雌核发育鲢RAPD指纹和蛋白质电泳研究

用２３个随机引物对雌核发育鲢子一代（普通鲢作对照）进行了ＲＡＰＤ—ＰＣＲ反应,在２３个引物中除一个引物无扩增产物外,其它均可得到１～１０条ＤＮＡ带,平均每个引物产生５３８条带。其中７个引物产生多态现象,占总引物的３１４％。多态座位达１３６８％。用Ｓｈａｎｎｏｎ指数对ＲＡＰＤ数据进行遗传多样性（Ｈｏ）分析,得出所研究样本的Ｈｏ为０１７５。用血清酯酶和血清蛋白电泳作对比时没有发现在蛋白质水平的多态现象,说明ＲＡＰＤ技术是一种比较灵敏实用的ＤＮＡ多态检测方法。以ＲＡＰＤ所得数据进行了雌核发育鲢子代和普通鲢个体间的遗传相似性与遗传距离分析,为鲢选育提供了依据。     

中国对虾黄渤海沿岸群亲本及子一代RAPD分析

１９９７年３月从山东海阳市近海捕获中国对虾,取两尾单独暂养,产卵后培育出子代,用随机扩增多态性ＤＮＡＡ（Ｒａｎｄｏｍ Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ＤＮＡ,ＲＡＰＤ）技术对亲本和子代的基因组ＤＮＡ进行多态性研究,目的是在分子水平上解亲本与子一代之间的遗传结构,比较了两个家系的遗传差异。结果表明,使用ＯＰＧ系列２０个引物,有１６个引物获得了谱带清晰且重复性好的产物,扩增的多态性片段分子     

三江水系草鱼种群RAPD分析↑（*）

用１２０个含１０碱基的随机引物,对长江、珠江、黑龙江三大水系的草鱼产卵场及太湖中捕获的草鱼进行覆盖性的ＲＡＰＤ分析,实验共扩增出２３４６条重复性高而清晰的ＤＮＡ带,获得多态性片段８４４条。结果表明,每一水系的草鱼种群均有其特征性基因图谱,可作为种群鉴定的依据;统计学分析后绘制的遗传距离树状图与经典的数量遗传、质量遗传分析结果相吻合。     

洞庭湖区两个鲫鱼群体的遗传多样性分析

采用随机扩增多态DNA技术,对洞庭湖区两个不同的鲫鱼群体(彭泽鲫养殖群体和野鲫群体)进行比较分析。在使用的30个随机引物中有26个引物的扩增效果良好,实验结果可见:彭泽鲫与野鲫群体间的遗传相似率为0.7505,彭泽鲫群体内的遗传相似率为0.9822,野鲫群体内的遗传相似率为0.7910。统计结果表明:彭泽鲫养殖群体与野鲫群体间的遗传差异较大,彭泽鲫养殖群体内的遗传多样性贫乏,而野鲫群体内的遗传多样性明显高于彭泽鲫的养殖群体,说明野鲫种群内的遗传变异度较大,遗传多态性丰富,存在较大的育种潜力。     

RAPD技术分析荷包红鲤抗寒品系与亲本的基因组变化

用４０个随机引物对荷包红鲤、荷包红鲤抗寒品系和黑龙江野鲤三个品系鱼进行ＲＡＰＤ反应,共扩增出３６６条带,获得多态性的ＤＮＡ片段６０条。荷包红鲤抗寒品系与荷包红鲤、荷包红鲤抗寒品系与黑龙江野鲤的基因组变异指数分别为０．７７和０．９０。说明荷包红鲤抗寒品系的基因组与其亲本黑龙江野鲤的基因组较荷包红鲤具有更大的变异。     

