基因芯片技术与缺血性脑损伤的基础研究

缺血性脑损伤通常导致神经元死亡或功能障碍,从而引发脑功能障碍.细胞死亡或功能障碍往往伴随或源自特定基因表达的变化.因此,确定参与缺血性脑损伤过程及损伤后细胞修复及塑型过程的基因,对损伤机制及基于该损伤机制而采取适当的治疗措施是至关重要的.基因芯片技术是20世纪90年代发展起来的一项前沿生物技术,它从根本上改变了生理学和生物技术的观念和效率[1].其应用高密度的显微阵列进行大批量的基因筛选,只有巨大的功能信息处理能力,近年来在缺血性脑损伤的研究中得以应用,为该领域研究提供了丰富信息.     

栀子苷、胆酸及其配伍干预脑缺血全基因表达谱的比较研究

目的比较脑缺血后清开灵主要组分栀子苷、胆酸及其配伍对基因表达谱的影响。方法建立全脑缺血再灌注小鼠模型,分为栀子苷组、胆酸组、栀子苷 胆酸组。一步法抽提小鼠脑组织的总RNA,Cy3/Cy5标记,16463个小鼠脑oligo片段芯片检测全基因组表达谱,每组重复实验669次。Genespring分析显著变化基因,GO原则分类,层次聚类分析全基因组表达谱信息。结果栀子苷组、胆酸组、栀子苷 胆酸组所致差异表达基因数分别为95、86、102,其中上调63、48、56个,下调32、38、45个基因,共同调节基因19个。3组差异基因集中在代谢和信号转导相关基因方面。重叠基因数栀子苷 胆酸组与胆酸组(30个)多于栀子苷 胆酸组与栀子苷组(25个),前两者及早反应基因如Pip92表达相似,后两者则在炎症相关因子,如NFκB、Irf5、IL-1β、TNF-α、IL-6、IFN-γ等表达雷同;聚类分析发现栀子苷组表达谱较胆酸组更接近栀子苷 胆酸组;实时定量PCR结果与芯片结果一致。结论①虽然栀子苷组、胆酸组与栀子苷 胆酸组存在共同的调节基因,但栀子苷组偏重于对炎症相关因子,特别是对NFκB、Irf5等炎症介导因子的调控;而胆酸组对Pip92等凋亡前功能基因的调节较为突出;②重叠基因数与聚类分析结果的不一致提示基因分析不能仅局限在差异数量上,而应该深入分析基因功能和组分的关系。     

缺血性中风血瘀证患者MTHFR基因多态性研究

目的探讨N^5，N^10亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因C677T多态性与缺血性中风病血瘀证易感性的关系。方法收集缺血性中风病血瘀证患者84例（病例组），缺血性中风病非血瘀证患者143例（对照组），抽外周静脉血提取DNA，采用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性（PCR-RFLP）检测MTHFR基因C677T多态性类型。结果2组MTHFR基因C677T基因型频率分布差异有统计学意义（χ^2=12．618；d．f．=2，P=0．002），突变型等位基因频率病例组高于对照组（分别为39．29％和24．48％），TT基因型与缺血性中风血瘀证发生显著相关（OR=3．730；95％CI为1．229～11．318；P=0．014）。结论MTHFR基因TT型可能是缺血性中风病血瘀证发病的易感危险因素之一。     

亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T、β-纤维蛋白原基因G448A多态性与缺血性卒中遗传易感性的关系

目的 探讨亚甲基四氧叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MqHFR)基因C677T、β-纤维蛋白原(β-fibrinogen,β-Fg)基因C0448A多态性与缺血性卒中遗传易感性的关系.方法 采用寡核苷酸芯片技术对88例缺血性卒中患者及与其配对的88名对照者进行单核苷酸多态性位点检测和分析.结果 缺血性卒中患者组MqHFR基因T纯合基因型、杂合基因型和T等位基因频率分别为17.0%、50.0%和42.05%.对照组为11.4%、36.4%和29.55%,两组间MTHFR基因C677T基因型频率(P=0.034)和等位基因频率(P=0.014)分布有显著差异,β-Fg基因杂合基因型和A等位基因频率分别为27.3%和15.91%,对照组为25.0%和14.77%.多元logistic回归分析显示,M31-IFR基因C677T CT基因型与缺血性卒中发病有关(优势比为2.181,95%CI 1.138～4.181;P<0.05);β-Fg基因G448A与缺血性卒中无显著相关性,其与MTHFR基因C677T位点无协同作用.结论 MTHFR基因C677T位点突变可能足缺血性卒中发病的遗传因素之一.     

缺血性脑卒中主要候选基因关联分析研究进展

脑卒中是一种高致死、高致残的神经系统疾病,已经成为威胁人类健康的主要杀手之一,大约80%的脑卒中是缺血性的.缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)按照TOAST分类法又可分为5种亚型:(1)大动脉粥样硬化型(large-arteryatherosclerosis,LAA);(2)心源性栓塞型(cardiogenicembolism,CE);(3)小动脉闭塞型(small-artery occlusion,SAA);(4)其他明确病因型(stroke of other determined etiology,SOE);(5)不明原因型(stroke ofundetermined etiology,SUE).已有研究指出不同的IS亚型可能有不同的遗传机制[1].     

非生物专业《普通生物学》课程体系建设的实践与探索

本文简要论述了非生物专业开展生命科学教育的重要性和必要性,结合自身教学实践,介绍了<普通生物学>课程体系建设的基本方案和效果,初步探索了该课程发展的思路.     

用主成分分析探索不同中药组分配伍干预脑缺血的基因表达模式

目的比较清开灵主要组分黄芩苷、栀子苷及其配伍干预脑缺血损伤的基因表达模式。方法12只4周龄小鼠随机分为黄芩苷组(BA组)、栀子苷组(JA组)、栀子苷+黄芩苷组(BJ组)、尼莫地平组(NM组),建立全脑缺血再灌注小鼠模型后,各组分别给予尾静脉注射黄芩苷、栀子苷、栀子苷+黄芩苷以及尼莫地平。抽提小鼠脑组织的总RNA,制备小鼠全基因组表达谱,对其进行基因本体论功能分类,构建相关系数矩阵,对差异表达的细胞黏附相关基因进行主成分分析。结果获取16463个小鼠脑测全基因组表达谱,筛选出32个差异表达的细胞黏附相关基因。主成分分析结果显示,4组的前2个主成分的累积贡献度为100%,BJ组总得分大于单一组分组,NM组对细胞黏附相关基因干预的总得分高于BA和JA组。各次检测的主成分分布显示,NM组和3个中药组均距离较远,BJ组和BA组的距离均近于JA组。结论黄芩苷、栀子苷及其配伍均能有效干预细胞黏附相关基因,配伍后的干预对黏附相关功能基因的影响大于单一组分组,其基因表达模式和黄芩苷相近。