2009—2016年新疆流感网络实验室检测数据分析

目的了解新疆流感病毒检出的时间分布,初步分析2009—2016年季H3亚型流感病毒HA基因的演变过程,为科学防控流感提供依据。方法分析流感监测系统中2009—2016年全疆流感网络实验室的流感病毒核酸检测结果;对新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心分离的每个流行年度2株季H3亚型毒株的HA基因进行测序,与每年的疫苗株一起绘制种系发生树。结果 2009—2016年全疆流感网络实验室检出样本甲型6 639份、乙型2 801份、甲乙混合型7份,1—3月、11月和12月检出阳性率较高,4—10月也有流感病毒检出;仅2009—2010年检出季H1亚型流感病毒,2009年起开始检出新甲H1亚型流感病毒;新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心分离的季H3亚型流感毒株的HA基因以2012年为界分为2个大的分支,2012年后分支又分为4个子分支。结论新疆流感检出以甲型为主,流感阳性标本检出集中在每年的冬春季,夏秋季也可检出;从2009年开始新甲H1亚型取代季H1亚型成为优势株,季H3亚型HA基因每年都有变异。     

2017-2020年新疆流感网络实验室检测数据分析

目的 了解新疆流行性感冒(流感)病毒检出的时间分布,初步分析2017-2020年季H3亚型流感HA基因的演变过程以及与疫苗株匹配情况,为科学防控流感提供依据.方法 分析流感监测系统中2017-2020年全疆流感网络实验室的流感核酸检测结果;对每个流行年度2株季H3亚型毒株的HA基因进行测序,与每年的疫苗株一起绘制种系发生树.结果 2017-2020年全疆流感网络实验室检测样本50 515份,流感病毒检出阳性率为14.64％,季节性流感4种亚型均有检出,其中阳性率甲型11.12％、乙型3.52％,甲型流感H3N2亚型检出最多(38.25％),其次是新甲H1(37.71％);阳性率2018年最高(21.85％)、2020年最低(3.99％),2017-2020年总体检出阳性数较多的3个月依次为12月(2 473份,33.44％)、1 月(1 995份,26.97％)和 11 月(1 224份,16.55％).2017年和2018年的4个HA序列结果在一个小分支,2019年和2020年6个序列在一个小分支,10株均与疫苗株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016在同一分支,疫苗株A/Hong Kong/4801/2014和A/Kansas/14/2017在单独的分支.结论 2017-2020年新疆流感检出集中在11月至次年1月,甲型流感检出率高于乙型流感,2019-2020年新疆H3N2亚型流行株与2019年推荐的疫苗株不在同一分支上;流感网络实验室连续开展流感监测,有助于及早发现流感病毒的变异特征.     

乌鲁木齐市儿童医院流感样病例监测结果

目的分析新疆乌鲁木齐市儿童医院流感样病例(ILI)的监测结果及病原学分型,了解乌鲁木齐市儿童流感的流行特征,为制定防控措施提供数据支持。方法汇总2013─2016年乌鲁木齐市儿童医院流感样病例数、咽拭子采样数和咽拭子病原学检测结果,分析ILI患儿的发病趋势和病毒分型。结果 2013─2016年,乌鲁木齐市儿童医院共采集0~16岁ILI咽试子标本3 711份,检出阳性804份、阳性检出率21.67%;病毒分型以季H3型检出最多(340份)、占42.29%,其次是乙型Victoria B(257份)、占31.96%;发病集中在3~9岁儿童,4岁~组(3.20%)和7岁~组(3.15%)阳性检出率高,差异有统计学意义(χ2=217.049,P0.05)。结论乌鲁木齐市儿童流感发病以3~9岁儿童为主,季H3型流感病毒为各年度主要流行株,同一年度多种流感病毒亚型共同流行;医院应加强对托幼儿童、学龄儿童的健康教育和防控工作,降低流感暴发的几率。     

