中国对虾皮下及造血组织坏死杆状病毒（HHNBV）DNA探针的制备及应用

ＨＨＮＢＶ是１９９３年中国对虾暴发性流行病的主要病原之一。从纯化的病毒中提取ＤＮＡ，用ＥｃｏＲｌ限制性内切酶酶切成ＤＮＡ片段，与ＰＵＣ１８体外重组，建立ＨＨＮＢＶＤＮＡ文库。从中筛选出三个重组质粒（５＃、８＃、９＃），它们所插入的片段大小分别为：２．８Ｋｂ、０．８Ｋｂ、１．６Ｋｂ，它们分别用光敏生物素标记成探针，与感染ＨＨＮＢＶ的病虾ＤＮＡ呈阳性反应，以此利用制备的ＨＨＮＢＶＤＮＡ探针的高敏感性和特异性来检测虾病。     

鳜鱼病毒核酸随机引物扩增与克隆↑（*）

从感染鳜鱼病毒（ Ｓｉｎｉｐｅｒｃａ ｃｈｕａｔｓｉ Ｖｉｒｕｓ,简称ＳＣＶ） 的鳜鱼体中分离病毒,提纯核酸作模板。通过ＲＡＰＤ 法,用带酶切位点的引物进行病毒核酸随机引物扩增,获得扩增带谱。从带ＥｃｏＲⅠ酶切位点的引物扩增产物中,用琼脂糖凝胶电泳回收大小约为０ ．４ 和０ ．５ Ｋｂｐ 的片段,经ＥｃｏＲⅠ酶切处理制备成带粘性末端的片段,分别插入质粒ｐＵＣ１９ 的ＥｃｏＲⅠ位点。ＥｃｏＲⅠ酶对重组子进行了酶切鉴定,获得２ 种带插入ＳＣＶ 核酸ＰＣＲ扩增产物的重组子。     

镢鱼病毒核酸随机引物扩增与克隆

从感染鳜鱼病毒（Ｓｉｎｉｐｅｒｃａ ｃｈｕａｔｓｉ Ｖｉｒｕｓ,简称ＳＣＶ）的鳜鱼体中分离病毒,提纯核作模板。通过ＲＡＰＤ法,和带酶切位点的引物进行病毒核酸随机引物扩增,获得扩增带谱。从带ＥｃｏＰＩ酶切位点的引物扩增产物中,用琼脂糖凝胶电泳回收大小约为０．４和０．５Ｋｂｐ的片段,经ＥｃｏＲＩ酶切处理制备成带粘性未端的片段,分别插入质粒ｐＵＣ１９的ＥｃｏＰＩ位点。ＥｃｏＲＩ酶对重组子进行了酶切鉴定,     

斑节对虾白斑综合症病毒部分基因组文库及核酸探针检测法

通过分离纯化白斑综合症病毒（ＷＳＳＶ）粒子，抽提病毒ＤＮＡ。用限制性内切酶ＥｃｏＲⅠ或ＳａｌⅠ酶切后，克隆入质粒ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔⅡＫＳ中，从而建立了ＷＳＳＶ部分基因组文库。估计ＷＳＳＶ基因组ＤＮＡ在１６５ｋｂ以上。将ＷＳＳＶ ＥｃｏＲⅠ克隆片段标记制备为探针。进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交、打点杂交和原位杂交，其结果证明了克隆片段对ＷＳＳＶ特异，并为检测ＷＳＳＶ提供了方法。通过对部分基因组文库序列     

一种用PUC质粒高效克隆PCR产物的方法

ＰＵＣ质粒用Ｓａｍｌ酶切，经Ｔａｑ酶和ｄＴＴＰ处理，构建成ｄＴ载体。ＰＣＲ产物经低熔点琼脂糖凝胶纯化，与ｄＴ载体直接进行连接反应，再转化受体菌。运用该法对不同长度的病毒、细菌和动物细胞的ＤＮＡ片段进行了克隆试验，均获得高效率克隆。     

