临床实践指南实施性促进研究之三: 中医/中西医结合指南知识图谱框架设计

临床实践指南存在的意义在于它的实施性.然而,目前指南的实施存在诸多问题,临床证据转化存在瓶颈.知识图谱技术的引入为指南智能化提供了坚实的基础,为解决指南实施问题提供了良好的手段.中医/中西医结合体现了我国医疗体系的特色.本研究基于心血管疾病中医/中西医结合诊疗现状及相关指南实施存在的问题,明确心血管疾病中医/中西医结合...     

中西医结合卒中知识图谱的构建与应用的研究进展

目前知识图谱在国内外被广泛应用于医学领域，尤其是西医方面，通过构建知识图谱将临床思维进行降维，并运用到临床诊疗中，为临床医师诊疗提供重要依据，同时节省患者诊疗时间。由于中医相对特殊的医疗理论体系，中医相关知识图谱的构建与应用仍有许多困难，中西医结合卒中知识图谱的构建仍需要克服许多障碍。现从中西医结合治疗卒中的现状、中西医结合知识图谱的现状、中西医结合卒中知识图谱的应用三方面出发，对中西医结合卒中知识图谱的构建与应用的研究进展进行综述。     

基于中成药知识图谱的知识推理及智能推荐

目的/意义构建中成药说明书知识图谱,实现基于知识推理的智能推荐。方法/过程基于Py2neo结合Neo4j图数据库搭建知识图谱的技术,整理1 380种中成药信息并构建数据库,基于三元闭包算法实现知识推理,运用概率模型计算中成药推荐评分。结果/结论共形成实体概念11 103个,语义关系24种。构建了中成药智能推荐知识图谱,搭建中成药智能推荐平台实现中成药的准确推荐。实现中成药与知识图谱领域结合,为中医辅助诊疗提供方法借鉴,为进一步开展中成药知识可视化研究提供参考。     

中医类流感知识图谱的构建

目的：以《中国百年百名中医临床家丛书》、中医书籍等为知识图谱构建素材,借鉴国际系统医学术语全集（SNOMED）、统一医学语言系统（UMLS）和中医药学语言系统（TCMLS）的语义关系构建“症状-证候-治法”及“所用方剂-中药”之间关系的语义网络。方法：采用人工知识抽取的方法,利用知识图谱构建素材和SQL Server 2008对数据进行预处理,选取图数据库Neo4j构建中医类流感温病理论知识图谱。结果：构建的知识图谱包含实体812个和关联4 759个。结论：通过Cypher语言使“证-治”“证-症”“症-药”等关联知识图谱可视化,能够直观地展示各个实体之间的关系,为今后将中医类流感知识图谱与深度学习技术相结合应用于中医奠定了基础。     

中医诊断学辨证知识图谱构建研究与实践

阐述中医诊断学辨证知识图谱构建方法和过程,包括知识梳理、知识图谱结构模型构建、命名实体获取、关系提取、图谱表示、可视化等方面,实现中医诊断学辨证知识地图Web服务,在利用知识图谱技术开展中医智能辅助辨证研究方面进行探索和初步实践。     

基于Neo4j的中医导引学知识图谱构建

目的：以中医导引学的特点为基础构建知识图谱,方便用户查询、学习,传播中医养生保健传统文化,提高健康素质。方法：使用BERT-CRF模型辅以人工校对,对导引功法相关文献进行命名实体识别,根据学科特征制定实体之间的关系,并使用Neo4j构建中医导引学知识图谱。结果：纳入相关文献3 152篇,构建的知识图谱共包含2 262个实体节点,5 108条关系数据,7种实体类别属性,7种关系,并可以使用Neo4j的Cypher查询语言进行知识检索。结论：本知识图谱将中医导引学知识进行可视化展示,可用于构建导引知识检索、智能问答、功法推荐等应用程序与网络平台,开发相关人工智能应用设备,应用于计算机、自动化等学科的研究与生产创新中,同时也可用于深入数据挖掘,发现新研究方向。     