2013-2018年我国流感流行特征分析北大核心CSCD

目的了解我国近5年流感性感冒(简称流感)流行的季节性、病毒亚型、发病率和病死率等流行病学特征。方法通过中国疾病控制中心信息系统和中国流感监测信息系统收集2013年1月-2018年3月我国流感发病数和死亡数及每周上报流感样病例(ILI)监测实验室检测数据,采用Excel 2010进行统计学分析。结果 2013-2017年全国共检测流感样病例鼻咽拭子标本1 143 123份,检出流感病毒阳性154 699份(阳性率13.53%),以甲型流感病毒(H1N1、H3N2)和乙型流感病毒为主;2018年截止4月1日共检测阳性标本102 166份,流感病毒阳性31 154份(占30.49%),主要流行毒株为甲型H1N1、乙型流感病毒和甲型H3N2。每年的流感发病高峰主要集中在上年的12月至次年的4月,但2015、2017年的7月和8月发病率均较高(>10%)。结论 2013-2017年我国流感发病呈明显季节性,以冬、春季节发病率较高,2015年和2017年夏季出现流感发病高峰期。2017年12月-2018年2月流感发病数达到近5年的最高峰,甲型H1N1和乙型流感病毒为主要流行株。     

2016—2020 年深圳市盐田区流行性感冒流行特征分析

目的 分析深圳市盐田区流行性感冒的流行病学特征,预测其流行趋势,为流感防控提供科学依据。 方法 收集 2016—2020 年盐田区流感样病例(ILI)监测数据、辖区内流感暴发疫情数据和病原学检测结果并进行分析。结果 2016—2020 年深圳市盐田区哨点医院共报告 ILI 1 563 例,其中男性 898 例,女性 665 例;年龄以 0~ 15 岁人群为主,占 67. 31%(1 052 / 1 563)。 2016—2020 年共采集 ILI 样本 1 563 份,检出阳性样本 302 份,总阳性率为19. 32%。 2016—2020 年 ILI 样本阳性率分别为 23. 79%、21. 39%、16. 23%、31. 11%和 2. 42%,各年度阳性率差异有统计学意义( χ2 = 87. 829,P<0. 05)。 2016 年主要流行病毒株为甲型 H1N1 和 B 型 Victoria 系,2017 年为甲型 H1N1和 A(H3N2),2018 年为甲型 H1N1 和 B 型 Victoria 系,2019 年为甲型 HINI、A(H3N2)和 B 型 Victoria 系,2020 年仅 有 A(H3N2)检出。 2016—2020 年深圳市盐田区共报告 ILI 暴发疫情 82 起,采集样本 451 份,阳性 314 份,阳性率为 69. 62%。 暴发疫情全部发生在学校,以小学为主,中学次之。 结论 深圳市盐田区不同监测年份各流感亚型交替流行,0~ 15 岁人群为重点关注人群,学校是盐田区流感防控重点场所。 应提高重点人群流感疫苗接种率,加强学校流感监测工作。     

2016-2019年新疆流感监测分析

目的了解2016—2019年新疆流感样病例(influenza-like illness,ILI)的流行病学特征和病原学监测数据,为流感防控工作提供科学依据。方法通过中国流感监测信息系统收集2016—2019年新疆流感哨点医院报告的ILI、病原学监测数据和流感聚集性疫情报告资料,分析流行病学特征。结果 2016年第14 w—2019年第13 w,新疆共报告门诊病例9 820 366例,其中流感样病例405 394例,ILI%为4.1%;病例集中在15岁以下人群;检测样本38 975份,检出流感病毒阳性6 584份、阳性率16.9%,分离病毒株为新甲型H1N1型848株、H3型603株、BV型47株和BY型606株,聚集性疫情中病毒型别与当年流行的病毒型别一致。结论新疆流感疫情集中在每年的第40 w至次年第20 w,新甲型H1N1,B型和H3型交替流行;流感主要发生在冬春季,以学龄儿童为主;应加强学龄儿童的流感防控工作。     

新疆克拉玛依市流感样病例检测分析

目的分析2011─2013年新疆克拉玛依市流感样病例检测结果,探讨本地区流感流行的特征及趋势,为流感防控工作提供科学依据。方法采用Real-timeRT-PCR方法对2011—2013年克拉玛依市流感哨点医院定期采集的流感样病例咽拭子标本进行核酸检测。结果 3年共采集流感样病例标本1 161份,流感病毒核酸检出率21.5%,2011—2013年流感病毒核酸检出率分别为15.7%、33.5%、17.4%;流感病毒型别主要为甲型H1N1、季节性H3N2和B型;哨点医院监测还发现全市流感发病有明显的季节性,当年11—12月到次年1—2月为高发季节,其中12月和1月最高;流感病毒优势株2011年底至2012年初以B型为主,2012年底至2013年初以季节性H3N2型为主,2013年底以新甲型H1N1为主。结论加强哨点医院流感样病例监测,有助于掌握本地区流感病毒的流行趋势和当地流感疫情的防控。     

