| 基于高通量测序的厚唇裸重唇鱼微卫星分子标记筛选 |
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| 引用本文： | 刘峰林,王泽松,王太,邓嘉俊,王小东,金燕君,宋昭彬.基于高通量测序的厚唇裸重唇鱼微卫星分子标记筛选[J].动物学杂志,2023,58(6):817-826. |
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| 作者姓名： | 刘峰林 王泽松 王太 邓嘉俊 王小东 金燕君 宋昭彬 |
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| 作者单位： | 四川大学生命科学学院，生物资源与生态环境教育部重点实验室 成都 610065;甘肃省水产科学研究所，甘肃省冷水性鱼类种质资源与遗传育种重点实验室 兰州 730030;四川大学自然博物馆 成都 610065;四川大学生命科学学院，生物资源与生态环境教育部重点实验室 成都 610065;四川大学生命科学学院，长江上游鱼类资源与环境四川省野外科学观测研究站 成都 610065 |
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| 摘 要： | 本研究对厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychus pachycheilus)基因组进行Illumina HiSeq高通量测序，共获得85 905条序列，包含567 200个微卫星位点，从中筛选出15个微卫星位点，采用雅砻江新龙种群和黄河渭河种群对其多态性进行了验证。新龙种群中，15个位点的平均等位基因数为6.9(3 ~ 13)，观测杂合度(Ho)为0.712 4，多态信息含量(PIC)为0.630 3，有8个位点显著偏离哈迪-温伯格平衡，1对位点表现出连锁。渭河种群中，15个位点的平均等位基因数为8.4(4 ~ 16)，观测杂合度(Ho)为0.719 5，多态信息含量(PIC)为0.680 7，有7个位点显著偏离了哈迪-温伯格平衡，4对位点表现出连锁。筛选获得的15个微卫星位点多态性较高，适合用于厚唇裸重唇鱼种群遗传学研究。
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| 关 键 词： | 厚唇裸重唇鱼 高通量测序 微卫星分子标记 |
| 收稿时间： | 2022/11/26 0:00:00 |
Isolation and Characterization of Microsatellite Loci for Gymnodiptychus pachycheilus by Illumina HiSeq Sequencing |
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| LIU Feng-Lin,WANG Ze-Song,WANG Tai,DENG Jia-Jun,WANG Xiao-Dong,JIN Yan-Jun,SONG Zhao-Bin.Isolation and Characterization of Microsatellite Loci for Gymnodiptychus pachycheilus by Illumina HiSeq Sequencing[J].Chinese Journal of Zoology,2023,58(6):817-826. |
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| Authors: | LIU Feng-Lin WANG Ze-Song WANG Tai DENG Jia-Jun WANG Xiao-Dong JIN Yan-Jun SONG Zhao-Bin |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Bio-Resources and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu 610065;Gansu Key Laboratory of Cold Water Fishes Germplasm Resources and Genetics Breeding, Gansu Fisheries and Science Research Institute, Lanzhou 730030;Museum of Natural History, Sichuan University, Chengdu 610065; Key Laboratory of Bio-Resources and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu 610065 ;Observation and Research Station of Sichuan Province of Fish Resources and Environment in Upper Reaches of the Yangtze River, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu 610065, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gymnodiptychus pachycheilus High-throughput sequencing Microsatellite |
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