氧化葡萄糖酸杆菌启动子的筛选及鉴定

利用缺乏启动子的绿色荧光蛋白TFP作为报告基因,与广宿主型质粒pBBR1MCS-5相结合,构建了可在氧化葡萄糖酸杆菌中稳定存在的探针质粒pBBR1MCS5-TFP.利用构建的启动子探针质粒从氧化葡萄糖酸杆菌中分离到多个具有启动子功能的DNA片段--G12、G65、G69和G78,序列测定结果显示G12片段上具有典型的细菌启动子保守序列(-35和-10区)和核糖体结合位点(RBS),将其命名为Lhp启动子.鉴定Lhp在氧化葡萄糖酸杆菌中的启动活性,结果显示该启动子能有效启动异源基因绿色荧光蛋白以及NADH脱氢酶Ⅱ基因的表达.     

鲍曼不动杆菌临床分离株16S rRNA甲基化酶基因研究

目的 了解临床分离鲍曼不动杆菌(ABA)氨基糖苷类药物耐药性与16S rRNA甲基化酶基因存在的关系,探讨多药耐药机制.方法 收集临床标本20株鲍曼不动杆菌,采用K-B法测定细菌对卡那霉素、阿米卡星、妥布霉素、庆大霉素、奈替米星的敏感性;采用PCR法检测armA、rmtA、rmtB、rmtC和rmtD 5种16S rRNA甲基化酶基因.结果 19株鲍曼不动杆菌对上述5种氨基糖苷类药物全部耐药,1株对阿米卡星敏感,对另外4种表现为中度耐药.基因检测显示armA阳性率为90％,且armA基因存在变异,未检测到rmtA、rmtB、rmtC和rmtD基因.结论 鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类药物耐药情况严重,16S rRNA甲基化酶基因armA为本次临床分离菌株耐药的主要原因,且armA基因存在变异.     

多形类杆菌的分子生物学鉴定

目的用聚合酶连反应技术(PCR)鉴定多形类杆菌。方法采用16S rRNA基因序列为靶基因设计引物,建立PCR反应体系对该种细菌进行鉴定,并测定PCR产物序列,验证PCR反应的特异性。结果3株多形类杆菌能被扩增,其他菌株和基因组不能被扩增;所测得的PCR产物序列和标准的多形类杆菌16S rRNA基因序列99%同源。结论建立PCR反应体系能特异地鉴定多形类杆菌。     

氨基糖苷类药物双圈耐药型鲍曼不动杆菌16S rRNA甲基化酶基因研究

目的 探讨在K-B法药物敏感试验中对氨基糖苷类药物双圈耐药的鲍曼不动杆菌16S rRNA甲基化酶基因携带状况以及药物诱导对该基因mRNA表达量的影响.方法 收集42株鲍曼不动杆菌,K-B法测定其药敏情况;PCR法扩增三种16S rRNA甲基化酶基因armA、rmtB及rmtC;用RT-PCR的方法分析阿米卡星诱导前后耐药基因表达量.结果 90.4％(38/42)的菌株阿米卡星药敏纸片周围呈现双圈耐药,且均检测到armA,未检测到rmtB及rmtC,其余3株为敏感,1株为普通耐药,且PCR检测耐药基因为阴性.RT-PCR结果显示经阿米卡星诱导后细菌armA基因mRNA表达量显著上升.结论 双圈耐药现象与armA基因诱导型表达有关.     

多重耐药鲍曼不动杆菌16S rRNA甲基化酶研究进展

氨基糖苷类抗生素在治疗鲍曼不动杆菌引起的感染中起着重要的作用.而鲍曼不动杆菌对该类抗生素的耐药机制主要包括产氨基糖苷修饰酶,外膜孔蛋白表达缺失,药物外排泵的表达和核糖体结合位点的改变等.质粒介导的16S rRNA甲基化酶是近年在多重耐药鲍曼不动杆菌中发现的一种新的耐药机制,可导致对氨基糖苷类抗生素的高水平耐药.本文就细菌rRNA的修饰作用、16S rRNA甲基化酶的发现、耐药与传播机制、耐药菌的流行、多重耐药鲍曼不动杆菌16S rRNA甲基化酶基[因的研究进展等方面作一综述.     