2013—2022年阿克苏地区儿童流感样病例监测结果分析

目的 分析新疆阿克苏地区儿童流行性感冒(简称流感)病原学特征,为当地流感防控提供科学依据。方法收集2013—2022年阿克苏地区流感监测哨点医院流感样病例(ILI)信息,采集咽试子标本,利用实时荧光RT-PCR法检测流感病毒,统计分析儿童流感样病例监测结果。结果 2013—2022年共检测儿童流感样病例标本4 582份,其中阳性464份、阳性率10.13%。不同年度甲乙流感病毒构成差异有统计学意义(χ²=559.066,P<0.05)、甲型流感不同亚型构成差异有统计学意义(χ²=424.779,P<0.05)、乙型流感不同系别构成差异有统计学意义(χ²=350.000,P<0.05);儿流行高峰从12月—次年3月,12月阳性率最高27.78%;6—9月阳性率最低0.00%。7～10岁儿童阳性率最高14.95%,1岁以下儿童阳性率最低3.73%;儿童流感阳性率无性别差异(χ²=3.718,P>0.05)。MDCK细胞分离培养出流感病毒93株。结论阿克苏地区出现儿童甲乙型流感病毒...     

2017—2018 年甘肃省外环境禽流感病毒监测分析

目的 了解 2017—2018 年甘肃省活禽市场外环境中禽流感病毒的分布情况,为禽流感疫情防控提供科学依据。 方法 采集全省 14 个市(州)的活禽批发市场、城乡农贸市场或菜市场、家禽规模养殖场(户)和家禽散养户等禽流感监测点的笼具表面擦拭物、粪便等环境样本,采用实时荧光 RT-PCR 法检测样本中甲型流感病毒核酸(FluA),阳性样本再检测 H5、H7 和 H9 亚型禽流感病毒核酸。 结果 共采集外环境样本 7 038 份,检出 FluA 核酸阳性 1 510 份,总阳性率为 21. 45%。 H5、H7 和 H9 亚型禽流感病毒核酸的阳性率依次为 0. 06%(4 / 7 038)、1. 19%(84 / 7 038)和 20. 52%(1 444 / 7 038)。 共检出 H5、H9 混合感染样本 2 份,H7、H9 混合感染样本 20 份。 不同类型样本中 FluA 核酸阳性率差异有统计学意义( χ2 = 50. 232,P<0. 01),宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭样本阳性率最高 (36. 04%),禽类饮水样本阳性率最低(13. 27%)。 FluA 阳性率在 2018 年 1 月最高( 36. 64%),2017 年 6 月最低(5. 60%)。 定西市 FluA 核酸阳性率最高(63. 32%)。 结论 2017—2018 年甘肃省涉禽外环境中存在禽流感病毒污染,主要为 H9 亚型,同时检出 H7 和 H5 亚型,混合型占一定比例,需持续加强主动监测,防止禽流感暴发流行。     

2010—2015年新疆流感监测分析

目的了解2010—2015年新疆流感活动特征,为制定流感防制策略提供依据。方法通过疾病监测信息报告管理系统、突发公共卫生事件报告管理信息系统和中国流感监测信息系统收集流感及流感样病例(ILI)监测资料,分析其流行病学、病原学以及流感暴发疫情监测结果。结果新疆ILI在冬春季有较明显的流行高峰,报告流感暴发疫情27起,主要发生在学校;检测47 256份ILI标本,核酸检测阳性率9.7%;流感毒株亚型为甲型H1N1流感、H3N2亚型和B型交替流行,哨点医院流感样病例就诊百分比(ILI%)与标本核酸检测阳性率高峰时间基本吻合,两者呈正相关(r=0.281,P<0.001),但部分地区核酸检测阳性率与ILI报告不一致。结论新疆流感流行具有明显的冬春季节流行性特征,部分地区ILI监测不能及时、有效地探测出社区流感病毒的活动情况,应进一步评估和改进ILI监测,提高其探测疾病的灵敏性和及时性。     

