石家庄地区已知HLA型别单采血小板捐献者基因资料库库容评价

目的 分析石家庄地区单采血小板捐献者HLA-I类基因(A、B位点)分布特点,探讨在该地区血小板捐献者基因资料库中找到HLA-I类基因(A、B位点)相合供者的概率并进行血小板捐献者基因资料库最小规模评价。方法 对石家庄地区1 935位无血缘关系的血小板捐献者HLA-I 类基因A、B位点基因分型采用聚合酶链反应-序列特异引物(PCR-SSP)和聚合酶链反应-直接测序分型(PCR-SBT)方法,得到基因型后转化为对应的抗原特异性,计算基因频率和单体型频率,进行血小板捐献者基因资料库最小规模评价,并统计交叉反应组(CREG)表型频率及不配合率。结果 1 935位无血缘关系的血小板捐献者中共检出HLA-A位点抗原特异性19种,其中频率最高的抗原为A2(0.313 4)和A11(0.158 4);检出HLA-B 位点抗原特异性43种,其中频率最高的为B13(0.118 1)和B61(0.086 3);观察到HLA-A-B单体型355种,频率大于0.01的共28种,其中频率最高的为A2-B13(0.044 4)和A2-B62(0.029 5);石家庄地区单采血小板捐献者A-A、A-B抗原CREG表位不配合的概率最高分别为1C-2C和7C-5C,Broad CREG不配合概率最高的为4C-6C。结论 理论上石家庄地区建立一个总库容1 500人的血小板捐献者基因资料库有93.18%的患者有95%的可能性找到至少1例HLA相合的供者,本研究1 935人的基因资料库基本可以满足本地区血小板输注无效患者寻找HLA相合供者的需求。     

中山地区血小板供者HLA基因分型资料库的建立

目的 建立血小板供者HLA基因分型资料库,探讨HLA-A、B基因频率及单体型频率,为临床患者提供HLA匹配的血小板,解决血小板输注无效(PTR)患者的血小板输注.方法 采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针杂交技术 (PCR-SSOP)对568名中山地区单采血小板捐献者进行HLA-I类(A、B位点)基因分型并形成数据库,根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(EM)计算HLA-A、B单体型频率.结果 HLA-A位点共检出17种等位基因,HLA-B位点共检出29种等位基因,单体型数153种.结论 血小板供者HLA分型资料库的建立可以为PTR患者迅速寻找到HLA相合血小板,提高血小板输注效果.     

血小板捐献者HLA资料库的建立

目的建立血小板捐献者HLA基因分型资料库,探讨HLA-A、B基因频率及单体型频率,为临床患者提供HLA匹配的血小板。方法应用聚合酶链反应-序列特异性引物方法和Luminex-SSO方法对730名沈阳地区血小板捐献者进行中低分辨率HLA-A、B基因分型,根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(Expectation-Maximization,EM)计算HLA-A、B座位单体型频率。结果 HLA-A位点共检出15种等位基因,HLA-B位点共检出36种等位基因,单体型数222种。结论为向临床提供HLA匹配的血小板,各地区有必要建立血小板捐献者HLA基因分型资料库。     

陕西地区血小板供者基因数据库拓展性应用的研究

目的 通过分析本地区无偿献血与造血干细胞捐献群体之间的共性和特性,挖掘包括血小板基因供者库在内的无偿献血者与造血干细胞捐献者资料库间的融合潜力,提高招募成功率和已知结果库存率。方法 应用数据库建模和比对方法对本市近10年无偿献血者与中华骨髓库陕西分库造血干细胞捐献者之间的匹配度和融合度进行筛选分层,采用Arlequin 3.5.2.2软件计算HLA、HPA基因频率及单体型频率,并根据表型频率计算不同血小板供者后备库中找到HLA、HPA全匹配供者概率。结果 在本地区已入库造血干细胞志愿捐献者中,依据其献血行为挖掘出的活跃献血者分别划分为血小板供者库后备一、二、三、四梯队,分别为696名、2 752名、9 092名和12 028名捐献者。第一梯队具有10～50次血小板捐献经历和10～20次全血捐献经历的占比最高,分别为13.65%和26.01%;第二梯队具有10～20次全血捐献经历和10～50次血小板捐献经历者占比分别为15.04%和1.38%,与其他梯队献血特征有差异(P<0.05)。在现有血小板库+一二梯队的核心库容中(n=4 955),患者找到至少1名HLA-A,B表型相同的供...     

