淫羊藿苷治疗去势大鼠骨质疏松症基因表达谱分析

目的利用基因芯片技术探究淫羊藿苷治疗去势大鼠骨质疏松症的分子机制。方法将20只SD雌性大鼠随机分为模型组和治疗组,每组10只,采用去卵巢法造模,治疗组予淫羊藿苷[水相0.4 mL/(100 g.d),油相0.6 mL/(100 g.d)]灌胃,模型组每日灌胃相应体积冷开水和油中王牌植物油,每日1次,连续13周,应用基因芯片技术检测淫羊藿苷治疗后去势骨质疏松症大鼠与模型骨质疏松症大鼠相关基因的表达,通过Gene Ontology数据库对差异表达基因进行基因信息学分析。结果淫羊藿苷治疗去势大鼠骨质疏松症共有532条基因发生了差异表达,其中有175条基因上调,357条基因下调。结论多种基因差异表达是淫羊藿苷治疗去势大鼠骨质疏松症的可能分子机制。     

“正常-脑瘫”脾肾两虚型双生子的基因表达谱研究

目的研究脾肾两虚型脑瘫双生子的差异基因表达谱,从基因表达水平探讨脾肾两虚型脑瘫发生的分子机制。方法利用基因芯片技术对筛选的两对"正常-脑瘫"脾肾两虚型双生子进行基因表达谱实验,利用GO、KEGG等数据库对获得的差异表达基因进行生物信息挖掘。结果两对脑瘫双生子差异表达基因均涉及多个GO类及KEGG通路,其差异表达基因注释到的通路大多与免疫功能相关。结论免疫功能的异常可能是脾肾两虚型脑瘫发生的关键病机之一。     

肾阴虚证及肾阳虚证不孕症患者卵巢颗粒细胞基因表达谱研究

目的运用基因组学方法研究不孕症不同肾虚证型的基因表达差异并探索其潜在的目标基因。方法选取肾阴虚证、肾阳虚证、正常(因男方因素不孕)行体外受精-胚胎移植/卵胞浆内单精子显微注射(IVF-ET/ICSI-ET)的不孕症患者各33例。收集3组患者取卵日直径1.80~2.00 cm卵泡的卵泡液,提取颗粒细胞,应用高通量测序技术测定各组基因表达,分析各组差异表达的基因,对差异表达基因进行功能和通路分析。结果与正常组相比,肾阴虚证组、肾阳虚证组基因表达谱均存在明显差异。肾阴虚证组与正常组的差异表达基因313条,其中219条上调、94条下调;肾阳虚证组与正常组的差异表达基因319条,其中218条上调、101条下调。差异表达基因的基因本体论(GO)和信号转导通路分析表明,肾阴虚证单独调节的基因主要与细胞凋亡、生殖功能相关,肾阳虚证单独调节的基因主要与女性妊娠、胚胎着床相关。结论p53、Bax、Bcl-2、IGFBP7、HSL、RPL29等基因与细胞凋亡、生殖功能、女性妊娠、胚胎着床相关,这些基因有望成为不孕症中医肾虚辨证分型的目标基因。     

逍遥散对肝郁脾虚证大鼠下丘脑基因表达谱的影响

目的:在全基因组水平上系统探讨逍遥散对慢性束缚应激肝郁脾虚证大鼠下丘脑基因表达谱的影响及其抗应激调节机制。方法:采用Agilent大鼠全基因组表达谱芯片检测慢性束缚应激肝郁脾虚证大鼠模型(每天束缚3 h,连续21 d)正常组、模型组、逍遥散组(大、中、小剂量)下丘脑基因表达的差异,筛选出组间两两比较的差异基因表达谱,并利用生物信息学技术对差异基因表达谱进行GO功能分析、信号通路分析。结果:模型组、逍遥散大、中、小剂量组具有不同的差异基因表达谱,多条生物过程和信号通路的功能被显著上调或下调,其中模型组、逍遥散大、中、小剂量组差异基因参与的显著生物过程分别有909、712、516、1322个功能基因群,参与的显著信号通路分别有60、57、41、90条。结论:肝郁脾虚证具有下丘脑差异表达基因组学背景,逍遥散大、中、小剂量对肝郁脾虚证大鼠下丘脑众多差异表达基因及功能改变的信号通路、生物过程均有一定的干预作用,大剂量和中剂量结果显示优于小剂量。     

“寒淫”致病对大鼠基因表达及相关通路影响的实验研究

寒淫致病以及中药干预下,寻找大鼠差异基因表达及相关信号通路,探讨寒淫对大鼠免疫功能的影响。方法:分析正常组与寒淫组、正常组与麻黄细辛附子汤药组比较筛选差异表达基因,采用了基因功能、信号通路分析等方法探讨寒淫致病对大鼠免疫功能的影响,并作RT-PCR验证。结果:通过差异表达基因作高级筛选,得到共同的差异表达基因21条及通路10条,其中与寒淫致病密切相关的免疫功能基因及其通路有RT1-Ba基因与抗原处理和递呈通路。结论:结合差异表达基因谱的分析,提示寒淫致病与细胞因子等有密切的相关性,为下一步的研究寒淫致病提供了重要的指示性研究方向。     

