学分类,胶质母细胞瘤与少突胶质肿瘤的差异有显著意义(P=0.011)。脑胶质瘤中RASSF1A基因启动子发生甲基化的频率为39.3％(11/28),正常脑组织和U251细胞株中,RASSF1A基因启动了未发生甲基化。11份启动子区甲基化的胶质瘤标本中,5份同时伴mRNA表达缺失(P=0.022)。结论 RASSF1A基因启动了在胶质瘤中发生异常甲基化。尽管RASSF1A mRNA在脑胶质瘤中表达缺失并不广泛,但其表达普遍下调。推测启动子区CpG岛甲基化可能是导致RASSF1A基因在胶质瘤中表达缺失或表达水平下调的一种机制。     

Runx3基因启动子区甲基化与胃癌的关系

目的通过检测胃癌Runx3基因启动子区域甲基化状态，来探讨Runx3基因启动子区域甲基化在胃癌发生和发展过程中的临床意义。方法采用DNA甲基化特异性PCR（MSP）技术对37例胃癌患者手术切除肿瘤组织及其癌旁组织Runx3基因启动子区域甲基化进行检测。结果Runx3基因在37例胃癌及其癌旁组织中甲基化率分别为40．5％（15／37）和8％（3／37）。结论Runx3基因启动子区甲基化可能是肿瘤特异性的（P＜0．05），可作为胃癌早期诊断的分子标记物。     

白血病患者RASSF1A基因甲基化状态及其临床意义

目的研究白血病患者骨髓中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子甲基化状态及其临床意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MS-PCR)检测86例白血病患者和60例非白血病患者对照组骨髓中RASSF1A基因启动子的甲基化状况,分析不同白血病类型之间的差异。结果 86例白血病患者中,有12例(13.95%)RASSF1A基因启动子甲基化,而60例非白血病患者骨髓均未检测到甲基化,二者比较差异均有统计学意义(P<0.05)。淋巴系白血病患者RASSF1A基因甲基化比例(23.1%)明显高于髓系白血病患者(6.4%)(P<0.05)。结论白血病患者骨髓中存在RASSF1A基因甲基化,淋巴系白血病甲基化比例明显高于髓系白血病。RASSF1A基因甲基化检测可能成为白血病分型的生物标志物之一。     

胃癌中多基因甲基化状态及其表达的研究

目的了解胃癌中p16、E-cadherin、Runx3、DAPK和CHFR基因启动子CpG岛的甲基化状态,并探讨基因异常甲基化与mRNA表达的关系及其意义。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测12例胃癌患者癌组织及其相应的癌旁正常组织中5种基因的甲基化状态,以12例胃镜活检的正常胃组织作为对照,采用RT-PCR方法相应检测了5种基因的mRNA表达水平。并分析每种基因甲基化程度与表达水平之间的关系。结果胃癌组织中,p16、E-cadherin、Runx3、DAPK和CHFR基因的甲基化率分别为41.7%、8.3%、58.3%、33.3%和58.3%,相应的癌旁正常组织中,p16、E-cadherin、Runx3、DAPK和CHFR基因的甲基化率分别为8.3%、0.0%、8.3%、8.3%和16.7%,且75%的胃癌组织中至少有一种基因甲基化,显著高于癌旁正常组织25%(P<0.05),而健康对照组织中无基因甲基化,在甲基化的胃癌组织中均无p16、E-cadherin和DAPKmRNA表达,而癌旁正常组织、非甲基化的癌组织中均有其表达。结论胃癌中多基因启动子CpG岛高甲基化是一个频繁的事件,并且基因启动子高甲基化与其mRNA表达缺失有关,这可能参与了胃癌的发生发展。     

抑癌基因RASSF1A与RASSF1B基因的关系

目的：研究RASSF1基因2个转录本基因在胃癌组织及相对应的癌旁组织中表达情况以及RASSF1 2个转录本基因与肿瘤发生的相关性。方法：设计特异性的引物,用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）的方法检测胃癌及癌旁组织中RASSF1家族中2种不同转录本mRNA的表达情况。结果：40例胃癌组织中RASSF1A基因表达缺失率为60.2%（24/40）,RASSF1B基因表达缺失率为37.5%（15/40）。结论：RASSF1A和RASSF1B2种转录本在胃癌组织中的表达下调,RASSF1A基因在胃癌的发展中起重要的抑制作用,RASSF1B的表达还可能与细胞的分化程度有关。     