长沙地区血小板供者基因数据库理论建模分析*

摘要:目的分析长 沙地区血小板供者基因数据库建设情况,评估为临床提供HLA/HPA匹配的单采血小板的可能性。方法分析长沙地区血小板供者基因数据库1 029例无亲缘关系单采血小板供者HPA、HLA-A/B等位基因及抗原分布情况，评估长沙地区血小板供者基因数据库建设规模。结果在不考虑ABO血型的情况下,当库容为207人时,约有95%的患者能在该库中找到至少1名HPA基因型全匹配的供者;当库容为2127人时,约有95%的患者能在该库中找到至少1名HLA-A/-B表型匹配的供者;当库容为1 029人时,约有79.25%的患者能在该库中找到至少1名HLA-AB表型匹配的供者。单采血小板捐献者A.B抗原CREG表位不配合的概率最高分别为1C-2C和7C-5C, Broad CREG不配合概率最高的为4C-6C。结论长沙地区已建立已知HLA/HPA基因型的血小板供者基因数据库库容1029人，在扩大有效库容的同时将进一步验证理论建模的适用性和匹配概率的符合性。     

青岛地区已知HLA和HPA分型血小板供者库的建立及临床应用

目的建立青岛市已知HLA和HPA分型的无偿机采血小板供者库并用于解决血小板输注无效(PRT)患者的血小板输注。方法采用PCR-SSO流式磁珠法和PCR-SSP法分别对青岛地区无偿机采血小板捐献者1 800人进行HLA-Ⅰ类(A,B位点)、HPA-1—-5,-15基因分型,针对不同免疫状态的PTR患者比较3种不同配型法(血小板随机交叉配型法、抗原特异性配合法、抗原阴性选择法)解决血小板输注无效的效果。结果在高致敏(群体反应性抗体PRA>60%)患者中,HLA和或HPA特异性配型效果较好;轻度致敏(PRA<60%)患者随机交叉,抗原阴性选择,抗原特异性配型方案效果相似。不考虑ABO血型的因素1 800名的血小板供者库可以使99%的患者在库中找到至少1例HLA完全相合的供者,理论估算的供者库规模被不同表型的患者库中检索结果证实。结论理论上青岛本地化已知分型血小板供者库规模需达到6 000人左右可以有效解决血小板输注无效患者的血小板输注问题。只有重度致敏的患者需要HLA完全相同的供者,而轻度致敏的患者可以选择随机交叉配合或抗原阴性选择方案。     

应用不同类型白血病患者群体HLA-A、B和DRB1遗传学数据评估HLA相合供者的概率

目的探讨不同类型白血病汉族患者群体找到HLA-A、B和DRB1低分辨全相合无关供者可能性。方法依据1201名急性淋巴细胞白血病(ALL)、1065名急性非淋巴细胞白血病(AML)和1432名慢性粒细胞白血病(CML)汉族患者群体HLA-A、B和DRB1低分辨分型结果,计算这3类白血病汉族患者群体的HLA-A、B和DRB1抗原频率,单体型频率和表型频率,联合应用中华骨髓库(CMDP)中健康汉族供者HLA表型频率数据,进一步推导出这3类白血病汉族患者群体找到至少1名HLA低分辨全相合供者概率及回归方程。结果ALL、AML、CML汉族患者群体表型种类数分别为416851、373903和464373种,其中31%的表型频率均>1/100万;ALL、AML、CML汉族患者群体在CMDP的汉族供者群体中找到至少1名HLA表型相同供者回归方程分别为:P=0.0824LgN-0.3667、P=0.0825LgN-0.3636和P=0.0829LgN-0.3644;计算出81.6%的ALL、81.9%的AML、82.4%的CML汉族患者要找到1名HLA低分辨表型相同的无关供者,CMDP中汉族有效供者群体数平均146.7万。结论应用不同类型白血病患者群体HLA-A、B和DRB1遗传学数据评估患者找到HLA相合供者概率较仅以健康供者群体HLA遗传学数据评估更为精确。为有效地提高患者的移植效果,需要征募更多的无关供者。     

