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利用基因芯片技术筛选棉纤维伸长相关基因 总被引:6,自引:1,他引:5
从回交近交系(backcross inbred lines, BIL)群体中选取纤维长度差异较大的两个系NMGA-062 (33.03 mm)和 NMGA-140 (25.87 mm),利用Affymetrix棉花基因芯片,分析其开花后10 d (DPA, days post anthesis)棉纤维伸长相关基因表达谱。在24 029条转录本中,两材料间差异表达的转录本有7 282条,占总数的30.31%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3 993条,占筛选转录本总数的16.62%,功能分类表明这些转录本主要包括功能预测基因(15.57%)、翻译、核糖体结构相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换相关基因(9.29%)3大类。为了验证芯片数据的可信性,8个差异表达显著的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at, ACO1, ARF1, SAHH, TUA6, TUA7, β-tub1, β-tub10)被用于实时荧光定量PCR。两种检测手段表现出一致性。随后,利用实时荧光定量PCR对3个与棉纤维相关基因(ARF1, β-tub1, β-tub10)在纤维发育不同时期(5、10、15、20和25 DPA)的表达模式进行了研究,结果表明,3个基因在纤维伸长发育时期(10和15 DPA)大量表达,推测这3个基因可能与棉纤维伸长有重要关系。 相似文献
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磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)是控制植物体中蛋白质和脂肪酸含量比例的关键酶。本研究从棉花中克隆得到船PC基因,长度为433bp,并将该基因的正反义片段分别和种子特异性启动子napin启动子(1123bp)、α球蛋白B基因启动子(1149bp)连接,插入到植物表达载体pCADS1341中。经酶切和PCR鉴定,成功的构建了PEPC基因的种子特异性ihpRNA表达载体pCADSNPSPA和pCADSBPSPA,为后期高含油量棉花材料的选育打下了基础。 相似文献
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利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因 总被引:3,自引:3,他引:0
miRNA (microRNA)是一类21~24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA),它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程.试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs (Backcross inbred lines)的0DPA (Days post anthesis)、3 DPA的胚珠和10 DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa 测序.以已公布的棉花D5基因组序列和棉属其他序列为参考,经分析共发现561个miRNAs,其中包括254个已知的miRNAs(属于40个miRNA家族),75个候选的miRNAs和232个新的miRNAs,研究结果极大地丰富了棉属miRNAs.通过miRNA靶基因预测分析发现多数miRNAs负调控其对应的靶基因,少数正调控.KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)注释结果表明miRNA的靶基因在植物激素代谢途径中显著富集. 相似文献
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棉花纤维发育相关基因表达谱的比较分析 总被引:3,自引:0,他引:3
本研究通过3年4环境的田间试验,在BIL(backcross inbred lines)群体中选取断裂比强度最大的材料NMGA-062(32.5cN/tex)和断裂比强度最小的材料NMGA-144(26.67cN/tex),利用Affymetrix棉花基因芯片,比较分析NMGA-062和NMGA-144纤维发育10d时的基因表达谱。在24029条转录本中,两个基因型中差异表达的转录本6504条,占筛选转录本总数的27.07%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3461条,占筛选转录本总数的14.41%,对其进行功能分类。对8个差异表达明显的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at,ACO1,ARF1,SAHH,TUA6,TUA7,β-tub1,β-tub10)进行实时荧光定量PCR的检测,发现表达模式均与芯片结果一致,说明芯片数据具有生物学意义上的可重复性,结果是可信的。本研究为以后克隆及功能验证纤维发育相关基因提供了重要参考。 相似文献
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近年来 ,随着杂交棉种植面积的不断扩大 ,杂交制种人员越来越紧张 ,制种成本越来越高。为了减少制种用工量 ,2 0 0 1 - 2 0 0 2年在山东省惠民县进行了花粉不同贮藏方法和不同授粉时间的研究 ,并进行了生产示范试验。该方法用于中棉所 38两系杂交制种田 ,采用全天授粉 ,每公顷制种田仅需1 2 .5人。比常规法制种减少用工 49% ,减少工费1 9.8%。研究还进一步探明了杂交制种的最佳时间和最佳时段。1试验方法以中棉所 38不育系亲本为供试材料 ,早上7∶ 0 0以前将父本花粉从田间取来并将其存放 ,贮藏方法分为 3种 :1常规法 (即在当天上午授粉 ) ;… 相似文献
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自2000年以来,笔者对三系配套的选育进行了深入的研究,经5年7季的南繁北育,成功地选育出稳定的抗虫不育系,不育度和不育率均达100%,并且保持系及恢复系也成功育出,经两年南、北方棉区多点试验,恢复率达100%,实现了三系配套。1保持系的选育1.1发现不育株。2000年收集了国内多个抗虫杂交棉新品系(种),进行新品种比较试验。7月中旬,在调查棉花开花期时,在HD01的新品系里偶然发现1株不育株,把该不育系取名为“中抗B”经过7天的连续观察,不育株花的柱头发育正常,花丝较短,无花粉颗粒,植株生长稳健。于是,选用了3个抗病、丰产的常规抗虫棉做父本… 相似文献