A localized surface plasmon resonance DNA biosensor based on gold nanospheres coated on the tip of the fiber

A localized surface plasmon resonance (LSPR) biosensor was prepared with gold nanospheres (AuNSs) coated on the tip face of the optical silica fiber. AuNSs with the sizes of 20 nm and 80 nm were used. The sensitivities of AuNS20 nm and AuNS80 nm modified sensors to bulk refractive index (RI) variation are 82.86 nm/RIU and 218.98 nm/RIU, respectively. The AuNS80 nm modified sensor was used for the detection of 40 bases DNA hybridization and the limit of detection is 50 nmol/L, where the 40-bases DNA probe was covalently linked with AuNS80 nm. The complementary DNA sequence in tris-acetate-EDTA (TAE) buffer solution was detected as the target DNA. This fiber sensor has the advantages of small sample consumption, easy fabrication and high sensitivity.     

基于排队网络的多优先级MapReduce作业调度算法

MapReduce是一个能够对大规模数据进行分布式处理的框架,目前被各个领域广泛应用。在提供MapReduce服务的集群中,如何保证不同优先级用户的截止时间限定是MapReduce作业调度问题的一个挑战。针对这一问题,提出了一个基于排队网络的多优先级作业调度算法（MPSA）。首先分析和归纳了基于MapReduce模型的算法,提出了三种常见模式,采用Jackson排队网络对基于MapReduce模型的算法建立了数学模型,应用该网络模型可以求出不同优先级队列对资源的需求;随后使用AR(1)模型进行预测,使算法可以动态地适应不同的用户访问量;利用二分查找算法,分步计算出不同优先级在map阶段和reduce阶段分配的槽位数;最后实现了在MapReduce模型中应用的实时调度算法。实验结果表明,与传统的FIFO和公平调度算法相比,本文提出的算法在用户到达率和任务规模变化的情况下,可以更加有效地满足不同优先级用户的截止时间限定。     

MapReduce模型中reduce阶段负载均衡分区算法研究

MapReduce是一种处理大规模数据的并行计算模型,针对传统模型中reduce阶段各个结点负载不均衡的问题,提出一种reduce阶段负载均衡分区算法.算法将map阶段产生的中间数据划分为更多的分区,减少了每个分区的工作量,每次给reducetask分配一个分区,reducetask完成一个分区的工作之后会继续获得新的分区,直到所有的分区都被分配完毕,实现了动态调节reducetask的负载.还改进了MapReduce的通信协议来支持算法并且设计了新的容错机制.最后,通过重写Hadoop平台内核实现了算法并进行了实验分析,结果表明,该算法在不影响MapReduce模型的情况下显著的缩短了任务的处理时间.