牛乳外泌体中miRNA的测序与分析

采用密度梯度离心法提取牛乳外泌体，利用Illumina测序技术对外泌体中非编码小RNA(sRNA)进行测序，探索牛乳microRNA(miRNA)的表达谱。对原始序列进行质量控制，共获得3 899 629条纯净sRNA序列，长度集中于28 nt，与数据库比对后鉴定到61种已知miRNA,346种新miRNA。基因本体论富集结果表明，牛乳外泌体miRNA在细胞过程、单一生物体过程、代谢过程等生物过程发挥作用；主要构成细胞、细胞器等组成；主要参与结合、催化活性、转运蛋白活性等分子功能。京都基因与基因组百科全书通路富集结果表明，已知miRNA与新miRNA靶基因均显著富集在百日咳（ko05133）、趋化因子信号通路（ko04062）、内吞作用（ko04144）、溶酶体（ko04142）等通路，牛乳外泌体miRNA在特定信号通路中发挥重要作用。     

驴乳外泌体中miRNA的测序与分析

为探究驴乳外泌体中微小RNA（miRNA）的种类和功能性,利用Illumina测序技术对驴乳外泌体中非编码小RNA（sRNA）进行测序分析,鉴定其中的miRNA并以人乳外泌体miRNA作为对照组进行生物信息学分析。驴乳外泌体中sRNA在质量控制之后,长度主要分布在18～22 nt,在其中共鉴定到212 个miRNA,其中包括16 种已知miRNA和196 种新miRNA。基因本体论富集分析发现,驴乳外泌体miRNA的功能性与人乳相似,构成细胞、细胞器等组分;具有结合和催化活性等功能;参与细胞代谢、生物调节等过程。京都基因与基因组百科全书通路富集分析发现,驴乳外泌体miRNA参与醛固酮的合成与分泌、Hedgehog信号、线粒体调节、癌症等通路。