甲基化寡核苷酸诱导灭活RASSF1基因在肝癌发病机制中的应用

目的:甲基化寡核苷酸诱导灭活RASSF1基因并探索其启动子甲基化在肝癌发病机制中的应用。方法:将与RASSF1基因启动子互补的甲基化寡核苷酸转染至肝癌SMMC-7721细胞系内,分别采用BSP和RT-PCR检测转染前后RASSF1基因启动子甲基化状态和mRNA表达状况。结果:正常SMMC-7721细胞系RASSF1基因启动子表现无甲基化状态并表达相应mRNA。转染互补甲基化寡核苷酸后,相应CG位点被诱导成完全甲基化状态,mRNA表达明显受到抑制。结论:互补甲基化寡核苷酸可诱导基因启动子甲基化状态,RASSF1基因启动子甲基化在原发性肝细胞癌发病机制中扮演重要角色。     

结肠癌中RASSF 1A基因启动子甲基化及其临床意义

本研究探讨结直肠癌组织中RASSF1A基因启动子甲基化和mRNA表达异常与结直肠癌病理生物学特征的关系,为阐明抑癌基因RASSF 1A基因在结直肠癌发生发展中作用及其分子机理提供有力科学实验依据。     

胃癌组织中HOXA5和HOXA10基因启动子甲基化状况及其临床意义

[目的]研究胃癌组织中HOXA5和HOXA10基因启动子甲基化状况及与临床病理特征关系.[方法]采用甲基化特异性PCR(MSP)法检测51例胃癌组织和正常胃粘膜组织中HOXA5和HOXA10基因启动子甲基化状态,并探讨其与临床病理特征的关系.[结果]①胃癌组织中HOXA5基因启动子的甲基化率(74.5％)明显高于正常胃粘膜组织(37.3％),差异有统计学意义(x2=14.356,P=0.000).HOXA5基因启动子甲基化率与肿瘤分化程度(x2=4.311,P=0.038)、浸润深度(x2=5.669,P=0.017)、淋巴结转移(x2=9.349,P=0.002)和肿瘤分期(x2=16.023,P=0.000)呈负相关,而与年龄和性别无关(P均＞0.05).②胃癌组织中HOXA10基因启动子的甲基化率(68.6％)明显高于正常胃粘膜组织(41.2％),差异有统计学意义(x2 =7.761,P=0.009).HOXA10基因启动子甲基化率与肿瘤分化程度(x2=5.304,P =0.021)、浸润深度(x2=15.457,P=0.000)和淋巴结转移(x2=6.157,P=0.013)呈负相关,而与肿瘤分期、年龄和性别无关(P均＞0.05).③HOXA5基因启动子甲基化率与其蛋白表达之间具有负相关性(r=-0.495,P=0.000),HOXA10基因启动子甲基化率与其蛋白表达之间亦具有负相关性(r=-0.343,P=0.000).两基因启动子甲基化率之间存在正相关性(r=0.751,P=0.000).[结论]胃癌组织中HOXA5和HOXA10基因启动子呈高甲基化状态,并且与其蛋白表达之间呈负相关;DNA异常甲基化可能是HOXA5和HOXA10基因表达改变的重要调控机制之一.     

应用MSP方法检测非小细胞肺癌RASSFlA基因启动子甲基化

目的探讨应用甲基化特异性PCR（MSP）方法检测非小细胞肺癌（NSCLC）RASSF1A基因启动子甲基化情况。方法留取58例非小细胞肺癌患者手术标本及正常肺组织，甲基化特异性PCR分析RASSF1A基因启动子甲基化情况。结果58例非小细胞肺癌中RASSF1A基因启动子甲基化阳性率为34．5％，甲基化与各临床参数之间无显著相关性。结论原发性非小细胞肺癌中存在着较高比例的RASSF1A启动子过度甲基化，提示RASSF1A在非小细胞肺癌的发生中起着重要作用。     

肺癌患者血浆RASSF1A和BLU基因甲基化检测及临床意义

【目的】探讨肺癌患者外周血血浆中抑癌基因Ras相关结构域家族1A（RASSF1A）和BLU基因启动子的甲基化状态及其临床意义。【方法】利用巢式甲基化特畀性PCR（nMSP）法检测肺癌患者外周血血浆与正常人血浆中抑癌基因RASSF1A和BLU基因启动子的甲基化状态。【结果】58例肺癌患者血浆样品中分别发现22例（37．93％）RASSF1A基因启动子的异常甲基化和17例（29．31％）BLU基因启动予的异常甲基化,20例正常对照血浆中都未检测到RASSF1A和BLU基因启动子的异常甲基化,差异有显著性（P〈0．01）;但血浆中两基因甲基化检出率与患者性别、肺癌组织学分型及临床分期无明显相关性（P〉0．05）。【结论】利用nMSP法检测外周血血浆中RASSF1A和BLU基因启动子的甲基化,可为肺癌的筛查、早期诊断提供有用的信息。     