条纹斑竹浙江省鲨线粒体DNA的研究

用６种限制性内切酶分析了４条条纹斑竹鲨的线粒体ＤＮＡ，ＰｓｔＩ，ＨｐａＩ，ＸｂａＩ，ＥｃｏＲＩ，ＥｃｏＲＶ，ＢｇｌⅡ在条纹斑竹鲨ｍｔＤＮＡ分子上分别具有０至２个切点，ｍｔＤＮＡ分子大小为１６．６ｋｂ，根据单酶和双酶完全酶解片段的大小，构建了条纹斑竹浙江省ｍｔＤＮＡ的限制性酶切图谱。     

鲇鱼线粒体DNA的酶切图谱

采用差速离心法及ＤＮａｓｅⅠ、ＲＮａｓｅ消化法制备并纯化了鲇（Ｓｉｌｕｒｕｓａｓｏｔｕｓ）肝脏线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ，ｍｔＤＮＡ）。用８种限制性内切酶对ｍｔＤＮＡ进行了分析。ＢｇⅡ、ＥｃｏｒⅠ、ＰｓｔⅠ、ＢｇｌⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＸｂａⅠ、ＨｉｎｄⅢ、ＸｈｏⅠ在鲇ｍｔＤＮＡ分子上分别具１、１、１、２、２、７、７和０个切点。ｍｔＤＮＡ分子量约１０．８４×１０￣６道尔顿，大小为１７．５４ｋｉｌｏｂａｓｅｐａｉｒｓ。根据单酶和双酶解片段的数目和分子量，建立了鲇ｍｔＤＮＡ的限制性酶切图谱。     

鳜鱼病毒核酸的初步分析

提取鳜鱼病毒核酸，分别用ＤＮａｓｅ、ＲＮａｓｅ和绿豆芽核酸酸处理表明，该病毒为双链ＤＮＡ病毒，用带ＥｃｏＲⅠ酶切位点的随机引物扩增病毒核酸，获得扩增核酸带谱。经低熔点琼脂糖回收ＰＣＲ产物，与质粒ｐＵＣ１９连接，获得三个重组子，已经对两个小插入片断进行了序列分析，插入序列分别为３６９ｂｐ和４５０ｂｐ。ＧｅｎＢａｎｋ检测显示，尚未有类似的序列报导。     

鲢鳙线粒体DNA的九种限制性内切酶酶场图谱的比较

以十一种限制性内切酶对鲢鱼ｍｔＤＮＡ进行单酶完全酶解的切点数：ＳａｌＩ和ＢｇｌⅡ为０；ＰｓｔＩ．ＸｈｏＩ．ＫｐｎＩ和ＳａｃＩ为１；ＨｐａＩ和ＸｂａＩ为２；ＢａｍＨＩ为３；ＢｇｌＩ和ＥｃｏＲＩ为４。以九种限制性内切酶对鳙鱼ｍｔＤＮＡ进行单酶完全酶解，其切点数；ＰｓｔＩ．ＸｈｏＩ．ＳａｌＩ．ＫｐｎＩ．ＢｇｌⅡ均为１；ＨＰａＩ和ＸｂａＩ为２；ＳａｃＩ为３；ＢｇｌＩ为４。采用琼脂糖凝胶电泳法测得鲢鱼ｍｔＤＮＡ分子量为１５９３０±２２０碱基对（ｂｐ）；鳙鱼ｍｔＤＮＡ分子量为１６６５０±１５０碱基对（ｂｐ）。用单、双酶解法和部份酶解法构建了鲢鱼九种酶１８个切点和鳙鱼九种酶１６个切点的限制性内切酶酶切图谱。另外，对这两种鱼的酶解位点数，片段大小和限制酶图谱进行了比较。     

鳜鱼病毒PCR诊断方法的建立

从ＲＡＰＤ扩增的鳜鱼病毒（ＳＣＶ）核酸电泳带中回收了二个片断，克隆子pUC19质粒（称为ＳＣＶＥ３６９和ＳＣＶＥ４５０），序列分析表明插入片段分别为３６９bp和450bp与ＧenBank序列没有显著的同源，根据克隆序列调计两对引物Ｐ１／Ｐ２和Ｐ３／Ｐ４ ，在健康鳜鱼，病鳜以及提纯的ＳＣＶ核酸中进行ＰＣＲ试验，结果表明，Ｐ１／Ｐ２组引物在ＳＣＶ基因组中扩增出特异性核酸片段，可作为鳜鱼病毒ＰＣＲ诊断，检测片段为３６９bp.     