气虚血瘀大鼠炎症免疫相关基因差异表达的研究

目的探讨气虚血瘀证的炎症免疫分子机理。方法12只大鼠随机分为气虚血瘀模型组和正常对照组。应用全基因芯片对气虚血瘀大鼠和正常大鼠进行全基因表达谱检测，分析与炎症免疫相关的差异表达基因。结果气虚血瘀模型组较正常组大鼠表达上调的基因有831个，已知功能的基因563个；表达下调的基因782个，已知功能的基因544个。在已知功能基因中，与炎症免疫反应相关的表达上调的基因50个，表达下调的基因17个。结论炎症免疫相关基因的差异表达揭示出气虚血瘀证与异常的炎症免疫反应密切相关。     

芪莲茅根汤含药血清对大鼠肾小球系膜细胞凋亡相关基因表达谱的影响

目的利用cDNA基因表达谱芯片观察芪茅莲根汤含药血清干预后的大鼠肾小球系膜细胞基因表达水平的变化,通过诱导肾小球系膜细胞凋亡相关基因的表达谱变化,探讨其在凋亡信号转导途径中的机制。方法建立大鼠肾小球系膜细胞培养体系,用Trizol一步法、抽提法分别从正常对照组、含药血清组的大鼠肾小球系膜细胞中抽提mRNA,经逆转录后合成荧光分子(Cy3/Cy5)标记的cDNA探针,与含有11260个cDNA基因的大鼠12K基因表达谱芯片杂交,将图像导入分析软件Imagene进行图像分析,数据导入分析软件Genespring进行标准化处理,计算ratio值(两种荧光Cy3、Cy5的比值)。分析正常对照组、含药血清组之间差异表达的基因,对所获得的基因进行生物信息学分析。结果含药血清组与正常对照组中差异表达上调的基因147条、下调的168条;涉及参与细胞凋亡发生以及能量代谢、蛋白合成、信号转导和激活因子。与细胞凋亡相关的差异表达基因37条,占芯片基因总数的0.3286%,其中表达上调的21条(平均Ratio值为3.975),下调的16条(平均Ratio值为0.402);生物信息学分析表明,Bcl-2、Bak1、Caspase9、Timp1、Cdk5、Pdgfra、Igfbp5、Irf1等在芪莲茅根汤含药血清诱导大鼠肾脏系膜细胞凋亡的调控中发挥了重要作用。结论芪茅莲根汤含药血清诱导肾小球系膜细胞调亡涉及多个基因,通过细胞内、外信号传导途径共同调节完成,从而调控肾小球系膜细胞的增殖。     

逍遥散对肝郁脾虚证大鼠胃组织基因表达谱的影响

目的:在全基因组水平上系统探讨逍遥散大、中、小剂量对慢性束缚应激肝郁脾虚证大鼠胃组织基因表达谱的影响及其抗应激调节机制。方法:采用Agilent大鼠全基因组表达谱芯片检测慢性束缚应激肝郁脾虚证大鼠模型(每天束缚3h,连续21 d)正常组、模型组、逍遥散组(大、中、小剂量)胃组织基因表达的差异,筛选出组间两两比较的差异基因表达谱,并利用生物信息学技术对差异基因表达谱进行GO功能分析、信号通路分析。结果:模型组、逍遥散大、中、小剂量组具有不同的差异基因表达谱,多条生物过程和信号通路的功能被显著上调或下调,其中模型组、逍遥散大、中、小剂量组差异基因参与的显著生物过程分别有597、1216、817、924个功能基因群,参与的显著信号通路分别有27、60、41、59条。结论:肝郁脾虚证具有胃组织差异表达基因组学背景,逍遥散大、中、小剂量对肝郁脾虚证大鼠胃组织众多差异表达基因及功能改变的信号通路、生物过程均有一定的干预作用,中剂量结果显示优于大剂量和小剂量。     

基于转录组测序技术研究玄参提取物干预阴虚火旺甲状腺功能亢进大鼠的分子机制

目的:研究玄参提取物对阴虚火旺甲状腺功能亢进(简称甲亢)大鼠基因表达谱的影响,探讨玄参提取物干预大鼠的分子机制.方法:采用转录组测序技术检测对照组、模型组和玄参组大鼠肝脏组织的基因表达谱,通过STEM软件筛选差异表达基因(DEGs),并针对DEGs进行GO功能富集KEGG通路分析.结果:与对照组比较,模型组筛选DEGs...     

肾虚质大鼠免疫相关基因表达谱与肾藏象理论相关性研究

目的:研究肾虚质大鼠脾脏淋巴细胞免疫相关基因表达谱的状况,筛选差异表达的免疫基因谱,探索用现代免疫及基因芯片技术研究肾藏象理论的新方法。方法:采用"猫吓鼠"的方法,造成先天不足、后天失养的复合型肾虚质动物模型,提脾脏淋巴细胞总RNA,经标记、杂交、芯片扫描、图象采集与数据分析等过程获得基因表达谱。结果:模型组与空白组大鼠脾脏淋巴细胞mRNA杂交得到了149条差异表达基因;药物干预后与模型组杂交得到了45条差异表达基因,有20条基因在两次杂交中均有差异。结论:肾虚质大鼠脾脏淋巴细胞存在差异表达的免疫基因谱,补肾中药可以通过调控某些基因的表达而发挥改善肾虚质的作用。