| 生物信息软件的自动化策略及其实现 |
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| 引用本文： | 李友元,庄英萍,张嗣良.生物信息软件的自动化策略及其实现[J].计算机工程,2011,37(4):81-83. |
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| 作者姓名： | 李友元 庄英萍 张嗣良 |
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| 作者单位： | 华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室,上海,200237 |
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| 基金项目： | 国家"973"计划基金资助项目"工业生物技术的过程科学基础研究"，生物反应器工程国家重点实验室专项基金资助项目 |
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| 摘 要： | 分析基于OLE自动化、内嵌VBA、键盘模拟以及智能网络代理技术的4种程序自动化策略。实现基于OLE自动化和内嵌VBA技术的生物质谱数据处理自动化程序AutoDataExplorer、基于键盘模拟技术的引物设计自动化程序OligoMask、基于网络智能代理的质谱数据库搜索自动化程序BatchMascot，在高通量蛋白质组学数据采集和分析工作上的成功应用证明其能使软件设计更方便快捷。
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| 关 键 词： | 生物信息软件 OLE自动化 VBA语言 |
Automation Strategies for Bioinformatics Software and Their Implementation |
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| LI You-yuan,ZHUANG Ying-ping,ZHANG Si-liang.Automation Strategies for Bioinformatics Software and Their Implementation[J].Computer Engineering,2011,37(4):81-83. |
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| Authors: | LI You-yuan ZHUANG Ying-ping ZHANG Si-liang |
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| Affiliation: | (State Key Laboratory of Bioreactor Engineering,East China University of Science and Technology,Shanghai 200237,China) |
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| Abstract: | Four kinds of automation strategies based on Object Linking and Embedding（OLE） automation, built-in Visual Basic for Application（VBA）, keyboard simulation, and intelligent network Agent technology are summarized. Successful automation achievements such as bio-MS software AutoDataExplorer based on OLE, primer design software OligoMask based on keyboard simulation, and MS database searching engine BatchMascot based on intelligent network Agent are applied in high-throughput proteomics data acquisition and analysis. This method can make software design easy and fast. |
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| Keywords: | bioinformatics software Object Linking and Embedding（OLE） automation Visual Basic for Application（VBA） |
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