濒危珍稀植物半枫荷转录组中SSR位点分析

分析半枫荷转录组中的SSR位点信息,并设计简单重复序列(SSR)引物,以期为半枫荷EST-SSR分子标记提供有力工具。利用MISA工具筛选了半枫荷转录组测序获得的77629条Unigenes,对其SSR位点信息进行了分析;在此基础上利用Primer 3.0设计SSR引物,并随机选择50对SSR引物对4株不同来源的半枫荷进行多态性扩增分析。在半枫荷的转录组中,共找到15041个SSRs,分布于10669条Unigenes,SSR位点发生频率为13.74%,含多个位点的序列数为3114,占SSRs位点总数的29.19%,以复合形式出现的位点数2044个,占SSRs位点总数的19.16%,SSRs的平均距离是3.2 kb。SSRs位点中二碱基重复是主要类型,占总SSRs的42.17%;其次是单碱基重复基序(38.25%)SSRs。所包含的重复基元中,单碱基重复基元A/T(5572),二碱基重复基元AG/CT(4845)是优势重复基元类型,分别占总SSRs的37.05%、32.21%。利用Primer 3共设计出28590对SSR引物。随机选择50对引物进行PCR扩增,其中44对(88.0%)扩增出清晰、可重复的条带,15对(34.1%)扩增条带表现出多态性。半枫荷转录组SSR位点出现频率高,类型丰富;大量的SSR为其遗传多样性分析、分子标记辅助育种和遗传图谱构建提供了丰富的候选分子标记。     

基于SSPs预测格木在中国的潜在地理分布

[目的]格木为珍贵硬材树种,由于木材珍贵,其天然林资源遭受严重破坏,分布范围急剧缩小,数量稀少,被列为我国二级保护树种,探讨格木适生分布区对气候变化的响应,为格木天然资源的保护与引种栽培提供理论依据.[方法]基于格木55个天然分布点,以BCC-CSM2-MR气候模式和未来共享社会经济路径作为气候数据,结合海拔、土壤以及...     

Cd、Pb单一胁迫对芳樟矿物质元素及叶绿素含量的影响

以1a生芳樟扦插苗为研究对象,在福建农林大学温室大棚采用盆栽的方法研究不同浓度的Cd、Pb单一胁迫下芳樟对矿物质元素的吸收特性。经方差分析,结果表明:总体上来看Cd胁迫对于芳樟叶、茎、根对矿质元素K、Ca、Mg有促进吸收作用的浓度范围分别为0~20mg·kg~(-1)、0~40mg·kg~(-1)、0~20mg·kg~(-1)。Pb胁迫对于芳樟叶、茎、根对矿质元素K、Ca、Mg的吸收普遍呈抑制的趋势,但在浓度0~400mg·kg~(-1)Pb胁迫下对芳樟叶、茎对矿质元素Ca的吸收的却有促进作用。进一步的对芳樟叶绿素含量进行分析,Cd、Pb单一胁都会降低芳樟叶绿素a、叶绿素b的含量,高浓度胁迫下影响最为强烈。