华东地区中华鳖地方群体mtDNA多态分析

应用多聚酶链式反应（ＰＣＲ）技术和限制性长度多态（ＲＥＬＰ）方法，对我国华东地区中华鳖三个地方群体的线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）的细胞色素（ｃｙｔ）ｂ基因进行了分析。６种限制性内切酶共获得１８种酶谱和１４种基因型。ｃｙｔｂ基因大小的估算值为１０８０±６０ｂｐ。基因型多样性和核苷酸序列多样性指数分别为０．６８７９±０．０９７８和０．０２６６±０．０９７８。浙江绍兴、江苏南京和山东青岛中华鳖群体间存在显著的遗传差异（Ｐ＜０．０５），其中南京群体与绍兴群体的遗传距离最近，青岛群体与绍兴群体的遗传距离最远。三群体的遗传关系与地理距离相一致，暗示地理分隔可能是造成中华鳖群体遗传分化的主要原因。还发现内切酶ＨｅⅢ和ＨｈａⅠ可作为中华鳖种群鉴定的标志酶。     

RAPD技术在鱼类杂种优势研究中的应用↑（*）

从４０个引物中筛选了２７个引物,对兴国红鲤、德国镜鲤和苏联镜鲤进行随机扩增多态ＤＮＡ分析,共得到１９９条带,其中１５５条带（占７７９％）具多态性。计算得出这３个群体内的相似系数分别为：兴国红鲤０．７２２,德国镜鲤０．８２７,苏联镜鲤０．７８７,表明群体内的遗传变异较大;群体间的遗传距离为：兴国红鲤与德国镜鲤０．０９２,兴国红鲤与苏联镜鲤０．１０５,德国镜鲤与苏联镜鲤０．０７７,表明群体间的亲缘关系相近。兴国红鲤与苏联镜鲤遗传距离最大,推断这２个品种间的杂种优势较强,与育种实践一致。     

杂交一代（尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂）及春亲本基因组ＮＤＡ的比较

采用ＲＡＰＤ技术，用２０个随机引物对尼罗罗非鱼，奥利亚罗非鱼及其杂交一代的精巢ＤＮＡ进行扩增反应，发现引物ＯＰＺ－１４和ＯＰＺ－１８在尼罗罗非鱼和奥利亚鱼之间扩增出有差异的ＤＮＡ片段，作为鉴定两种鱼的分子标记有较高可信度，对这两种鱼的杂交一代基因组ＤＮＡ的ＲＡＰＤ扩增能获得中够的多态性，２０个引物中有８个引物扩增出差异性产物，表明杂交一代基因杂合性增强，这是杂种优势得以形成的重要遗传物质基础之一。     

RAPD技术及其在鱼类育种上的应用

ＲＡＰＤ技术是以ＰＣＲ为基础的一种分子标记，具有简单快速，ＤＮＡ需要量少等优点。本文主要介绍该技术的产生背景、原理和特点。探讨了ＲＡＰＤ在水产经济动物的标记鉴定，遗传作图，系统发育和进化，亲缘关系、种群划分和群体遗传多样性方面的应用。     

2种育珠蚌遗传多样性分析

采用ＲＡＰＤ和同工酶凝胶电泳的方法,对三角帆蚌和褶纹冠蚌的遗传多样性进行了分析。结果显示,三角帆蚌群体内的相似度为０．２９１７,褶纹冠蚌的为０．３６３６;两者的群体间相似系数为０．６７２３,遗传距离为０．３２７７。ＥＳＴ和ＬＤＨ同工酶在褶纹冠蚌外套膜及内脏团组织中的表达酶谱均比在三角帆蚌中复杂,２种组织相比则内脏团中的表达酶谱比外套膜复杂。三角帆蚌和褶纹冠蚌同作为亲缘关系比较接近的主要育珠蚌种,两者各有优缺点。在珍珠养殖和育种上,一方面要重视野生资源的保护,避免近亲繁殖;另一方面要建立种质资源库,不断筛选出更多更好的优良性状,提高育珠的质量和产量。     

