基因芯片技术在法医学中的应用进展

基因芯片,又称DNA芯片或DNA微阵列,是生物芯片的一种,是将大量可寻址的基因序列信息,即DNA序列有序地固定在固体介质上而成.……     

基因芯片在肝癌诊断与治疗中的应用

基因芯片包括DNA芯片(又称DNA微阵列)与cDNA芯片(又称cDNA微阵列)，是目前应用最广泛的生物芯片，它以DNA杂交技术为基础，采用微加工和微电子技术，在玻璃、硅、塑料等固相表面上固定成千上万个分子识别探针，能在同一时间平行检测大规模的基因分子信息，主要用于肿瘤的DNA测序、基因表达、突变、诊断、药物筛选和遗传图谱等研究。肝     

基因芯片技术在恶性血液系统疾病研究中的应用

基因芯片是用微阵列技术将大量DNA片段通过机器人或原位合成方式以一定的顺序或排列方式使其附着在如玻璃、硅等固相表面制成的高密度DNA微点阵，用荧光物质标记的探针，借助碱基互补原理与基因芯片杂交，可进行大量的基因表达及监测等方面的研究。基因苡片技术在基因诊断，基因表达，基因突变，发现新基因及各种病原体的诊断等生物医学领域中具有重大的应用价值。本文简要综述基因芯片的分类，制作原理及基因芯片技术在恶性血液系统疾病研究中的应用。     

基因芯片技术在肝炎病毒研究中的应用

0 引言基因芯片(gene chip)也称为DNA微距阵(DNA microarray)、DNA芯片(DNA chip)等,是近年发展起来的一项前沿生物技术。他是指将大量靶基因或寡核苷酸片段有序地高密度地排列固定于玻片、硅片等固相载体上,然后与待测的标记样品的基因按碱基互补配对原理进行杂交,通过激光共聚焦荧光检测系统等对芯片进行扫描,再经计算机软件处理,从而获取大量生命信息。该技术可以将极其大量的探针同时固定于支持物上,所以一次可以对大量的生物分子进行检测分析,从而解决了传统核酸     

动脉粥样硬化基因表达谱研究概况

基因芯片又称DNA芯片或微阵列,为近些年发展起来的一项前沿技术—生物芯片中的一种(广义的生物芯片还包括蛋白芯片、组织芯片等)。基因表达芯片是用于基因表达谱研究的一种应用型基因芯片。本文主要综述了基因表达芯片在炎症、氧化低密度脂蛋白、感染、同型半胱氨酸、血流动力学、吸烟等与动脉粥样硬化关系上的研究概况。     

基因芯片技术的原理及其在肝病研究中的应用

基因芯片（gene chip）,即DNA芯片（DNA chip）代表的微阵列（microar-ray）技术,是集成了成千上万的网络状密集排列的基因探针,能够在同一时间内杂交分析大量的基因,迅速读取生命相关的基因信息的一种高通量分析技术。这种技术在基因诊断、基因表达、基因组研究、发现新基因及各种病原体的研究中具有广泛的应用前景。在肝脏疾病的研究中也具有十分重要的意义。     

核酸微阵列技术及其在寄生虫学研究中的应用前景

核酸微阵列技术是近年来DNA芯片(DNA chip)技术的一个重要进展。该技术是将多个基因的cDNA或mRNA片段点阵于尼龙膜等固相表而而组成一个高密度的二维阵列所得。本文综述了其基本原理、方法、特点及其在寄生虫学研究中的应用前景。     

序

人类基因组序列图绘制成功表明“人类生命密码书中所有章节的秘密已被解读”,基因组序列图首次在分子层面上为人类提供了一份生命“解剖图”,这不仅奠定了人类认识自我的基石,推动了生命和医学科学的革命性进展,而且为全人类的健康带来了福音。人类基因组计划(HGP)的研究耗资30亿美元,当今人类基因组单体型图计划(HapMap)、单核苷酸多态性(single nucleotide poly-morphism,SNP)及人类蛋白组计划(HPP)的研究在不断深入,不断会有大量新的基因和蛋白被发现,我们如果不能广泛、及时、充分地运用这些大量遗传信息的话,那就愚不可及了。基因芯片(gene chip)即DNA芯片或DNA微阵列(DNA Microarray),是随着HGP的进展应运而生,现已广泛地应用于生命科学、生物医药研究等各个领域,生命科学的研究因此进入了信息化研究时代。随着基因组、功能基因组和基因、蛋白芯片研究的深入进展,目前已发现许多重要的基因及其蛋白,人们迫切需要了解这些基因、蛋白在人体组织中表达的变化和功能。传统的疾病组织病理学和分子病理学研究难以满足信息化时代生命科学和生物医药的研究需要,由此组织芯片技术这种高通量的...     

