计算机自动结构解析专家系统研究──一个新的拓扑等价性识别算法

介绍了一个正确识别化合物结构或结构片断中各原子的拓扑等价性问题的新算法。算法中引入了节点矩阵Ｎ和键矩阵Ｂ，并由这两个新矩阵来计算化合物结构图中的各节点的特征值，以此来表征节点的环境特征，从而识别节点的拓扑等价性，以保证结构解析专家系统结构产生器的穷举和非冗余性。     

计算机辅助结构解析中自同构群的生成算法

在结构解析过程中,自同构群的生成是必须的。通过全通道拓扑等价性算法,得到了化合物的自同构群,并比较了几种拓扑等价性算法,结果发现,全通道算法能够正确划分化合物的结构图,从而为ＥＳＥＳＯＣ系统的立体异构体穷举生成奠定了基础。     

分子中芳香性自动识别算法

以图论为基础,从化合物的二维连接表出发,在环识别算法的约束下,对分子中的节点进行判断。结果表明,该算法能够识别大多数化合物中的芳香性。作为约束条件,把芳香性的识别算法应用于ESESOC系统中结构的穷举生成,得到了较好的结果。     

计算机自动识别拓扑等价性方法研究

本文介绍了一个计算机自动识别有机化合物结构图中原子的拓扑等价性的新方法, 该方法引入了路径指数和环指数等新的图的不变量以表征节点的拓扑环境, 由此正确地且高效地进行原子的等价类划分。     

计算机结构自动解析专家系统--空间异构体穷举生成算法

提出了一种穷举生成化合物立体异构体的算法. 该方法包括以下3个步骤: 首先输入该化合物的二维连接表, 查找该化合物中不对称碳和碳碳双键所产生的立体中心. 然后, 在自同构划分的基础上得到以该二维连接表作为图的自同构群. 最后, 通过立体中心在自同构群的作用下得到不同的等价类, 即可穷举生成该拓扑结构的所有可能的立体异构体. 最终得到的立体异构体用2.5维连接表表示.     

Am指数的扩展与手性化合物的构效关系研究

构效关系研究中的分子拓扑指数(Am)通常仅代表一个化合物的拓扑特征,所以预测手性化合物活性的能力较差.我们对Am指数进行了扩展,得到eAm指数,并将其应用于手性分子的结构-活性相关研究.结果表明,由手性拓扑指数得到的QSAR模型比传统的拓扑指数有更好的统计和预测手性化合物活性的能力.     

拓扑-量子指数醛酮气相色谱保留指数及沸点的定量构效关系

通过对醛酮化合物分子结构特征及其气相色谱保留指数(RI)和沸点与分子结构间关系的研究,提出了分子极化效应指数(MPEI)、奇偶指数(OEI)、立体效应指数(SVij)、顶点度-距离指数(VDI)及键连接矩阵特征根(∑X1CH)等拓扑-量子结构参数,用多元线性回归(MLR)方法获得了醛酮类化合物的沸点及其在不同极性色谱柱上的气相色谱保留指数与这些拓扑-量子指数间良好的定量结构-性质相关(QSPR)模型,相关系数均大于0.99。5个分子结构参数具有明确的物理化学意义且易于计算和运用。与文献研究的比较结果表明:由上述分子结构参数得出的模型方程适用于各类醛酮化合物的气相色谱保留指数及沸点的预测且具有较好的稳定性和准确性。     

杂氮硼三环类化合物的UPS及化学键的理论研究

报道了六种杂氮硼三环类化合物的紫外光电子能谱(UPS).采用RHF/3-21G优化了各分子的优势构型,根据化合物UPS的谱带特征结合RHF/6-31G^*的计算结果对化合物的UPS进行了解析和指认,精确给出了各化合物中σN-B配键电子的电离峰位置.利用电子密度拓扑分析方法对各化合物的成键情况的研究显示:在该类化合物中B原子具有较为明显的阳离子的特征,N,B原子间均存在键鞍点.从实验和理论上证实了该类体系中σN-B的存在.各化合物的UPS,SCFMO计算和电子密度拓扑分析都表明,在该类体系中环上CH~3,CH~2的引入削弱了B,N间的成键作用;环上羰基的引入增强了B,N间的成键作用。     

目标化合物析分系统中的重要算法

介绍了目标化合物析分系统中所用到的三个重要算法。它们是：最短拓扑距离的求解、析分过程结束的判别以及合成树的构建。分子结构中任意两个原子之间最短拓扑距离的求解是建立在采用队列数据结构的宽度优先搜索算法基础上的,析分过程结束的判别是由在新Morgan算法基础上产生的化合物的唯一编码和B－树两种算法构成,前者是为了将前体与原料库中每个化合物是否同构的复杂问题简化为码之间的比较问题;后者是一种高效文件组织方式,将代表原料库中化合物的唯一编码作为检索键来组织建库,从而实现对原料库的快速查询,合成树采用的是链表存储方式,每一个结点由六个域组成,且在建树和画树的过程中,均用前序遍历。这些算法是实现析分系统的基础,因此它们的正确设计与高效实现就显得尤为重要。     

