| 基因的无树评估(英文) |
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| 引用本文： | 李川,唐常杰,陈瑜,代术成,邱江涛,罗谦,朱军.基因的无树评估(英文)[J].计算机工程与应用,2008,44(14):80-84. |
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| 作者姓名： | 李川 唐常杰 陈瑜 代术成 邱江涛 罗谦 朱军 |
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| 作者单位： | 1. 四川大学,计算机学院,成都,610065
2. 中国出生缺陷监测中心,成都,610065 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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国家科技支撑项目
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四川省科技攻关项目
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四川大学校科研和教改项目 |
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| 摘 要： | 传统基于表达式树ET的基因评估从性能角度讲主要缺点是:重复遍历表达式树和进行大量重复计算。提出基于Scale的基因评估。变量矩阵用来避免基因评估中的重复计算。实验表明,在绝大多数数据分布下和参数选择情况下:基于Scale的基因评估较基于ET的基因评估快3～5倍。
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| 关 键 词： | 数据挖掘 基因表达式编程 基于Scale的基因表达 |
| 文章编号： | 1002-8331(2008)14-0080-05 |
| 收稿时间： | 2008-1-18 |
| 修稿时间： | 2008-3-25
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Evaluating genes without expression trees construction |
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| LI Chuan,TANG Chang-jie,CHEN Yu,DAI Shu-cheng,QIU Jiang-tao,LUO Qian,ZHU Jun.Evaluating genes without expression trees construction[J].Computer Engineering and Applications,2008,44(14):80-84. |
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| Authors: | LI Chuan TANG Chang-jie CHEN Yu DAI Shu-cheng QIU Jiang-tao LUO Qian ZHU Jun |
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| Affiliation: | 1.School of Computer,Sichuan University，Chengdu 610065，China 2.Birth Defects Supervising Centre，Chengdu 610065，China |
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| Abstract: | Traditional ET(Expression Tree)-based GEP has a major performance defect:Repetitive ET traverses and calculations.This paper proposes a novel model called Scale-Based GEP to solve the problem.Variable matrix is used to avoid repetitive calculations and traversing in ET-based gene evaluation.Experiments show that Scale-based evaluation outperforms ET-based method 3~5 times constantly. |
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| Keywords: | data mining gene expression programming Scale-based gene expression |
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