mRNA差别显示技术的研究进展

ｍＲＮＡ差别显示是继ｍＲＮＡ差减杂交技术之后又一种显示ｍＲＮＡ差异表达的新方法。它通过ＰＣＲ随机引物与锚定引物的合理搭配,在特定ＰＣＲ条件下,展示不同条件下真核细胞ｍＲＮＡ的差异扩增片断,为寻找未知基因提供了新途径。     

利用微波炉快速制备酵母质粒和基因组DNA PCR模板

制备基因组ＤＮＡＰＣＲ模板一般都比较费工费时 ,研究人员尝试用微波炉提取真核生物基因组ＤＮＡ ,然后做ＰＣＲ扩增取得了较好的效果[1 ,2 ] 。本文描述了一个利用微波炉快速制备酵母质粒和基因组ＤＮＡＰＣＲ模板的程序 ,具有良好的重复性。1　材料与方法1.1　材料酿酒酵母菌种 1ｃ163 6ｄａｒｇ11,ｕｒａ 3为比利时ＯｒｉａｎｅＳｏｅｔｅｎｓ馈赠。酵母载体ｐＹＸ13 3从美国康乃尔大学曹维国处获得 ,并由此构建了粗糙脉孢霉ａｒｇ 13ｃＤＮＡ的酵母表达载体ｐＹＸＡ5。培养基为ＳＤ或ＹＰＤ固体培养基。1.2　酵母质粒提取[3]取 1.5ｍｌ…     

HCV RNA的检测方法简介

本文讨论了检测丙型肝炎病毒核糖核酸（ＨＣＶＲＮＡ）的样本来源和处理,引物的设计,合成和选择等问题;重点介绍了蛋白酶Ｋ消化法,聚乙二醇沉淀法,异硫氰酸胍一步法,硅凝胶提取法和直接捕获法提取ＨＣＶ　ＲＮＡ的５种方法,以及一步ＰＣＲ法,常规ＲＴ－巢式ＰＣＲ,直接ＲＴ－巢式ＰＣＲ,化学修饰的ＲＴ－巢式ＰＣＲ,联合ＰＣＲ,双温ＰＣＲ和定量竞争性ＰＣＲ等７种ＰＣＲ方法检测ＨＣＶ　ＲＮＡ,用ＰＣＲ检测ＨＣＶ　ＲＮＡ方法的标准化以及检测ＨＣＶＲＮＡ具有非常重要的意义。本文还介绍了一种新型的定量方法－ｂＤＮＡ信号放大技术检测ＨｃＶＲＮＡ。     

人基因组YAC克隆DNA的Alu－PCR反应条件的系统研究

在人基因组ＹＡＣ克隆的Ａｌｕ－ＰＣＲ指纹分析中要求ＤＮＡ且扩增带具有ＹＡＣ特征性;在用ＡｌＵ－ＰＣＲ方法对ＹＡＣ克隆中的人类基因组ＤＮＡ片段进行特异的同位素标记时则要求被扩增标记的ＤＮＡ序列在插入片段中具有一定的弥散性。我们建立了两种不同的Ａｌｕ－ＰＣＲ反应体系以满足这一不同要求,并已得到较为满意的结果。根据不同条件下的Ａｌｕ－ＰＣＲ结果,分析了多引发位点ＰＣＲ中的一些现象,并作出了解释。     

Glycine—SDS—PAGE测定小分子多肽分子量

小分子多肽分子量的测定 ,目前多采用Ｔｒｉｃｉｎｅ -ＳＤＳ -ＰＡＧＥ系统[1～ 3 ] ,但系统中的Ｔｒｉｃｉｎｅ价格昂贵 ,加之电泳时间较长 ( 3～ 4ｈ) ,为此 ,作者经过实验摸索 ,建立了Ｇｌｙｃｉｎｅ -ＳＤＳ -ＰＡＧＥ测定小分子多肽的方法。1　材料和方法表 1　制胶配方成分分离胶 (ｍｌ)浓缩胶 (ｍｌ)分离胶单体母液 1 3 3 -浓缩胶单体母液 -0 23 2ｍｏｌ/ＬＴｒｉｓ-ＨＣｌ 1 3 3 -(ｐＨ8 8)0 5ｍｏｌ/ＬＴｒｉｓ-ＨＣｌ -0 3 8(ｐＨ6 8)尿素 1 44ｇ -Ｈ2 Ｏ 0 40 910 %ＳＤＳ 40 μｌ 15 μｌ10 %ＡＰＳ 2 5 μｌ 12 μｌＴ…     

