R法遗传参数估值置信区间的计算方法和重复估计次数的研究

探讨R法遗传参数估值置信区间的计算方法和重复估计次数(NORE)对参数估值的影响,利用4种模型通过模拟产生数据集。基础群中公、母畜数分别为200和2000头,BLUP育种值选择5个世代。利用多变量乘法迭代(MMI)法,结合先决条件的共扼梯度(PCG)法求解混合模型方程组估计方差组分。用经典方法、Box-Cox变换后的经典方法和自助法计算参数估值的均数、标准误和置信区间。结果表明,重复估计次数较多时,3种方法均可;重复估计次数较少时,建议使用自助法。简单模型下需要较少的重复估计,但对于复杂模型则需要较多的重复估计。随模型中随机效应数的增加,直接遗传力高估。随着PCG和MMI轮次的增大,参数估值表现出低估的趋势。     

高血压合并糖尿病临床治疗体会

目的探讨高血压合并糖尿病患者的有效治疗措施。方法选择2013年6月~2015年1月我院接诊的150例高血压合并糖尿病患者作为研究对象,采用数字表法将患者随机分为A、B、C组各50例。A组采用血管紧张素转换酶抑制剂联合小剂量利尿治疗,B组采用钙拮抗剂治疗,C组采用β受体阻滞剂治疗,并观察3组患者的治疗效果。结果A组治疗总有效率为94.0%,显著高于B、C组(分别为80.0%、78.0%),差异具有显著统计学意义(均P0.05);3组患者治疗后均出现不同程度的药物不良反应,B、C组的不良反应发生率分别为16.0%、18.0%,均显著高于A组的6.0%,组间比较差异具有显著统计学意义(P0.05)。结论高血压合并糖尿病患者采取联合用药的方案可更好的控制血压及血糖水平,有效降低药物不良反应,值得临床推广应用。     

影响山西肉用绵羊母本品系生长性状的非遗传因素分析

为研究非遗传因素对山西肉用绵羊母本品系的初生重、断奶重(100日龄)、6月龄重和周岁重的影响,收集了山西肉用绵羊母本品系育种记录.利用SPSS 19.0的GLM过程分析性别、出生年份、出生月份、母亲年龄、出生类型对山西肉用绵羊母本品系生长性状的的影响.结果表明:性别仅对6月龄重有极显著影响(P＜0.01),对初生重、断奶重、周岁重影响显著(P＜0.05);出生年份对初生重和断奶重有极显著影响(P＜0.01),对6月龄重和周岁重影响显著(P＜0.05);出生月份对6月龄重有极显著影响(P＜0.01),对初生重、断奶重和周岁重无影响(P＞0.05);母亲年龄对初生重影响显著(P＜0.05),对6月龄重影响极显著(P＜0.01),而对断奶重和周岁重无影响(P＞0.05);出生类型对6月龄重有显著影响(P＜0.05),对初生重和断奶重有极显著影响(P＜0.01).本分析结果对山西肉用绵羊母本品系的进一步选育和生产具有重要参考价值.     

FSHβ 基因PCR-SSCP多态性及其与济宁青山羊高繁殖力关系的研究

采用PCR-SSCP技术检测促卵泡素b亚基(follicle-stimulating hormone β, FSHβ)基因5′调控区、外显子1和外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性, 同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明: 山羊与绵羊的FSHβ 基因该段核苷酸序列同源性为98%。9对引物中, 只有P9的扩增片段存在多态性。P9的扩增片段在济宁青山羊和辽宁绒山羊中检测到AA、AB和AC 3种基因型; 在波尔山羊中检测到AA、CC和AC 3种基因型; 在安哥拉山羊中检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC共6种基因型。测序分析发现BB型与AA型相比在外显子2的第94 bp处有G→A突变, 并引起氨基酸改变(丙氨酸→苏氨酸); CC型与AA型相比在外显子2的第174 bp有一处C→T沉默突变。济宁青山羊AA、AB和AC基因型频率分别为0.686、0.137和0.177。AA基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型的多0.78只(P<0.05), 比AC基因型的多0.64只(P<0.05)。     