异源四倍体鲫鲤及其原始亲本遗传变异的RAPD分析

在优化RAPD检测条件的基础上，从100个随机引物中筛选出60个扩增较好的引物对异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和湘江野鲤相互间扩增DNA片段的异同性进行比较研究。结果显示，60个引物共产生1554条带，单一引物扩增的DNA片段数在6～20条之间，片段大小在200～3500bp之间。遗传相似率分析表明，异源四倍体鲫鲤与其原始母本红鲫的相似率为69．41％，与其原始父本野鲤的相似率为64．47％，说明异源四倍体鲫鲤接受原始母本红鲫的遗传物质要多一些；而红鲫和野鲤之间的相似率为42．18％，说明两者的基因组成有较大的相似性，从分子水平证实了红鲫和野鲤的远缘杂交具有较大的亲和性。在分析中，还发现异源四倍体鲫鲤有4条非亲本带，非亲本带谱率达0．72％，这些非亲本带可以作为异源四倍体鲫鲤特异性的分子标记。     

中国大陆沿海六水系绒螯蟹(中华绒螯蟹和日本绒螯蟹)群体亲缘关系:RAPD指纹标记

用 4 8个具有丰富多态性的 10碱基随机引物对辽河、黄河、长江、瓯江、珠江和南流江的中华绒螯蟹和日本绒螯蟹的 6个群体进行RAPD分析。结果发现 :(1)两个引物具有群体特异性带 ,其中Z2扩增的 880bp片段为珠江蟹和南流江蟹群体中所特有 ,而 70 0bp片段为长江蟹、辽河蟹、黄河蟹和瓯江蟹所特有 ,可作为区别日本绒螯蟹和中华绒螯蟹的分子遗传标记 ;(2 )Opp17扩增的 94 7bp片段的出现频率 ,在长江、黄河和辽河群体显著地从南到北递减 ,长江蟹 87.50 %、黄河蟹4 1.66%、辽河蟹 10 .83%。这一遗传渐变的度量可作为区别这三个水系的中华绒螯蟹种群的判据 ;(3) 6水系群体内的平均遗传相似度依次为 :辽河蟹 0 .90 8>南流江蟹 0 .897>瓯江蟹和珠江蟹 0 .895>黄河蟹 0 .890 >长江蟹 0 .850 ;6群体间遗传距离及其UPGMA、NJ聚类分析进一步表明 ,南流江蟹、珠江蟹同长江蟹、辽河蟹及黄河蟹在基因组之间存在明显的歧化。     

中华鳖五群体遗传变异的RAPD分析

从97个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物,对黄河鳖、淮河鳖、洞庭湖鳖、鄱阳湖鳖及太湖鳖5个群体共100只个体进行RAPD分析.结果表明,中华鳖的遗传多样性较丰富.表现在(1)在获得的341条RAPD扩增带中,有234条(68.6%)呈现多态性;2个引物有可明显地反映种群差异的扩增带,其中S105扩增的1408bp在黄河鳖的出现频率仅为20%,而在另外4个群体的出现频率达80%～90%;S37扩增的438bp在5个群体的出现频率大小为黄河鳖85% >淮河鳖65% >洞庭湖鳖55% >鄱阳湖鳖40% >太湖鳖20%,呈现出从黄河到淮河到长江、从长江的中游到下游逐步降低的遗传渐变现象;(2)多态位点比例(P)的大小顺序为太湖鳖59.25%>洞庭湖鳖56.52%>鄱阳湖鳖55.80%>淮河鳖55.03%>黄河鳖54.43%,但5个群体间的差异不显著(F=0.644<F0.05;4,145=2.45);5群体内的遗传多态度(π)在0.3644～0.3883间;(3)群体内遗传相似度大小顺序为淮河鳖0.782>黄河鳖0.771>鄱阳湖鳖0.768>洞庭湖鳖0.750>太湖鳖0.722,其中太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖、鄱阳湖鳖3个群体间的差异显著(P <0.05);(4)分子方差分析(AMOVA)表明,黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖及鄱阳湖鳖3个群体间,太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖2个群体间有极显著的遗传分化(P<0.001);(5)根据遗传距离,用UPGMA 和NJ法进行聚类分析表明黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖与鄱阳湖鳖分别先聚在一起,最后再与太湖鳖聚类,显示太湖鳖在基因组上与其它4个群体鳖存在明显歧化.     