一步法提取植物DNA用于大规模RAPD分析

ＲＡＰＤ技术已广泛地用于植物的系统演化、种群多样性、群体遗传学及杂种种子纯度的鉴定等工作中〔１～３〕。本文基于快速节省的原则对碱液法提取植物ＤＮＡ进行一些改进。１材料与方法ＤＮＡ提取方法取１０～２０ｍｇ幼叶 ,加１００μｌ０ ５ｍｏｌ／ＬＮａＯＨ（或附加０ ５ %～１ ５ %巯基乙醇）研磨后 ,取４０μｌ研磨液加入２００μｌ１００ｍｍｏｌ／ＬＴｒｉｓ ＨＣｌｐＨ７ ６缓冲液（或附加０ ５%不溶性聚乙烯吡咯烷酮 ,ＰＶＰ）中 ,８０００×ｇ离心５ｍｉｎ,上清液即可用于ＰＣＲ反应。ＰＣＲ反应体系含１０ｍｍｏｌ／ＬＴｒｉ…     

基因克隆的常用方法介绍

为能快速、准确地克隆出有意义的基因,本文介绍了目前常用的一些基因克隆方法,如差异显示ＰＣＲ、抑制性差减杂交、ＲＡＰ－ＰＣＲ、代表性差异显示、酵母双杂交系统、ｃＤＮＡ直接捕捉法等;并对这些方法作了简要的评价,以利于大家选择适合自己的方法。     

韭蛆病原菌cyt基因的克隆及工程菌株的构建

以Ｇｅｎｅｂａｎｋ中收录的来自Ｂａｃｉｌｌｕｓｔｈｕｒｉｎｇｅｎｓｉｓｓｕｂｓｐ .ｉｓｒａｅｌｅｎｓｉｓ(Ｂｔｉ)的ｃｙｔＡ基因序列为依据 ,设计了特异性的引物 :ｃｙｔＡ1和ｃｙｔＡ2 ,对从四川成都分离的韭蛆病原菌Ｂ .ｔＴＮ 189用ＰＣＲ方法扩增到 982ｂｐ的ｃｙｔ基因片段。利用设计的酶切位点将此片段用ＨｉｎｄⅢ /ＸｂａⅠ进行双酶切后 ,与克隆载体 ｐｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ( /- )连接 ,转化Ｅ .ｃｏｌｉＪＭ 10 9,通过蓝白菌落的筛选 ,挑出转化子 ,并通过ＰＣＲ和酶切验证了转化子的正确性。将重组子命名为ｐｂｌ ｃ…     

有毒铜绿微囊藻M.aeruginosa pcc7820对氨基酸的吸收

有毒铜绿微囊藻Ｍ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａＰＣＣ７８２０对氨基酸的吸收徐平,曾昭琪（南京大学生物系,２１０００８）ＵＰＴＡＫＥＯＦＡＭＩＮＯＡＣＩＤＳＢＹＴＯＸＩＣＭＩＣＲＯＣＹＳＴＩＳＡＥＲＵＧＩＮＯＳＡＰＣＣ７８２０￥ＸｕＰｉｎｇａｎｄＴｓｅｎｇＣｈ...     

几种差别表达基因显示技术及其在植物方面的应用

９０年代以来,先后出现了ＤＤ,ＲＤＡ,ｃＤＮＡ－ＲＤＡ,ＳＡＧＥ,ＧＥＦ,ＲＦＤ,ＳＳＨ以及ＡＴＡＣ－ＰＣＲ等数种未知产物的差别表达基因显示技术,本文对这些技术的异同。各自的优缺点以及它们在植物方面的应用现状和前景作了简单综述。     