江苏骨髓分库汉族造血干细胞捐献志愿者HLA-A、B、DRB1基因多态性和单倍型研究

目的分析中国造血干细胞捐献者资料库(简称江苏分库)汉族人群中HLA-A,B,DRB1基因多态性和单倍型的分布特征。方法用PCR-SSP和PCR-SSOP基因分型技术对江苏分库20 248名无关志愿者作HLA-A、B、DRB1低分辨基因分型,以直接计数法计算等位基因频率,应用Arlequin 3.01软件以最大似然法分析单倍型频率。结果江苏分库汉族志愿者HLA抗原频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;共检出HLA-A位点等位基因18个,B位点等位基因34个,DRB1位点等位基因13个;A位点频率最高的是A*02(29.6%),B位点频率最高的是B*15(14.4%),DRB1位点频率最高的是DRB1*09(16.2%);频率最高的HLA-A,-B,-DRB1单倍型是A*30-B*13-DRB1*07(6.92%),频率最高的HLA-A、B单倍型是A*30-B*13(8.04%),频率最高的HLA-B,DRB1单倍型是B*13-DRB1*07(8.07%),频率最高的HLA-A、DRB1单倍型是A*02-DRB1*09(7.70%)。结论对江苏分库汉族人群HLA的分布状况的了解,有助于指导临床寻找HLA匹配的无关骨髓供者,为HLA与疾病相关研究和我国人群群体遗传学研究等提供了有意义的基础性资料。     

辽南地区造血干细胞捐献者HLA基因分布和单倍型分析

目的了解辽南汉族造血干细胞捐献者的HLA基因多态性和单倍型的分布特点。方法应用PCR-SSP和PCR-SSO2种方法对辽南地区的9678份样本进行HLA-A、B、DRB1位点的基因分型,并对分型结果作统计学分析。结果辽南地区造血干细胞捐献者HLA基因分型,共检出A位点表型特异性18种,检出率为85.71%;B位点共检出表型特异性41种,检出率为93.18%;DR位点共检出表型特异性13种,检出率为92.86%。基因分布符合Hardy-Weinbery规律(P>0.05)。在HLA单倍型分布中,A30B13、A2B46、A33B58、A30DR7、A33DR13、A2DR10、B13DR7、B46DR9、B52DR15等均具有较高的连锁频率。结论本组数据了解辽南地区,汉族人造血干细胞捐献者的HLA基因分布特点,有利于估计相合供者的概率。     

肇庆地区血小板供者库的建立及应用

目的 建立肇庆地区已知人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因分型及人类血小板抗原(human platelet alloantigen,HPA)HPA-1~6、9、15基因型的无偿机采血小板供者库,为临床血小板输注无效(platelet transfusion refractory,PTR)患者提供HLA及HPA相合的血小板.方法 采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific olignuliotide probe,PCR-SSO)检测血小板供者的HLA基因分型及聚合酶链反应-序列特异性引物(polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)检测HPA-1~6、9、15基因型.对杂合度高的HPA-3、15随机抽样20个标本进行测序.对3例患者进行HLA-I分型.结果 成功检测出101名无偿血小板捐献者HLA及HPA-1~6、9、15基因型;HPA-3、15的测序结果与PCR-SSP一致.HLA-A位点等位基因共检出11个;HLA-B位点共检出等位基因20个.3例患者中的1例从已知的HLA血小板库中找到完全一致供者,另外2例也找到三位点吻合的血小板供者.结论 建立基于HLA-I类抗原及HPA基因分型的血小板供者资料库,有助于给PTR患者提供HLA和HPA相合的单采血小板.     

