PTEN基因剪接变异体与肝细胞肝癌发生的相关研究

目的研究PTEN基因在肝细胞肝癌中是否存在新的剪接变异体,探讨PTEN基因在肝细胞肝癌发生发展中的作用。方法提取肝细胞肝癌组织的RNA,逆转成cDNA。根据Genbank上的PTEN基因cDNA序列,设计6对引物,并以肝细胞肝癌组织cDNA为模板分别扩增外显子1～2、1～3、2～4、3～5、4～6和5～7之间的片段,得到的PCR产物进行3%琼脂糖凝胶电泳,比较不同样本扩增出来的目的条带的异同。结果每对引物分别做了61例肝细胞肝癌组织,3%琼脂糖凝胶电泳后发现每对引物扩出来的目的条带大小相同,与野生型剪切体一致。结论PTEN基因在肝细胞肝癌中不存在新的剪接变异体,说明在肝细胞肝癌发生发展中PTEN没有出现异常的mR-NA剪接突变。     

分子克隆技术制备D5S2845基因座的等位基因分型标准物及其法科学应用研究

目的:调查D5S2845基因座在华东汉族人群的群体遗传学数据,解决长期困扰短串联重复序列(shorttandem repeat,STR)分型上存在的准确性和标准化问题。方法:首先利用PCR结合聚丙烯凝胶电泳技术调查华东汉族群体的等位基因频率及基因型分布,再用PCR扩增出D5S2845基因座的8个等位基因片段,将其插入pUC重组质粒中,经DNA测序分析证实插入片段的结构及大小,用国际标准将插入的等位基因片段进行命名,最后经转染、扩大培养、扩增及再鉴定后,制备出标准的D5S2845等位基因分型标准物。结果:D5S2845基因座在华东汉族群体中均有较高的多态性,其非父排除概率及个人识别能力分别为0.558和0.896,应用分子克隆技术制备出大量的D5S2845基因座等位基因分型标准物。结论:D5S2845基因座是一个适合于群体遗传学研究和法科学应用的遗传标记。分子克隆方法制备的STR基因座等位基因分型标准物在法科学实践中应用价值较高。     

5个X染色体STR基因座的群体遗传学分析

目的 调查苏州汉族群体中5个X-STR的等位基因和单倍型分布,以及分析这些基因座间的连锁不平衡关系.方法 应用Chelex法提取样本DNA,PCR扩增5个X-STR,应用自动测序仪对PCR产物进行分型.结果 苏州汉族群体中,DXS7423、DXS10147、DXS10146、DXS10134、DXS8377分别观察到5、6、15、21、15个等位基因;男女性样本间,DXS7423、DXS10147、DXS10134的等位基因频率差异无统计学意义,P值分别为0.161、0.756、0.179;DXS10146、DXS8377等位基因频率差异具有统计学意义,P值分别为0.008和0.005.5个X-STR的观察杂合度在0.505～0.845间,DPf值在0.684～0.977间,DPm值在0.487 ～0.902间,MCEtrio值在0.469～0.894间,MCEduo值在0.266～0.860间.男性样本中,观察到111种单倍型,单倍型变异度为0.9916.结论 苏州汉族群体中,5个X-STR中DXS10146、DXS10134、DXS8377多态性较好;5个X- STR构成的单倍型鉴别能力较高.     

整合素信号通路可能参与大鼠束缚应激后的恢复过程(英文)

目的筛选与束缚应激大鼠应激反应恢复速度相关的基因,探讨应激反应个体恢复的分子机制。方法观察大鼠2小时束缚应激后血浆促肾上腺皮质激素(adrenocorticotropic-hormone,ACTH)及皮质酮的变化规律,根据应激结束后1小时的血浆ACTH及皮质酮下降程度将大鼠分为快速恢复组与慢速恢复组。采用微阵列技术检测快速恢复组与慢速恢复组下丘脑组织基因表达的差异,用实时逆转录-聚合酶链反应验证部分基因的表达差异。结果基因芯片分析结果显示:大部分基因在两组间并无差异表达,在11个差异表达的基因中,快速恢复组中参与整合素信号通路的踝蛋白(talin)、整合素α6和丝/苏氨酸蛋白磷酸酶PP1β催化亚基(serine/threonine pro-tein phosphatase PP1-beta catalytic subunit,PP1B)基因有1.5倍上调,而结合粘附分子1(junctional adhesion mol-ecule 1, F11r)基因有 1.5 倍下调。实时逆转录 - 聚合酶链反应结果与芯片分析结果一致。结论本研究构建了束缚应激大鼠恢复过程的下丘脑基因表达谱,结果提示整合素信号通路可能参与应激的恢复过程。     

华东地区汉族群体20个插入缺失多态的群体遗传学研究及法医学应用

目的:筛查适合华东汉族群体法医学应用的插入缺失多态并进行群体遗传学研究.方法:运用PCR技术结合聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对筛选的插入缺失多态进行分型并通过统计分析获得其相关法医遗传学参数.结果:筛选出了20个适合华东汉族群体法医学应用的插入缺失多态位点,并获得了这些基因座的等位基因频率.该20个基因座都具有较好多态性,其中最小等位基因频率为0.108,经计算该20个基因座的累积个人识别机率为0.999 993 845,累积非父排除率为0.916.从20个插入缺失多态位点中我们进一步筛选出了11个最小等位基因频率＞0.3的位点,对这11个具高信息量插入缺失位点进行进一步分析,结果显示11个插入缺失位点累积个人识别机率达到0.996 258 773,累积非父排除率达到0.814 27.结论:本研究获得的上述插入缺失多态位点等位基因频率丰富了华东汉族群体的群体遗传学资料,为插入缺失多态的法医学应用提供了候选的基因座.     

