PCR检测痰曲霉菌在慢性阻塞性肺疾病合并侵袭性肺曲霉菌病中的诊断价值

目的：探讨荧光定量PCR检测痰曲霉菌在慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者侵袭性肺曲霉菌病（invasive pulmonary aspergillosis, IPA）中的诊断价值。 方法：采用前瞻性观察性研究，入组2015年4月至2017年3月因COPD急性加重入住复旦大学附属中山医院的49例患者。收集患者常规痰液真菌培养后剩余的痰液，采用荧光定量PCR检测曲霉菌。同时分析患者的一般资料，包括临床症状、影像学资料、实验室检查结果。 结果：49例患者中18例诊断为IPA，多见于全身应用糖皮质激素及广谱抗生素的患者。该病确诊较困难，多依赖临床诊断，荧光定量PCR检测痰液中曲霉菌在COPD患者合并IPA诊断中的敏感性和特异性分别为72.2%、87.1%。 结论：COPD患者发生IPA并不少见，荧光定量PCR检测痰中曲霉菌对其具有早期诊断价值。     

核不均一核糖核蛋白C在肺腺癌中的表达及对临床预后预测价值

目的探讨核不均一核糖核蛋白C(HNRNPC)在肺腺癌(LUAD)中的表达及对临床预后的意义。 方法通过癌症基因组图谱数据库(TCGA)及临床蛋白质组肿瘤分析协作组(CPTAC)公共数据库,收集535例LUAD患者的临床病理资料、HNRNPC mRNA表达数据及111例LUAD患者HNRNPC蛋白表达数据,通过基因型-组织表达数据库(GETx)收集288例健康人肺组织HNRNPC mRNA表达数据。以HNRNPC mRNA中位数值为界值,将LUAD患者分为高表达组和低表达组,利用R语言比较LUAD组织与正常肺组织HNRNPC mRNA及蛋白水平的差异,分析HNRNPC mRNA高低表达与患者临床病理特征及预后的关系。运用受试者工作特征(ROC)曲线分析HNRNPC表达对LUAD的诊断价值;通过基因集富集分析(GSEA)HNRNPC调控的相关信号通路。 结果HNRNPC mRNA在LUAD组织中的表达明显高于正常组织,差异具有统计学意义(均P<0.01);LUAD组织中HNRNPC蛋白水平也显著上调(P<0.05)。HNRNPC表达水平与LUAD患者吸烟史、临床分期、T分期、远处转移有关(均P<0.05)。Log-rank检验结果显示,HNRNPC高表达组LUAD患者中位生存期(42.3个月)明显低于低表达组患者(59.9个月),差异具有统计学意义(P<0.01)。多因素Cox回归分析显示,淋巴结转移和HNRNPC mRNA表达水平是LUAD患者预后的独立影响因素。ROC曲线示HNRNPC mRNA表达水平对诊断LUAD具有一定的预测效能,AUC为0.843,95%CI：0.817~0.869。GSEA功能富集分析示Ras相似物GTP酶(Rho GTPases)途径、TP53信号途径、DNA损伤修复、细胞周期及M期调控在HNRNPC高表达组明显富集。 结论HNRNPC在LUAD组织中表达显著上调,高表达患者预后不良,HNRNPC可能是评估LUAD患者诊断与预后的新的潜在生物学分子标志物。     

侵袭性肺曲霉病实验室检测方法的研究进展

侵袭性肺曲霉病(invasive pulmonary aspergillosis,IPA)是指曲霉菌菌丝生长侵入肺实质而引起的感染性疾病,具有发病急性、进展迅速、病死率高的特点。长期中性粒细胞缺乏、血液系统恶性肿瘤发生、造血干细胞或实体器官移植、长期大剂量糖皮质激素或免疫抑制剂使用、遗传性或获得性免疫缺陷状态是感染侵袭性肺曲霉病的危险因素。早期诊断和及时治疗是良好预后的关键。但由于该病缺乏典型的临床表现,早期诊断尤为困难。传统的组织病理学、细胞病理学及分离培养的方法可以确诊IPA,但灵敏度低。近年来,一些非培养实验室检测方法逐渐得到应用,如半乳甘露聚糖(galactomannan,GM)试验、(1,3)-β-D葡聚糖(BDG)试验(G试验)、聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术、免疫层析侧流装置(lateralflow device,LFD)技术等,本文就此类检测方法诊断IPA作一综述。