生物芯片在原发性肝癌研究中的应用进展

随着人类基因组计划(HGP),即全部核苷酸测序的完成,人类基因组研究的重心逐渐转向功能基因组。由此,一个大规模基因分析工具——基因芯片应运而生。基因芯片又称DNA微阵列(DNA mi-croarray),是近年发展起来的一项DNA分析技术,一般包括寡核苷酸芯片和cDNA芯片两种。其基本原理是将成千上万个代表不同基因的寡核苷酸或cDNA“探针”密集而有规律地排列在固相支持物表面,通过与标记目的材料中的DNA或cDNA杂交,再对获得的信号应用扫描仪和相关软件进行分析。该技术具有高通量、高效率和样本量少等特点。正常基因的突变、癌基因的异常激活以及抑癌基因的失活、基因本身的多效性和机体免疫因素决定了肿瘤表型的表达与否[1]。通过对肿瘤基因表达谱的深入研究,有助于很好地定性肿瘤,揭示相似组织病理类型和不同临床特征的的亚临床分类,而且可以帮助确定不同肿瘤的治疗敏感性和判断预后,对肿瘤基因表达谱的分析寻找新的治疗靶点,为分子肿瘤学书写了新的篇章[2]。肝细胞肝癌(HCC)是临床常见的恶性肿瘤之一。对大多数中晚期HCC患者,治疗方案的选择很局限,预后凶险。迫切需要对其病因、肿瘤转移的分子机制、治疗敏感性和预后判断等进行更深入...     

生物芯片技术及其应用——生物芯片技术在病原微生物检测中的应用

生物芯片技术又称微阵列技术。根据芯片上的探针不同，可分为蛋白质芯片和基因芯片。目前生物芯片技术在病原微生物的诊断及抗药性基因、毒力基因、致病因子的检测等方面已取得了突破性进展，显示出诱人的应用前景。     

基因芯片技术在非霍奇金淋巴瘤研究中的应用

基因芯片技术是指通过微阵列技术采用原位合成或合成点样等方式将高密度DNA片段有序固定于固相支持物上，以荧光标记的DNA探针，借助碱基互补杂交原理，进行大量的基因表达及检测等方面研究的最新革命性技术。淋巴瘤起源于淋巴结和淋巴组织，其发生大多与免疫应答过程中淋巴细胞增殖分化产生的某种免疫细胞恶化有关，是最早发现的血液系统恶性肿瘤之一。根据组织病理学改变，可分为霍奇金淋巴瘤（HL）和非霍奇金淋巴瘤（NHL），后者占淋巴瘤的绝大多数，     

问号钩端螺旋体检测基因芯片的研制

目的　制备一种用于快速检测、鉴定问号钩端螺旋体的DNA微阵列芯片。方法　从Genbank中选取钩体 2 3SrDNA序列 ,设计一对种特异性引物和DNA探针 ,通过Blast的基因同源性比较 ,验证引物和探针的通用性与特异性。将合成的探针点样到玻片上制备成基因芯片。用Cy3标记引物 ,通过不对称PCR反应获取荧光素标记的靶序列 ,然后与制备的芯片杂交。结果　设计的引物与探针仅同时与问号钩体 2 3srDNA完全同源。该引物可扩增我国 18个血清群的 2 5株钩体 ,均出现单一 4 82bp的扩增产物 ,而双曲钩体及其他螺旋体、病原、空白对照均无任何DNA扩增条带。芯片杂交结果与常规PCR方法结果一致 ,敏感性高于PCR。结论　基因芯片可以快速、灵敏、特异地检测问号钩端螺旋体。     

生物芯片在结直肠癌研究中的应用进展

基因芯片(genechip)技术突破了传统肿瘤研究方法,如Northern杂交、逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和原位杂交只能分析一种病变与一种基因关系的瓶颈,极大地提高了研究速度。由于基因芯片技术具有高通量、大规模、高敏感性、高度自动化和并行性的特点,使其在生物医学研究中具有广阔的应用前景,包括肿瘤相关基因的检测、肿瘤的基因型分类、基因突变和多态性分析、DNA测序、基因诊断和新药开发等方面。广义的生物芯片除基因芯片外,还包括病理组织学研究的组织芯片(tissue microarray)、用于蛋白质组功能研究的蛋白质芯片(protein microarray)以及正在研制开发的微流体芯片(microfluidicschip)、微珠芯片(bead array)和芯片实验室(lab-on-chip)等。它们与基因芯片相互补充,有效地实现了由DNA到mRNA再到蛋白质的生物信息链的高速并行性研究。基础研究最大的挑战是将科学发现转化成对患者治疗的改进。对结直肠癌而言,目前对疾病的认识与治疗的改善是不平衡的,一些新的方法正处于临床完成阶段。研究手段的提高,如实时PCR和生物芯片技术与结直肠癌分子机制研究的结合使得发展...     