中华(江苏)骨髓库人群HLA-Ⅰ类抗原的PCR-SSP分型

目的分析中华(江苏)骨髓库HLAⅠ类抗原的分布特点。方法采用序列特异性引物(PCR SSP)基因分型技术,对中华(江苏)骨髓库初期的骨髓捐献志愿者的HLA A、B位点上的等位基因作低分辨基因分型,计算HLA A、B的基因频率、由基因分型结果指定的抗原特异性频率(以下简称抗原频率)、HLA A、B位点单倍型频率和连锁不平衡参数,获取中华(江苏)骨髓库HLAⅠ类抗原多态性分布的初步资料。结果中华(江苏)骨髓库志愿者中,A位点抗原频率较高的是A2、A11和A24,分别为0.5087,0.3505和0.3056;而A74的频率最低(0.0009);B位点抗原频率较高的是B13、B46和B60,分别为0.2372,0.1772和0.1603,频率较低的是B78(0.0002)。连锁不平衡参数>0的单倍型有80余种,最常见的单倍型有A33B58、A2B62、A2B13、A33B44、A30B13等。结论了解中华(江苏)骨髓库志愿者HLA遗传学分布特点,为器官或干细胞移植配型和疾病相关性分析提供了有价值的基础性资料。     

寻找HLA匹配无关供者概率曲线的计算及其应用

目的　建立在骨髓库中寻找到HLA匹配供者概率曲线P的回归方程式 ,并用于评估骨髓库的最适大小。方法　在哈迪 -温伯格群体中的HLA单体型频率可以从供者表型资料求得。寻找到一个HLA匹配供者的概率可以表示成供者数和HLA单体型频率的函数。使用对数曲线拟合方法推导出该概率曲线的回归方程。结果　笔者推导出在中国人骨髓库中寻找到至少一例HLA -A ,B ,DR抗原全配合供者概率的回归方程式为P =- 0 .6 7+0 .2 5lgN(N为骨髓库中的供者数 ,介于 5万到 1 0 0万 )。在骨髓库供者数达到 75万人时 ,大约 80 %的患者可以找到HLA配合供者。结论　找到HLA配合供者概率取决于骨髓库供者人数的多寡以及HLA单体型频率。HLA群体遗传学资料有助于决定骨髓库的最适大小及其供者成员的组成。     

3238名江苏汉族造血干细胞捐献者HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型结果的研究

目的 分析中国江苏地区汉族人群造血干细胞捐献志愿者的HLA-A、B、DRB1位点在高分辨基因分型水平上的基因多态性弹倍型分布特征以及常见与罕见等位基因的分布.方法 大量应用基因序列分型技术和少量应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术对中华造血干细胞捐献志愿者资料库江苏分库3238名无关供者的HLA-A、B、DRB1位点等位基因作高分辨分型.结果 HLA-A基因46个,HLA-B基因85个,HLA-DRB1基因51个.HLA-A位点频率最高的是A*11∶01(16.52％),HLA-B位点为B*13∶ 02(11.60％),HLA-DRB1位点为DRBl* 07∶01( 15.78％).单倍型频率最高是A* 30∶ 01-B* 13∶02-DRBl* 07∶01 (8.87％).HLA-A位点常见等位基因(CWD)种类有40种,在样本中的含量达到99.8％,HLA-B位点CWD则有77种(99.5％),HLA-DRB1位点的CWD有47种(99.8％),并发现少量在中国人群未报道的罕见基因.结论 本资料从高分辨水平反映了江苏地区汉族人群HLA的分布状况.对指导临床寻找HLA匹配的无关造血干细胞供者,HLA与疾病相关研究和我国人群群体遗传学研究等有重要意义.     

