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分子动力学(molecular dynamics)模拟蛋白质等大分子内原子间的相互作用,蛋白质折叠所需的时间通常在微秒(10^-6s)量级,而进行模拟的时间步长在飞秒(10^-15s)量级,并且每步需要计算大量的相互作用(O(n^2),n为原子数),以致于无法模拟足够长时间的折叠过程.现今在满足精确度的需求下没有更好的模拟算法.最近,生物学家研究了一种分布式的动力学方法,使得可以利用分布在Internet上的计算机进行并行模批成为可能,本文的目标是设计并实现在分布式P2P和网格计算环境等多种异构计算资源下进行动力学模拟的可靠框架,以便更大限度地利用计算资源,加快计算过程.我们基于Java和web service技术,已经实现了对应用透明的计算框架,并已将它扩展到我们的网格计算环境,实验表明分子动力学模拟程序在该框架下运行良好. 相似文献
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模糊制造系统中的不同尺寸工件单机批调度优化 总被引:2,自引:0,他引:2
将工件尺寸不同的单机批调度问题扩展到模糊制造系统中,建立了基于模糊批加工时间和模糊批间隔时间的制造跨度模型,提出了一种集成粒子群优化和差异演化的混合算法,将制造跨度最小化.为提高算法的收敛速度,设计了基于工件优先值向量的统一编码方式,并采用线性的缩放因子以确保足够的差异化信息;为解决差异演化算法早熟收敛的问题,将粒子群优化的全局搜索技术嵌入了差异演化算法;最后,在解码时利用批调度的启发式算法,将混合算法的个体加以优化分批.仿真实验结果验证了该混合算法的求解性能优于目前文献中的其他算法. 相似文献
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并行分布计算中的任务调度模型 总被引:3,自引:0,他引:3
In this paper,we first describe the concept of task scheduing in Parallel and Distributed Computing(PDC) ,then illustrate the task scheduling model in PDC and the way of calculating the execution cost and communication cost ,and lastly discuss an approach to estimate the communication contention overhead. 相似文献