| 3种常用单核苷酸多态性检测方法的应用比较 |
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| 引用本文： | 侯君,谭云山,韩琼林. 3种常用单核苷酸多态性检测方法的应用比较[J]. 中国临床医学, 2004, 11(2): 255-257 |
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| 作者姓名： | 侯君 谭云山 韩琼林 |
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| 作者单位： | 1. 复旦大学附属中山医院病理科,上海,200032
2. 江西省宜春市第二人民医院病理科,宜春,336000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助(编号:39870741) |
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| 摘 要： | 目的：通过比较变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis．DGGE)、单链构像多态性(single—stranded conformational polymorphism，SSCP)、限制性酶切检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)的优缺点。为不同条件下选择最适合的SNP检测方法提供借鉴。方法：DGGE、限制性酶切检测150例大肠癌APEX基因第3外显子，SSCP检测第5外显子，最后结果经直接测序验证。结果：DGGE检测出17例异常泳动条带；测序结果证实该17例均存在1247A→G的SNP；SSCP检测到57例异常条带；经直接测序证实38例有2197T→G的SNP；PCR-限制性酶切结果与DGGE所测结果完全吻合。结论：DGGE检测结果无假阳性，重复性好，准确率高。而且可判断基因型；SSCP简便易行．但存在假阳性与假阴性，而且不能判断基因型；限制性酶切对SNP位点检测及基因分型均能进行较准确的判断。
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| 关 键 词： | 单核苷酸多态性 检测 变性梯度凝胶电泳 大肠癌 限制性酶切 检测 |
Comparison of Three Methods in Detection the Single Nucleotide Polymorphism |
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| Hou Jun TanYunshan Han Qionglin. Comparison of Three Methods in Detection the Single Nucleotide Polymorphism[J]. Chinese Journal Of Clinical Medicine, 2004, 11(2): 255-257 |
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| Authors: | Hou Jun TanYunshan Han Qionglin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Single nucleotide polymorphism Denaturing gradient gel electrophoresis Single - stranded conformational polymorphism PCR - restriction enzyme digestion |
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