基于系统生物学的肺气虚证证本质探究

生物体是一个整体化和网络化的复杂系统,证的本质需要采用适用于复杂系统和现象研究的系统科学理论来阐释。系统生物学的出现给证候实质研究带来了新希望。本文基于系统生物学的研究方法和技术,从基因组学、蛋白质组学、代谢组学等组学角度,论述肺气虚证的证本质研究,并对肺气虚证的研究前景予以展望。     

系统生物学——一生命科学的新领域

20世纪生物学从宏观到微观进步巨大，传统的分析还原的研究方法受到质疑。在此背景下，系统生物学是继基因组学、蛋白质组学之后一门新兴的生物学交叉学科。从系统角度来进行生物学研究逐步成为现代生物学研究方法的主流。在研究上．了解一个复杂的生物系统需要整合实验和计算方法、基因组学和蛋白质组学中的高通量方法为系统生物学发展提供大量的数据，计算生物学通过数据处理、模型构建和理论分析，成为系统生物学发展的一个必不可缺的、强有力的工具，已经在诸多医学前沿领域的研究中成为重要研究方法而被广泛应用。本文旨在阐述系统生物学的发展现状及其应用前景，希望能对广大相关领域的读者有所价值。     

系统生物学技术在中药复方中的研究进展

系统生物学技术可从整体上分析细胞内动态变化的蛋白质的组成与活动规律,为中药复方的研究提供了可行的理论和方法。在其应用方面,近几年的研究更加注重整合,其全面检测、综合分析的特点与中医的整体观、动态观不谋而合,为中医药研究提供了全新的研究手段。近年来,系统生物学技术在中药复方研究中的应用取得了实质性的进展,但仍存在以下不足:现有的方法学知识难以满足具有高度系统性、复杂性的系统生物学研究需求,如转录组测序技术的应用就相当有限;相关文献以理论性阐述为主,实验研究较少,系统生物学在中药复方中的研究还处于理论论证和方法学探索阶段;现有的单一横向的系统生物学技术研究较为局限;现有数据库在规模及完整性、原创性方面明显不足,且数据的可靠性、准确性有待实验验证。此外,样本量较少、代谢产物种类较多、实验设计欠严谨、临床实用性欠缺等问题亦存在。因此,在借鉴系统生物学的方法研究中药复方时,要具有批判性和创造性思维,充分了解各种组学技术的差别及结合技巧,整合多项系统生物学技术,从DNA、mRNA、蛋白和代谢物等不同层次、多个变量的研究结果中发现中药复方的规律和联系。同时,有必要构建综合数据平台,链接中医药领域中的知识资源,实现更全面的数据共享与传播。     

系统医学是中西医结合的新途径

系统生物学的崛起,再次说明了应用系统论方法研究与发展现代医学的重要性。对于与系统论渊源颇深的中医来说,是一个重新振兴的契机。回顾系统生物学的研究方法,探讨系统医学的真正内涵,剖析中西医学两大诊治体系的主要异同点,提出了系列发展系统医学,包括系统生理学、系统病理学、系统诊断学、系统治疗学等。建立中西合璧的系统医学,既要重视运用西医提高中医,同样应该重视中医理论、诊治手段及经验对西医的启发,从人体系统的平衡理论或稳态概念出发进行整合。     

系统生物学及其研究进展

随着分子生物学的发展、人类基因组计划、微生物基因组计划、功能基因组学以及蛋白质组学等学科的发展,传统生物学家通过直接的观察与实验已经获得了海量的数据,如何应用这些大量的实验数据进一步阐明疾病、健康等生命本质,已成为当前研究者共同努力的目标,系统生物学(Systems Biology)为此提供了一种新的思维、研究方法.自2001年系统生物学概念一提出就受到各国研究者高度重视,目前生物学研究的重点正从20世纪的还原论研究转向21世纪的系统论研究,系统生物学将是21世纪医学和生物学的核心驱动力[1],极大推动生物学、医学的发展.本文将对系统生物学的产生发展及其研究热点作一综述.     