症状消除性抗糖尿病药Epalrestat

本品为醛糖还原酶抑制剂,是抗糖尿病症状的药物。多元醇途径中有两种酶,即醛糖还原酶和山梨醇脱氢酶,这两种酶催化以下反应: 葡萄糖山梨醇果糖在此途径第一步醛糖还原酶利用辅因子NADPH,使葡萄糖醛式还原成相应的葡萄糖醇式,山梨醇。第二步中山梨醇脱氢酶利用NAD~+使山梨醇氧化成果糖。山梨醇途径首先发现于精囊,以后在多种组织也有发现。 1959年在糖尿病鼠的晶状体中发现有山梨醇,这表明醛糖还原酶在晶状体中也有     

氨基糖苷类修饰酶基因aac(2 ')-Ⅰb型在耐药鲍曼不动杆菌中流行

目的 调查一组耐药鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类的耐药机制.方法 收集2013年1至3月江苏省淮安市第一人民医院住院患者标本中分离到的鲍曼不动杆菌共32株,用分子鉴定法确认为鲍曼不动杆菌,再用聚合酶链反应(PCR)方法分析9种氨基糖苷类修饰酶基因与7种16S rRNA甲基化酶基因.结果 本组32株耐药鲍曼不动杆菌共检出5种氨基糖苷类修饰酶基因:aac(2')-Ⅰb 32株(100.0％)、aac(3)-Ⅰ 15株(46.9％)、aac(6')-Ⅰb 19株(59.4％)、ant(3")-Ⅰ 20株(62.5％)、aph(3')-Ⅰ 19株(594％),与1种16S rRNA甲基化酶基因armA 25株(78.1％).阳性基因共分为7种检测模式,其中以aac(2')-Ⅰb+ aac(3)-Ⅰ+ aac(6')-Ⅰb+ ant(3")-Ⅰ+ aph(3')-l+armA等6种基因均阳性的模式最高,为12株(37.5％).结论 产5种氨基糖苷类修饰酶基因(aac(2')-Ⅰb、aac(3)-Ⅰ、aac(6')-Ⅰb、ant(3")-Ⅰ、aph(3)-Ⅰ)与1种16S rRNA甲基化酶基因armA是本组耐药鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类耐药的重要原因.在鲍曼不动杆菌临床分离株检出aac(2')-Ⅰb型氨基糖苷类修饰酶基因为国内首次报道.     

氧化葡萄糖酸杆菌胞内脱氢酶Gox0525的酶学性质研究

将氧化葡萄糖酸杆菌胞内脱氢酶推测基因Gox0525克隆至表达载体pET-28a(+)中,并在大肠杆菌中得到可溶性表达的蛋白,纯化后经HPLC以及SDS-PAGE检测,表明其活性形式为四聚体.重组蛋白Gox0525属于短链脱氢酶家族,选择该家族的催化底物谱测试,结果表明Gox0525具有还原二酮的能力,且专一性利用辅酶NADPH,在pH 9.0、30℃条件下活性较高,适合保存在pH 7.0、4℃条件下.酶反应的发生对金属离子无依赖性,添加Ca2+对酶活力有促进作用,而Fe3+有抑制作用.     

控制糖尿病并发症的醛糖还原酶抑制剂

虽然使用胰岛素可延长糖尿病患者的生命,但不能预防糖尿病并发症的发生。糖尿病并发症,如白内障,视网膜病变,角膜上皮病变、神经病变和微血管病变等已证明与醛糖还原酶有关。醛糖还原酶和山梨醇脱氢酶一起构成了多元醇途径,在此途径中,第一步醛糖还原酶利用辅因子NADPH使葡萄糖还原成山梨醇;第二步山梨醇脱氢酶利用NAD~+使山梨醇氧化成果糖。 (?) 多元醇途径和醛糖还原酶最初在精囊内发现,目前已发现它存在于多种与糖尿病有关的组织。研究表明,由于醛糖还原酶活性     

多重耐药鲍曼不动杆菌16S rRNA甲基化酶基因研究

目的 调查临床分离多重耐药鲍曼不动杆菌中介导氨基糖苷类高水平耐药的16S rRNA甲基化酶基因armA、rmtA、rmtB的流行情况.方法 收集台州市中心医院、台州市立医院两家多重耐药鲍曼不动杆菌128抹,用K-B法测定18种抗菌药物;采用琼脂稀释法测定4种氨基糖苷类药物MIC值;PCR检测armA、rmtA、rmtB...     