江苏汉族群体D12S391和D6S1043基因座遗传多态性研究

目的：调查D12S391和D6S1043基因座在江苏汉族人群的群体遗传学数据,为亲子鉴定和个人识别工作提供数据基础。方法：利用AmpF1STR Sinofiler试剂盒进行多重PCR扩增,3130型遗传分析仪进行毛细管电泳,Gen-eMapper软件自动分析各基因座的基因型。PowerStats软件计算两个基因座的等位基因频率、杂合度、个人识别机率、非父排除率及多态信息含量等群体遗传学参数,χ2检验验证Hardy-Weinberg平衡。结果：D12S391和D6S1043基因座在江苏汉族群体中均有较高的多态性,其非父排除概率和个人识别率分别为0.616、0.638、0.946和0.964。两个基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0.05）。结论：本研究获得了D12S391和D6S1043两个基因座在江苏汉族群体的群体遗传学数据,分析结果显示这两个基因座适合江苏汉族群体法医学应用。     

Lack of association between ADRA2B -4825 gene insertion/deletion polymorphism and migraine in Chinese Han population

Objective

The present study aimed to estimate the association between susceptibility to migraine and the 12-nucleotide insertion/deletion (indel) polymorphism in promoter region of α_2B-adrenergic receptor gene (ADRA2B).

Methods

A case-control study was carried out in Chinese Han population, including 368 cases of migraine and 517 controls. Genomic DNA was extracted from blood samples, and DNA fragments containing the site of polymorphism were amplified by PCR. Data were adjusted for sex, age, migraine history and family history, and analyzed using a logistic regression model.

Results

There was no association between indel polymorphism and migraine, at either the allele or the genotype level.

Conclusion

These findings do not support a functional significance of ADRA2B indel polymorphism at position -4825 relative to the start codon in the far upstream region of the promoter in the present migraine subjects.     

亲子鉴定数据管理系统软件的开发与应用

法医物证学主要解决生物性检材的个人识别及亲子鉴定问题［1］。STR分型技术现已被大多数实验室所采用。亲子鉴定最烦琐的工作就是计算父权指数（PI）、联合父权指数（CPI）以及相对父权机会（RCP）。人工计算PI值和CPI值需反复查基因频率表，且计算也容易出错。有鉴于此，笔者开发了一套适合于亲子鉴定的数据管理系统，用以存储、分析、计算结果、管理档案。     

主动脉夹层动脉瘤合并肾上腺嗜铬细胞瘤、胃平滑肌瘤一例

患者女,43岁,2004年10月8日,无明显诱因忽然意识丧失、神志不清,被急送至张家港市中医院,经抢救20min无效死亡。尸检表面未见异常,内部检验可见左侧胸膜部分粘连,双侧胸腔内有约700ml血性积液;心包腔内有约1000ml积血,并有大量凝血块,主动脉根部半月瓣上方2·0cm处有一横行的内膜破裂口,破裂口长度为3·0cm,外膜距根部2·5cm处有一0·2cm大小的破裂口,冠状动脉腔Ⅱ级狭窄;右侧肾上腺有一大小约为0·4cm×0·4cm×0·3cm的肿块,切面呈棕黄色,有包膜包裹,周边仍可见正常肾上腺组织;胃底前壁粘膜隆起,有一3·0cm×2·0cm×2·0cm肿块,表面有出…     

整合素信号通路可能参与大鼠束缚应激后的恢复过程

目的筛选与束缚应激大鼠应激反应恢复速度相关的基因,探讨应激反应个体恢复的分子机制。方法观察大鼠2小时束缚应激后血浆促肾上腺皮质激素（adrenocorticotropic-hormone,ACTH）及皮质酮的变化规律,根据应激结束后1小时的血浆ACTH及皮质酮下降程度将大鼠分为快速恢复组与慢速恢复组。采用微阵列技术检测快速恢复组与慢速恢复组下丘脑组织基因表达的差异,用实时逆转录-聚合酶链反应验证部分基因的表达差异。结果基因芯片分析结果显示：大部分基因在两组间并无差异表达,在11个差异表达的基因中,快速恢复组中参与整合素信号通路的踝蛋白（talin）、整合素α6和丝/苏氨酸蛋白磷酸酶PP1β催化亚基（serine/threonine pro-tein phosphatase PP1-beta catalytic subunit,PP1B）基因有1.5倍上调,而结合粘附分子1（junctional adhesion mol-ecule 1, F11r）基因有 1.5 倍下调。实时逆转录 - 聚合酶链反应结果与芯片分析结果一致。结论本研究构建了束缚应激大鼠恢复过程的下丘脑基因表达谱,结果提示整合素信号通路可能参与应激的恢复过程。