第一届“系统生物医学上海论坛”——代谢组学（metabonomics）与中医药国际化研讨会在上海召开

由上海系统生物医学研究中心主办，上海交通大学系统生物医学研究院、上海中医药大学中医方证与系统生物学研究中心承办的第一届“系统生物医学上海论坛——代谢组学与中医药国际化研讨会”于2006年6月22日在上海交通大学召开。会议特邀了代谢组学创始人、英国帝国理工大学生化系主任Jeremy Nicholson教授做主题报告，中国科学院副院长陈竺院士、刘昌孝院士、杨胜利院士做重要讲话和报告；我国中医药学科著名学者和活跃在代谢组学、系统生物学等新兴学科的学者会聚一堂，深入探讨中医药国际化和现代化的新方向与新思路。     

代谢组学在中西医结合眼科研究中的应用与展望

代谢组学是近10年发展起来的组学技术,是系统研究代谢产物的变化规律并揭示机体生命活动本质的科学,是系统生物学研究的重要学科之一。代谢组学研究具有整体性、动态性、综合性的特点,能够从代谢层面反映机体功能水平,与传统中医学     

中药现代化在系统生物学时代所面临的若干潜在危机

近几年系统生物学包括系统生物医学的发展很快。系统生物学相关学科的发展将在一定程度上逐步改进人们在生物技术上的研究手段和研制理念;系统生物医学正在逐渐把西药与中药联系起来,但是在这个联系的过程中蕴涵着中药现代化的重大危机。从其中的一个角度来看,中药是一种多位点定向或定点改变基因表达的技术;但是中药成分复杂,系统庞大,很难在几十年的时间内实现在基因水平上对中药的全面理解;而西药已经把基于基因网络和细胞信号传导系统结构的药物设计方法变成了常规技术。当基因网络相关的基础研究达到一定深度时,就可以发展一套成熟的多位点定向或定点改变基因表达的技术,很可能研制出中药化的配伍西药。从技术层面和研究资金强度上看,国际上大的生物制药公司实现西药中药化的目标已经准备了很好的条件,正在时间上与中药现代化进行赛跑并可能逐步与个体化医学接轨。     

浅析肿瘤系统生物学与中医药学的关系

随着系统生物学的发展,对肿瘤的认识逐渐深入到基因水平,癌基因、抑癌基因、信号传导、细胞凋亡等机制的阐述使人们认识到基因组学研究在对单个基因研究工作的基础上,充分认识到基因之间相互联系的复杂性。肿瘤系统生物学认为肿瘤是一类全身代谢障碍性疾病,肿瘤的产生是一个多因素、多步骤、多基因作用的复杂过程,属于体细胞多基因遗传性疾病。从结构研究向功能研究方式的转变,对基因之间的相互联系、相互作用日趋重视,反映出基因组学与中医药两个学科在思维方法学上越来越多的趋近特征,显示出研究思路与方法相互渗透的可能性。一、系统生物学与中医药学的共同特征     

系统生物学与中药现代研究(一)

传统医药在疾病治疗中起着整体调节的作用,从整体观来认识,中医药与系统生物学是一完美的整体观的匹配。在中药现代研究开发中,应用系统生物学方法研究中药的药理作用、作用机制、药物安全性和配伍规律将是十分重要的。代谢组学正在快速发展,它将是系统生物学研究中的关键技术。因此,它将是研究中药的有用技术。现介绍一些系统生物学的基础概念和代谢组学应用中药现代研究的一些设想。     

系统生物学与中药现代研究(二)

传统医药在疾病治疗中起着整体调节的作用,从整体观来认识,中医药与系统生物学是一完美的整体观的匹配。在中药现代研究开发中,应用系统生物学方法研究中药的药理作用、作用机制、药物安全性和配伍规律将是十分重要的。代谢组学正在快速发展,它将是系统生物学研究中的关键技术。因此,它将是研究中药的有用技术。现介绍一些系统生物学的基础概念和代谢组学应用中药现代研究的一些设想。     

基于系统生物学的溃疡性结肠炎中医证候研究现状

溃疡性结肠炎(UC)当前治疗策略能够大大改善患者临床结局,但是总体治疗效果仍远未达到最佳状态。中医药发挥整体调控,多靶点作用的优势,在UC治疗中具有显著的疗效。"证候"是中医领域研究的核心问题,但中医证候缺乏客观、量化指标制约中医学的发展和中医现代化的进程。系统生物学是一种整合性研究方法,通过研究生物系统中不同部分(基因、蛋白质、代谢物等)之间的相互关系和相互作用,从整体性、动态性、多维度的角度去解析生命活动过程及机制,其研究特点与中医药"整体观"、"辨证论治"十分契合,在中医药研究中发挥了重要作用。本文通过阐释系统生物学的UC中医证候研究现状,从系统生物学角度提出UC疾病研究的未来展望。     

研究和建立代谢综合征中医浊病学说

首先对浊阴、浊气,浊邪、浊病的概念做出界定.继而讨论浊邪、浊病与“五高”(高血糖、高血脂、高血粘、高尿酸、高血压)、浊痰瘀三者胶着混杂形成的有形实邪与代谢综合征脂质、蛋白质……异位沉积之间在病理上的联系.最后通过临床经验方的药物组成规律进行总结分析,反证浊病与代谢综合征之间存在着特异性联系.建议深入挖掘、系统整理中医学关于“浊”的认识和经验,使其概念明确,体系完善,疗效确切,以提高中医学“治未病”的水平;借助现代系统科学理念和实验技术手段,从系统生物学直至分子生物学水平,分层次、分阶段研究阐释浊邪、浊病在代谢综合征中的病理机制、病变特点以及诊疗策略.     