应用16SrRNA基因序列分析快速鉴定临床标本中的革兰氏阳性杆菌

目的探索一种快速鉴定临床标本中革兰氏阳性杆菌的方法。方法利用PCR技术扩增待检菌株的16SrRNA基因序列,通过分析待检菌株的16SrRNA基因序列对其进行鉴定。结果5株待检菌株的16SrRNA基因序列均成功扩增,其中4株的16SrRNA基因序列与基因库中已注册的核酸序列相似率达99．9％以上,将其鉴定到种的水平,1株的16SrRNA基因序列与基因库中雷弗森菌属的核酸序列相似率为97．09％,将其鉴定为雷弗森菌属。结论应用16SrRNA基因序列分析可快速、准确地鉴定临床标本中的革兰氏阳性杆菌。     

基于COⅠ与16S rRNA基因对广地龙的DNA分子鉴定研究

目的:建立一种快速、准确和标准化的广地龙DNA分子标记鉴别方法。方法:测定了5个不同居群广地龙的线粒体细胞色素酶亚单位(CO)Ⅰ和16S rRNA基因序列,采用CodonCode Aligner进行序列拼接,通过下载GenBank地龙原动物的COⅠ与16S rRNA序列,采用MEGA4.1计算广地龙及其伪品地龙的种内、种间的K2P遗传距离,并基于K2P模型构建NJ和MP树。结果:COⅠ变异位点、信息位点均高于16SrRNA,COⅠ基因无插入和缺失,16S rRNA存在4个插入和缺失。COⅠ和16S rRNA序列种间遗传距离均明显大于种内,COⅠ和16S rRNA基因均能将广地龙从其他地龙或蚯蚓物种鉴别开来。结论:获得的广地龙COⅠ和16S rRNA序列可为动物性中药材地龙的分子水平鉴定提供参考,为动物性中药材DNA条形码数据库积累了相关信息数据。     

4株脑膜炎球菌菌株的16S rRNA、PorA和PorB基因序列分析

目的  对A、C、Y和W135 4个不同血清群脑膜炎球菌菌株的16S rRNA、PorA和PorB基因进行序列分析,从分子水平对其做出鉴定。方法  提取脑膜炎球菌基因组DNA为 模板,设计特异性引物进行16S rRNA、PorA和PorB基因的PCR扩增并测序。结果  A、C、Y和W135群4个菌株的16S rRNA基因序列与GenBank中奈瑟菌属的脑膜炎球菌的同源性最高。4个菌株的PorA基因分型分别为P1.5-2,10; P1.7-1,1; P1.5-1,2-2; P1.5,2。PorB基因分别与porB3-26、porB2-40、porB3-100和porB3-25同源。结论  从基因水平分析表明4个菌株属于脑膜炎球菌,并在PorA和PorB基因分型上有差异。     

多重耐药大肠埃希菌16S rRNA甲基化酶、氨基糖苷类修饰酶基因研究

目的了解多重耐药大肠埃希菌(ECO)氨基糖苷类药物耐药机制。方法采用PCR检测20株多重耐药ECO菌11种16S rRNA甲基化酶和氨基糖苷类修饰酶基因。结果1株检出16S rRNA甲基化酶基因(5.0%),并为新亚型;16株检出氨基糖苷类修饰酶基因(80.0%)。15号株rmtB基因测得序列翻译成氨基酸序列与美国核酸库(GenBank)已登录的rmtB氨基酸不同,为新亚型。结论本组多重耐药ECO菌氨基糖苷类耐药机制与产16S rRNA甲基化酶和产氨基糖苷类修饰酶相关。多重耐药ECO菌存在新的氨基糖苷类药物耐药机制。     

Mitochondrial benzodiazepine receptors regulate oxygen homeostasis in the early mouse embryo