缺氧诱导因子1和红细胞生成素3‘—增强子调节内皮细胞？…

目的和方法：将红细胞生成素（ＥＰＯ）３＇－增强子野生片断及点突变片断借脂质体主人脐静脉内皮细胞株ＥＣＶ－３０４,用半定量ＲＴ－ＰＣＲ测定正常秘缺氧诱导因子－１（ＨＩＦ－１）诱导剂氧化钴（ＣｏＣｌ２）作用下培养６ｈ的细胞环氧合酶２（ＣＯＸ－２）和血栓素合酶（ＴＸＳ）的ｍＲＮＡ。结果：ＨＩＦ－１诱导剂ＣｏＣｌ２可放ＣＯＸ－２和ＴＸＳ基因转明显增强２,向细胞导入野生ＥＰＯ３＇增强子片断可阻断ＣｏＣｌ２诱     

多重PCR法检测对皮下和造血器官坏死杆状病毒

根据对虾皮下和造血坏死杆状病毒（ＨＨＮＢＶ）ＨＨＮＢＶ－ＸＩＡ靶基因序列设计了４个多重ＰＣＲ法用引物（Ｐ１、Ｐ２、Ｐ３、Ｐ４）。采用了五种引物组合形式分别对ＨＨＮＢＶ－ＸＩＡ、ＨＨＮＢＶ基因和ＰＲＤＶ－ＪＡＰＡＮ片段进行了物异扩增,建立了多重ＰＣＲ检测ＨＨＮＢＶ方法。通过优化多重ＰＣＲ法检测ＨＨＮＢＶ条件,可从阳性感染的中国对虾ｆｇ级ＤＮＡ中定性检测出皮下和造血器官坏死杆状病毒。     

抑制性扣除杂交技术(SSH)及其研究进展

一般认为,真核生物基因总数为100,000个左右。但在一定发育阶段,在某一类型的细胞当中,则只有15%左右的基因得以表达[1]。而生物体几乎所有的生命活动过程包括病理的变化,从本质上讲均是基因表达变化的结果。因此,关于真核生物发育过程中基因的表达与调控的研究已引起人们的高度重视。过去,人们对差异表达基因的分离主要依赖于示差筛选和差别杂交技术,但它们又存在着重复性差、敏感度低等缺点。近几年,随着ＰＣＲ技术的出现,涌现了许多基于ＰＣＲ的分离有差别表达基因的新方法。1992年ＬｉａｎｇＰ等[2]提出ｍＲＮＡ差异显示技术(ｍＲＮＡｄ…     

杂交水稻及其“三系”线粒体DNA的AP—PCR指纹图谱

为了研究水稻（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ．）细胞质雄性不育（ＣＭＳ）与线粒体基因组的关系,应用ＡＰ－ＰＣＲ 分析,用７ 个任意单引物对６ 种水稻品系线粒体ＤＮＡ 进行了扩增。水稻线粒体ＤＮＡ 的ＡＰ－ＰＣＲ 产物可分为三种类型：（１）所有供试品系均能扩增的片段,它们代表了线粒体ＤＮＡ 在进化上的保守性序列。有４ 个引物检测到这类片段。（２）２ 个以上水稻品系共同出现而在全部供试材料间存在差异的扩增片段,这类片段是检测水稻线粒体ＤＮＡ多态性的主要来源。（３）一种细胞质类型所特有的扩增片段,从引物Ｒ２ 和Ｖ５ 的扩增产物中发现了这类片段,它们可能与ＣＭＳ有关联。另外,ＷＡ型不育系珍汕９７Ａ 与其杂种之间在６ 个引物的扩增图谱上均存在不同程度的差异,说明两者的线粒体ＤＮＡ序列结构可能存在某种差别     

人微小纤溶酶原基因在甲醇营养型酵母中的表达

用ＰＣＲ方法扩增人微小纤溶酶原（Ｍｉｃｒｏｐｌａｓｍｉｎｏｇｅｎ,ｍｐｌｇ）ｃＤＮＡ,与分泌型酵母表达载体ｐＨＩＬＤ８重组,构成受醇氧化酶基因（ＡＯＸ１）的启动子与转录终止区控制的酵母表达质粒,然后转化ＧＳ１１５酵母菌,经表型筛选、ＰＣＲ扩增筛选阳性克隆,然后以甲醇诱导表达,ｍｐｌｇ分泌至培液,以酪蛋白琼脂糖平板溶圈法、发色底物法检测,ｍｐｌｇ显示出纤溶活性。     

