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割手密过氧化氢酶基因(Ss CA T-1)的克隆与比较分析
引用本文:刘洋,姚艳丽,胡小文,徐磊,邢淑莲,张树珍.割手密过氧化氢酶基因(Ss CA T-1)的克隆与比较分析[J].分子植物育种,2014(6).
作者姓名:刘洋  姚艳丽  胡小文  徐磊  邢淑莲  张树珍
作者单位:1. 中国热带农业科学院湛江实验站,热带旱作农业研究中心,湛江,524000
2. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,甘蔗研究中心,海口,571101
基金项目:中国热带农业科学院生物技术研究所中央公益性科研基本业务费项目,海南省自然科学基金项目
摘    要:割手密是栽培种甘蔗最重要的近缘物种之一,具有较强的抗逆性。本研究以高粱过氧化氢酶基因(NCBI登录号为XM002437586.1) cDNA序列为探针,对甘蔗EST数据库进行同源检索、筛选和拼接,后经基因组PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了2个割手密过氧化氢酶基因cDNA序列(Ss CA T-1c和Ss CA T-1d, GeneBank登录号为KF864229和KF864230)。2条序列全长均为1532 bp,包含10 bp的5'非翻译区(UTR)和43 bp的3'UTR,以及一个1479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,此蛋白序列具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。2条序列之间相似性为99.2%,存在12个单核苷酸多态性(SNP)位点,蛋白相似性99.0%,存在5个氨基酸变异位点。将推测的SsCAT-1c和SsCAT-1d蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种进行同源进化分析,均表现出极高的保守性。研究结果能对今后深入了解甘蔗及其近缘材料CAT基因家族的信息提供帮助,从而为进一步通过生物技术改良甘蔗品种抗逆性提供理论依据。

关 键 词:割手密  过氧化氢酶  基因克隆  PCR验证

Isolation and Characterization of Catalase (Ss CA T-1) Gene in Sac c harum s p ontane um L
Liu Yang,Yao Yanli,Hu Xiaowen,Xu Lei,Xing Shulian,Zhang Shuzhen.Isolation and Characterization of Catalase (Ss CA T-1) Gene in Sac c harum s p ontane um L[J].Molecular Plant Breeding,2014(6).
Authors:Liu Yang  Yao Yanli  Hu Xiaowen  Xu Lei  Xing Shulian  Zhang Shuzhen
Abstract:
Keywords:Saccharum spontaneum L    Catalase  Clone  PCR validation
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