The peripheral benzodiazepine receptor (Bzrp) has been implicated in the control of several processes, including mitochondrial biogenesis and embryo development. The present study examined the impact that specific Bzrp ligands have on oxygen homeostasis in the early mouse embryo. Day 9 embryos at the 16-18 somite pair stage were exposed to standard (21% oxygen) and suboptimal (5% oxygen) oxygen tensions in whole embryo culture. Analysis of gene expression used relative PCR to monitor changes in nuclear respiratory factor-1 (Nrf1), mitochondrial 16S ribosomal RNA (16S rRNA), and genes for several glycolytic enzymes. Ocular development was highly sensitive to periods of hypoxia through a mechanism blocked with the potent Bzrp ligand PK11195. Hypoxia led to a decline of Nrf1 and 16S rRNA levels also through a mechanism blocked with PK11195. Similar activity was observed for FGIN-1-27 whereas Ro5-4864 had contradictory effects. Morpholino-based gene knockdown of Nrf1 (anti-NRF1) produced a sequence-specific decrease in 16S rRNA insensitive to PK11195. These functional relationships suggest that Bzrp-dependent signals regulate the Nrf1 --> Tfam1 --> mtDNA --> 16S rRNA pathway in response to oxygen levels. The activity of PK11195 most likely has a pharmacodynamic basis with regards to specific embryonic precursor target cell populations, transducing a mitochondrial signal to an Nrf1 response analogous to retrograde regulation in yeast for mitochondria-to-nucleus signaling.     

铜绿假单胞菌临床分离株16S rRNA甲基化酶基因研究

目的:了解临床分离铜绿假单胞菌氨基糖苷类药物耐药性与16SrRNA甲基化酶基因的关系,探讨多药耐药机制。方法:收集20株铜绿假单胞菌临床标本,采用K-B法检测20株铜绿假单胞菌对卡那霉素、阿米卡星、妥布霉素、庆大霉素、奈替米星的敏感性;采用PCR法检测5种(armA,rmtA,rmtB,rmtC,rmtD)16SrRNA甲基化酶基因。结果:10株铜绿假单胞菌对上述5种氨基糖苷类药物全部耐药,1株对阿米卡星敏感,对另外4种药物表现为耐药,6株对1~2种药物表现为耐药,其余3株对5种药物全部敏感。基因检测显示rmtB和armA阳性率为15%,未检测到rmtA,rmtC,rmtD基因。结论:铜绿假单胞菌对氨基糖苷类药物耐药情况严重,并在其中检出16SrRNA甲基化酶基因,应引起重视。     

台湾海峡海洋沉积物放线菌的多样性

目的探究台湾海峡海洋沉积物中放线菌的多样性及发现合成药物先导化合物的新菌源。方法采用6种选择性培养基分离15份来自台湾海峡沉积物样品中含有的放线菌。挑选不同培养特征的放线菌进行初步分类鉴别、16S rRNA基因序列系统进化分析及基于PCR的烯二炔抗生素基因筛选。结果共分离到497株放线菌,挑选的95株放线菌分别属于放线菌7个科,11个属。16S rRNA基因序列分析结果提示分离到的小单孢菌科菌种存在数个潜在新种,95株菌中有27%的菌株含有烯二炔抗生素核弹头的生物合成基因片段。结论海洋环境蕴含丰富的放线菌资源,具有产生烯二炔类抗生素的潜能。     

Identification of endogenous reference genes for RT‐qPCR analysis of plasma microRNAs levels in rats with acetaminophen‐induced hepatotoxicity

Circulating microRNA (miRNA) expression profiles have been reported to be promising biomarkers for drug‐induced liver injury in preclinical and clinical practice. Proper normalization is critical for accurate miRNAs expression analysis. Herein, using SYBR green quantitative real‐time PCR (RT‐qPCR), we evaluated the expression stability of six candidate reference genes including two commonly used small RNAs (U6, 5S) and four miRNAs (let‐7a, miR‐92a, miR‐103 and miR‐16) in plasma of rats with acetaminophen‐induced hepatotoxicity. Data were analysed using geNorm, Normfinder, BestKeeper and comparative delta‐Ct statistical models, and the results consistently show that miR‐103 is the most stably expressed reference gene. Whereas the commonly used housekeeping genes 5S or U6 are all not suitable normalizers, because 5S exhibits extensive variability in expression and U6 has a low expression level across the plasma samples. Then the effect of reference genes on normalization of plasma miR‐122 was assessed; when normalized to the most stable reference gene there were significant differences between the acetaminophen‐treated group and the vehicle group. However, when the data were normalized to a less stably expressed gene, miR‐16, a biased result was obtained. Therefore, we recommend that miR‐103 as suitable reference gene for plasma miRNAs analysis for acetaminophen‐induced liver injury. Data presented in this paper are crucial to successful biomarker discovery and validation for the diagnosis of the early stage of acetaminophen hepatotoxicity. Copyright © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.