| 双链置换探针实时PCR用于DNA池的等位基因频率测定 |
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| 引用本文： | 程金平,梁基选,李庆阁. 双链置换探针实时PCR用于DNA池的等位基因频率测定[J]. 厦门大学学报(自然科学版), 2004, 43(Z1): 113-118 |
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| 作者姓名： | 程金平 梁基选 李庆阁 |
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| 作者单位： | 1. 厦门大学生命科学学院,细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室
2. 厦门大学医学院,抗癌研究中心,福建,厦门,361005 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30170834)，福建省自然科学基金重点项目(C0220001)资助. |
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| 摘 要： | 结合荧光双链置换探针的特异性和实时PCR的准确定量能力,建立了一种新颖、准确、价廉且高通量的测定DNA池等位基因频率的方法.该方法采用不同荧光标记的双链置换探针1次PCR反应即可测定出等位基因频率.实验以β 地中海贫血CDs41 42( TCTT)突变为对象,分别用荧光染料FAM和ROX标记野生型和突变型探针,由实时PCR检测建立的等位基因浓度与循环阈值的响应曲线计算DNA池的等位基因频率.结果表明,建立的系列等位基因浓度与循环阈值呈线性关系,线性相关系数分别为0.9977(野生型等位基因)和0.9938(突变型等位基因),可检测的最低等位基因频率达1%,等位基因频率在1%～90%范围内测定误差小于4%.该方法可广泛用于流行病学调查、遗传连锁分析以及全基因组连锁不平衡扫描等领域.
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| 关 键 词： | 双链置换探针 实时PCR DNA池 等位基因频率 |
| 文章编号： | 0438-0479(2004)S-113-06 |
| 修稿时间： | 2004-03-25 |
Determination of Allele Frequency of Pooled DNA by Double-stranded Displacing Probe-based Real Time PCR |
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| CHENG Jin-ping,LIANG Ji-xuan,LI Qing-ge. Determination of Allele Frequency of Pooled DNA by Double-stranded Displacing Probe-based Real Time PCR[J]. Journal of Xiamen University(Natural Science), 2004, 43(Z1): 113-118 |
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| Authors: | CHENG Jin-ping LIANG Ji-xuan LI Qing-ge |
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| Affiliation: | CHENG Jin-ping~1,LIANG Ji-xuan~2,LI Qing-ge~ |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | double-stranded displacing probe real-time PCR DNA pooling allele frequency |
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