中医古籍《灵枢》的知识图谱构建与可视化探讨

【目的】探讨《灵枢》的知识图谱构建与可视化方法,以期为中医古籍理论知识的结构化存储与展示提供思路。【方法】借鉴专业领域知识图谱的构建思路,利用文本挖掘技术,进行词库构建,对《灵枢》原文进行分词、实体识别、关系抽取等处理,得到知识图谱的构建基础。再利用图数据库Neo4j进行知识图谱的存储与查询,实现知识图谱的可视化展示。【结果】得到《灵枢》词库的1 216个高质量词汇,实现了《灵枢》理论的知识图谱构建。构建的知识图谱可基本展示《灵枢》文本中描述的中医理论,如藏象与精气之间的关系、情志与五脏的关系等,使得相关实体与关系的检索调用成为可能,为中医古籍理论知识的结构化存储与展示提供了思路。【结论】通过知识图谱构建可以得到《灵枢》的中医理论知识图谱,展示《灵枢》中表达的阴阳五行、脏腑经络等的知识联系。知识图谱的构建与在图数据库中的存储,可使《灵枢》文本涉及的知识图谱能以可视化语义网络图的形式进行展示,还可使嵌入语义搜索、语义维基等系统成为可能,为中医智能医疗服务发展助力。     

消渴病经方知识图谱构建与知识发现

[目的] 构建经方领域的消渴病知识图谱,并在此基础上进行知识查询和发现。[方法] 筛选经方古籍中消渴病的相关内容,通过本体七步法构建消渴病本体,以结构化的三元组数据来表示研究内容,并进行语义消歧,用Excel软件存储结构化数据,再导入Neo4j图数据库,构建消渴病的经方知识图谱。[结果] 构建了包含1 432个节点、3 067个关系的消渴病经方知识图谱,其模式层包含24个节点、24个标签、54条关系和24种关系类型,通过Cypher语言可以从辨证、立法、处方、遣药四个方向进行描述性检索与知识发现。[结论] 以知识图谱的方式结构化展示消渴病经方相关内容,模拟经方理论体系与临床诊疗思维,通过实现复杂知识之间的多途径联系,有助于更深入地进行知识发现与探索。     

中医药知识图谱研究现状及发展趋势

知识图谱研究在中医药领域迅速发展,已经应用于中医药的基础理论、临床辅助、方剂用药等多个方面.对知识图谱的概念、关键技术及中医药知识图谱研究现状进行综述,总结中医药知识图谱研究面临的问题,包括中医术语标准统一问题、知识图谱模式层构建问题、中医知识融合技术规范问题、推理方法设计和选择问题等,并对中医药知识图谱研究的发展趋势...     

国内外冠心病临床指南研究现状调查及对中医临床指南的思考

目的 了解国内外中西医诊疗指南的研究状况和差距,为建立中医临床指南提供思路.方法 仅以冠心病为例,通过PubMed,CNKI,CMB等网络检索系统查找近年资料,从指南的开发程序、方法、内容等方面进行分析和比较,进而对中医临床指南的研究方向进行思考.结果 中医临床指南的制定工作不可能完全套用国际上现有的循证指南模式,但要为世界所认可,又必须在方法上与国际接轨.结论 中医学应借鉴循证医学的方法,建立符合自身理论特点和临床实际的中医证据评价体系,并据此制定出为国际同行所认可同时又符合中医学理论的中医临床指南.     