2009～2010年北京地区甲型流感监测分析

目的了解北京地区2009～2010年甲型流感的流行情况,为预防和控制北京地区甲型流感的流行提供依据。方法以解放军总医院作为哨点医院,用Real-ti me RT-PCR从流感样病例咽拭子中检测甲型流感病毒,监测甲型流感病毒在该地区的流行情况。结果 2 134份标本中甲型流感病毒阳性575份,阳性率为26.94%,其中甲型H1N1占46.26%,季节性H3N2型占40.70%,H1N1型占3.30%,未分型占9.74%。甲型流感病毒感染者年龄分布峰值在20～30岁之间,感染时间分布的2个峰值在第37周和47周,分别以H3N2型和甲型H1N1流感病毒为主。结论 2009～2010年北京地区流行的甲型流感病毒以甲型H1N1为主,其次是H3N2,甲型H1N1取代了季节性H3N2流感病毒在冬季的流行。应加强对甲型流感病毒的监测,密切关注甲型H1N1流感病毒的抗原变化有重要意义。     

2010～2011年马鞍山市流感疫情监测分析

目的了解马鞍山市流感流行动态,探索流行规律,为流感的防制提供科学依据。方法收集监测医院流感样病例(ILI)数据,采集部分ILI咽拭子标本,采用实时荧光定量RT-PCR技术检测流感病毒核酸。结果马鞍山市2010～2011年共报告ILI 13 151例,占门诊就诊人数的4.79%。采咽拭子3 185份,核酸检测阳性486份,阳性率15.26%,其中A型H1N1亚型47份、A型H3N2亚型119份、B型320份。结论 2010～2011年马鞍山市流感呈现冬春季及夏秋季两个发病高峰,流感病毒以B型为主;流感的监测应进一步加强。     

2015—2020年铜陵市流行性感冒监测结果分析

目的 了解铜陵市流行性感冒（简称流感）流行特征,为辖区流感防控提供科学依据。方法 通过中国流感监测信息系统收集2015—2020年铜陵市流感样病例（influenza-like illnesses,ILI）、病原学监测和ILI暴发疫情等监测数据,分析ILI的分布特征以及病毒阳性标本的人群、时间分布和分型等流行特征。结果 2015—2020年,铜陵市2家哨点医院报告ILI共计26 862例,其中5岁以下人群占比最高,为46.04%（12 367/26 862）;流感样病例百分比（ILI%）为3.11%（26 862/862 671）,各年度ILI%差异有统计学意义（χ2=941.478,P<0.05）;监测年度内共出现8次就诊高峰,主要发生在冬春季。共采集ILI标本8 490份,总阳性率为12.60%（1 082/8 490）,男性和女性阳性率分别为14.44%（586/4 059）和11.19%（496/4 431）;各年龄组中,5～14岁组阳性率较高,为22.41%（322/1 437）;各年度中,以2017—2018年度阳性率较高,为20.63%（255/1 236）;不同性别、年龄组、年度间阳性率差异均有统计学意义（χ2=20.038、249.020、941.478,P均<0.05）。不同监测年度中,甲型H1N1、A（H3N2）流感在每个监测年度均有流行,B型流感Victoria 系和 Yamagata 系则呈交替流行。共报告流感暴发疫情20起,均发生在中小学。结论 铜陵市流感流行季节主要为冬春季,5～14岁组儿童青少年为发病重点人群,需加强学生疫苗接种及重点场所流感监测。     

2017—2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及NA基因遗传特性分析

目的 分析2017—2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据。方法 采集2017—2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行荧光定量PCR的检测,以自然年度为监测周期进行统计分析。H3N2亚型核酸阳性的标本进行狗肾胚细胞(MDCK)分离病毒,收集培养液提取病毒RNA,进行RT-PCR特异性NA基因扩增,扩增产物纯化后进行测序,用MAGE7.0软件和Clustal W2软件进行同源性、遗传进化和耐药位点分析。结果 2017-2019年,贵州省采集ILI咽拭子标本分别为15 553、15 164和15 348份,H3N2亚型阳性率分别为5.12%(797/15 553)、0.80%(122/15 164)和7.67%(1 177/15 348),呈交替流行趋势;高峰期主要出现在1-3月和10-12月。2017-2019年H3N2亚型NA基因核苷酸同源性为97.5%~100%,在进化树上主要分成2个分支,所有毒株NA基因关键位点均未发生突变。结论 贵州省H3N2亚型流感病毒呈年度周期性流行,多发于冬春季节,为更好防控流感,应及时掌握流行趋势,需加强监测并及时分析病毒基因特征变异情况。     