代谢组学及其应用研究新进展

代谢组学是近年来新发展起来的一门组学,是采用一些现代的分析技术,如磁共振、质谱技术等,取得整个研究体系的多维数据后,利用模式识别和专家系统技术寻找其中的系统生物学信息。文章从代谢组学的定义及特点、研究方法、应用等方面予以阐述。     

系统生物学与中药现代研究(一)

传统医药在疾病治疗中起着整体调节的作用，从整体观来认识，中医药与系统生物学是一完美的整体观的匹配。在中药现代研究开发中，应用系统生物学方法研究中药的药理作用、作用机制、药物安全性和配伍规律将是十分重要的。代谢组学正在快速发展，它将是系统生物学研究中的关键技术。因此，它将是研究中药的有用技术。现介绍一些系统生物学的基础概念和代谢组学应用中药现代研究的一些设想。     

系统生物学与中药现代研究(二)

传统医药在疾病治疗中起着整体调节的作用，从整体观来认识，中医药与系统生物学是一完美的整体观的匹配。在中药现代研究开发中，应用系统生物学方法研究中药的药理作用、作用机制、药物安全性和配伍规律将是十分重要的。代谢组学正在快速发展，它将是系统生物学研究中的关键技术。因此，它将是研究中药的有用技术。现介绍一些系统生物学的基础概念和代谢组学应用中药现代研究的一些设想。     

浅谈系统生物学与中医体质学的关系

生命系统和医学具有极强的复杂性,近年来各种组学的发展使得传统生物学家已经获得了大量的数据,如何利用这些实验数据进一步阐明疾病、健康等生命本质,已成为当前研究者共同努力的目标,系统生物学为此提供了一种新的思维方式和研究方法。本文着重从中医体质学的角度出发,探讨系统生物学与中医体质学说的关系。     

中医药治疗溃疡性结肠炎热点主题和前沿趋势可视化分析

目的:探讨中医药治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的研究现状、热点和未来趋势.方法:采用CiteSpace和VOSviewer软件,对中国知网和Web of Sicence (WoS)中中医药治疗UC相关文献构建可视化知识图谱,分析作者、机构、国家合作网络关系及关键词共现、聚类、突现结果.结果:共检索知网文献7141篇,WoS文献190篇,年度发文量均呈明显上升趋势;中文文献中介中心性大于0.1的关键词6个,聚类分析得到14个类别,主要聚类结果包括中西医结合、中药灌肠、美沙拉嗪、肿瘤坏死因子-α、大鼠、中医证型等,关键词突现分析共15个突现词,可知中西医结合治疗、中医药作用机制研究以及肠道菌群是目前研究热点.英文文献中介中心性大于0.1的关键词7个,聚类分析得到12个类别,主要聚类结果包括huanglian jiedu decoction、zingiberis rhizoma、antioxidation、bile acid、intestinal flora等,关键词突现分析共3个突现词,可知UC的治疗、相关体外实验研究、肠道菌群的研究是当前热点.结论:中医药治疗UC发文量总体呈上升趋势,作者和研究机构间合作均较分散,仅存在小型合作团体;中医药对于UC的研究主要集中在中西医结合疗法及具体中医方案的应用研究;中医药治疗UC的作用机制也是重点关注问题;未来肠道菌群在UC治疗中的重要作用可能成为关注的热点主题.     

蛋白质组学应用于中医虚证研究进展

蛋白质组学是后基因组时代系统生物学的一部分。从分子生物学角度研究机体在蛋白质水平上的定量、动态及整体性,同中医证候的"整体观""动态观"特征具有一致性。概述了蛋白质组学技术应用于中医气虚证、血虚证、阴虚证、阳虚证的研究,分析各证候蛋白质差异性表达,探寻了相应的生物标志物,以期为疾病证候诊断提供客观指标,阐明中医虚证的本质。参考文献32篇。     

系统生物学技术在方剂学中的研究进展

方剂学是中国医药的重要组成部分之一,长期以来,如何解释方剂配伍化学成分的意义、及有效性做出科学合理的解释,是目前中医药现代化亟需解决的问题。系统生物学是通过整体观念来研究生物成分的相互关系,本文系统阐述系统生物学四个方面基因组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学在方剂学研究的进展。