基于自然语言处理的临床合理用药知识图谱构建

目的：构建基于自然语言处理的临床合理用药知识图谱。方法：以国家食品药品监督管理总局（CFDA）、美国食品药品监督管理总局（FDA）及某大型三甲医院药品库中药品说明书为数据源，构建了一种基于深度学习算法的临床合理用药知识图谱库。对随机抽取的500份药品说明书进行人工标注，将标注的数据划分为训练集、测试集、验证集。基于深度学习模型BRET进行训练，通过训练集训练模型和验证集验证训练过程中的性能及训练后通过测试集测试模型性能，用优化后的机器学习模型预测未标注的药品说明书。结果：最终抽取出30余万条“实体-关系-实体”的三元组关系，将机器学习模型产生的三元组与领域专家标注产生的三元组一起导入Neo4j图形数据库中存储，以知识图谱的形式展现给临床药师。结论：通过基于深度学习算法的临床合理用药知识库构建，在标引少量药品说明书的前提下，挖掘出药品说明书中所有的医疗关系和实体。自动构建基于药品说明书的合理用药知识图谱，可提高合理用药的自动化程度和准确度，降低不合理用药。     

面向决策支持的临床指南知识表示方法研究

目的：更好地表示临床指南知识,以支持临床决策支持系统的构建。方法：以缺血性卒中为例,在系统梳理临床指南知识表示方法的基础上,提出使用解释节点、数据获取节点、动作节点、复合节点,以及有向边和无向边对指南诊疗流程进行表示,同时考虑实际的电子病历数据格式,设计自然语言处理模块,提高指南与电子病历系统的数据交互能力。结果：在实证研究中,使用8个节点、7条边,以及节点和边中的4个逻辑推理式表示了缺血性卒中患者临床类型判断流程,同时使用9个节点、8条边,以及节点和边中的6个逻辑推理式表示了缺血性卒中急性期的血糖管理,详细说明了临床指南知识表示建模过程。结论：本研究提出的临床指南知识表示方法可以使用节点、边、数据、逻辑推理算法等表示临床指南知识及推理逻辑,以支撑临床决策支持系统的构建。     

中医临床诊疗指南制修订现状调研、分析与工作建议

背景 2014年底,国家中医药管理局政策法规与监督司开展中医临床诊疗指南制修订工作,对中医13个专科领域的240项中医临床诊疗指南项目进行制修订,中华中医药学会承担本部分工作。目的 为了解中医领域临床诊疗指南制修订现状,从方法学角度对项目组工作中存在的问题进行分析并给出建议,本项目组对中华中医药学会中医临床诊疗指南制修订项目组进行调研。方法 2020年6—12月,以中华中医药学会中医临床诊疗指南制修订项目组为调研对象,每个项目组人员填写一份问卷,汇集项目组整体意见。采用问卷星电子问卷,通过中华中医药学会工作文件的方式下发通知至各项目组进行调查,网络端收取调查结果。围绕调研主题,问卷内容包括5大方面：对中医临床诊疗指南的认识、指南制修订程序和方法学应用、指南制修订工作重点问题和关键环节、指南实施推广和应用情况、指南制修订工作情况整体调研。问卷为半结构化设计,共30个结构化问题、4个开放性问题。调研完成后对结果进行数据汇总与描述性分析。结果 本调研最终收回有效问卷198份,调研结果提示,在对中医临床诊疗指南的认识上,大多数项目组（94.45%,187/198）认为本领域内依然需要更多的中医...     

面向文献组织的重大公共卫生事件知识图谱构建研究

提出一种融合中西医知识的新型冠状病毒肺炎知识模型及基于自然语言处理的领域知识自动发现方法,从等级体系结构、主题分类、关系类型等多维度对语义知识进行组织与关联。收集新冠肺炎专题文献、诊疗方案及网络新媒体数据,在自动知识发现基础上进行人工审核和标注,构建新冠肺炎知识图谱并实现可视化呈现与在线检索,以期支撑生物医学科技文献资源深度组织和有效利用。     

《暴聋中医诊疗指南》的德尔菲法评价与结果分析

目的:根据中医耳鼻喉科行业专家对<暴聋中医诊疗指南>初稿框架以及诊治意见的集中程度与协调程度,制定科学实用的<暴聋中医诊疗指南>.方法:采用德尔菲(Delphi)法,在文献计量研究基础上编制<暴聋中医诊疗指南专家问卷调查表>,向全国中医及中西医耳鼻喉科专家分别发送57份和53份问卷调查并进行1次专家会议,时第一、二轮问...     