彭泽鲫的分子遗传分析及其与方正银鲫A系的比较

Genetic homogeneity between Pengze crucian carp and strain A of silver crucian carp was studied by using transferrin,isozyme and RAPD markers.The studied individuals of Pengze crucian carp showed transferring patterns were the same of silver crucian carp A strain while distinct from those of other crucian carp populations.As far as isozyme is concerned,the MDH,LDH and EST are all of the same with only slight differences in SOD between them.The RPAD patterns clearly indicated high homogeneity among 16 individuals (6 sampled from individuals of two years old and the others aged one) from crucian carp of Pengze and 5 individuals from strain A of silver crucain carp.Nearly indentical banding patterns were observed among all individuals.Average genetic distance within all the individuals is only 0.011,suggesting crucian carp of Pengze might possess indentical genetic background with strain A of silver crucian carp.     

同水体银鲫与普通鲫遗传多样性比较研究

通过2003年、2004年连续两年采样,用20对具有稳定扩增的银鲫微卫星引物对样品进行扩增,结果如下：2003年样品三倍体银鲫与二倍体鲫的平均杂合度分别为0．5885、0．6066；2004年样品两者的平均杂合度为0．5946、0．6091。2003年样品三倍体银鲫与二倍体鲫的遗传相似性系数为0．6331,两者的遗传距离为0．3669；2004年样品两者的遗传相似性系数为0．6173,遗传距离为0．3827。两年测定的结果显示三倍体银鲫的杂合度略低于二倍体鲫,两者的遗传距离较近,在所扩增的大部分微卫星位点上基因型相同或相似,其差异为种内差异,三倍体银鲫是鲫的一个特殊种群,在进化上,三倍体银鲫可能是从鲫分化而来的,是其在特殊的环境下的一种适应。     

RAPD and microsatellite analysis of diploid gynogens from allotetraploid hybrids of red crucian carp (Carassius auratus)×common carp (Cyprinus carpio)

Genetic variation was comparatively analyzed between the artificially induced diploid gynogen population from F₁₀ allotetraploid hybrids of red crucian carp (♀) (Carassius auratus red var., 2n=100)×common carp (♂) (Cyprinus carpio L., 2n=100) and the normal F₁₀ allotetraploid hybrid population used as the control, using random amplified polymorphic DNA (RAPD) assay and microsatellite analysis. The specific 600-bp fragment for diploid gynogen population was detected by S45 and the specific 900-bp fragment for allotetraploid F₁₀ hybrid population was detected by S134. The results from RAPD assay and microsatellite analysis were in agreement with each other, that is to say, the diploid gynogens presented lower level of polymorphism than allotetraploid F₁₀ hybrids. Furthermore, as expected, microsatellite analysis revealed more detailed information on genetic diversity than RAPD assay. The mean percentage of polymorphic loci (12.71%) and Shannon's index of phenotypic diversity (0.25) from RAPD data for diploid gynogen population were significantly lower than those (30.69% and 0.63, respectively) for F₁₀ allotetraploid hybrid population. The mean number of alleles per microsatellite locus (1.73) in diploid gynogen population was considerably lower than that (2.55) in F₁₀ allotetraploid hybrid population. The average observed (0.36) and expected heterozygosity (0.26) in diploid gynogen population were lower than those (0.58 and 0.40, respectively) in F₁₀ allotetraploid hybrid population, indicating that the diploid gynogens presented lower genetic diversity than the allotetraploids. In addition, the mean effective number of alleles at 11 microsatellite loci (1.60) in diploid gynogen population was lower than that (1.88) in F₁₀ allotetraploid hybrid population. The significant differences between two populations in the average observed and expected heterozygosity, mean number of alleles and effective number of alleles, suggested that the effect of gynogenesis resulted in rather higher genetic homogeneity in diploid gynogens. The comparative RAPD analysis of diploid gynogens and their parents was performed with 34 primers. The identical RAPD pattern was detected between diploid gynogens and their female parent, however, some clear specific RAPD bands were detected between diploid gynogens and their male parents, but not detected in their female parent. The result indicated that heterologous genetic material had incorporated into diploid gynogenetic fish (G₁).     