The plasmid profile of Edwardsiellaictaluri*

Abstract. The plasmid content of 18 isolates of Edwardsiella ictaluri found in channel catfish was analysed by agarose gel electrophoresis. Each isolate contained an identical set of plasmids. This set consisted of two prominent plasmids of 5.2 and 4.4 kilobase pairs, and three smaller and less apparent plasmids. One plasmid (the 5.2 kilobase plasmid) was radiolabelled and used to probe a blot of DNA from all isolates. All plasmids were hybridized but no chromosomal DNA was labelled. These plasmids must share some homologous regions. DNAs from other bacteria, including the related Edwardsiella tarda, were also probed and no hybridization was seen. It is suggested that a plasmid probe may be a sensitive, specific probe for detection of E. ictaluri in channel catfish     

用于PCR检测对虾皮下及造血组织坏死杆状病毒(HHNBV)的一种快速提取DNA方法

使用采样液ＳＥＭＰ－Ｔｒｉｓ保存人工感染ＨＨＮＢＶ（ＷＳＳＶ的一个分离株）的中国对虾组织，然后分别用酚抽提法、玻璃乳（Ｇｌａｓｓ Ｍｉｌｋ）回收法、硝酸纤维素膜结合法和煮沸－乙醇沉淀法提取ＤＮＡ。应用ＨＨＮＢＶ引物对提取的ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增，使用琼脂糖凝胶电泳对扩增产物进行鉴定和检测。通过比较表明，煮沸－乙醇沉淀法是一种最快速、简便的从采样液ＳＥＭＰ－Ｔｒｉｓ保存的病虾组织中制备ＰＣＲ模板的方法     

单克隆抗体酶联免疫技术检测对虾皮下及造血组织坏死病的病原及其传播途径

用单克隆抗体ＥＬＩＳＡ技术对１９９４年５月～７月自山东和辽宁采集的虾池和海区材料，包括对虾、浮游生物、小型甲壳类生物、鱼类、底泥及饲料等共１９２个样品进行了对虾暴发性流行病病原ＨＨＮＢＶ的检测。结果表明，对虾中的ＨＨＮＢＶ阳性与虾池发病情况基本相符，用单抗ＥＬＩＳＡ方法可提前２０～４０ｄ对虾池的发病可能性作出预报；桡足类浮游生物的带毒率高于对虾，且其阳性的出现早于对虾，沿岸海区的桡足类浮游生物有较高的阳性率，它可能是对虾暴发性流行病的主要病原携带者；部分地区的卤虫也带有ＨＨＮＢＶ，同时还从糠虾等小型甲壳类生物中检出了病原。     

1994年浙江省对虾暴发性流行病病原及传播途径的初步调查

用Ｔ—Ｅ染色、单克隆抗体的ＥＬＩＳＡ现场诊断、组织切片和Ｈ—Ｅ染色和电镜观察等不同方法对１９９４年浙江省乐清和温岭两地区虾池及海区样品进行了现场和实验室检查。结果说明，１９９４年浙江省对虾暴发性流行病实质上是杆状病毒性的皮下及造血组织坏死，病原为ＨＨＮＢＶ。检查到的ＨＰＶ不是这场暴发病的病原。对非对虾类生物和对虾鲜活饲料的单抗ＥＬＩＳＡ检测表明，海区张网饲料可能是１９９４年浙江对虾暴发性流行病的主要传染源，病虾池中除对虾外，其它甲壳类生物在该病的传播上可能也起到一定的作用。这些生物除了可能传播ＨＨＮＢＶ外，还可能传播ＨＰＶ。     