HPA和HLA已知型的血小板供者库建立及应用

目的 开展血小板同型或配合性输注是预防和治疗免疫性血小板输注无效(PTR)的良策.为此建立一定规模的HPA和HLA已知型血小板资料库,为临床提供匹配的单采血小板,是血小板输注安全有效的保障.方法 对所有供者库单采血小板进行ABO、HLA-A、B及HPA1-6,15基因分型.根据ABO、HPA同型和HLA同型或HLA交叉反应组相同(CREG)配型策略,编制数据库软件,建立上海市单采血小板供者资料库.结果 上海市血小板供者库至今已接受80人/次患者查询,共有78名患者找到合适的供者.HPA和HLA的CREG相同配合率为97.5％.其中50名患者接受了单采血小板的同型(或配合型)输注,47名输注有效(24 h血小板回收率＞20％).其中更有15名患者同型输注疗效明显,24 h回收率＞80％.结论 建立血小板供者HPA和HLA Ⅰ类抗原基因分型资料库,为患者提供HLA和HPA、ABO匹配的单采血小板,可以降低PTR的发生率,是解决免疫性PTR的根本手段.     

黑龙江地区汉族HLA-A、B、DRB1基因及单倍型的研究与应用

目的研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库汉族捐献者HLA-A、B、DRB1等位基因和单体型频率分布特征,探讨中国广大地区乃至世界其他人种利用黑龙江汉族捐献者进行造血干细胞移植的可能性。方法采用序列特异性引物(PCR-SSP)和序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)基因分型技术,对黑龙江地区汉族捐献干细胞的9 019名供者进行HLA-A、B、DRB1基因低分辨检测。结果共观察到77个HLA等位基因,其中频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A2、A11、A24、B13、DR15、DR9、DR7、DR12、DR4。432条A-B单体型中,25条单体型的频率高于0.01,101条单体型呈现显著的正连锁不平衡,21条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40);437条B-DRB1单体型中,22条单体型的频率高于0.01,115条单体型呈现显著的正连锁不平衡,16条表现为强连锁不平衡;2 002条A-B-DRB1单体型中,971条单体型有意义(频率≥1.66×10-4),18条单体型频率高于0.005。截止2007年3月通过中国造血干细胞捐献者资料库管理中心检索,成功移植20例。结论黑龙江汉族人群HLA-A,B,DRB1等位基因和单体型的分布特征接近北方汉族人群,与中国汉族人总体分布特征相似。未发现群体特有的基因和单体型,但具有其自身分布特征。不同地区、不同人群有可能在中国造血干细胞库黑龙江地区汉族捐献者中寻找到HLA相合的供者。其中中国人群最容易找到HLA相合供者,其次是日本人和韩国人。     

中华骨髓库云南分库HLA基因多态性分析

目的了解中国造血干细胞捐献者资料库云南省分库HLA-A、B、DRB1基因多态性,及等位基因频率特征。方法采用流式PCR-SSOP方法对来自中国造血干细胞捐献者资料库云南分库的1000名无血缘关系的捐献者进行基因分型,运用直接计数法计算HLA-A、B、DRB1基因频率,并与其他人群进行比较。结果在云南地区人群中共检出了68种HLA基因特异型。其中HLA-A位点18个,HLA-B位点37个,HLA-DR位点13个。A*02(37.31%)、A*11(34.96%)和A*24(21.13%)3个等位基因为云南分库捐献者HLA-A座位的主要等位基因;B*46(13.1%)、B*15/62(11.8%)和B*40/60(9.7%)3个等位基因为云南分库捐献者HLA-B座位的主要等位基因;HLA-DRB1座位以DRB1*12(20.06%)、DRB1*04(14.44%)、DRB1*09(13.51%)和DRB1*15(13.11%)4个等位基因频率为高。结论云南造血干细胞捐献者资料库人群的HLA基因多态性与南方汉族接近,也有其自身的一些特点。     