上海地区2004年至2008年甲型流行性感冒病毒亚型的分布

目的 分析近5年上海地区甲型流行性感冒(流感)病毒亚型的分布并探究其原因.方法 对上海地区流感监测哨点流感样患者和聚集性流感暴发患者,采集咽拭子标本接种犬肾细胞(MDCK),直接荧光免疫法鉴定阳性分离株型别,多重RT-PCR鉴定亚型.结果 2004年至2005年初的季节性流感以A/H3N2为主;2005年末至2006年中期的季节性流感以A/H1N1为主;2006年末到2007年10月份分离到的流感毒株基本为A/H3N2亚型;2008年1月至5月份,人群流感病毒分离株仍以A/H3N2处于优势地位,但从2008年7月开始的季节性流感则以A/H1N1占绝对优势.结论 近5年上海地区季节性流感主要为甲型流感病毒H3N2和H1N1亚型,但在不同年份的季节性流感中流行强度有所不同.     

上海地区2009年人群甲型流行性感冒病毒抗体水平检测分析

目的 了解上海地区人群季节性H1、H3亚型流感病毒抗体水平及职业人群中H5、H9亚型禽流感抗体的检出情况.方法 应用血凝抑制试验对上海地区2009年与禽类密切接触的职业人群356人以及一般人群332人各年龄组进行H1、H3、H5、H9亚型流感病毒抗体的血清学监测.结果 A/Brisbane/59/2007(H1N1)抗体阳性分布,一般人群有275人,占82.8%,职业人群有263人,占73.9%;A/Brisbane/10/2007(H3N2)抗体阳性,一般人群有168人,占50.6%,职业人群有195人,占54.8%;人群中A/Brisbane/59/2007(H1N1)抗体阳性率明显高于H3,与2008年上海地区流感病原学监测情况相吻合.职业人群与一般人群H5亚型抗体阳性率分别为4.2%(15/356)和0.3%(1/332);H9亚型抗体阳性率分别为34.6%(123/356)和2.4%(8/332).不同年龄组中,6个月～5岁年龄组和≥60岁的老年组A/Brisbane/59/2007(H1N1)、A/Brisbane/10/2007(H3N2)抗体阳性率较低.结论 上海地区人群对H1、H3季节性流感有较强的免疫保护,儿童和老年人群H1、H3季节性流感抗体水平较低.职业人群禽流感病毒H5、H9抗体有明显升高趋势,要加强对职业人群流感样患者病原学和血清流行病学监测.     

Respiratory tract versus cloacal sampling of migratory ducks for influenza A viruses: are both ends relevant?

Please cite this paper as: Krauss et al. (2012) Respiratory tract versus cloacal sampling of migratory ducks for influenza A viruses: are both ends relevant? Influenza and Other Respiratory Viruses DOI: . Background  Early studies in dabbling ducks showed that cloacal swabs yielded a larger number of avian influenza virus (AIV) isolates than did respiratory tract swabs. Historically, AIV surveillance has been performed by collecting cloacal or environmental fecal samples only. Highly pathogenic avian influenza H5N1 virus emerged in 1996 and replicated to higher titers in the respiratory rather than the gastrointestinal tract of ducks, prompting the collection of respiratory samples in addition to cloacal swabs from wild birds. Studies confirmed that some virus subtypes, especially H9 and highly pathogenic H5, are shed primarily through the respiratory tract and may not be detected in cloacal swabs. Objectives  To examine prevalence and subtype differences for AIV isolates from cloacal or respiratory swabs of wild ducks and to determine whether individual respiratory tract samples should be included in AIV surveillance studies in wild birds. Methods  Individual respiratory tract and cloacal swabs were collected from each of 1036 wild ducks in Alberta, Canada, during the month of August from 2007 to 2010 in an ongoing surveillance study. Virus isolation in eggs and subtype identification by antigenic and molecular methods were performed. Results and conclusions  Respiratory tract and cloacal swabs yielded ten influenza virus HA subtypes representing 28 HA–NA combinations. Three HA–NA subtype combinations were found exclusively in respiratory tract samples. Only four HA subtypes (H1, H3, H4, and H7) were recovered from respiratory samples, but respiratory shedding was associated with the dominance of 1 year’s subtype. Might respiratory shedding provide a risk assessment indicator?