基于生物信息学分析FOXO4在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

目的利用生物信息学方法分析叉头框蛋白O4（FOXO4）在肾透明细胞癌（简称肾癌）中的表达及临床意义。方法Oncomine数据库可视化分析肾癌中FOXO4的表达,UALCAN数据库分析肾癌中FOXO4mRNA和蛋白表达水平。采用CRISPR/dCas9方法使肾癌细胞系FOXO4过表达,RT-qPCR法检测肾癌细胞中FOXO4mRNA表达水平。溴化噻唑蓝四氮唑法检测细胞存活能力。Kaplan-Meierplotter在线数据库分析FOXO4表达与肾癌预后的关系。使用4个在线数据库预测调控FOXO4表达的上游miRNA,通过StarBase数据库分析miRNA在肾癌样本中的表达及其与FOXO4表达的相关性,根据miRNA表达的中位值将肾癌样本分为高表达组和低表达组,分析预后关系。利用双荧光素酶报告基因实验验证它们的靶向调节关系。结果从Oncomine和UALCAN数据库分析得到肾癌样本中FOXO4mRNA和蛋白表达较正常肾组织样本均降低。769-P和786-O肾癌细胞中过表达FOXO4后其细胞存活水平均明显降低。Kaplan-Meierplotter在线数据库分析显示FOXO4低表达组总生存率低于高表达组。hsa-miR-142-3p是FOXO4表达的上游miRNA调控因子,其在肾癌样本中表达上调且与FOXO4表达呈负相关,hsa-miR-142-3p高表达不利于肾癌的预后。双荧光素酶报告基因结果显示hsa-miR-142-3p与FOXO4存在靶向调节关系。结论FOXO4在肾癌中低表达,并与患者不良预后有关,有望成为改善肾癌预后的生物标志物和治疗的靶标。