DKK-3和WIF-1基因启动子甲基化状态与肝细胞癌的关系研究

目的探讨DKK-3和WIF-1基因启动子甲基化状态与肝细胞癌发生的相关性。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应检测33例肝细胞癌及相应的癌旁组织和20例正常对照肝组织中DKK-3和WIF-1基因启动子甲基化状态,分析上述组织中两种基因甲基化状态与临床资料的关系。结果DKK-3和WIF-1基因在癌组织中甲基化率明显高于癌旁组织和正常组织(P<0.05,P<0.05),而癌旁组织和正常组织中DKK-3和WIF-1基因甲基化率相比无明显差异;癌组织中DKK-3基因甲基化与临床资料中年龄及肝硬化有关;癌组织中WIF-1基因甲基化与临床资料中乙肝表面抗原、肝硬化有关。结论DKK-3和WIF-1基因启动子甲基化与HCC的发生相关;DKK-3和WIF-1基因致肝细胞癌的发生机制可能与肝硬化致肝细胞癌的发生机制不尽相同,两者是否有相互作用尚不清楚。     

p16基因甲基化对胃癌的早期诊断

目的:检测胃癌患者癌组织及全血DNAp16基因甲基化,并探讨其在胃癌早期诊断中的作用。方法:收集新鲜的胃癌组织及血液标本4 4例,胃溃疡等胃部良性疾病患者标本2 0例。采用甲基特异性PCR(MSP)技术分别检测肿瘤组织DNA和全血DNA中p16基因启动子甲基化。结果:38.6 % (17/ 4 4 )胃癌组织出现p16基因甲基化,出现甲基化组织对应的血液标本中88.2 % (15 / 17)出现p16基因甲基化。胃溃疡等胃部良性疾病患者标本中未发现甲基化。肿瘤组织中p16基因的甲基化状况与全血中出现p16基因甲基化关系密切(P<0 .0 1)。结论:胃癌组织及血液标本中p16基因甲基化的检测有助于胃癌的早期诊断。     

膀胱移行细胞癌A激酶锚定蛋白12基因转录表达与其启动子区甲基化状态的相关性

目的 探讨膀胱移行细胞癌组织中A激酶锚定蛋白12(A-kinase anchoring protein 12,AKAP12)基因mRNA表达水平和基因启动子区CpG岛甲基化程度及其与临床病理参数之间的关系.方法 用荧光定量逆转录PCR(FQ-RT-PCR)和甲基化特异性PCR(MSP)检测30份膀胱移行细胞癌组织及其癌旁组织中AKAP12基因mRNA的表达水平及其启动子区CpG岛甲基化状态.并用亚硫酸盐修饰后PCR产物进行克隆测序.结果 在30份膀胱移行细胞癌患者组织标本中,AKAP12在癌组织中表达下调比率为73.3%(22/30),在病理Ⅱ和Ⅲ级膀胱移行细胞癌中下调比率明显高于Ⅰ级(P=0.02).MSP检测结果显示,膀胱移行细胞癌甲基化比率为53.3%(16/30),且与膀胱移行细胞癌TNM分期(r=0.52,Pn=0.03)和病理分级(r=0.61,Pn=0.01)有明显的相关性.结论 AKAP12基因启动子区出现的异常甲基化可导致其在膀胱移行细胞癌中的表达沉默,且与膀胱移行细胞癌的发生有关.     

乳腺癌组织及癌旁组织HER2基因CpG岛甲基化水平及其mRNA表达的研究

目的探讨乳腺癌组织及癌旁组织人类表皮生长因子受体2(HER2)基因CpG岛甲基化率和HER2mRNA表达的差异。方法收集经病理确诊的50份乳腺癌组织和对应的癌旁组织样本,采用焦磷酸测序法、实时聚合酶链反应(PCR)和免疫组化法分别检测HER2启动子CpG岛甲基化率、HER2 mRNA表达和HER2蛋白表达。结果 HER2阳性乳腺癌组织HER2 mRNA相对表达量高于HER2阴性癌组织(P0.05),但HER2启动子CpG岛甲基化率差异无统计学意义(P0.05)。HER2阴性乳腺癌组织HER2基因启动子CpG岛甲基化率显著高于对应的癌旁组织(P0.05),而HER2 mRNA表达则低于对应的癌旁组织(P0.05)。HER2阳性的乳腺癌组织与其对应的癌旁组织之间以及HER2阳性与阴性癌旁组织之间,HER2基因启动子CpG岛甲基化率和HER2 mRNA相对表达量差异均无统计学意义(P0.05)。结论在HER2阴性的乳腺癌癌旁组织中,HER2基因启动子CpG岛的低甲基化可能是HER2 mRNA高表达的机制之一。