赵炳南、朱仁康皮肤科流派用方经验知识图谱构建

目的构建用方经验知识图谱,辅助北京皮肤科赵炳南、朱仁康流派学术思想与临床经验传承。方法以书籍、论文为数据来源,制定包含疾病、证候、症状、病程阶段、治则、方剂、中药、用法、医家及其间关系的知识框架。基于框架编写知识抽取表,获取包含多类实体、关系的知识,将每条知识的唯一编码设置为所涉实体、关系的知识来源属性。参考术语标准,计算术语相似度,使用Protégé为证候术语构建本体。将本体对关系的匿名类表述修改为三元组,与知识图谱融合,选择图数据库Neo4j,导入知识并发布于在线平台。结果构建了包含5999个实体、20312条关系的赵炳南、朱仁康皮肤科流派用方经验知识图谱。约束涉及医家间有师承关系,可获取流派知识;约束知识来源属性相同,可区分涉及多类实体的已有知识与因知识融合而显现的隐性知识;也可通过实体、关联深度的筛选进行快速检索。结论通过知识图谱可便捷地获取、对比流派知识,能够辅助名老中医知识的传承、创新。     

小儿病毒性肺炎中医临床诊疗指南(修订)

围绕儿童病毒性肺炎进行文献检索,依照中医临床诊疗指南编写规则,完成2轮专家问卷调查和专家意见征求,最终形成《小儿病毒性肺炎中医临床诊疗指南(修订)》,明确指南适用范围、规范性引用文件、术语和定义、诊断、辨证、治疗、预防和调护,旨在为儿童病毒性肺炎中医临床实践、诊疗规范等提供重要参考。     

基于自然语言技术进行血管超声报告智能生成诊断提示的探索

目的:探索基于血管超声报告进行自然语言处理并智能生成诊断提示的方法。方法:对血管超声报告采用Bi-LSTM-CRF模型进行分词及命名实体识别,根据专家指南构建知识图谱,通过查询实体及关系属性,实现超声诊断的智能建议。结果:Bi-LSTM-CRF模型识别了4类实体,其识别准确度均在90%以上,单个报告的处理速度在毫秒量级,同时构建包括4类关系的知识图谱。结论:自然语言处理结合知识图谱可以用于血管超声报告的智能诊断提示生成。     

基于本体的中西医知识体系对比研究

中医知识体系中包含大量的隐性知识,运用本体构建中医知识体系有利于中医隐性知识的表达与共享。通过对医学系统命名法-临床术语(SNOMED CT)和中医临床术语系统的研究,从本体论的角度分析中西医学知识特点,对发展中医进行提示:利用本体论构建中医知识体系,进而完善中医临床术语系统,促进中医临床知识共享。     

基于知识元标引的《王旭高医案》逻辑数据及知识图谱探析

  目的  采用知识元理论的信息技术梳理、分析中医古籍内容,构建知识图谱探析隐含的逻辑关系以发现新知识。  方法  以《王旭高医案》为例,在基于知识元理论与技术深度标引的基础上,首先利用MS SQL Server数据库将标引数据读取为逻辑数据并初步分析;其次以基于neo4j数据库构建的中医古籍知识图谱技术呈现出显性知识,同时探析其深层的逻辑推理关系,进一步发现隐性知识。  结果  《王旭高医案》共有知识体787个,知识元5 153个,语义类型共有1 149个,语义关联共有510个。分析逻辑数据和机构化知识图谱可知,虚劳的知识元与语义关联最多,其中与肝脏、脾胃的语义关联最多。  结论  《王旭高医案》整体来看特点在于重视对各类疾病证候表现的描述以及病因病机的分析, 王氏诊治虚劳的经验较为丰富,从肝入手诊疗虚劳,尤其重视肝脾同病的病机。