中国人HIV辅助受体CXCR4基因的克隆及序列测定

为了获得ＨＩＶ辅助受体ＣＸＣＲ４基因,进一步探索艾滋病（ＡＩＤＳ）的诊断、防治方法,采用逆转录巢式聚合酶链式反应（ＲＴ－ｎＰＣＲ）从中国人外周血淋巴细胞中克隆了ＣＸＣＲ４　ｃＤＮＡ基因,得到了预期的１　１００ｂｐ左右的片段。将ＰＣＲ产物与Ｔ载体连接,并进行了酶切反应鉴定,获得与Ｔ载体正向连接的克隆。测序结果表明：克隆的片段含有一个开放性阅读框架,编码３５２个氨基酸残基。搜索ＧｅｎＢａｎｋ,目标片段与Ｍ９９２９３、ＸＭ０５１２２３、ＸＭ０５１２２４、　ＸＭ０５１２２５有很高的同源性,比较结果显示：克隆的片段包括完整的编码序列,含两个碱基的差异。     

用分子生物学技术对草菇进行菌株鉴别

利用ＡＰ－ＰＣＲ和ＲＡＰＤ技术对三个草菇菌株进行鉴别,其结果与用草菇菌株Ｖ３４基因文库中的中等重复序列为探针进行限制性内切酶长度多态性分析（ＲＦＬＰ）,及对编码核糖体５．８ＳｒＲＮＡ的ＤＮＡ（ｒＤＮＡ）进行ＰＣＲ扩增后的产物进行限制性内切酶长主多态性分析（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）的结果相一致。这一结果显示出用这四种方法对草菇菌株进行鉴别具有相似的效果。同时用这四种方法构建的分子生物学标记显示出这三个菌株     

t-PA cDNA的克隆及其在毕赤酵母中的表达

应用ＰＣＲ方法,在ｔ－ＰＡ ｃＤＮＡ５＇端引入合适的限制酶位点和酵母分泌信号肽,与酵母表达载体ｐＰＩＣ９重组,构建表达质粒ｐＳＴＥ－Ｙ,利用ＬｉＣｌ转化法转化酵母菌ＹＳ１０８,在ＭＭ和ＭＤ平板上筛选表型,ＰＣＲ筛选ｔ－ＰＡ ｃＤＮＡ与酵母染色体整合而形成的阳性克隆,阳性克隆经甲醇诱导表达后,用ＳＤＳ－ＰＡＧＥ证明表达产物的分子量为６ｋＤａ左右,用酪蛋白板溶圈法测定ｔ－ＰＡ的活性。Ｍｕｔ＾ｓ表型菌表     

新疆地区盐湖的中度嗜盐菌的16S rDNA PCR—RFLP分析

对来自新疆地区艾丁湖、艾比湖和玛那斯盐湖等盐湖的２８株中度嗜盐菌与９株相关的参比菌株,进行了１６Ｓ ｒＤＮＡ ＰＣＲ－ＲＦＬＰ分析,这些菌株是革兰氏阴性杆菌,能在０～２５％ＮａＣｌ中生长。在实验中,选用４种限制性内切酶ＡｌｕⅠ、ＨｉｎｆⅠ、ＲｓａⅠ和ＨａｅⅢ,将供试菌株的１６Ｓ ｒＤＮＡ的ＰＣＲ产物进行酶切,用３％的琼脂糖电泳分析酶切产物。结果表明,在７４％的相似性水平上分为３群。群Ⅰ包括新分离的     

RAPD技术及其在微生物学方面的应用

198 0年 ,Ｂｏｔｓｅｉｎ提出ＤＮＡ限制性片段长度多态性 (ＲＦＬＰ)可以作为遗传标记 ,从此开创了直接应用ＤＮＡ多态的新阶段。 80年代后 ,ＤＮＡ多聚酶链式反应 (ＰＣＲ)的发展 ,使直接扩增ＤＮＡ的多态性成为可能 ,并在此基础上产生了许多种新型分子标记 ,诸如扩增片段多态性 (ＡＬＦＲ)、串联重复序列(ＶＮＴＲ)、单链构型多态性 (ＰＣＲ ＳＳＣＰ)、序列特异扩增区域 (ＳＣＡＲ)、随机扩增多态性ＤＮＡ(ＲＡＰＤ)等。而ＲＡＰＤ是较为突出的一种。ＲＡＰＤ是由Ｗｉｌｌｉａｍｓ和Ｗｅｌｓｈ在 1 990年各自独立发现的一种ＤＮＡ多态检…