拓扑指数F(′F)与气相色谱保留指数RI的相关性研究

用结构参数构成的矩阵定义了拓扑指数Ｆ（′Ｆ），计算了１０个系列９４个分子的 Ｆ（′Ｆ）值。发现Ｆ（′Ｆ）与这些化合物的气相色谱保留指数有好的相关性．相关系数均在０．９７ 以上。     

有机化合物结构的唯一性表征方法研究——一个高选择性的拓扑…

以扩展连接矩阵ＥＡ的幂级数函数为基础，建立了一个新的拓扑指数ＥＡＴＩ，该指数对１￣２２个碳原子的所有３８０７４３４个烷烃异构体的指认并不出现简并，且能区分含杂原子的化合物，其唯一性良好。该指数可用于数据库中替代ＣＡＳ登录号进行结构的编码、管理及检索。     

拓扑指数F（‘F）与气相色谱保留指数RI的相关性研究

用结构参数构成的矩阵定义了拓扑指数Ｆ（’Ｆ），计算了１０个系列９４个分子的Ｆ（’Ｆ）值。发现Ｆ（’Ｆ）与这些化合物的气相色谱保留指数有好的相关性。相关系数均在０．９７以上。     

外消旋硫代缩水甘油醚在多糖基质手性柱上的手性拆分

在自行合成的3种多糖基质的手性固定相上直接拆分了7种外消旋硫代缩水甘油醚，初步探讨了手性化合物结构在手性识别过程中对手性拆分的影响，并对手性固定相的手性识别能力进行了评价。     

一种新的拓扑指数用于饱和链烃类化合物的结构/性质相关性研究

本文从距离矩阵出发, 结合分子中各原子的支化度, 产生一种新的拓扑指数Y~x, 并将它用于研究饱和链烃类化合物的理论性质, 获得了比较满意的结果。与其它已有的拓扑指数比较, 该指数具有良好的结构选择性和相关性。     

碳氢化合物、醛、酮和硫醇的定量结构-色谱保留指数相关性研究

采用平衡电负性和相对化学键长对传统距离矩阵进行修正,构建新拓扑指数Nt。结合路径数,建立碳氢化合物、醛、酮和硫醇等化合物在24种极性和非极性色谱柱上的定量结构-色谱保留指数关系(QSRR)模型,23种模型的相关系数大于0.99。模型经留n法交叉检验,显示出良好稳健性和预测能力。模型物理意义明确,表明色谱保留指数可用分子的大小、平衡电负性、支化度和形状等内在结构信息进行有效表征。模型经Needham公式分析,结果显示新指数Nt对保留指数影响最大。借助Hyperchem软件进行对比研究,结果表明拓扑化学法优于量子化学AM1法。     

拓扑指数F'与烷基苯标准生成焓相关关系研究

新建议的拓扑指数F'考虑了分子的图形特征,顶点原子的性质,顶点原子与相邻原子的键合情况,并以矩阵的形式把这些特征表达出来。n个原子构成的体系通过矩阵运算可得到包含n项的多项式,其中,每一项对应一个顶点原子对F'的贡献,从而赋予了拓扑指数F'明确的物理意义。用F'研究一些烷基苯的标准生成焓,得到了令人满意的结果。     

一种有机质谱谱图的库检索新算法

一种有机质谱谱图的库检索新算法律祥俊，林少凡，张金碚，张法义（南开大学中心实验室，天津，３０００７１）关键词检索，算法，质谱，数据库利用计算机匹配技术识别有机质谱谱图中的库检索方法仅需用低分辨质谱图即可识别未知化合物，似为最成功的方法［１～３］．质谱...     

杂氮硅三环类化合物的紫外光电子能谱及化学键的理论研究

报道了10种杂氮硅三环类化合物的紫外光电子能谱(UPS).采用RHF/3-21G^*对各化合物进行了构型优化.根据各化合物UPS的谱带特征结合RHF/6-31G^*的计算结果对谱图进行了合理的解析和指认.利用6-31G^*基组进行的电子密度拓扑分析表明,各化合物的N和Si原子间均存在键鞍点,从理论上证实了N和Si原子间存在成键作用.各化合物的UPS和SCFMO计算和电子密度拓扑分析都表明,在该类体系中σ_N→Si配键是比杂氮硼三环类化合物中σ_N→B配键弱得多的成键作用;文中同时讨论了不同取代基对Si和N间成键作用的影响.     

大环化合物在高选择性分子印迹识别体系中的研究进展

分子印迹技术（Molecular Imprinting Technology,MIT）因其预定性、专一性和适用性而被广泛应用于色谱分离、固相萃取、药物分析以及手性识别等领域。近些年来,研究者们将大环化合物引入MIT中,在增加识别位点的同时,有效改善了印迹聚合物材料的结构和性能,提高了对模板分子的选择性识别能力。本文重点综述了近10年来环糊精、杯芳烃、柱芳烃、冠醚和葫芦脲等大环化合物在分子印迹技术中的研究进展及应用,并对该领域的发展前景进行了展望。     

有机化合物结构的唯一性表征方法研究──一个高选择性的拓扑指数

以扩展连接矩阵EA的幂级数函数为基础,建立了一个新的拓扑指数EATI,该指数对1～22个碳原子的所有3807434个烷烃异构体的指认并不出现简并,且能区分含杂原子的化合物,其唯一性良好。该指数可用于数据库中替代CAS登录号进行结构的编码、管理及检索。