淇河鲫与两野生鲫鱼群体遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR技术对淇河鲫、金堤河鲫、沁河鲫3个群体进行遗传多样性研究。结果表明:(1)筛选8个引物共得到94个扩增位点,其中多态位点82个,多态位点百分率为87.23%。(2)Popgene分析结果,淇河鲫群体的遗传多样性水平相对较低,PPB=61.70%,H=0.2036,I=0.3085。(3)3个群体间的遗传分化系数GST=0.1303,基因流Nm=3.3359。表明3个群体的遗传分化尚未达到种群的分化水平。(4)金堤河鲫和沁河鲫群体间遗传距离较近,淇河鲫有一定的遗传分化,形成了较稳定的、独立的遗传结构。     

剑尾鱼RW-H近交系的遗传结构分析

筛选31条随机引物对剑尾鱼的第8代近交RW-H系A、B、C3窝共11尾剑尾鱼个体基因组DNA进行RAPD扩增，计算近交系个体间及不同窝间的相似系数及遗传距离。结果筛选的31条引物共扩增出383条带，扩增片段的大小在0．2～3kb。其中多态性带30条，多态性带频率在0～58．33％，平均为7．83％。近交系剑尾鱼不同个体拥有相同条带的比率较高。计算得到近交系的平均相似系数(S)为0．9829(0．9716～0．9960)，平均等位基因频率(q)为0．8692，最低平均杂合率(H)为0．1308。同时，用5个微卫星标记对非选育剑尾鱼和近交系RW-H系的基因组进行分析，检测等位基因的个数和大小，结果5个微卫星座位在非选育剑尾鱼中显示为多态，而在近交系RW-H系除1个位点出现等位基因外，其余均为纯合子，计算得到近交系的平均遗传相似系数为0．9345，两种方法均证明近交RW-H系第8代剑尾鱼有较高的遗传纯合度。     

中国大陆沿海六水系绒螯蟹_中华绒_省略__群体亲缘关系_RAPD指纹标记

用 4 8个具有丰富多态性的 10碱基随机引物对辽河、黄河、长江、瓯江、珠江和南流江的中华绒螯蟹和日本绒螯蟹的 6个群体进行RAPD分析。结果发现 :(1)两个引物具有群体特异性带 ,其中Z2扩增的 880bp片段为珠江蟹和南流江蟹群体中所特有 ,而 70 0bp片段为长江蟹、辽河蟹、黄河蟹和瓯江蟹所特有 ,可作为区别日本绒螯蟹和中华绒螯蟹的分子遗传标记 ;(2 )Opp17扩增的 94 7bp片段的出现频率 ,在长江、黄河和辽河群体显著地从南到北递减 ,长江蟹 87.50 %、黄河蟹4 1.66%、辽河蟹 10 .83%。这一遗传渐变的度量可作为区别这三个水系的中华绒螯蟹种群的判据 ;(3) 6水系群体内的平均遗传相似度依次为 :辽河蟹 0 .90 8>南流江蟹 0 .897>瓯江蟹和珠江蟹 0 .895>黄河蟹 0 .890 >长江蟹 0 .850 ;6群体间遗传距离及其UPGMA、NJ聚类分析进一步表明 ,南流江蟹、珠江蟹同长江蟹、辽河蟹及黄河蟹在基因组之间存在明显的歧化。 更多还原     

不同地理群体星突江鲽养殖子一代群体遗传多样性分析

采用RAPD标记技术对取自韩国沿海和俄罗斯沿海的星突江鲽养殖子一代进行了遗传多样性分析。从40个10bp随机引物中筛选出11个效果稳定的引物,对每个群体40个个体进行扩增,各获得57个位点。韩国群体多态位点数为33个,其多态位点比例P为57.89%;俄罗斯群体多态位点数为32个,其多态位点比例P为56.14%。韩国群体和俄罗斯群体的Shannon遗传多样度分别为0.3384和0.2963,Nei的多样性指数h分别为0.2305和0.1947。星突江鲽两群体遗传多态度总量Hsp为0.4252。其中,群体内遗传多态度Hpop为0.3174,源于群体内的遗传多样性的比例为0.7465,而源于群体间的遗传多样性的比例为0.2535。