基因芯片技术在心血管疾病研究中的应用

<正>基因芯片(Gene chip)也被称之为DNA阵列(DNA array)。基因芯片技术被誉为继大规模集成电路后又一次意义深远的科技革命[1]。目前,国内外多家提供基因芯片的知名公司不断开发提供了多种先进的基因芯片,如寡核苷酸芯片(Oligo芯片),mRNA表达谱芯片、miRNA芯片、DMET芯片、Cytogenetics芯片等,涉及基因表达、miRNA、药物代谢和染色体遗传分析等多个研究领域,促进了转化医学的发展。目前,越来越多的实验室开始将这项技术应用到心血管研究领域,并取得了不小的进展。本文主要对基因芯片技术在心血管系统研究应用进行综述。     

组织芯片技术及其在肺癌研究中的应用进展

随着人类基因组计划(human genome project,HGP)的完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(postgenome Era),即向基因的功能及基因多样性倾斜。基因芯片(gene microarray)、蛋白质芯片(protein microarray)的广泛应用,发现了大量新的功能基因和蛋白质,但对其功能的进一步确定,须回到组织学的水平,与形态学结构联系起来,需要经过组织形态的研究予以确认和支持[1],在这样的背景下一种新的生物芯片———组织芯片(tissuemicroarray,TMA)应运而生。TMA又称组织微阵列,是将数十个、数百个乃至上千个小的组织标本按研究需要整齐地排列…     

核酸微阵列技术及其在寄生虫学研究中的应用前景

核酸微阵列技术是近年来DNA芯片（DNAchip）技术的一个重要进展。该技术是将多个基因的cDNA或mRNA片段点阵于尼龙膜等固相表面而组成一个高密度的二维阵列所得,本综述了其基本原理、方法、特点及其在寄生虫学研究中的应用前景。     

乙型肝炎病毒表面抗原基因启动子Ⅰ结合蛋白1反式调节基因的筛选

目的应用表达谱基因芯片技术，研究乙型肝炎病毒(HBV)表面抗原基因启动子DNA结合蛋白1(SBP1)反式调节基因，阐明SBP1蛋白可能的分子生物学功能。方法设计并合成SBP1基因序列特异性的引物，应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增SBP1基因片段，以常规的分子生物学技术将获得的SBP1编码基因片段克隆到TA载体中进行核苷酸序列测定，构建真核表达载体pcDNA3．1(-)-SBP1。以脂质体转染肝母细胞瘤细胞系HepG2，提取mRNA，逆转录为cDNA，与转染空表达载体pcDNA3．1(-)的HepG2细胞进行cDNA芯片分析。结果构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定，证实准确无误。提取高质量的mRNA，逆转录为cDNA，进行cDNA芯片分析。在1152个基因容量的表达谱芯片的筛选中，发现有12个基因表达水平显著上调，6个基因表达水平显著下调。结论应用基因表达谱芯片成功筛选了SBP1转染细胞后差异表达基因，为进一步阐明SBP1蛋白可能的生物学功能提供依据。     

口腔常见厌氧性细菌感染检测基因芯片的研制

目的研制一种用于检测口腔常见无芽胞厌氧性细菌感染的基因芯片。方法选择口腔感染中常见的无芽胞厌氧性细菌作为菌种,将16S rDNA作为靶基因。借助生物信息学方法,设计通用引物和特异性探针,选择与反义引物互补的核酸序列作为阳性质控探针;大肠杆菌16S rDNA基因序列为阴性质控探针,制备微阵列。进行厌氧性细菌DNA的提取、扩增、杂交、结果分析以及微阵列质量检测。结果制备的用于检测口腔常见无芽胞厌氧菌感染的基因芯片特异性、灵敏度、重现性和稳定性均符合实验要求。结论利用生物信息学方法设计的引物和探针合理,制备的芯片可用于口腔常见无芽胞厌氧性细菌感染的诊断。     

基因微阵列技术与结直肠癌的研究

结直肠癌是我国常见恶性肿瘤．其发病率逐年增高，死亡率在消化道肿瘤中上升也最快。结直肠癌的发生、发展是一个多步骤、多阶段、多基因参与的过程，伴随着复杂的基因改变。基因微阵列（microarray）技术也称基因芯片（genechip），系在玻璃、硅等载体上有序、高密度地排列固定大量靶基因片段（分子探针），样品核苷酸经标记后，与周定在载体上的分子探针杂交，所得信息以计算机进行集约化和平行处理。与传统基因研究方法．如RNA印迹法和逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）相比，基因微阵列技术具有高信息量、高通量等突出优点．     

基因芯片技术在肝病诊疗中的应用

基因芯片技术是20世纪90年代末兴起的一项前沿生物技术。它是指将大量靶基因或寡核苷酸片段有序地高密度地排列固定于玻片、硅片等固相载体上,然后与待测的标记样品的基因按碱基配对原理进行杂交,通过激光共聚焦荧光检测系统等对芯片进行扫描,再经计算机软件处理,从而获取大量生命信息。自从1995年美国斯坦福大学的Schena和Brown