基于抗原中介三链DNA结构的0-1整数规划

利用同源的存在抗原蛋白质的脱氧核苷酸定位于双链DNA中很容易形成三螺旋结构的DNA链,可以利用这种独特的结构来研究一些可能的或可行的的计算模型。尝试了用三螺旋结构的DNA链来解决简单的0-1整数规划问题。而对于整数规划和可满足问题都可以转化为0-1整数规划来解决,从而都可以利用三链DNA计算模型得以解决。     

有界整数规划问题的DNA计算

基于生化反应原理的DNA计算具有强大的并行运算能力,对于解决NP完全问题上具有硅计算机无法比拟的优势,因此对DNA计算的研究具有重要意义.基于荧光标记的策略,提出了约束方程变量分解的概念,通过将约束方程进行分解和增加约束补链的方法,解决了有界整数规划问题.利用荧光猝灭技术,基于DNA计算的新算法具有编码简单和错误率低的特点.     

基于改进PSRS的并行0-1规划算法

结合0-1整数规划的隐式枚举法对目标排序法进行分析.引入PSRS(并行正则采样排序)算法对目标排序法的核心运算进行并行化,并改进PSRS算法的数据收集策略以适应0-1整数规划的并行隐式枚举.最后给出了基于改进的PSRS的并行0-1整数规划的求解算法,并对算法的时间复杂度进行了分析.     

0-1运输型问题

0-1运输型问题是一类特殊的0-1整数规划.虽然求解0-1整数规划的方法已有许多,但是它们都有一个共同的弱点:运算量大,存贮量大.对0-1运输型问题用传统的办法求解,效率很低.为此,我们必须对0-1运输型问题进行专门研究,寻找有效算法.     

一类特殊整数规划问题的DNA计算

基于生化反应原理的DNA计算由于在解决一类困难问题,特别是完全问题上具有硅计算机无法比拟的优势,因此对DNA计算的研究具有重要意义．提出了约束方程组的“秩”以及约束方程的3种“约束补链”概念,并基于这些概念,利用在基于表面的DNA计算中采用荧光标记的策略,给出了一类特殊整数规划问题最优解的一种基于DNA计算的求解算法．新算法利用荧光猝灭技术来排除非解,从而得到满足约束条件的所有可行解,最后再通过比较所有可行解的目标函数值来求得问题的所有最优解．算法分析表明,新算法具有解读、编码简单和错误率低的特点。     

一种新的属性约简算法

属性约简是粗糙集理论中的一个核心问题,为了有效获取属性最小相对约简,提出了一种新的基于相对差异比较表的属性约简算法.该算法给出了一种将信息表转化为相对差异比较表的方法,且该方法对于不相容决策表也是可行的,进而就将求解最小属性约简问题转化为求解一个0-1整数规划问题,并分别采用一般求解规划问题的方法和遗传算法两种方法来求解这个0-1整数规划问题.实验结果证明该算法结合遗传算法能够更加快速有效地进行属性约简.     

基于压电基因传感器的DNA计算(英文)

压电基因传感器是一种新型的生物传感器,它把压电传感器的灵敏性和DNA杂交反应相结合．与传统的基因检测技术相比,它具有结构简单、无需标记、检测时间短、检测信号易处理等特点．将它用于分子运算,与常规的DNA芯片相比,它的检测结果更易于进行自动化处理,因此便于构建大规模的分子运算机器．文中在压电基因传感器和新兴学科DNA计算的基础上,给出了解决0-1规划问题新的DNA计算方法,并指出以前两种基于表面DNA计算在解决这一问题时的不足．与以往的DNA计算方法相比其输出的是电信号,因此具有操作易自动化、识别解更方便和高信息量的优点．与使用常规DNA芯片的表面DNA计算相比,使用压电基因传感器进行DNA计算可以克服可行解识别困难的问题．压电基因传感器技术有望成为新的分子运算工具,可作为构建自动化的DNA计算机的基础．     

非线性整数规划的粒子群优化算法

提出了一种新的粒子群优化算法来求解无约束的整数规划问题，粒子在[0，1]空间内运动，并与整数空间对应。对粒子群优化算法参数的合理选取进行了实验分析，给出了算法参数选取的基本原则。数值试验计算结果表明该方法比较有效，并具有通用性。     

求解0-1规划的生长竞争蚁群算法

0-1规划是决策变量仅取值0或1的一类特殊的整数规划,具有深刻的背景和广泛的应用。植物的生长取决于对光资源的获取,本文将植物生长的竞争机制引入蚁群算法,给出了一种求解0-1规划的生长竞争蚁群优化算法。算法定义了0-1规划的生长竞争演化规则,建立了算法模型,提高了蚁群的全局优化能力。通过对多个实例的求解和验证,结果表明该方法是一种有效的方法。     

求解0-1规划问题的DNA计算模型(英文)

DNA计算是以DNA分子作为数据的一种新型计算模式．在DNA计算中首要面对的问题是编码问题．文中提出了一种双编码方法,利用这种编码方法可以使得在DNA计算的读解过程类似于DNA测序过程,容易实现自动化操作．基于该编码方法所建立的DNA计算模型可用于求解0-1规划问题,只需4次PCR反应即可读取问题的可行解．与其他DNA计算模型相比,该模型具有操作简单、易于实现的优点．