投影边缘在硝基苯类化合物构效关系研究中的应用

在三维投影的基础上,对投影的边缘进行了描述,并以其进行了定量结构活性相关研究.实验结果表明,与Am指数、指示变量和量化参数相结合,可使其数学模型得到明显提高.通过人工神经网络对硝基苯类化合物的毒性进行预测,结果令人满意.     

计算机辅助结构解析中自同构群的生成算法

在结构解析过程中,自同构群的生成是必须的。通过全通道拓扑等价性算法,得到了化合物的自同构群,并比较了几种拓扑等价性算法,结果发现,全通道算法能够正确划分化合物的结构图,从而为ＥＳＥＳＯＣ系统的立体异构体穷举生成奠定了基础。     

计算机辅助有机化合物结构解析ESESOC—Ⅱ

简要介绍了有机化合物结构自动解析专家系统ＥＳＥＳＯＣ－Ⅱ及其结构产生器由分子式穷举生成有机化合物结构异构体的基本算法。主要讨论了结构２产生器的穷举性，非冗性和有效性问题。     

原子对空间距离法及其应用

采用原子对空间距离法表征化合物的三维结构信息. 提出了计算端点的频数的方法, 与段的频数相比, 该方法能更好地描述原子对频数. 以不同段的距离, 分别采用上述两种频数计算得到化合物的相似度矩阵, 然后把相似度衍生为新的变量. 运用多元回归分析和人工神经网络分别构造了预测数学模型, 并对所得到的预测结果进行了比较. 这两种频数均较好地预测了HEPT类化合物的活性.     

基于MOLMAP 指数的光化学反应分类预测

由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP 指数, 其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征. 将前述MOLMAP 指数应用于一个含七类光化学反应的数据集, 通过随机森林建立了三种类型的模型: (1)预测反应物可能发生的反应类型; (2)预测可能合成产物的反应类型; (3)预测整个化学反应的类型. 由于无需指定数据集中参与反应的化学键, 所以, MOLMAP 指数能够得到广泛的应用. 所得分类预测结果好于我们此前对同一数据集的研究, 表明改进化学键的描述有助于提高MOLMAP 指数的预测能力.     

苯环型化合物定量二维手性程度的研究

基于权原子和, 提出了镶嵌在二维空间的苯环型化合物的手性程度, 其中权原子和为与原子间的距离有关的原子不对称环境描述. 在描述化合物的手性时, 并没有采用简单的标记-手性或非手性, 而是采用定量的方式来表征化合物的手性程度. 定量手性程度能够区分对映体, 并且一对对映体的手性程度为相反数. 手性程度不仅仅可以采用单值,还可以采用多维向量来表示. 此外, 还将手性程度推广到三维正烷烃的旋转构象异构体描述, 即首先将正烷烃的旋转异构体转化为苯环型化合物, 然后采用手性程度描述其三维构象.     

计算机结构自动解析专家系统--空间异构体穷举生成算法

提出了一种穷举生成化合物立体异构体的算法. 该方法包括以下3个步骤: 首先输入该化合物的二维连接表, 查找该化合物中不对称碳和碳碳双键所产生的立体中心. 然后, 在自同构划分的基础上得到以该二维连接表作为图的自同构群. 最后, 通过立体中心在自同构群的作用下得到不同的等价类, 即可穷举生成该拓扑结构的所有可能的立体异构体. 最终得到的立体异构体用2.5维连接表表示.     

空间距离在三维分子相似度计算中的应用

采用Tripos公司的MOPAC模块计算分子的空间距离,所得距离矩阵用带有约束条件的空间距离方法计算分子的相似度,同时通过4组化合物的计算,与纯空间距离方法进行比较,得到了较为满意的结果。     

应用量化参数和拓扑指数研究吡喃酮类化合物结构与活性的相关性

QSAR;量子化学参数;应用量化参数和拓扑指数研究吡喃酮类化合物结构与活性的相关性