| 基于转录组测序的慈竹笋木质素基因筛选及其表达分析 |
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| 引用本文： | 蒋海港,王树刚,刘阳,沈彦合,李祥宁,曹颖. 基于转录组测序的慈竹笋木质素基因筛选及其表达分析[J]. 植物研究, 2018, 38(3): 415-421. DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.03.014 |
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| 作者姓名： | 蒋海港 王树刚 刘阳 沈彦合 李祥宁 曹颖 |
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| 作者单位： | 西南科技大学生命科学与工程学院, 绵阳 621010 |
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| 基金项目： | 四川省大学生创新创业训练计划资助项目（16cxcy13）；西南科技大学实验技术研究项目（16syjs19）；西南科技大学生命科学基地班创新实践项目（SMJDB009） |
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| 摘 要： | 慈竹（Bambusa emeiensis）纤维素含量丰富，是较好的造纸原料，但竹茎中木质素影响着制浆生产及纸浆质量。目前，对慈竹木质素生物合成机制所知甚少，这限制了遗传调控竹木质素的研究。本文以拟南芥、水稻等植物的已知木质素基因作为查询序列，通过BLASTp和系统进化分析，从10、50、100和150 cm慈竹笋转录组数据中筛选到351个木质素生物合成相关Unigenes，包括51个LAC，37个4CL、26个PAL、34个CCR和25个CAD相关转录子，其数量高于其他已报道的竹类植物。转录丰度和定量基因表达分析发现16个木质素基因，包括2个PAL、5个CCR、3个4CL、2个CADH2和4个LAC，随着笋发育而表达上调，表明其可能与发育性木质素积累相关。
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| 关 键 词： | 慈竹 笋 木质素生物合成 差异表达 |
| 收稿时间： | 2017-10-30 |
Transcriptome-wide Identification of Lignin Gene Families of Bambusa emeiensis Shoots and Their Differential Expression |
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| JIANG Hai-Gang,WANG Shu-Gang,LIU Yang,SHEN Yan-He,LI Xiang-Ning,CAO Ying. Transcriptome-wide Identification of Lignin Gene Families of Bambusa emeiensis Shoots and Their Differential Expression[J]. Bulletin of Botanical Research, 2018, 38(3): 415-421. DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.03.014 |
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| Authors: | JIANG Hai-Gang WANG Shu-Gang LIU Yang SHEN Yan-He LI Xiang-Ning CAO Ying |
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| Affiliation: | School of Life Science and Engineering, Southwest University of Science and Technology, Mianyang 621010 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bambusa emeiensis bamboo shoots lignin biosynthesis differential expression |
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