普通变形杆菌TWN-3株基因组文库构建及免疫印迹筛选

在从患病大口鲇中分离到普通变形杆菌TWN-3株的基础上,将该菌总DNA用EcoRI不完全酶切后,分离5kb左右的片段,连接入pUC18质粒,转化E.coli BL21,构建基因组文库,得到3.6×103个重组子,远大于理论计算的1831个重组子,随机挑选重组子经EcoRI酶切鉴定重组率为100%,文库构建成功;将该菌裂解液与佐剂混合,免疫雄性新西兰大白兔,免疫程序结束后,抽血并分离血清,对用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后的文库进行免疫印迹筛选,最终得到8个阳性克隆子。本实验为该菌的DNA疫苗以及重要基因表达研究打下基础。     

日本蟳微卫星富集文库的建立与多态性标记的筛选

采用磁珠富集法筛选日本蟳微卫星分子标记。日本蟳基因组DNA经Sau3 AⅠ酶切后,收集400~1 200 bp大小的片段并纯化,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)¹⁵从中筛选出含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的基因组文库,经PCR检测筛选出阳性克隆进行测序。从随机挑选的970个菌落中筛选出369个阳性克隆进行测序,结果86.99%(321个)含有微卫星序列,其中完美型占80.54%,非完美型占15.95%,混合型占4.28%。除使用的探针AC重复外,还得到GA、CT等重复序列。共设计出102对微卫星引物,其中65对能扩增出清晰条带,27对具有多态性。同时筛选出的微卫星标记可为今后研究日本蟳的分子遗传育种提供有效的遗传标记。     

对虾一种杆状病毒多角体蛋白基因的PCR扩增

根据已发表的几种杆状病毒的多角体基因的序列比较与分析，设计并合成两对ＰＣＲ简并引物Ｐ—６０／Ｐ７４０和Ｐ１６４／Ｐ６４０，从纯化的对虾皮下及造血组织坏死杆状病毒提取ＤＮＡ并进行ＰＣＲ扩增，Ｐ—６０／Ｐ７４０的扩增片段较为复杂，基中１条的长度为８００ｂｐ的主带与设计的ＤＮＡ片段长度相近。Ｐ１６４／Ｐ６４０经优化ＰＣＲ的反应条件后，成功地扩增出与设计相同的约４８０ｂｐＤＮＡ片段。进一步的实验表明，Ｐ—６０／Ｐ７４０扩增的分子量为８００ｂｐ的片段可被Ｐ１６４／Ｐ６４０引物对扩增，分子量与预期的相同，初步研究结果显示，Ｐ—６０／Ｐ７４０可用于杆状病毒多角体蛋白全基因的克隆，Ｐ１６４／Ｐ６４０对于对虾杆状病毒的调查和研究有实际应用价值。     

三疣梭子蟹C-型凝集素的原核表达和活性检测

通过RT-PCR扩增三疣梭子蟹C-型凝集素（C-type lectin like-domain protein,CTLD）基因序列,将目的基因克隆入质粒pET32a,构建原核表达重组质粒pET32a-CTLD.将重组质粒转化入大肠杆菌BL21中,通过IPTG诱导CTLD的表达,对其表达产物进行SDS-PAGE和Western blot 检测.用His GraviTrap Ni亲和层析柱及超滤离心管纯化目的蛋白,并对其进行活性检验.结果表明,构建得到CTLD基因的原核表达载体,双酶切鉴定得到与预期片段相符的外源基因插入片段,经测序与目的序列完全一致;诱导表达出相对分子质量（M） 39 600的目的蛋白,经SDS-PAGE和Western blot检测,融合蛋白成功表达;重组C-型凝集素对兔的红细胞没有明显的凝集作用,但对小鼠红细胞的凝集效价是22,而对所选5种细菌的凝集作用存在差异,其中对大肠杆菌具有明显的凝集作用,而对溶藻弧菌、哈维氏弧菌、鳗弧菌和金黄色葡萄球菌均无凝集现象.本研究结果为进一步研究C-型凝集素在免疫防御中的作用与地位提供依据.