南京地区血小板固定捐献者HLA和HPA基因资料库的建立及库容评估分析

目的 探讨南京地区血小板固定捐献者HLA-A、-B和HPA-1～6w、10w、15、21w基因多态性分布特点并进行血小板固定捐献者基因资料库库容评估分析。方法 采用荧光定量PCR法对南京地区1059例血小板固定捐献者血液样本进行HLA-A、-B位点和HPA-1～6w、10w、15、21w基因分型,计算等位基因频率、HLA单体型频率、HPA组合型频率,并以此为数据基础,评估库容水平。结果 1059例血小板固定捐献者中共检出HLA-A位点等位基因15个,频率较高的有A^*02、A^*11、A^*24、A^*33、A^*30;检出HLA-B位点等位基因29个,频率较高的有B^*15、B^*40、B^*13、B^*46、B^*51、B^*58;观察到HLA-A-B单体型共269种,频率>0.01的有22种,其中频率最高的为A^*02-B^*     

HLA-A,B,DRB1单体型频率计算及其在骨髓库中的应用

目的从群体资料计算HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,并用于骨髓库寻找HLA匹配供者。方法根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(ExpectationMaximization,EM)计算HLA三座位单体型频率。通过实例运算介绍HLA表型频率以及发现HLA匹配无关供者的概率。结果①使用DNA基因分型技术鉴定12193例无关汉族健康个体HLA表型,计算求得HLAA,B,DRB1单体型频率。②预期概率与观察结果吻合,并用于评估骨髓库的最适大小。结论使用EM算法估计大样本汉族群体HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,结果可靠,可用于评估骨髓库的最适大小和组份。     

云南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因遗传多态性的分析

目的了解中国造血干细胞捐献者资料库云南省分库HLA-A、B、DRB1基因多态性,分析云南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因频率特征。方法采用流式序列特异性寡核苷酸探针(PCR-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)结合直接测序法(PCR-sequence based typing,PCR-SBT)方法,对来自中国造血干细胞捐献者资料库云南分库的1 000名无血缘关系的捐献者进行基因分型,运用方根法计算HLA-A、B、DRB1基因频率,并与其他人群进行比较。结果在云南地区人群中共检出68种HLA基因特异型。其中HLA-A位点18个,HLA-B位点37个,HLA-DR位点13个。A*11(34.66%)、A*02(34.2%)和A*24(19.63%)3个等位基因为云南分库捐献者HLA-A座位的主要等位基因;B*46(12.83%)、B*40(60)(10.9%)和B*15(62)(9.78%)为HLA-B座位的主要等位基因;HLA-DRB1座位以DRB1*12(16.7%)、DRB1*15(16.46%)、DRB1*09(13.46%)和DRB1*04(12.77%)4个等位基因频率为高。最常见的A-B-DRB1单倍型是A*02-B*46-DRB1*09,频率是3.76%。结论云南地区人群的HLA基因多态性与南方汉族接近,但有其自身的一些特点。有必要在本地区开展造血干细胞捐献者的招募工作。     

安徽合肥地区汉族群体HLA基因频率分布

目的分析安徽合肥地区汉族造血干细胞捐献者人类白细胞抗原HLA—A,B,DRB1基因频率的分布特征。方法应用PCR—SSOP和PCR—SSP基因分型技术,对合肥地区1174名造血干细胞捐献者血样进行HLA—A,B,DRB1基因分型,并用统计学方法对基因型频率进行Hardy—Weinberg平衡检验。结果共检出61个基因,合肥地区HLA—A,B,DRB1位点基因频率最高的分别为A＊02（37．3％）,A＊11（20．8％）,A＊24（17．8％）;B＊15（13．8%）,B＊40（17．6％）,B＊13（11．3％）;DRB1＊15（16％）,DRB1＊09（15％）,DRB1＊04（14％）。发现了A＊34和B＊15中的B＊95等在中国人群中比较罕见的基因。结论合肥地区汉族造血干细胞捐献者HLA部分位点的基因频率呈现出地区差异。