中国境内不同地理型东方蜜蜂遗传多样性的AFLP分析

利用22对AFLP引物组合对我国9个省市的11个东方蜜蜂种群和1个西方蜜蜂种群的39个个体基因组DNA的遗传变异进行了研究;根据AFLP分析结果,采用GeneScan3.0软件、群体遗传数据分析包（Hickory v1.0.4） 和群体遗传变异分析程序（AFLP-SURV 1.0）,分别计算了39个个体间的遗传相似系数和各蜜蜂种群的Nei's遗传距离、Reynolds遗传距离和成对的固定指数F_st,并构建了各自的UPGMA聚类关系图。结果表明：AFLP标记具有很高的多态检测效率,适合于蜜蜂种群遗传多样性分析和品种鉴定。蜜蜂种间的遗传分化明显,亲缘关系较远。中国境内不同地理型东方蜜蜂群体间存在着广泛的遗传变异。UPMGA聚类关系图显示,海南东方蜜蜂由于长期的海岛隔离,已经形成了一个独特的类群,支持了通过形态学认定的海南东方蜜蜂为东方蜜蜂的一个新亚种。     

用R法估计方差组分的原理、方法和应用

综述了R法估计方差组分的原理、方法和应用,目的是使该方法能够得到合理应用。R法是通过计算全数据集对亚数据集随机效应的回归因子（R）来估计方差组分的。利用一种基于一个变换矩阵的多变量迭代算法,结合先决条件的共扼梯度法求解混合模型方程组使R法的计算效率大为改善。R法的主要优点是计算成本低,同时可以得到方差组分估值的抽样误差和近似置信区间。其缺点是对于同样的数据,R法较其他方法的抽样误差大,而且在小样本中估计值往往有偏。做为一种可选方法,R法可以应用到大数据集的方差组分估计中,同时应进一步研究其理论特性,拓宽其应用范围。Abstract: Theory, method and application of Method R on estimation of (co)variance components were reviewed in order to make the method be reasonably used. Estimation requires R values,which are regressions of predicted random effects that are calculated using complete dataset on predicted random effects that are calculated using random subsets of the same data. By using multivariate iteration algorithm based on a transformation matrix,and combining with the preconditioned conjugate gradient to solve the mixed model equations, the computation efficiency of Method R is much improved. Method R is computationally inexpensive,and the sampling errors and approximate credible intervals of estimates can be obtained. Disadvantages of Method R include a larger sampling variance than other methods for the same data,and biased estimates in small datasets. As an alternative method, Method R can be used in larger datasets. It is necessary to study its theoretical properties and broaden its application range further.     

不同额外随机效应对估计协方差函数的影响

将6个世代的686头SD-Ⅱ系猪的生长记录资料用于研究,分别将窝效应和个体效应作为额外随机效应时对估计加性遗传和永久环境协方差函数的影响.配合将年龄的勒让德多项式作为自变量的随机回归模型,用平均信息约束最大似然(AIREML)法估计.结果表明,窝效应只能反映部分永久环境效应,估计协方差函数时需配合全阶多项式;而将个体效应作为额外随机效应,降阶配合即可.降阶配合涉及的参数较少,同时可以缓和协方差估值间的差异.对协方差函数的意义和应用做了讨论。 Abstract:Growth records of 686 pigs of SD- Il Swine Line over 6 generations were used to study the influence of litter effect and animal effect,which was used as different additional random effect,on estimating additive genetic and permanent environmental covariance functions.A random regression model with Legendre polynomials of age as independent variables was used to estimate the covariance functions by restricted maximum likelihood employing the average information algorithm (AIREML).The results showed that litter effect only reflected part of the permanent environmental effects and full order fit was necessary to estimate the covariance functions.However,a reduced order fit was feasible using animal effect as additional random effect.Moreover,it involved less parameters and smoothed out differences in estimates of the covariances.Significance and application of covariance functions are discussed.     

家畜合成群体保留杂种优势的预测与培育效果评价

摘要：合成群体是由两个或多个组分品种培育的一个品种,旨在不与其他品种杂交就可利用杂种优势,因而被认为是利用杂种优势的一种替代方法。合成群体培育的成效在于其保留杂种优势的高低。本文综述了家畜合成群体保留杂种优势、相对生产效率和生产性能的预测及其培育效果的评价方式。合成群体包含了所有类型的杂种优势,只要避免近交,就可以保持一定的杂种优势。其高低取决于参与杂交的品种数目和所占血缘比例。合成群体的生产性能取决于各组分品种的育种值和保留杂种优势。合成群体的培育效果可通过理论预测、估计实际保留杂种优势、考察群体的遗传变异或者与有关品种比较等方式加以评价。